Splice junction sequence |
ATCGGAGGAGCCAGTGAAGCTGAAGTTGGTGAGAAGAAGGATAGAGTGACAGATGCATTGAATG CCACTAAAGCTGCTGTGGAAGAGGGTATTGTACCAGgttggaagcaggcttgccttgagcagga actatgctgccaaggatatcaagtttggagttgaggcccgtgctttgatgctgaggggtgttga ggagttgg
|
Assembled circRNA sequence |
Yes
The sequence of a circRNA based on assembly using circseq-cup (Ye et al., 2016) or CIRI-full (Zheng and Zhao, 2018) or CIRCexplorer2 (Zhang et al., 2016).
|
Full-length trsnacripts |
Transcript length: 1270 Transcript exons: 17049013-17049144,17049448-17049607,17050180-17050355,17 050448-17050543,17050677-17050781,17050864-17050950,1705 1040-17051129,17051199-17051279,17051366-17051434,170515 79-17051656,17051744-17051839,17052147-17052246 GTTGGAAGCAGGCTTGCCTTGAGCAGGAACTATGCTGCCAAGGATATCAAGTTTGGAGTTGAGG CCCGTGCTTTGATGCTGAGGGGTGTTGAGGAGTTGGCAGATGCAGTCAAAGTGACAATGGGTCC TAAGGGACGCAATGTGGTTATTGAGCAGAGCTATGGTTCACCGAAAGTCACAAAGGACGGTGTG ACTGTTGCCAAGAGCATTGAGTTCAAGGATAGAGTCAAGAATGTTGGTGCAAGCCTTGTAAAGC AGGTTGCTAATGCGACCAATGATACTGCTGGAGATGGTACCACTTGTGCTACTGTATTGACTAA AGCAATATTTACTGAGGGGTGCAAGTCTGTTGCTGCTGGCATGAATGCAATGGATTTAAGGCGT GGTATTTCAATGGCTGTTGATGCTGTTGTAACTAACCTAAAGGGCATGGCTAGAATGATCAGCA CATCAGAGGAAATAGCTCAGGTGGGCACAATATCAGCAAATGGGGAAAGGGAAATTGGTGAGCT TATTGCAAAGGCTATGGAGAAGGTTGGCAAGGAGGGTGTAATCACCATTGCGGATGGTAACACC CTTTACAATGAGCTTGAAGTTGTGGAAGGCATGAAACTTGACAGAGGCTACATCTCTCCTTACT TTGTTACCAACCCAAAGACCCAGAAATGTGAACTGGATGACCCCTTGATCCTGATACATGACAA GAAGGTTTCGAACCTGCATGCAGTAGTTAAAGTCTTGGAGTTGGCTCTGAAGAAGCAAAGGCCT CTGCTGATTGTTGCTGAAGATGTAGAGAGCGAGGCATTGGGTACTCTGATTATTAACAAGCTTC GTGCAGGCATCAAGGTCTGTGCTGTTAAAGCTCCTGGGTTTGGGGAGAACAGGAAAGCAAACTT ACAGGACCTTGCGATCCTTACTGGAGGAGAAGTCATAACTGAAGAGCTAGGAATGAATCTTGAG AAGTTCGAGCCTCAGATGTTGGGTACATGCAAGAAGGTAACTGTATCTAAGGACGACACTGTTA TTCTTGATGGAGCTGGAGACAAGAAATCCATTGAAGAGAGGGCTGAGCAGATTAGATCTGCAAT TGAGCTAAGCACTTCTGATTATGACAAGGAAAAGCTACAGGAGCGGTTGGCAAAGCTCTCCGGA GGTGTTGCTGTTCTAAAGATCGGAGGAGCCAGTGAAGCTGAAGTTGGTGAGAAGAAGGATAGAG TGACAGATGCATTGAATGCCACTAAAGCTGCTGTGGAAGAGGGTATTGTACCAG
|
Genomic sequence |
GTTGGAAGCAGGCTTGCCTTGAGCAGGAACTATGCTGCCAAGGATATCAAGTTTGGAGTTGAGG CCCGTGCTTTGATGCTGAGGGGTGTTGAGGAGTTGGCAGATGCAGTCAAAGTGACAATGGGTCC TAAGGTATAATTGTGTTCATGTAAATGTGTCATTGTGCACTTGTGTACTTGTCTGAATACGTTA ATTGTTTTGTAGCTATTATAAATGAAGTTCCTTTGATAGAAAGCCAAATGATTGGTTTATGATT CTGAAAATAACTGTCATAAACATGGTGCACCTTTTCTCTGATGACAAAATTAGTCTTTATGTCA TGCTTTCATTGTTGCAGCACAGTGTTTGTTGGGCCTACAACTTTTTATGTTTTTATTTTGTCAG AGTGCTGTGTTGTGTTATTTGCAGATTGGACTTAACGTGTCTATTATGCAGGGACGCAATGTGG TTATTGAGCAGAGCTATGGTTCACCGAAAGTCACAAAGGACGGTGTGACTGTTGCCAAGAGCAT TGAGTTCAAGGATAGAGTCAAGAATGTTGGTGCAAGCCTTGTAAAGCAGGTTGCTAATGCGACC AATGATACTGCTGGAGATGGTATGGCTGTACTTGTACCATTCTGTTGAGAATACTTGGTCCTTC TGTTAGCATTCTACAACTTTGGTTATATATTATAAACAATTCCAGACCATCTCATGTTTTGCCT TCCTGTAATATTTAACCTGTAACTTATATTTACAAATATGTTCATTATTTGCATTTTTGCATAA AGTAATTCACTGTATTTAATTTATTGTTGGACGAAGGTTTGAGTGTATGCAGTTCTTATCTTCA TTGTATTCATAGGTGTGAGTTTTGGCATTGTAATTTATTGTTGTTTGGGCATTTTCAATCATCT ATCAATGCTACCTTGAATTATAATGCTATATAGTACCACTGGTTTTTGATAGATGTCACGGTTG ACTTTTTTATACACAATTTGTTTTGTTAAAAAACGAAAATTATTATTCATTTTGTTGTGACTTG GTTTATCATCAAAGGTAGTATAAGCATGACTTACATTTTCACATATTTGCACAAATTCAATATG TGGATTGCATTGTACTTTAGGATTTGCTTAGTTGCATAATTTGTTTGTTCTAACTGTGTTATTC TGATCCAAAATTCAGGTACCACTTGTGCTACTGTATTGACTAAAGCAATATTTACTGAGGGGTG CAAGTCTGTTGCTGCTGGCATGAATGCAATGGATTTAAGGCGTGGTATTTCAATGGCTGTTGAT GCTGTTGTAACTAACCTAAAGGGCATGGCTAGAATGATCAGCACATCAGAGGAAATAGCTCAGG TAATACTTGTGATTCATTGCAGATCTCATTATGTGTTTGACTTGTTTCTTAATCTTAATCTGTT ACTAAGTTCTTATGTTCATATATAAAGGTGGGCACAATATCAGCAAATGGGGAAAGGGAAATTG GTGAGCTTATTGCAAAGGCTATGGAGAAGGTTGGCAAGGAGGGTGTAATCACCATTGCGGTAAG TTGATCCAAGTTAAAACTGAACTTGGCCTCTCTTATCTCTATTTGGTTGGTAGACTTCCTTTAG TTAAAACTGAACTTGTGCCAACACTCTGGTTTTTCGTTAATTTGTTTGCTTAAACATTTGGTAG GATGGTAACACCCTTTACAATGAGCTTGAAGTTGTGGAAGGCATGAAACTTGACAGAGGCTACA TCTCTCCTTACTTTGTTACCAACCCAAAGACCCAGAAATGTGTAAGTTTTTAACTTCTGTTGTT GGTTGATATGTTCAGTTTTTCTTTTGGAACTATCTAAGTCATGAGGTTATATTTAACAGGAACT GGATGACCCCTTGATCCTGATACATGACAAGAAGGTTTCGAACCTGCATGCAGTAGTTAAAGTC TTGGAGTTGGCTCTGAAGGTATGTGTTTGCTTTCATAAAATAGTTGTATATTGTGGTGGTGCTA CTGATTTTCTTGCTATAACTGGTCAACATCTTGCCTTGCACAGAAGCAAAGGCCTCTGCTGATT GTTGCTGAAGATGTAGAGAGCGAGGCATTGGGTACTCTGATTATTAACAAGCTTCGTGCAGGCA TCAAGGTCAGTAAATACTGGGCATTTGTGATTTGAATCTGTGTAGTTGTCCTAAATGAGGGATG TGTTGTTCAGGTCTGTGCTGTTAAAGCTCCTGGGTTTGGGGAGAACAGGAAAGCAAACTTACAG GACCTTGCGATCCTTACTGGAGGAGAAGTAAGTTTAACAATCACCTCTCCAAGTTGGTGCATAT AAATTTAACCAATTGAATGCATTATAACCTGTTTATTTTAATGATTCAGGTCATAACTGAAGAG CTAGGAATGAATCTTGAGAAGTTCGAGCCTCAGATGTTGGGTACATGCAAGAAGGTATGAATGA TTCCTAGAAGGCTGGTAGATAAGCTTTGGCTATCTTTGGAAAGAAATTTGTTTGAAGTGTATCT TTTGTCCGCTAACATTTAAGATGATACCAGTCTGTTCTGATGGTTGAGTGATATTCCATGTCCA TTACAGGTAACTGTATCTAAGGACGACACTGTTATTCTTGATGGAGCTGGAGACAAGAAATCCA TTGAAGAGAGGGCTGAGCAGGTTCGTACAACATTAATTCATTGCGTTACTAGTGCATTATTTTG AAAATCGTGGTTGTTGATAGATTATATAAATGCTGTGTTGCAGATTAGATCTGCAATTGAGCTA AGCACTTCTGATTATGACAAGGAAAAGCTACAGGAGCGGTTGGCAAAGCTCTCCGGAGGTGTTG CTGTTCTAAAGGTGAGGTTCACAATATTATGTTTATATTGAGGAATATATATTGAATGAAATAA CAAACTTTCCGAACATTCCATGGTTAGATAAACCATCTGAAAGAGCCAATGTTAGACAGAATAC CAGATATGTTACTGTGTAGCCACCTAGTGTTGATTCTATTATATTGATGGTAAAAGCTTGTGAA GTCTCATTAGAGACCTCACACTTGTAACACACAATGATGTTGAGAATGGAAGTTGAATTGCACT GCTAGGAGTGGTGCCCTGAAGTTATATTTTGACCTGTATATGCATCATGACCTTTCCTACAGAT CGGAGGAGCCAGTGAAGCTGAAGTTGGTGAGAAGAAGGATAGAGTGACAGATGCATTGAATGCC ACTAAAGCTGCTGTGGAAGAGGGTATTGTACCAG |