Splice junction sequence |
CAAAGTCTCCCATGTGTATAGCATAGTTCAGTTAATCAGTTGGTGCAAATAACATGGAGCCATC ACAATTTCGTCATCAGTTGGTTGCAAACTGTAATGCatttgtataagaaatggtcacttatatg tgaatgtgtgatcctcaacttctcctagaagttttaaataaagtagagttgcagatatatatta tgatcctt
|
Assembled circRNA sequence |
Yes
The sequence of a circRNA based on assembly using circseq-cup (Ye et al., 2016) or CIRI-full (Zheng and Zhao, 2018) or CIRCexplorer2 (Zhang et al., 2016).
|
Full-length trsnacripts |
Transcript length: 259 Transcript exons: 18026764-18026847,18029433-18029607 ATTTGTATAAGAAATGGTCACTTATATGTGAATGTGTGATCCTCAACTTCTCCTAGAAGTTTTA AATAAAGTAGAGTTGCAGATAATCTTTCTACAAGCCTTTGCATTAGCATTGGACATGTATCTTT TTCTAATTACTCTGATTTCTAATCCTTTAACCAAAGTCTCCCATGTGTATAGCATAGTTCAGTT AATCAGTTGGTGCAAATAACATGGAGCCATCACAATTTCGTCATCAGTTGGTTGCAAACTGTAA TGC
|
Genomic sequence |
ATTTGTATAAGAAATGGTCACTTATATGTGAATGTGTGATCCTCAACTTCTCCTAGAAGTTTTA AATAAAGTAGAGTTGCAGATATATATTATGATCCTTTGAACCTGACAAAACAGCATAGCATGGT CAATCAGCTTTGTTAGAAAATACAAAAACCCTGCAATATTTCTAGAAAAAGAACAGCTAACTTG TAACTCCAAGTAGCATATATTGCAACCTGCTCTTAGAATAGCTTTCTTTTTTTAAAAAAAAACT TACACTTAATGATACTTAGCCAATGTAATCCCAAGCTTACTGGCAGTGAATCGCTAGGCCAATA TCTGATTGAACATAGAGAGATTTTAACGAACAATTCCGCAGAATATGAAGAATGAGAAGAATTG AAGATACAACTAACTCGTTTGTTTTGAAACAAACCATTCCCTCAAGCTAGCTAGCAACATTGAA AAACTAACACAACTTGCACTGTACTTATGAAGTGCATGCATCGTATCGATCACCAGATTATGCT AAAGAGATCCATCAAGCAAGGATGCATTTAGAAAACATTCAGATTAAAATCAGTTATGATCTGT AGTTCAACTGCTAAAACTTTTATTGAGGTCAACAGGTTACAGGTAGCGAATAACTCAGAACCAA TCCAATGGGCCAATCCGTGATAAAAGAAAAGGTGGCAACAGTAGATCTTTATATTAGATGAGGT CTTATACTTGTGTGATACTGGAATATCAATTCAAGCTATTTTCTGCTAGCTATGTCATAATAAG GTGTGAGATTTGGGTACCTGCTACACTTTTTTTTAATAGTAGCCCAAAATCTTTATATCATCAG CAGATTGATCCTTGTACACATAAGGACCACTTAGGTACCACGAACCTGCAGCACAATGATAATA TTCTTCAACACATCATTGATTTGCTTGATCAGGGATGTAAGAAAAATTCAAGGGGGACAACATA AGAGCAATCAGACAACAATATCAAGAAAAACAGTAGTTACCTTTTTGTATTTGTGAAATTTAAA GAACTACTACTATGCCGGACCATGCCAATCAAGGTTGAAAATAACAAGCCAATATGAAGGCAAA ATTAATTAGATTCATGGAATGCAATTCGGTTGCACGCTCCTAGCACGGAGGTCGGGAACACAAC ACACCTTGTGCTTCAATAAAATGTCTCTAAAGAAAGATGCATCATTTCTTTTAATATATCTGTC TTTGGATCCACTCAAACCAAATTTTAAGAGATTGGTCCTTGGGCAGGTTCATTGTGAGGCAATC TAAGCCTTGGTAATGAAAAGATAAACACTCAAATTCCTGGACCAGAGAAATGGATCAATTTTCA TAGTCAGAATTAGAATTGTTCCATGCCAAGTTTAGTTCATCTAATAGGTACTACTCAAATATAG GTCTTTGCCCTTGCTTGACCAGTGAACCGTTATCTTATAAAATAGTAAAAACTAAAAGTAAAGA AATAATTGCACGTATGGATATTACCTTCATGTTGTGCTTACGGAGTATATGAAATTAGATACAT CAACTAGAGACCAATCAATGCTAAATAAAAGAACAAAATCTCCTCGACCAACATCCTGGATAGA TATGGAGACATGTTGATCATCTATATTAAGGAGTTCATGTGGTCCTGCTCCTCTGCCTCTGTCT GAAGTTTGGGTAGCCTGAAACAATGGAATTGTTAAAACTAAACACTAGACAGTCTAATTAGTTG ACTAACAGTTGTCGTACTGATTAGTTCGCCAATTCCCCTTGACCTTTGTCAAATGCACCTTCAT ATGCACAACAATTTACTCACATAGAAATTCCATTGAATATCTTGCAAATGAATGAAATTGTGAA TCTAACACTACAGCTAATGATTTCTAGAGGAAAAGCATACTCACTGAATAAACGAACCCTTTTT TTTCTTGAGAGCAAGCATAATGTACCTTGTTTGTGTGGATATGTTGTTTAACCAAAAGGAGCTC CAAGACACCATTGTCTAGAGCCTCCATATTATCTAGAGCACTATAAACAAAATATGCTAGCTGT GTACTGTTTAGCAGTCCCAAGTCACATAAACCAAGCTACTAGGAATAAATCATAATTGAGCTTA ATCATTGATTTTCTACTTTTGTGGAGTATGGAACAAAACTACAAATAAATAACAAAACCATTCC TTGATATGTCTATATGTACATATCACGAAACATAATGTATATACATGAATATTCACCAAATGAA GTCATATCCACGCTGTTTTGTGTAGTGAGCTTAATCAAGTAGCTCTTGGGGATTAGCACCGGAT CAATAGGGCATGTTGAACTGTTAGTCGATACAGTAGTTAGATGCACACAAACCACCACATGACC ACTCACGGGTGAAACATAATAAAGAACCTTAGGATTATACCTGACCGTTTAGGTTCCTATTCTT CTTGACCTGGCGAAGAAATATTTCAGCTCCTGCACTTTTCTATTGCAGCATGTACGGAGATAAA TCAAATTGATTGCTGCATATAATTTATTATAGAATTTGTCATGTTAATTCAGAGTGCAAGGGAA ACAATACCTTAGAGGTAAGCACTGTCACCGTCTGAAGTAGCTAGAAGGCTCTCAGAATACATGA TCGTGTTGTAGTGTCTAGAGATTATTTCGGGTAAACACTCTACATAATCTTTCTACAAGCCTTT GCATTAGCATTGGACATGTATCTTTTTCTAATTACTCTGATTTCTAATCCTTTAACCAAAGTCT CCCATGTGTATAGCATAGTTCAGTTAATCAGTTGGTGCAAATAACATGGAGCCATCACAATTTC GTCATCAGTTGGTTGCAAACTGTAATGC |