Splice junction sequence |
CCTCCCTTTGCTTCTCCGAGCCTACAATGATAATGATGTCCGGATACAGGAGGAAGTTCTGAAA AGATCTACATCTGTTGCTAAACAACTCGATGGTCAGtacatgaacacattgaactatttaacaa atgaaactttctcatctataccctcggacttggtatctgatttacaacggatgctatcaatgaa cgagtcat
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Assembled circRNA sequence |
Yes
The sequence of a circRNA based on assembly using circseq-cup (Ye et al., 2016) or CIRI-full (Zheng and Zhao, 2018) or CIRCexplorer2 (Zhang et al., 2016).
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Full-length trsnacripts |
Transcript length: 606 Transcript exons: 8090767-8090893,8090994-8091055,8091152-8091238,8091349- 8091435,8091741-8091854,8092288-8092416 TACATGAACACATTGAACTATTTAACAAATGAAACTTTCTCATCTATACCCTCGGACTTGGTAT CTGATTTACAACGGATGCTATCAATGAACGAGTCATATAGACCAACAGCTTTAGATTTCACAGG ATCTAGTTTTTTCCGAAGCGACACTAGGTTGCGTGCCCTCCGTTTCCTTGATCATATGCTTGAG AGAGACAACATGCAGAAGTCTGAGTTCTTAAAAGCATTATCAGATATGTGGAAAGACTTTGATT CTCGTGTATTACGGTATAAGGTGCTTCCTCCTCTTTGTGCTGAACTTAGGAATTTGGTTATGCA ACCAGTGATTCTTCCCATGGTTCTAACTATAGCAGAGTCTCAGGATAAAAATGACTTTGAGTTG ACAACGCTCCCAGCCCTTGTTCCTGTCTTAAGTACTGCTACGGGTGATACATTACTGTTGCTTA TAAAGCGTGCAGAGCTAATTATTAACAAGACTAATGCAGAGCATCTTGTATCACATGTCCTCCC TTTGCTTCTCCGAGCCTACAATGATAATGATGTCCGGATACAGGAGGAAGTTCTGAAAAGATCT ACATCTGTTGCTAAACAACTCGATGGTCAG
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Genomic sequence |
TACATGAACACATTGAACTATTTAACAAATGAAACTTTCTCATCTATACCCTCGGACTTGGTAT CTGATTTACAACGGATGCTATCAATGAACGAGTCATATAGACCAACAGCTTTAGATTTCACAGG TAGGAATACTGAGCTTCATGTGGTTTGATTATTTCTTGTGACAAACTTTACCTCCTTGCTTGTT ACACTTATATCTTGAACTTGAACTTTCACCTGCAGGATCTAGTTTTTTCCGAAGCGACACTAGG TTGCGTGCCCTCCGTTTCCTTGATCATATGCTTGTATGTATATTAAATTTTAATCATCGTTTCA GACAGACGTGATTTTGATAGTTGGAAACATATAAAACCTTTGGGGCATTTTTTTATTTATTGCA GGAGAGAGACAACATGCAGAAGTCTGAGTTCTTAAAAGCATTATCAGATATGTGGAAAGACTTT GATTCTCGTGTATTACGGTATAAGGTAGTCACTTTCTGGATTCTTTTGCGTATTCTGTTACTTA ACAGAAAACAAATCAGTTACTCAAGTGATTTGCCTAGTAACAACTAATCAAACCAGGTTTTGTC AAGCAGGTGCTTCCTCCTCTTTGTGCTGAACTTAGGAATTTGGTTATGCAACCAGTGATTCTTC CCATGGTTCTAACTATAGCAGAGTCTCAGGTGCTTTTTCTAATCTTAAGTACTTACATTTCGTC AATCAGATCGTATTCTATTGGAGGTTTACAGATACCAGTGATTCTATATAAAATTTGTTTTTCT TATTACTTGTGTTATATGACCTATCACATGCACATATACTTAGACCTGATTATTTCAGTTGTAC ATATGGTGATTGCACAAATAAATACCGGCATTATCAACCTGTCATGTGTTACTTGGAAGTTGCA TTGATCTTGGACAAGAATTTCTTTTAGATCTTTACTCATGCTTTAATGATGCTTGAGACCTTAA ATAATGATTTGCAGGATAAAAATGACTTTGAGTTGACAACGCTCCCAGCCCTTGTTCCTGTCTT AAGTACTGCTACGGGTGATACATTACTGTTGCTTATAAAGCGTGCAGAGCTAATTATTAACAAG GTAAATCTCTAACCAATATGTATGCATAACTAAAAGTCTAAAACTATGTGATGTATGCATAACT GGAACTATGTTTTTGAACCCTGCGTATTTAGTGTCTGCTAAATTCTACCGATTTGACACAATGG GATAGGGTAAATGAATAAAAGTGCAAAGTATAGTTACTTATCTATGACTTATCTGGTGCCATTA CTTATAATTTTAAATAATTGGTAGTCCCACACATGAATCCTTATGCTTTCTTACACCAATAACC TTCATTTTCTTAAAGCTGACACATATTTCTCTCTTGACTTCTATTGCTAACTGCTAATTGCTTC TTTGCTACAATTCTAAATATGCTTAAAATGGTATCACTTTTCTCTTATTCATTTATTATCTTAC TCCCTCGGCCCTCAGATCTTTACTATTGTGTTTTTGTATAAATTTGTAGACTAATGCAGAGCAT CTTGTATCACATGTCCTCCCTTTGCTTCTCCGAGCCTACAATGATAATGATGTCCGGATACAGG AGGAAGTTCTGAAAAGATCTACATCTGTTGCTAAACAACTCGATGGTCAG |