| Splice junction sequence |
CTGTTGCTTGTTAATGGAACGTATCGGAAAACAATTCGCACCTATCTCGATTCATCTATACTCC AGTATCAATTGCAAAGATTGGATCATTCCCTTAAAGaaagatcatcaagccattgatatacttt tagcagagattgacatatatgagctttttgctttcaaacattgcaagggaaggaaagtcaaact tgctctct
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| Assembled circRNA sequence |
Yes
The sequence of a circRNA based on assembly using circseq-cup (Ye et al., 2016) or CIRI-full (Zheng and Zhao, 2018) or CIRCexplorer2 (Zhang et al., 2016).
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| Full-length trsnacripts |
Transcript length: 679 Transcript exons: 25812319-25812424,25812579-25812718,25812859-25813017,25 813092-25813195,25815409-25815578 AAAGATCATCAAGCCATTGATATACTTTTAGCAGAGATTGACATATATGAGCTTTTTGCTTTCA AACATTGCAAGGGAAGGAAAGTCAAACTTGCTCTCTGTGAAGAACTTGATGAGAGGATGCGGGA CTTGAAAAATGAGCTTCAGTCGTTTGATGGTGAAGAATATGATGAAGATCATAAGAGGAAGGCC ATAGATGCACTAAAACGAATGGAGAATTGGAACTTATTTAGTGATACGTACGAGGAGTTCCAAA ACTACACTGTAGCACGTGATACTTTTCTGGCTCATCTGGGTGCTACTCTCTGGGGGTCAATGAG ACATATTATATCACCTTCACTGTCTGACGGGGCATTCCATTATTTTGAGAAAATATCATTTCAA TTGTTTTTCATCACACAGGAGAAAGCTAGAAACATTAAACAATTGCCAGTAGATCTTAAAGCTA TAAAGGATGGGCTCTCGTCTTTGTTGTTACCTTCACAGAAACCTCTATTTAGTCAGACCATGTT ACCACTCTCAGAGGATCCTGCTTTGGCAATGGCTTTCTCAGTGGCACGACGTGCAGCAGCTGTT CCACTGTTGCTTGTTAATGGAACGTATCGGAAAACAATTCGCACCTATCTCGATTCATCTATAC TCCAGTATCAATTGCAAAGATTGGATCATTCCCTTAAAG
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| Genomic sequence |
AAAGATCATCAAGCCATTGATATACTTTTAGCAGAGATTGACATATATGAGCTTTTTGCTTTCA AACATTGCAAGGGAAGGAAAGTCAAACTTGCTCTCTGTGAAGGTTACTAATTTCTTCCTTTAGA ATGCAAGCTTGAATATTAATTTTATATTTAATTCAGTTGACATTGTTGCTTTGATAAATTGCGT TTCAAAAGAATGCTTGGTATATGATTGTTTGATTTCTATGTGTACAATTTGGTGTTCTTTTCAC ACAGAACTTGATGAGAGGATGCGGGACTTGAAAAATGAGCTTCAGTCGTTTGATGGTGAAGAAT ATGATGAAGATCATAAGAGGAAGGCCATAGATGCACTAAAACGAATGGAGAATTGGAACTTATT TAGTGATACGTACGAGGTAAAGGCCAGACTTTTATAGGTTTTGTTATTTTTCACTTTTGTGCAA CACTTCATGCATTCTTTATTATGTTTTGTAGAAGTGTTGTAACACTCAACATGAATGTGTACTT TTTTTCTCTAAATTTTTGTAACATGCAGGAGTTCCAAAACTACACTGTAGCACGTGATACTTTT CTGGCTCATCTGGGTGCTACTCTCTGGGGGTCAATGAGACATATTATATCACCTTCACTGTCTG ACGGGGCATTCCATTATTTTGAGAAAATATCATTTCAATTGTTTTTCATCACACAGGAGGTATG GTCCATATTTCTAAATATACGGAAGGACCATTGGTATATATTAAAATTTTCCAAACTCTCTTGA TGCAGAAAGCTAGAAACATTAAACAATTGCCAGTAGATCTTAAAGCTATAAAGGATGGGCTCTC GTCTTTGTTGTTACCTTCACAGAAACCTCTATTTAGTCAGACCATGTATGTCGTTTATCATGTA GTCATATACAATTTATATTATATTTATATCTTTGTACCGTCTGTTCATTATCTCCATGAAGATG CTCGTTTCCTTTTTTTTTTCCGAAGAAATAAAGAAAGCGAAGAAATCTAGTGATAAAAACAAAG TAAAGCAAACCAAAGCATCCAAAAGAAACTAAAGAAAGACAAAGAAGACCAAACACAAGGCTAG AAACAGCCAAACTAAACAGCGCTAGACCCATAAATTAGAAGTGACGACAACCGAACTTTGAGGC AGCAACAAAGAACCAAAAAACCAAAAGTAGCTAAAACTCAAACTCCATATCGGAAACAACCAGG ATGCAAACAGAGAGCCGGTAGCCATGATAACCAAGATAAAACTCTTTATTAGGCACAATATACA GGAATTTCACGTAATTGAAGGCCACAAACTGGCATAAGAGAACCAAGTTTGCTTTGAATTGATG AAGGATGTAAAGAAGACTTGTCAGCGCAATCCTGAAAAAAAGAGCTTCCTAAGAAATATCATCC AATATTTATTAATGGTGGGCAATATGGACTCCATACTACTCATGCTGACCTTAGAATCAGCATC CAAAGTATCAAATCTAAAAGGATTCTTTCATTTTTTTCTCAATGAAAGTCATCATTCTCCTCAA AAGAAAAAGCATCAAATCTAAAAAGAGAATTTGTAGAAGTTGAAGGATCTTTTGGTGAATGAAT GACTCCTTTGGTGAATAAAGGATTAGGAAAATCCTTAGTGATGGCTTGTTGGCTGCAAAAAGTG GGATTGGGGACCAAGAAGAAGATGATTATTTGATTAAGGAAACCACTAAACCTGTAAGCCTTTT TTCAAGAATATCCGAGTCTGCATCAGGGAATATAGGTGACTTTCTCCATAGAACTCGGGGATAC AGTTGTCCAACCTATATAATAGATCTTGTTCAAGTAAGGTCGTTATAGGTAATTTTCTCCAAGA ATAGGACTTAAGAAATGCTTCAATATGGCTTCTCTTCTAACTAAGAGGTCATGGTTCAATACAT GATGACCCCCTACTTAGAAATTAATTTCCTACGAGTTTCCTTGATACCCAAATGTTGTATGGTT AGGCGAGTTGTTCCGTTGCACTCACTGATATTGAAAAAACATACCCTTCTTTTCAAGGGAATTT AAATTGTGCCTCTTCACTGCAAAAAGAGCTTCCCTCTCATTGCCTATCTCCTCATATCTCCTAT TTATGTTGTATGAATCAAGAAGACATTCAGCACTTTCTTTTCAAGTGTCCTTATGCAGTCAATT GTTGGTATAGAGGCTGTTGCAAAATTTTAATTTCAGATAGGGTTTTTATGGCAGCTTTAGTGGG TAATGTGCTGCAAATTCTCCCTGGACCAGATTTAAAGAGAACCCCATCAATTTATGGTGCAATG CAGTCAAGGCCTTGTTAGTAGAAATATGGTTTGAAAGAAATCAACGCGTATTCCACAATACGAC TTCAGTATGGTTCGATCGATTTAAGTATGCCCGTTTAAATGCTTCATCATGATGCCATGTGGTC ACAGGATTTCAGGATTACTCCACACAGGACATTCACCTCAATTGGCAAGCTTTTATTGTTTAGT CATTTTGAGTCCAGCTAAGGAGATTTAGGCAAGTGCCTTGTTTTTGCCCAGTTTAGAGTTGTCT TTTAGTCTTTTGTTAATGATAGGCTGCTGATGTAAAGGTCTTATGTTTTCGACCATTTTTACTT TTTCAATGTCATTTCATTTCTCTATTTTTTTTTATATGATGAGGAAGCTAAGGGGGGTGTCAAC CTAGTTGAGATGTCTGGGTGTGTCTACTCATCTCTAGTTTTTTAATTTCTTATCGTATAATCTT CTTGTAATTTGAGTTCTGCCACATTCTTTATAATAAATGGGATTTGTTTCCTTGTTTTTTTTAA AAAATATCACCTGGAGAATTAATCCATTAAAATACCTGAAATTTCTGGTAAAGATCAAAATTTC AGAATTCTTTTCTGAAAAGCTAACCAAAGCATCAAGTTCTATTCCACCTGGAAGTTAAAGAAAA ATTTAACCAAAAATAATCCTTCTAAGATCAAGTTCTTCCTCCTTGGATTTCATATCCTGCCATG AGATTTTTAATATCTGTAATGTGAGGGTTATCTCTTCTTTTGGAATTGTAGTTCCCCTGATATT TTTAATTATGTATTGTAGGTTACCACTCTCAGAGGATCCTGCTTTGGCAATGGCTTTCTCAGTG GCACGACGTGCAGCAGCTGTTCCACTGTTGCTTGTTAATGGAACGTATCGGAAAACAATTCGCA CCTATCTCGATTCATCTATACTCCAGTATCAATTGCAAAGATTGGATCATTCCCTTAAAG |