Splice junction sequence |
TGGGGATGCTGTACTGTTAAAATTTGAGAAAGCAAAATCTGCACTTATCGATAGTCTTAGACGT GTGGAGGACATTGTTCCTAGTTCAATTGGGTCTCAGgtttgtataaagctgtggctagctaatt agagtctccagattgagttaagatcatggatgttagcgagctcgaggagaatttgttcgctgct agcgatgc
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Assembled circRNA sequence |
Yes
The sequence of a circRNA based on assembly using circseq-cup (Ye et al., 2016) or CIRI-full (Zheng and Zhao, 2018) or CIRCexplorer2 (Zhang et al., 2016).
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Full-length trsnacripts |
Transcript length: 398 Transcript exons: 8631726-8631829,8632187-8632372,8632463-8632570 GTTTGTATAAAGCTGTGGCTAGCTAATTAGAGTCTCCAGATTGAGTTAAGATCATGGATGTTAG CGAGCTCGAGGAGAATTTGTTCGCTGCTAGCGATGCCAAGTTACATGGAGATATGTGCAAGGAA CTATCTGCAGTTTATTGCAAGGTATTGTCCATCTTCCCTTCGTTGGAAGAAGCAAGACCTCGGA GTAAATCAGGGATTCAAACCTTGTGTTCGTTACATATTGCACTTGAGAAGGCAAAGAACATTCT TCAACACTGTTCTGAGTGTAGCAAACTTTATTTGGCCATTACTGGGGATGCTGTACTGTTAAAA TTTGAGAAAGCAAAATCTGCACTTATCGATAGTCTTAGACGTGTGGAGGACATTGTTCCTAGTT CAATTGGGTCTCAG
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Genomic sequence |
GTTTGTATAAAGCTGTGGCTAGCTAATTAGAGTCTCCAGATTGAGTTAAGATCATGGATGTTAG CGAGCTCGAGGAGAATTTGTTCGCTGCTAGCGATGCCAAGGTTATATTCTCATAAATGGATATG TTTTAACCATCTCTATCTCTAAGATTCTTGTCGGTAGTTGTTGGAATCTAATGAACAAGGGATA TGCTTAGTATGTTATTGTTATCTCCTTTTTTGTGTTTTGGTTTTGGATTGCTTCTATTTTTTGA TGTTATAGAGTTTTGATTCTCCTGAATTCAGACTTGCCCCTTTGATCCCTTTCCCTGTTAATTG TTAGCAAATCTTGTGTTGAGAGAGTATATGGGAATCTTAGCGGCATTAGTATTATTTCCATTCT TGTTCTATGATGTAACTCTTTCAATTTGATGGTGTTCTCTATTCTTTGCTAAAAGTTGTGTGCT GGGTAAAATGCAGTTACATGGAGATATGTGCAAGGAACTATCTGCAGTTTATTGCAAGGTATTG TCCATCTTCCCTTCGTTGGAAGAAGCAAGACCTCGGAGTAAATCAGGGATTCAAACCTTGTGTT CGTTACATATTGCACTTGAGAAGGCAAAGAACATTCTTCAACACTGTTCTGAGTGTAGCAAACT TTATTTGGTTAGTTGCTCTTTCTTTCTTTGGATACATTATTCTCTTTTGTGTGTTTGGTCTCTC TCTTGAATTCCTCCACTTTTATATGTTGAGCAGGCCATTACTGGGGATGCTGTACTGTTAAAAT TTGAGAAAGCAAAATCTGCACTTATCGATAGTCTTAGACGTGTGGAGGACATTGTTCCTAGTTC AATTGGGTCTCAG |