Splice junction sequence |
GAGAGTATATTAGATTGTCCATGGAAGAAGATGGTGAAGATGCTTCAAATGGAAGTGGTGATGT GTGGGATGAATCGCTTGAAGCTCCATTTTGAAATATgtgaactctttgattgaagatgcaaaag ctggtgctacattgaatgttactgggagctctgctagcacaaatgctgcttcaagtggttcttt gccatcaa
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Assembled circRNA sequence |
Yes
The sequence of a circRNA based on assembly using circseq-cup (Ye et al., 2016) or CIRI-full (Zheng and Zhao, 2018) or CIRCexplorer2 (Zhang et al., 2016).
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Full-length trsnacripts |
Transcript length: 1478 Transcript exons: 17758710-17758958,17759069-17759171,17759256-17759355,17 760267-17760372,17760515-17760605,17760916-17761057,1776 1335-17761482,17761562-17761671,17762096-17762252,177624 04-17762529,17762611-17762756 GTGAACTCTTTGATTGAAGATGCAAAAGCTGGTGCTACATTGAATGTTACTGGGAGCTCTGCTA GCACAAATGCTGCTTCAAGTGGTTCTTTGCCATCAATGTTTCCGGCTGGTAGTGCTCCTCCCCT TTCTCCTAGAAGCACTTCTGGCTCCCCCCGTGTTATGAGGCGAGGATCTGGAGCTGGACCATCA TCCTTGGGATCTCCACTAAAAGTAGTTAGTGAACCAGTGAGGGAGGTTATACCCCAGTTTTACT TCAAATATGGGCGCCCTGCTCCAAAAGATTTGAAGGAGCAATGCTTATCTAGAATAGATCACCT CTTTTTTGCAGGGGAGGGACTCCAGATTCAAGAATTTAGATCAGTCACAAAAGATATATGCAAA CTTCCATCGTTCTTCTCCAGTGTTCTTTTCAAGAAGATCGATGCTGCAGGCTCTGGAACTGTCA CAAGGGATGCGTTTGTTGATTACTGGATCAATGATAACAAGATTACAATGGACACAGCTAGCCA AATCTTTGAAATATTAAGAAAGCCGGATTACAATTATCTCACTCAGGAGGACTTTAAGCCTGTC TTAAAAGAACTTCTGGCAACTCACCCTGGATTAGAGTTCTTGCAAGGCACCCCTGAGTTTCAGG AGAGATATGCTGAGACTGTAATATACAGAATCTTTTATTCCATAAATAGAGCTGGAAATGGCCA TCTTACCCTCAGAGAGCTAAAACGTGGGAATTTAATTGCTGCGATGCAGCAGCTGGATGAGGAA GAGGATATCAATAAAGTGTTGAGATACTTCTCATACGAGCACTTTTATGTGATATACTGCAAAT TTTGGGAGTTGGACACAGATCATGATTTTTTGATTGATAAAGAGAACCTTATCAGATATGGAAA TCATTCATTAACCTACCGAATCGTTGATAGAATCTTCTCACAGGTCCCAAGAAAATTCACAAGC ATGACAGAAGGAAAGATGGGTTATGAAGATTTTGTTTACTTTATTTTGTCTGAGGAAGACAAAT CATCCGAGCCTAGCCTTGAATACTGGTTTAAGTGTATTGACCTTGATGGAAATGGCATTTTAAC CACCACTGAAATGCAATTTTTCTATGAGGAGCAATTGCACCGGATGGAGTGCATGGCACAAGAA CCTGTGCTTTTTGAGGACATATTATGCCAGATGATTGATATGATTGGACCAGAGAACGAGTGCT ACTTTACACTACGGGACTTAAAACGGTGTAAACTCTCAGGGAATATATTCAACATCCTATTCAA TCTCAACAAATTTATGGCATTTGAAACTCGTGATCCATTCCTCATTCGCCAGGAACGTGAAAAT CCAACTTTAACCGAGTGGGATCGGTTCGCACATAGAGAGTATATTAGATTGTCCATGGAAGAAG ATGGTGAAGATGCTTCAAATGGAAGTGGTGATGTGTGGGATGAATCGCTTGAAGCTCCATTTTG AAATAT
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Genomic sequence |
GTGAACTCTTTGATTGAAGATGCAAAAGCTGGTGCTACATTGAATGTTACTGGGAGCTCTGCTA GCACAAATGCTGCTTCAAGTGGTTCTTTGCCATCAATGTTTCCGGCTGGTAGTGCTCCTCCCCT TTCTCCTAGAAGCACTTCTGGCTCCCCCCGTGTTATGAGGCGAGGATCTGGAGCTGGACCATCA TCCTTGGGATCTCCACTAAAAGTAGTTAGTGAACCAGTGAGGGAGGTTATACCCCAGGTACTTC TTATCTATTTTTGCAGTTAGTATTATTGTTGCGTTATTTCTGTTTGTCATCATTCGACCATATA TTTATTTCTAATACTTCTTTGCATGCTATATGTTTTCAGTTTTACTTCAAATATGGGCGCCCTG CTCCAAAAGATTTGAAGGAGCAATGCTTATCTAGAATAGATCACCTCTTTTTTGCAGGGGAGGG ACTCCAGATTCAAGGTGATTGCTTTGAGGATTTCATTTCTTGATTTTACGCATTAAAAATACAT TTCTAAGTTTGAATATTATATTTCTCCATATCAGAATTTAGATCAGTCACAAAAGATATATGCA AACTTCCATCGTTCTTCTCCAGTGTTCTTTTCAAGAAGATCGATGCTGCAGGCTCTGGAACTGT CACAAGGTATATTGTTCATTTCAATATCTGTGTCGATGCAATATAATGGCATCATTGGCATGTG CTAGAAGTTTATGGACCTTAGCTGTTAATCTGTTATCATGTTTGGAAGACACGATCAATATTTT GTAGATGGACTGTTATGTTATAGCATAATTGTTCATTCCACAGGCTGTTCAAATTCTATACACT GCTTCATGGTGAAGCAATATCTGTGTTGATTTTGTTCTATTTACGTGGTTCTTTGTACTTGGAA CTCAATCTGTTATACCTAGAAGTAAGGTATTCTTGGTTGGATCCTTCATTGCACAATTGGCTTT CTGAATCTGTTAGCTCGTGCTACTTTTCACTTGTCCTGGCTTTTGCCAGGAAATACAACATTCC AGACTATTTTAAGATATTATAAATACCAGTTTTGATAACCATCCTTATGTGTTATTCTATGGGC ATGATATTTGATCCTTCATTAGTAACTCTTAATTTTTATGCCACTAGAATGTGCTTTGGCACCA TGTGTTTCTTATGTACCTCATTATATTTGCTTTGTAATTGTTTTTGTAACTGGACTAGATTATC ATATACCCTTAGCTTTAACGGTTGAATTTATTGATAACTACACATGAAGTGTTTCATATGTATT ATTAAACAAATTTTGAACAATTTCATTTGTTTTTCTGGCTCATGCAGTCTAGCGGTGTTATGAT AACTAGAGTTCTGATGTAAAATATCCCAGTTCACAAGTTTATCTCAGCCCCACTGCGCTGTTGA AGTCCTGAAACTTGAATTTAAGTGTACTTCCCATACATGTAGATGATTCCCCTTTGATGCATGT AGATGATTCCCCTTTGATCTTCATACTAAAATCTAATGTTTTCAGATTTGACATGGGTAAAGTA TGAATTTATTTATATATTCAGGGATGCGTTTGTTGATTACTGGATCAATGATAACAAGATTACA ATGGACACAGCTAGCCAAATCTTTGAAATATTAAGAAAGCCGGATTACAATTATCTCACTCAGG TATGTAATTCTTGTGCTGGTTCTTTGTACCCTCACACCAGTATATTCGACTACAATTGGCAAAG ATGTTCTTATATGTTGCTCATTTTCTTTGATGGGATCACTAGTTTGTAATTTCATTGATTTTGT GTAATTCCCACAGGAGGACTTTAAGCCTGTCTTAAAAGAACTTCTGGCAACTCACCCTGGATTA GAGTTCTTGCAAGGCACCCCTGAGTTTCAGGAGAGATATGGTACTTTCTGCCATCCAGTAGCAA TGTTGTTGTGTATCTCTCGTTCATTTTGGTGACAATCAAAATACTGATTTTCTTCTCATATAGT GATGTATGACACTGAATTTTTTTAGTAGTGTATGGTGAATGTTGATATGTAAAAATATAGGCAT GTGTGTGTTCTAACTAGAGATTGCCATAGTAAAAAACAACTAGCTATTGATTATTTTATGAGGA TTCTACGATTGGACCTGGTCAATGACTATTGGTAGTGATTTGCTGGATGCCTGCATCTCATTCA TCTGCTAATCGTTTATTATGTAATTTTCAGCTGAGACTGTAATATACAGAATCTTTTATTCCAT AAATAGAGCTGGAAATGGCCATCTTACCCTCAGAGAGCTAAAACGTGGGAATTTAATTGCTGCG ATGCAGCAGCTGGATGAGGAAGAGGATATCAATAAAGTGTTGAGGTAATTAACATATTTGATTG TTAATGTATCTGCGATATCCATTCTTGCATGCATTTGCAATATATCTTAGCAGAATGGTGGCAC TGATTATAATAATATTAATAATTGTGATTTAATTCCTTACATGTATTTTTGTTGTTACCTGTAA TAATCTATTACTGGGTCCTGGGGATCCTCACGAATTACTTGGATTCAAGTTATATTATTTATGT GCGAATCAAACAAGATTTTTTACATTTTTTTTCCAAATGTGTTAATTTTCTGATGCCTAATGCA GATACTTCTCATACGAGCACTTTTATGTGATATACTGCAAATTTTGGGAGTTGGACACAGATCA TGATTTTTTGATTGATAAAGAGAACCTTATCAGATATGGAAATCATTCATTAACCTACCGAATC GTTGATAGAATCTTCTCACAGGTTAGTATGTTCTATTCTGCATACAGAACTGAGATGCTGCCTT AGTTGGCCTAAATGTTGTTTCCTATATGTTACTTAGGTCCCAAGAAAATTCACAAGCATGACAG AAGGAAAGATGGGTTATGAAGATTTTGTTTACTTTATTTTGTCTGAGGAAGACAAATCATCCGA GCCTAGCCTTGAATACTGGTAAGTATGTTCTATTAGCGTAGATAATTGTCCTTGGTAGGCACTC GTAGTTTTTATCTTCTATATGCATTTGTATATTCTGTCTCACTTAGCTTGATTAAGCTATCACT ATCACTGTTTAATTTCGAGTGCAAATGTGTGGTGGAACCAGCTATTGTCCTGTTTTATGTCCAG GCATTGAAGACTACAGTGAACTCAAAGATTTTTATTTTTACAGCACACTTTGTTTTGCAGAATT TTAAGTAACAAACAAATTTCCAAATAAGATATTTTTGGATACAACTTATGCATCTACTTTTAAC TGGTATGGGGCTAGCAAGGAGCTTGCCTATTGAGTTTTGCCTTACAGTGGCTTTAATATTGTAG TATATTTTACAACTAATTATGTTACTGTATTCATTGAACATATGAACCAATTTTACAGGTTTAA GTGTATTGACCTTGATGGAAATGGCATTTTAACCACCACTGAAATGCAATTTTTCTATGAGGAG CAATTGCACCGGATGGAGTGCATGGCACAAGAACCTGTGCTTTTTGAGGACATATTATGCCAGA TGATTGATATGATTGGACCAGAGGTAGCATCTTGGACAGAATTATTGATGCATTTTAGGCCTGT TTGGAACAGTGGAATGTCAGCATGTTGAGGAATTGCACCATTTAATGCAAAATTCCTGTGTTCC AAACAAGTCCTTAAACTGAATTTGATAAATCTTTTCTTTTCCACAGAACGAGTGCTACTTTACA CTACGGGACTTAAAACGGTGTAAACTCTCAGGGAATATATTCAACATCCTATTCAATCTCAACA AATTTATGGCATTTGAAACTCGTGATCCATTCCTCATTCGCCAGGTGATCACAACTTCTTGCCA TAAAGCAGTGAATTCACTGTTAATCATCTAAATAACAAGTTGGATCATCTTTTTATTTCAGGAA CGTGAAAATCCAACTTTAACCGAGTGGGATCGGTTCGCACATAGAGAGTATATTAGATTGTCCA TGGAAGAAGATGGTGAAGATGCTTCAAATGGAAGTGGTGATGTGTGGGATGAATCGCTTGAAGC TCCATTTTGAAATAT |