Splice junction sequence |
GGGTAGGGGGCGGATTGCTGTCATGCGCCAGGTTATAGATACTTATGAGAAATGGTGTTTAAGG TTGTCGACCTCACGGCTGAACCGTTGGTTGCGTAAGatggactcaaccaagatgaccctacctc tgaggctgagacggaagcccatgaaggtgatgaaagcaagttacctttgcaattggcaattgtt gggcgtcc
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Assembled circRNA sequence |
Yes
The sequence of a circRNA based on assembly using circseq-cup (Ye et al., 2016) or CIRI-full (Zheng and Zhao, 2018) or CIRCexplorer2 (Zhang et al., 2016).
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Full-length trsnacripts |
Transcript length: 1621 Transcript exons: 6899596-6899825,6900122-6901374,6902079-6902216 ATGGACTCAACCAAGATGACCCTACCTCTGAGGCTGAGACGGAAGCCCATGAAGGTGATGAAAG CAAGTTACCTTTGCAATTGGCAATTGTTGGGCGTCCTAATGTTGGGAAGTCTACCCTGCTGAAT ACCTTGTTGCAAGAACAAAGAGTTCTGGTTGGCCCCGAGGCAGGCTTAACAAGGGACTCTATTC GGACTCAGTTTCAGTTTGACAATCGAACTGTATATTTGGTGGACACTGCAGGTTGGATGGAAAG GTCAGGAAAGGAGAAAGGTCCAGCATCGTTGAGCGTGGTGCAGTCAAGAAAGAATCTGATGAGA GCTCATATTGTAGCTCTTGTTCTGGATGGAGAAAAGGTACTTAATTTCATCCTGATGTGCTCTG AGCCAATGACCTGCATATTTCTTACTATGCTTCTTTCTATATGGTTAAGGGATAACATTTTCAA TGCTCCCCTGTTCTGTAGTTTGTGTCTTTTTTTTTTCATAACGAAGAACTCCAAGTGAATATCT TTTACTACGGGTTTCTGGTGCCATGTTATTAATGTGGCATATATTCATGCCCCTTTGGAATGTG GAAAAAAAAAATCCTGATTTGCACTTGAGCAGGGCGTGCTATTCAACATTTCAACCTCTCAAGC CATGATTTGCTAATGGAGGCATCACTACATGTGTATGACTTTTGTCTGAATATTTGAGGGAATA AACAATAACTCAATTGATTGTGGTGTTCTTCTTTACCAATTGCATTTGCTAGATCACCTGGGTT ATCTGCTCTTTAACCTTGATATGCATAAGTTCTATGTCAACTTGCCAAGTACAAAGAGTCAGAC AGAGGATGAACAACCTCATCAAGCATGTTAACGTTGTTTATGTACTCTGCTAGAAACTAAGTTG CATTAGTCATGGGGCTGCACTACTAAAGTGCTAGTATTGGATGTGTTGGTGGTTGTAAATCATA GTTGATGTGCTTTTCACATTTATGGCGAGTGCCACCACCTTTTTATGTAAAATACATGTGAAAT TTGGTCCAGTGCCAGTAATATTTTGTACAGTCATTTATTTTGTAACAATCGCCTCCTCAATACT ATTACTTCTTAACCGTAGTTCTGTTTAATGTACTGAATTTAGTTTTTGTAAGCTTGATGTTGTA ATGTCAGTCCTATTTCAAACTAGTAAGCATCAGAAGCATCATAGTCAATGTTTAAATTGAATAT ACCAGTCTGATACTTTGCATGTCTATGCATTTGCTGTCATTTGATTTTTAACGGCCAATGCCAT AACAAATCTTTATTAATTTGTAGATTGCAAAGTCTAAAAGTAGCATGAATCACCCTGAAGTTCT GATAGCACGGCAAGCAATAGAAGAAGGTCGTGGACTTGTTGTGATTGTCAACAAAATGGATCTT CTTAGGGAAAACCGACCATTGTTTGACAAAGTGATAGATGCTGTTCCTAAAGAAATCCAGACAG TTATTCCCCAGGTTACAGGAATACCAGTTGTGTTTATGTCTGCATTGGAGGGTAGGGGGCGGAT TGCTGTCATGCGCCAGGTTATAGATACTTATGAGAAATGGTGTTTAAGGTTGTCGACCTCACGG CTGAACCGTTGGTTGCGTAAG
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Genomic sequence |
ATGGACTCAACCAAGATGACCCTACCTCTGAGGCTGAGACGGAAGCCCATGAAGGTGATGAAAG CAAGTTACCTTTGCAATTGGCAATTGTTGGGCGTCCTAATGTTGGGAAGTCTACCCTGCTGAAT ACCTTGTTGCAAGAACAAAGAGTTCTGGTTGGCCCCGAGGCAGGCTTAACAAGGGACTCTATTC GGACTCAGTTTCAGTTTGACAATCGAACTGTATATTTGGTAATTCCTTTTTATGAGTTCAATAT TATATTTTTCACTTTTATTTCTTGTATTGGCCATATATATATGTGCTTGTGTTGTGAACTTTAG TGGTCTTACACTATGATGTGTCACACAGCCTTTTTGCGAGAACATAATGATTATTTGTTTAAAA ATATTATCTAGTTGGAGTGTGTCAAATTCACTCAAAGTTGCGATTGCATGGTGCAATCTAGGAG CTCATATCATAATGTCCATGCAAGCTACTTATCTGAACGGAGTCATCATTTTCATTTTTCCTTT TTTTCGTGGTGCAGGTGGACACTGCAGGTTGGATGGAAAGGTCAGGAAAGGAGAAAGGTCCAGC ATCGTTGAGCGTGGTGCAGTCAAGAAAGAATCTGATGAGAGCTCATATTGTAGCTCTTGTTCTG GATGGAGAAAAGGTACTTAATTTCATCCTGATGTGCTCTGAGCCAATGACCTGCATATTTCTTA CTATGCTTCTTTCTATATGGTTAAGGGATAACATTTTCAATGCTCCCCTGTTCTGTAGTTTGTG TCTTTTTTTTTTCATAACGAAGAACTCCAAGTGAATATCTTTTACTACGGGTTTCTGGTGCCAT GTTATTAATGTGGCATATATTCATGCCCCTTTGGAATGTGGAAAAAAAAAATCCTGATTTGCAC TTGAGCAGGGCGTGCTATTCAACATTTCAACCTCTCAAGCCATGATTTGCTAATGGAGGCATCA CTACATGTGTATGACTTTTGTCTGAATATTTGAGGGAATAAACAATAACTCAATTGATTGTGGT GTTCTTCTTTACCAATTGCATTTGCTAGATCACCTGGGTTATCTGCTCTTTAACCTTGATATGC ATAAGTTCTATGTCAACTTGCCAAGTACAAAGAGTCAGACAGAGGATGAACAACCTCATCAAGC ATGTTAACGTTGTTTATGTACTCTGCTAGAAACTAAGTTGCATTAGTCATGGGGCTGCACTACT AAAGTGCTAGTATTGGATGTGTTGGTGGTTGTAAATCATAGTTGATGTGCTTTTCACATTTATG GCGAGTGCCACCACCTTTTTATGTAAAATACATGTGAAATTTGGTCCAGTGCCAGTAATATTTT GTACAGTCATTTATTTTGTAACAATCGCCTCCTCAATACTATTACTTCTTAACCGTAGTTCTGT TTAATGTACTGAATTTAGTTTTTGTAAGCTTGATGTTGTAATGTCAGTCCTATTTCAAACTAGT AAGCATCAGAAGCATCATAGTCAATGTTTAAATTGAATATACCAGTCTGATACTTTGCATGTCT ATGCATTTGCTGTCATTTGATTTTTAACGGCCAATGCCATAACAAATCTTTATTAATTTGTAGA TTGCAAAGTCTAAAAGTAGCATGAATCACCCTGAAGTTCTGATAGCACGGCAAGCAATAGAAGA AGGTCGTGGACTTGTTGTGATTGTCAACAAAATGGATCTTCTTAGGGAAAACCGACCATTGTTT GACAAAGTGATAGATGCTGTTCCTAAAGAAATCCAGACAGTTATTCCCCAGGTTTGCTTTCTTG TTGTACTAACCTACAACCTTGACCTATATACTGCTAACATGATTGCACAGACACTGGAAACTTT TGTGTAATTTCTGCTAAGTATTATCTAATTATCTTGGAGACTTTCATTTCCAATTGATTCTGGG AAAGCTTTCTGATTATTTGTTCTTTAGTTGAAACCTTGCCAAGTTTATAATCAGTTTTTTCAGC AACAAGCTTGATGTTTTATTATCAGTTTAGTGCTTTCTGAGTATTACTCATGTAGATGCTTTAC TTTGTTTGCCGATGGAGTACGAGAAATGGAAGATTGAAGTTTCTTTGTTTTGGTTGTTATTGCA CATGGAGATGTCTTGCTCTGTCTACTGACGGAATGTAGATATTGAGATTCATTTTGATGGATCT TCCATGTTCTTGATTGACAAACCATGATTTCTTTAGTGTCTGCTAATGGCTGGAAATGTGCAAT CTAATCTCTGGCTTATTTTTTTGACCTTTCCAGAGCACGTTGCATATCTATTAATGATTTAGTG TAGTAATATCATTATGAAATATGAAGTGTTGCTTTTCCAGTGCATTTCGTATAACTTTTGATTC ACTAAAAAGGGAGAATTACAGTGAACCATTTTACCAGAATATATCAGTAGTTTGCTTCATATTT TGACAGGGGACCACGTGACAAAATATACTAATCTTCTCCTATTTCTGGCAGGTTACAGGAATAC CAGTTGTGTTTATGTCTGCATTGGAGGGTAGGGGGCGGATTGCTGTCATGCGCCAGGTTATAGA TACTTATGAGAAATGGTGTTTAAGGTTGTCGACCTCACGGCTGAACCGTTGGTTGCGTAAG |