Splice junction sequence |
TTACTTCAATCGAGGGATATGGTCCAGATAACCTTAAGTCAGCTCTACAACAATTTGGTATACT GAAAGACAATGTTTAACTTTGAGAGAAATCAAGTAGacacttatcatgggtaaccgtgatgtta ttgatgaaatgtcaagcacaaattcagctgttttgacatcaatactcaagttaattgacaagta tgatctat
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Assembled circRNA sequence |
Yes
The sequence of a circRNA based on assembly using circseq-cup (Ye et al., 2016) or CIRI-full (Zheng and Zhao, 2018) or CIRCexplorer2 (Zhang et al., 2016).
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Full-length trsnacripts |
Transcript length: 1637 Transcript exons: 12417836-12418012,12418327-12418380,12418472-12418534,12 418638-12419549,12419650-12419777,12420922-12421224 ACACTTATCATGGGTAACCGTGATGTTATTGATGAAATGTCAAGCACAAATTCAGCTGTTTTGA CATCAATACTCAAGTTAATTGACAAGTATGATCTATATGGCCAAGTGGCATACCCCAAGCACCA TAAGCAATCTGAAGTTCCAGATATTTATCGTTTAGCGGCAAGAACAAAGGGGGTGTTTATCAAT TGTGCTTTTATCGAGCCATTTGGACTAACCTTGATTGAGGCTGCTGCTTATGGTCTACCAATGG TTGCTACTCGAAATGGTGGGCCCGTTGATATACATCGGGTTCTTGACAATGGTATTCTCGTTGA TCCCCACAATCAAAATGAAATAGCTGAGGCACTTTATAAGCTTGTTTCTGATAAGCAGTTGTGG GCACAGTGCCGCCAAAATGGTCTGAAAAATATTCATCAATTTTCTTGGCCTGAACATTGCAAAA ACTATTTGTCACGGGTTGGTACACTCAAGCCACGACATCCTCGATGGCAAAAGAGTGATGATGC TACTGAAGTTTCCGAAGCTGACTCACCTGGAGATTCCTTGAGGGATGTTCATGATATATCTCTT AACTTGAAGCTTTCCTTGGACAGTGAGAAATCAAGCACAAAGGAAAATAGTGTAAGAAGAAACC TTGAGGATGCTGTACAAAAGTTGTCAAGAGGTGTTAGTGCCAACAGAAAGACAGAGTCTGTTGA GAATATGGAGGCTACCACAGGCAATAAATGGCCATCTTTGCGAAGAAGGAAACACATTGTAGTC ATTGCTATAGATTCTGTGCAAGATGCTAACCTGGTTGAGATTATCAAAAATATTTTTGTGGCTT CAAGCAATGAGAGATTATCTGGTTCTGTTGGTTTTGTTTTGTCAACATCCCGAGCAATATCAGA GGTACATTCTTTGCTAACATCTGGGGGCATAGAAGCTACTGATTTTGATGCCTTCATATGCAAC AGTGGTAGCGATCTTTGCTATCCATCCTCAAATTCTGAAGACATGCTTAGCCCTGCAGAGCTCC CATTTATGATTGATCTTGATTATCACACTCAAATTGAGTACCGTTGGGGTGGAGAAGGTTTAAG GAAGACACTAATTTGTTGGGCAGCAGAAAAAAGCGAGGGTGGTCAAGTGGTACTTGTAGAAGAT GAAGAATGTTCATCCACTTATTGTATTTCATTTAGAGTGAAGAATGCTGAGGCTGTACCTCCTG TGAAAGAGCTTAGGAAGACAATGAGAATTCAAGCACTGCGCTGTCATGTTTTGTACAGTCATGA TGGTAGCAAGTTGAATGTTATTCCTGTTTTAGCATCACGATCGCAGGCTCTAAGGTACTTGTAT ATAAGATGGGGGGTAGAGCTGTCAAATATGACAGTGGTTGTTGGTGAAAGTGGTGATACTGATT ATGAAGGACTATTAGGAGGCGTGCACAAGACCATTATTCTCAAAGGCTCATTTAATGCTGTTCC TAACCAAGTCCATGCTGCCAGAAGTTATTCATTACAGGATGTCATATCCTTTGACAAACCAGGA ATTACTTCAATCGAGGGATATGGTCCAGATAACCTTAAGTCAGCTCTACAACAATTTGGTATAC TGAAAGACAATGTTTAACTTTGAGAGAAATCAAGTAG
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Genomic sequence |
ACACTTATCATGGGTAACCGTGATGTTATTGATGAAATGTCAAGCACAAATTCAGCTGTTTTGA CATCAATACTCAAGTTAATTGACAAGTATGATCTATATGGCCAAGTGGCATACCCCAAGCACCA TAAGCAATCTGAAGTTCCAGATATTTATCGTTTAGCGGCAAGAACAAAGGTAGTCAAATATTAT ATCTTCATATGTTGAAATGTTTCATATGGTTTCTGCAATAAGTATTCTAGTGGACTCTTGACAT GTGGTTCTTGAGATTAGTTGTATGGTGATCCAGATAAGTGTTGACAATAGGATTTATGATGAGC CATATGCATTGATAGTTACATAATTGTCATTTTGGATATTTGCTTCCTTTTACCTATCCCAGTT TTACTTTCAGCAAGGAACTGATTATGCTGCTTCTATGCTTCTTTATGCCAGCCTCAATCACATC TTCATGTTTGAACTAATTATTGTTTGAATCTTATCAATTTCAGGGGGTGTTTATCAATTGTGCT TTTATCGAGCCATTTGGACTAACCTTGATTGAGGTTATGTACTGCTGTGGGATTTCCTGTTGTT GCTCAACTTTATATGTGAATTAATATGCTTATGCAATCTTAACATCTTGTTGGTTGGCAGGCTG CTGCTTATGGTCTACCAATGGTTGCTACTCGAAATGGTGGGCCCGTTGATATACATCGGGTACT GTGGCCCAATCCTTATTATACATTTTTGCTGAAACTAAATGCTCCAGTTGTTGGTGTCATACAT ATTTCTCTTATTCTGATCATGTTTGTTTGTTCAGGTTCTTGACAATGGTATTCTCGTTGATCCC CACAATCAAAATGAAATAGCTGAGGCACTTTATAAGCTTGTTTCTGATAAGCAGTTGTGGGCAC AGTGCCGCCAAAATGGTCTGAAAAATATTCATCAATTTTCTTGGCCTGAACATTGCAAAAACTA TTTGTCACGGGTTGGTACACTCAAGCCACGACATCCTCGATGGCAAAAGAGTGATGATGCTACT GAAGTTTCCGAAGCTGACTCACCTGGAGATTCCTTGAGGGATGTTCATGATATATCTCTTAACT TGAAGCTTTCCTTGGACAGTGAGAAATCAAGCACAAAGGAAAATAGTGTAAGAAGAAACCTTGA GGATGCTGTACAAAAGTTGTCAAGAGGTGTTAGTGCCAACAGAAAGACAGAGTCTGTTGAGAAT ATGGAGGCTACCACAGGCAATAAATGGCCATCTTTGCGAAGAAGGAAACACATTGTAGTCATTG CTATAGATTCTGTGCAAGATGCTAACCTGGTTGAGATTATCAAAAATATTTTTGTGGCTTCAAG CAATGAGAGATTATCTGGTTCTGTTGGTTTTGTTTTGTCAACATCCCGAGCAATATCAGAGGTA CATTCTTTGCTAACATCTGGGGGCATAGAAGCTACTGATTTTGATGCCTTCATATGCAACAGTG GTAGCGATCTTTGCTATCCATCCTCAAATTCTGAAGACATGCTTAGCCCTGCAGAGCTCCCATT TATGATTGATCTTGATTATCACACTCAAATTGAGTACCGTTGGGGTGGAGAAGGTTTAAGGAAG ACACTAATTTGTTGGGCAGCAGAAAAAAGCGAGGGTGGTCAAGTGGTACTTGTAGAAGATGAAG AATGTTCATCCACTTATTGTATTTCATTTAGAGTGAAGAATGCTGAGGCTGTATGTTTCTTTTC GTCCTGTTAGCCACTTCTCATAGCCTTCTGATTTTCTCGGACATTTTGTAAGTTACCTGATGTT TTATGATTTTCATGTGTTTCAGGTACCTCCTGTGAAAGAGCTTAGGAAGACAATGAGAATTCAA GCACTGCGCTGTCATGTTTTGTACAGTCATGATGGTAGCAAGTTGAATGTTATTCCTGTTTTAG CATCACGATCGCAGGCTCTAAGGTCGACTTTCTTTGTTCAACTGCTCTTCCATTTTTTCTCCTC ATGTTGCCATGTTCCTCATTGGAGCAAAATATTATACTCAGTTTTCCACTAAATAAAGTTTACA TATAATTTTCATTCCGCAAAGTAAACAAGTAAAGACTTAGATAACATATATTTTTTATTGCTAT ATTTGGTCATATATACTCCCATCAATATTTATTTTTGTGAGTGTTAACATCATATACTCAGTTT CCAATTCTAAAGTTTGATCACTGTCTTTCCTGATAATAAATCCATAAAAATTAAATGTATAACT ACATGAACGTATTTTTATGAAAATGTACTAATCATTTTTTTCATGTATAAAATCTAACCTTTTT GCATATAGTAGCAAGTTAAGATTTTGAGGATTAGCCTAAAGAGCGAAAATTAATCTTAGTGGAA ATCTGTCACAAACAATATTTTGTTTGTTCTTGTAAGAGCATGTATTGTAGTCCCGTCTGAACAT GCAAGCCATTATTGACTTTTCATGGTCCCCAATCAAAGACTTTGACAAAAGTTCTGAATTGTGC TTTACCAGTAAAAATAATAGGATTTTGCTAGACAATTTTAGTACTATTTGTTCTCATATACTCC CTCCGTTTCAGGTTGTAAGACATTTTGACTTTGGTCAAAGTTAAACTGCTTTAAGTTTGACCAC GTTTATAGAAAAAAGTAGTAACATTTTCAACCCAAGATAAATTTATTTTGAAAATATATTCAAT TATTGATTTGATGAAACTAATTTAGTATTATAAATATTACTATATTTGTCTATAAACTTAGTCA AACTTGAAACAGTTTGACTTTGACTGAAACGGAGGGAGTAGTCAATTTATATGGTCGAGATACA TGAATGATTGAAGTTTTAGGATCGTGAGTGCACAATTTCCAGGGTTACCATAGGAATTAACAGG GGATTCATATAAACAAAACAGAAGTTGGAATTGCAAAAAAATAGTTGTCTTGTAGTGTCGCCAT AAAGTCTGAATATGTCTTTGAGAGCAATCGACCTCTCATATTTCAGCATGAAACTTATGCAGTA TCATCTATCAACTTTGTTTTCAGCCTTTTCAGCTTCCCTATACTACGGATGTGACAATCTATGT TTGCTCTCTTGTAGGTACTTGTATATAAGATGGGGGGTAGAGCTGTCAAATATGACAGTGGTTG TTGGTGAAAGTGGTGATACTGATTATGAAGGACTATTAGGAGGCGTGCACAAGACCATTATTCT CAAAGGCTCATTTAATGCTGTTCCTAACCAAGTCCATGCTGCCAGAAGTTATTCATTACAGGAT GTCATATCCTTTGACAAACCAGGAATTACTTCAATCGAGGGATATGGTCCAGATAACCTTAAGT CAGCTCTACAACAATTTGGTATACTGAAAGACAATGTTTAACTTTGAGAGAAATCAAGTAG |