Splice junction sequence |
ACCAAGCTATATATTGCCAATAATTTGACAGAGTTCCAGCGTGTATTCACTTTCTCTAAGGGTA ATAAGAAGACAATTCTTGTAAATACCAGCTCATCAGgatgttacagccaccaaaggaaatgagt ttgaagactattttctcaagcgtgaacttctgatgggaatatatgagaaaggatttgaaagacc ctctccga
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Assembled circRNA sequence |
Yes
The sequence of a circRNA based on assembly using circseq-cup (Ye et al., 2016) or CIRI-full (Zheng and Zhao, 2018) or CIRCexplorer2 (Zhang et al., 2016).
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Full-length trsnacripts |
Transcript length: 1226 Transcript exons: 25769332-25769566,25769799-25770037,25771207-25771458,25 771550-25771730,25772371-25772459,25772776-25772849,2577 2936-25773091 GATGTTACAGCCACCAAAGGAAATGAGTTTGAAGACTATTTTCTCAAGCGTGAACTTCTGATGG GAATATATGAGAAAGGATTTGAAAGACCCTCTCCGATCCAAGAAGAAAGCATTCCTATTGCATT AACTGGTAGTGATATTCTAGCCAGAGCAAAAAATGGAACTGGCAAGACTGCTGCATTTTGTATC CCTGCACTAGAAAAGATTGATCAAGAGAAAAACGCTATTCAAGTTGTTATATTGGTTCCCACAA GGGAGCTGGCTTTGCAAACGTCACAAGTTTGTAAAGAGCTTGGGAAACATCTGAAGATCCAGGT CATGGTCACCACTGGAGGAACCAGCCTGAAAGATGATATCATTCGTCTCTATCAACCTGTCCAT TTACTTGTTGGAACGCCTGGGCGTATTTTGGACCTTACAAAGAAAGGTATCTGCATTTTGAAGG ACTGCTCTATGCTTATCATGGATGAGGCAGACAAGCTTCTCTCTCCTGAGTTCCAGCCTTCCGT GGAACAGCTGATTCGTTACCTTCCAGCGAGCCGGCAAATTTTGATGTTCTCGGCAACGTTCCCT GTGACTGTGAAGGAGTTCAAGGACAAATACCTGCCTAAACCTTATGTTATTAACCTTATGGATG AACTTACACTGAAGGGAATTACACAGTTTTATGCTTTTGTAGAAGAAAGGCAGAAAGTTCATTG CCTTAACACTCTCTTTTCCAAGCTTCAAATCAACCAATCAATAATCTTCTGCAACTCTGTAAAT CGTGTTGAGCTTCTGGCAAAGAAGATCACGGAGCTTGGTTACTCTTGCTTCTACATCCATGCAA AGATGCTGCAAGACCATCGTAATAGAGTTTTCCATGATTTCCGTAATGGGGCATGCAGGAACCT GGTTTGTACAGATCTTTTCACAAGGGGAATTGACATTCAAGCTGTTAATGTTGTTATCAATTTT GATTTCCCCAAAACCGCTGAAACATACCTCCACAGGGTTGGTAGATCTGGGAGATTTGGCCATC TTGGCCTGGCTGTGAATTTGATCACCTATGAGGATCGGTTTAACTTGTATAGGATTGAGCAAGA GCTTGGGACTGAGATAAAACCAATTCCTCCTCAGATTGACCAAGCTATATATTGCCAATAATTT GACAGAGTTCCAGCGTGTATTCACTTTCTCTAAGGGTAATAAGAAGACAATTCTTGTAAATACC AGCTCATCAG
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Genomic sequence |
GATGTTACAGCCACCAAAGGAAATGAGTTTGAAGACTATTTTCTCAAGCGTGAACTTCTGATGG GAATATATGAGAAAGGATTTGAAAGACCCTCTCCGATCCAAGAAGAAAGCATTCCTATTGCATT AACTGGTAGTGATATTCTAGCCAGAGCAAAAAATGGAACTGGCAAGACTGCTGCATTTTGTATC CCTGCACTAGAAAAGATTGATCAAGAGAAAAACGCTATTCAAGGTTTGTTCCAGAATCCAAACT ATTAAACTTATTTTGTACCAACTCTCACAGTCAAACATGCTATAAACCTGTGCCTTTATAATGC CTGTTGGACCTCCTTTGGTACCGTTTATTTTATATTATTACTTTTTTTGGGGTGTTGGGGGGGG GGTGGCCTGTAGGGGATCTTCTTTAGTAAATATAATATTATATTGTGCAAGAATGGTTCAATGA TTGCTCTTGTTATTTGTAGTTGTTATATTGGTTCCCACAAGGGAGCTGGCTTTGCAAACGTCAC AAGTTTGTAAAGAGCTTGGGAAACATCTGAAGATCCAGGTCATGGTCACCACTGGAGGAACCAG CCTGAAAGATGATATCATTCGTCTCTATCAACCTGTCCATTTACTTGTTGGAACGCCTGGGCGT ATTTTGGACCTTACAAAGAAAGGTATCTGCATTTTGAAGGACTGCTCTATGCTTATCATGGATG AGGTAATTCATCTATTCTTTGCAATTGATATTATATTCTCATGAAAACTGTTCAGCAGTTCAGT ACTCAGTGCCTTCCCAGTTGTATATGTTATTTCATGGCTCAAAAGATTATTTTATAAGGAGAAA TTAGGGATTGGGCTAAAAAGAATAGTAAAAATCTCATTTACAATCAAACAATTAGTGACAAAAA AAATTAGTGTTTCTATATACTTAATGCAAGTATTTTTTTTAGTTGCTCTTTCCTAAGTTTTTCC TTCAAATTAATGTTTGCATCCTTCTTGGGTTGTGCTGAACCAATGAACCCCGTTTCTTGTGTTT ACAACTGATTATTCTGCTTGCCAATACCCATATGCTGAATTCTTGTTATTACACTATCCCTTGT TTGTACTTCTTTCCAGATATGTTTGTCTTTAGTAAATTTCACGAAAGCCCAGGTTTTCAGGCAT CTGTAATGCAAAACCCATTGTATTTTAATTTGTTTTAATGAACCCCAGATTTTGGGAAACACTT GACTACCTATTGCACTATTTTACTTGGATTGTAAATTTATTGCTTAAGACAACAGCAATGACAA CACAACTAGGAATATTTTGGAACATCCTGCATACAGGGAAAAATAAGCACAAAAAAAAGATTTG AGTAGCCCATTCAGAGTGTGCGGTGTGTCTATGATAGGTACTTGGCCACCGGGAGGTAGGGACT TAGGGTGCGTTCACGAAACGAGAAAGCTCATTAACACATGATTAATTAAGTATTAACTACTATA AACTTGAAAAATGGATTTATTTGTTTTTTAAAAGAAACTTCTACATATATTTTTTTTTTCACAA AACACACTTTAGCACTTTGGAAAGCTAATGGAAAACAAGGAAGTTGTTGCTTGGAGTTGAAGCT TAGAGCAGGGCCTTAGTATTAGTCCTTCTAAAAAGAACCAGTGTAATGGTTCATGAGGCGAAGT AGTATCTTCAAGTGAGAACTGAGAAACATCGTGGTTTTTCTTTTTTGCACCATTTAAGATTCTA GTGAACTATATGAACCTCTGTTTTTTGAGAATCTACGTTGCATGATTTGGCTTGATAACGATAA TTTGTTTTGGTTGTGTAGCATTGAACATTTTAGTTGATAAGAATTTTTATCTTCTTACGAGTGA AATATTGCCTTCTGTTCAGGCAGACAAGCTTCTCTCTCCTGAGTTCCAGCCTTCCGTGGAACAG CTGATTCGTTACCTTCCAGCGAGCCGGCAAATTTTGATGTTCTCGGCAACGTTCCCTGTGACTG TGAAGGAGTTCAAGGACAAATACCTGCCTAAACCTTATGTTATTAACCTTATGGATGAACTTAC ACTGAAGGGAATTACACAGTTTTATGCTTTTGTAGAAGAAAGGCAGAAAGTTCATTGCCTTAAC ACTCTCTTTTCCAAGGTTTTACCGATGAGCACCTTTGCTTTGTGTTCAGTTAGCCACTTTTACC TCCCTTATAGCCTGTAAATCATGCACATTTGTTTTGATGCAGCTTCAAATCAACCAATCAATAA TCTTCTGCAACTCTGTAAATCGTGTTGAGCTTCTGGCAAAGAAGATCACGGAGCTTGGTTACTC TTGCTTCTACATCCATGCAAAGATGCTGCAAGACCATCGTAATAGAGTTTTCCATGATTTCCGT AATGGGGCATGCAGGAACCTGGTTTGTACAGGTATGGAATTCTCCGTGTTCCGCATCAACTCTT GACTGGTTCTATTCTTGATGGATATTTGTTACTGTTCACTGTCTAGTGAAATCTCATTAATGTC CTACTAGAACTAATTGTTTCAGCCGATCTGAATGTATTTTGTTACTTCATCCCTGCTTTTGTAT ATTCTTTTTCTTCTTAAAAAGAAGCGTTGATGACAGTGTTGGTGTGCTTTATTTACCCGCAATC CAGATGTTCCGTAGATGGATTTATGTGAATACGCATGTGTTATATCTTATTTTACTAATGTATT CATTATTTGTACATGTGCATATGTTGTTGTTAGCTGGTGGTATAATTAAAATGTATGCAACCTT TTTGATCCAAGTGTAATTAATTTTCAAACTCACAATGTGTCATACATATATTTGAGATGTGTGG CAACACAGGTACAATGAAAAGGAGGAAACAATATGCTAATTTTAATACTTCACTACCAAGTTCT GTTTCTTGCAAGCCTCCATAATTCACTTATATGGAATAGTTTTGAAATGTTGTGATTTTGTGCA AGTATATAGAAATGTGTGGATATATTGCTTACGGCTACACGAAATTCTGATATTCTTTCTTCTA TTTTAACTTTTCATTTCTTTTTTCTTTGCAGATCTTTTCACAAGGGGAATTGACATTCAAGCTG TTAATGTTGTTATCAATTTTGATTTCCCCAAAACCGCTGAAACATACCTCCACAGGGTATGGCA TTTGAATAAATTCAGCTTTTGATCTTAGGCTTTAATCTAATTAGGATGTCATATGCTGCTATGA GAATAATATTCTAGAAACTAATCTTAACCAGTAAGATGTTTGTACTAAGAAGAAAATGCACACA CAAGTGTTAGATCAAATGTGGAAACATGCACACATATGTTTTATCATGTAATTGGTTGCCCCTG TAATTTGTTCATAGTTTGGAACTAAATACCAACTGTTATTGTCATGGTATCTCTCCTTTGCAAT GTTGTGTAGGCAGTGCAGTTCTTTAACTGTTATTTTGTTGGCCTTTTTCTAGGTTGGTAGATCT GGGAGATTTGGCCATCTTGGCCTGGCTGTGAATTTGATCACCTATGAGGATCGGTTTAACTTGT ATGAACAATTACCCACCACAATTTTATTCATGTATTTTATTCTGACGTTTGGTTCATTGAACTA AGTTTTCTTTCTGGGAACAGGTATAGGATTGAGCAAGAGCTTGGGACTGAGATAAAACCAATTC CTCCTCAGATTGACCAAGCTATATATTGCCAATAATTTGACAGAGTTCCAGCGTGTATTCACTT TCTCTAAGGGTAATAAGAAGACAATTCTTGTAAATACCAGCTCATCAG |