Splice junction sequence |
AATTTTGCGTGGTAAGGTTGTCGAACATCATAACGTTGCTGATGATCTCATGCATCCGCAGTAC ATCTTGTATAAGCCTCAGGCTGCTGGATCTGAAGAGttggattacgagtttaatgcttcagctg gcgagttcaagacattgcaagaccgagaacattttatatccagtctctctattctactagaatg gtctccat
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Assembled circRNA sequence |
Yes
The sequence of a circRNA based on assembly using circseq-cup (Ye et al., 2016) or CIRI-full (Zheng and Zhao, 2018) or CIRCexplorer2 (Zhang et al., 2016).
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Full-length trsnacripts |
Transcript length: 462 Transcript exons: 6597340-6597468,6597915-6598013,6598110-6598196,6598464- 6598610 TTGGATTACGAGTTTAATGCTTCAGCTGGCGAGTTCAAGACATTGCAAGACCGAGAACATTTTA TATCCAGTCTCTCTATTCTACTAGAATGGTCTCCATTTTCAACAGAAGCAGAACTTTTGCAGCA GTTTGATGATGTTGGACCACATGGGACAAAGGTTATCATCTATAATATGTGGCTCAACAGTGAT GCTAAATTGGAATTAGACTTTGATTCGGTTGCAGAGGATATTCTCATTGAAGGAAGCATAAAAA AAACTGGATCTAAGATTGTGAATGATCATATTGCCAGCCGGTTTTCTTACTCTCTTCGTGTTTA CCTATCTATATTATACTTGCGGATTCCTGAGACTTTCAAGATAATTTTGCGTGGTAAGGTTGTC GAACATCATAACGTTGCTGATGATCTCATGCATCCGCAGTACATCTTGTATAAGCCTCAGGCTG CTGGATCTGAAGAG
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Genomic sequence |
TTGGATTACGAGTTTAATGCTTCAGCTGGCGAGTTCAAGACATTGCAAGACCGAGAACATTTTA TATCCAGTCTCTCTATTCTACTAGAATGGTCTCCATTTTCAACAGAAGCAGAACTTTTGCAGCA GGCAAGGCCAATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAATTTTCTCCATGCAACCCATTTTGTCTACAC TCTATACATTCTGGTTACTTGGTTTGAAATTTGGGGTCTTTCATGAGTGTGATATTCCTTGGCA TTGTACTAATTATAAAAGCTTTTGATGAGCTTTAAGTTCTGTATATAGTAATTTGATCATAACC GTGAAAGCATCCATGATTGCTCTCCATTTTTGGATGTTGTCGTCTAAGGTAGTATCCTTCAAGA TATGGATGAATGAATGCTCAGATAAGACTAGAGCAATTCATTGGAGACTTTAGTGTGCGCTTAA ATTAGGCCCCTACATGTTGGTCAATTCTCTATTTGTGTTTGCCCCATTTAATAAAGTTTTTCCC TTTATTTGATATGTTGCCAAGTTCTTCTCTTCAATGACCATTACTCTTTTTTATTTGTATCAGT TTGATGATGTTGGACCACATGGGACAAAGGTTATCATCTATAATATGTGGCTCAACAGTGATGC TAAATTGGAATTAGACTTTGATTCGGTTGCAGAGGTGATATTCTTGATCTTTGCTATCTTTGTT CTTCTCTTCGTTCCCAAGTATTATTATTTAATTGAGATCTTGTTTCTTTCCTTGTTTTTTTTGT AGGATATTCTCATTGAAGGAAGCATAAAAAAAACTGGATCTAAGATTGTGAATGATCATATTGC CAGCCGGTTTTCTTACTCTCTTCGTGTGAGCTTCTATTTCTATTTGTCAATAATGTTTAGGGAA CTGTGTATGCTTATGTTCATGTGCAAGTGGTTATGGTGATATTGAATCATACATGTATGTGTGA ATGTACTCATGAATACTCTTGGGAAATACGTAATACACATAGACATAGAAAATGCTGCAGATTG CTGTATATCCGAAAGAAATACTTGTGCAACTGTGTTTATACTAAACCTAGATAACTGGCATGCA ACTGAAATCCTTTCCGCTGCTGATACCTTTGTGCAGGTTTACCTATCTATATTATACTTGCGGA TTCCTGAGACTTTCAAGATAATTTTGCGTGGTAAGGTTGTCGAACATCATAACGTTGCTGATGA TCTCATGCATCCGCAGTACATCTTGTATAAGCCTCAGGCTGCTGGATCTGAAGAG |