Splice junction sequence |
GAGCACGATTTTCTCTTGATGATTCGCAATGGCCAAGGAGACAACAGAGGATTTGGGAACTGGG ACCAAGATATCAAGAAATATGGAAAGACATCCCATCgttgacaaagacggagttgtgcttactc ctgccttcatgatatgtgacaaaactttgtatcttgaacctcacctcactttctcattggacgg gatcaaga
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Assembled circRNA sequence |
Yes
The sequence of a circRNA based on assembly using circseq-cup (Ye et al., 2016) or CIRI-full (Zheng and Zhao, 2018) or CIRCexplorer2 (Zhang et al., 2016).
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Full-length trsnacripts |
Transcript length: 368 Transcript exons: 172503483-172503683,172503768-172503825,172507779-172507 887 GTTGACAAAGACGGAGTTGTGCTTACTCCTGCCTTCATGATATGTGACAAAACTTTGTATCTTG AACCTCACCTCACTTTCTCATTGGACGGGATCAAGATTGAGTATTTGGATTTAGATTCCTTTGA AGACGAGAAGCTGTCAGCTCTACAATGGGAAATATCTAATATTATTTCCATCAGTTGTAAATGG ACTCGTAGTGTTGGATCTGCCTTAATAACACTCCTTGTTGGATCTACAGCAGAAACAGGAAATG CAGGTCCTGTTAGAGCACGATTTTCTCTTGATGATTCGCAATGGCCAAGGAGACAACAGAGGAT TTGGGAACTGGGACCAAGATATCAAGAAATATGGAAAGACATCCCATC
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Genomic sequence |
GTTGACAAAGACGGAGTTGTGCTTACTCCTGCCTTCATGATATGTGACAAAACTTTGTATCTTG AACCTCACCTCACTTTCTCATTGGACGGGATCAAGATTGAGTATTTGGATTTAGATTCCTTTGA AGACGAGAAGCTGTCAGCTCTACAATGGGAAATATCTAATATTATTTCCATCAGTTGTAAATGG ACTCGTAGTGTAAGCAATTCACTTTATTTCTGTCACTATTACTCTTATTTCATGTGTTTCATAG TTTTCAATACCTATTATCATCCTAACCAGGTTGGATCTGCCTTAATAACACTCCTTGTTGGATC TACAGCAGAAACAGGAAATGCAGGTATCATATGCGTTCAAGATATTGTATTCCAGATTTATCTG TTTTCCTCCATATTAATGTTGCATGGCATAATTTTTTCTACACGAGGCAACCCCATTTCCCTTG TAGCATAACAGAAATACATGAGTTTGTTCAGGTCAGCAAAGAAAAAATGATGCATGACATATAT CTGTTCCTAATACTAAAGTGGCAACATGAATTTGTGTCCTTCGTTTTTTTTGTATTTGACCACG ATCATTTTTTGGCCATCTGTATTTTTATTGGGGTCACATTTTTTCTTCGTCGGTTGTTTTTGCT TTTCCCTGATTTTCTCTCTTCTGTCCGTCATTTTTTTCCAGTGTCATGCTTAATTTTTTGTTCT ATTTTTTCTTTGAACGCTGTCAGAGGGGGGGGGGTGGTCGTTTTTTGGAGGAAACCAATAGTAG GAGGGGAACATAAAGATAATTATGACAAAAAAAAGATGTGAAAAAACAATGATGAAAAAGGCAA CATCATGGGCTTTTGAACCCTTGACCCTTCCTTGAAGAGGTTGATGGTCAAACTAAAGAAACCG TTAACTGAGACTTTGATGGTTCGTTGTCCAGTCAGATCTAACTAACTGTGCTCTTTGGCTGTAC ACATGCATTAGTGGAATCCACAGCTAGTGTGGCACATGGAAAATCGAGAGAGGTCTAGTTATCA TGTTTGATGGAAGTGTAACAATATTTCTGCCACTAGCAGAGGTCAACATCATGGTTTTTAAAGC GGTAAGGCTAGACAAGGCGTTGGAACGCCTAGACTGCGCCTAGGCAGGCAAGGCACCTAGGATT TTTTGGGCGCCTGGACGCCTAGGCGACGCCTTTAAAACACTGGTCAACATTAGTTTTCTGTCTT CAATAGAAAATTCTATGTTGTCCCCTCCCCTGTCGCATTCTCTGTGATCTGAAATTATTATGAT CTTGTAAAATAGTACAACAGTTTGTCTTGCGCAGTAGTTTGTGTATTTTACGCTTATGAGGTGG CTGAGGGCGTTTCATTGTTTTCGTTTCCATTTCATTTTGTGTTTTGTTCAGGAAAATGTAAACT GAGACTAGTACTGAGTGTCAAAATAACATTCGTTTTTAAGTTCATCGGGTTAGATTTTATTTTT TATTTTCACATGTGTATTAGCTAGCTTGAAATAGTATCAAGTACTAAGTAGCAATGTAGCATAA GTTTGAGGTGATTTGGACATTTGGCCTTGCCATCCTTTTTCTATCTAAAAGATATATTGGGTGT TGACTAGAAAAAATCATATGTGCATTGCAACAGCAAAACAGACCAAACAATTAAACATGCGCAC ACAGTTCTTGTAAGAATGGTGTCACTTAGAAAATACAAACGAGAAAACATGTAACTATTACCAT TGACAAATGAAATAACACAGTCAGAAAATCCCCCATACTTAGAGTCAGAGGCAAGGTGGGTAAA TAAGAAAAAAGTTTTGGGGGCAGAGTGGTGGTGATGGCACACCATCACCACCAACTCCTGTTTT AGTTAGCAGAAAAATGTATCGGTTTTGCACATTTTCAACCTTCAAAAGTCTAGCCCTACATATG CCACTATAATGGCAGCCTATGATGCTCACTATCATGGTGTCTAAATTTGCCATTAGCAGCCCAT TACCCATCCAACGGTTCCCCACACCTCTTACCAGGGGCCTCCCAATGGTCACACTGTAGTTATT CTAGCAGTGGCTCTGTGTTAAACCATCTGCTTTTCATGGAGTGCACACAGCGGCTAGCAATGCA GAATGGAGAGGGCATTTTCCTCTGCATGGTGTAGGATGGAGCCAGATGCATCCTGTCTGGAATG CATCCCACCACTAGTGTTCATGTTGGTGGACATGGTTTTCAAGGAACCTCCTATGTGGCATGTC AAGGCTGTGCTAGGGGCATTGCCACTGTGGTGACAGCTCTTCCCTTGCTGCTGCCGAATCCCCC AGATTGCGTTGGAGATGAGGTAGCTGTAGGCGTGGAAGACACTTGTGGAGGTGAGTAGTTGTTC ATGATTATGGAGCTGAGGGATAGGCATGGTAGTGCAGGTGACGGCAAGCAGAGTGGAGGTGGAA AAGGTGGGGCAAAGATTCATAGGTACTTTCTTTACGTCACATGTATGCTTGAGATGTTTCTGGG CTCGTTGGCTACTGTGGGATAGCCGGATAGGGGTAGGTGGTTCTTCCATCTTTTGCCCTTTTCC CATCCCTTTGTGTTTGTCATTTCTATCTAATCACCTCTAGGTTCTGTTTTTATGCCATCCATTC GACAAGTGTTGAGCACTTCTGTGGTATGAAGGTGGCAGATTGCCTCTCTATTTATTAACTTAAT AATCATGATTCGGGGATTGTGCTTAAATATCTCCAGATTCGGGTGCACCATCTTTGGGTGGCTT GGATAGCATCGCTTCGAGTTGCAACTACTCAAACAATCCATGTATTTTTCTCACTGCCTATCCA TGTCCATGCAAAGAGGGGGGGGGAGTAAAGGGGGCATTATGATCATTTACAAAAAAACTCGATT TGCGGGGGTAAAGACAACCCTCGAGCATTGTATTAAGAGAAGACCTTCTCACACAGGTCGAGAA CCCTTCAGACCCTTGCCCCACCCATACACAACGACAACGTAGCCTATGTGAGAACGACCACGAA CAGGCTGGGACCTTAGACCTCTGCTTTGGCGTGAGATAGATGGATGGGATTTTTTTAACCCCAG CCTGAAATCTGCTCTCAGGGGGAATCAAAATTAGGACCTAAGGAGTGCTACTCAGACCACCTAA CCAACTCAGCTAGAGGCCCTTTCACATTTGCGATCATTTACATTGCATAATTTTTCCTTCTATT CTTGTAGGTTGAGAGAACTCTTGTGCTTTCTTGTGAAGAGCTTGAACTTAGATATTTTTAATGG AAAATCTCAAATTGAGGGTCCGATAATTGTTAAACATGTCATTTTCCTTGAGTTATGCTTGCTC TTTCCATTTGAGGTTTGGTCTCAACATGAGATCTTGTTTTGTTGCATACATCTAATCTAAGATG TTTGCATAGTTTATTAAGAAAAACGACAGTAACTCTAATGGATAAGTAATAAGCAACTTTTCTT TACTATATTAAAGCACCAGTTTCCATGGTTCAATGGTTCCACCGTCGTCACTTTAGCAAAAAGC TCCTTATAATTTTTAAATCAAACCCGCGCTCCAGCCGGCCTATTCTATCTCACCGAGCACATGT CTATGGCTCCTCTAGGCAAAGCGAAACACAGTCTAAGGCCTCCTTTGAATCAAAGGATAATTTC CTGAATCATGCGTTTTTCCTGTGTTTTTGAACTAATTCCTGTGAAATTCCTATATCATTCCTAT GAAATTCTTACGTACCAAAGGAGACCTAAACTGTAGATACACATGTGGTCATGTGGAACATTTG TTCTTCGGCCTCCTACAGCCAATGCAGTGCAGGATGAGTCATGTGATGACATATGCTTTTGTTG CCCATTGACCTCAGACTGCGAGTACCTATCACCTGCAGGCAGAGGTGACAACAGGCATCTTCAA ATTTTCTTTTATATATCCAGCTTTCAAGTGGATTTAGAAGTCTATCATGTTACCTGTATACTTT GTGCTGATGCTTATGCACAATGAGTACTAGAGTTCTTTCTCGAAAGTCCTTTCAATTGCTTGAA TGTTCCTAGGCTAGCAAACGATTCAGCCCTTGTACCCAATAGAGATCAATGTTGTAGCTTGCAA GCTTGACCAATTTAAATAGAGCACAAATTACTGTAAAGGTTTGGAACGTATTTGAACAACTGTC CCATTTAAATAACGTCTACCTATATATAGAAACCGCAGCAACGCACGGGCACTTAACTAGTATA TGTATATTGTTGAGATTGAGATACTCCTTGCTTCTTACCAGCCAGCTTGTTTTTCTTTTTTATT TTCGACAGGTCCTGTTAGAGCACGATTTTCTCTTGATGATTCGCAATGGCCAAGGAGACAACAG AGGATTTGGGAACTGGGACCAAGATATCAAGAAATATGGAAAGACATCCCATC |