Splice junction sequence |
TCTCTCGGTTCAGTTGCTACAGTCAATAGTCTGATCAAATGCACTGTCGAGCGGATTAAAGCCG CTCTGGCCTGCGACGGAGCCTAATCGATGTTTTCGGgttcttcaaggaatgtcctcatccagac gataagcaaagaaaggagctgagtcgcgagctaagcttagaacctcttcaagtcaagttttggt tccaaaac
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Assembled circRNA sequence |
Yes
The sequence of a circRNA based on assembly using circseq-cup (Ye et al., 2016) or CIRI-full (Zheng and Zhao, 2018) or CIRCexplorer2 (Zhang et al., 2016).
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Full-length trsnacripts |
Transcript length: 2066 Transcript exons: 11557292-11557409,11557712-11558368,11558460-11558561,11 558672-11558872,11558969-11559143,11559272-11559543,1155 9626-11559721,11559812-11560256 GTTCTTCAAGGAATGTCCTCATCCAGACGATAAGCAAAGAAAGGAGCTGAGTCGCGAGCTAAGC TTAGAACCTCTTCAAGTCAAGTTTTGGTTCCAAAACAAACGCACTCAAATGAAGGCACAACATG AGAGGCACGAGAACCAGATACTGAAGTCAGAAAATGACAAGCTCCGAGCAGAGAACAATAGGTA CAAGGATGCTCTAAGCAACGCAACATGCCCAAACTGTGGTGGTCCGGCAGCTATAGGAGAAATG TCCTTCGACGAACAGCATTTAAGGATCGAAAATGCTCGTTTACGCGAAGAGATTGACAGAATCT CTGCCATAGCTGCTAAATACGTAGGGAAGCCTTTAATGGCTAATTCCTCTTCTTTCCCTCAGCT CTCTTCTTCACACCACATTCCCTCGCGCTCGCTTGATCTTGAAGTTGGGAACTTTGGGAACAAT AACAATAGCCACACTGGTTTCGTTGGGGAAATGTTTGGAAGCAGCGACATTTTGAGGTCGGTTT CGATACCTTCTGAGGCTGATAAGCCTATGATTGTTGAGTTAGCTGTTGCAGCAATGGAAGAGCT TGTGAGAATGGCTCAAACTGGTGATCCCTTATGGGTTTCAAGCGATAATTCTGTTGAGATTCTC AATGAAGAAGAGTATTTTAGGACGTTTCCTAGAGGAATTGGACCGAAACCTATCGGTTTGAGAT CAGAAGCTTCAAGAGAGTCTACTGTTGTTATCATGAATCATATCAATCTCATTGAGATTCTAAT GGATGTGAATCAATGGTCTAGTGTGTTCTGCGGGATTGTATCAAGAGCATTGACTCTAGAAGTT CTCTCAACTGGCGTAGCAGGGAACTACAATGGGGCATTGCAAGTGATGACAGCAGAGTTCCAAG TCCCATCGCCGCTTGTCCCTACTCGTGAGAACTACTTTGTAAGGTACTGTAAACAGCACAGTGA CGGTATTTGGGCGGTTGTGGATGTCTCTTTGGACAGCCTAAGACCAAGTCCGATCACTAGAAGC AGAAGAAGACCCTCTGGTTGTCTGATTCAAGAATTGCAGAATGGTTACTCCAAGGTGACATGGG TAGAGCATATTGAGGTGGATGATAGATCGGTTCACAACATGTATAAACCGTTGGTTAATACCGG TTTAGCTTTCGGTGCAAAACGTTGGGTGGCTACACTTGACCGCCAATGTGAGCGGCTCGCCAGT TCCATGGCCAGCAACATTCCGGCTTGTGATCTTTCCGTGATAACGAGTCCTGAGGGGAGAAAGA GCATGCTGAAACTAGCGGAGAGAATGGTGATGAGCTTCTGTACCGGAGTCGGCGCGTCAACTGC GCATGCCTGGACTACATTGTCGACCACAGGATCCGACGACGTTCGGGTCATGACCCGAAAGAGC ATGGATGATCCGGGAAGACCTCCAGGCATCGTTCTCAGCGCCGCTACTTCTTTCTGGATCCCTG TAGCTCCAAAACGAGTGTTCGATTTTCTCAGAGATGAAAACTCAAGAAGCGAGTGGGATATACT TTCCAATGGAGGCTTGGTTCAAGAAATGGCTCATATCGCAAATGGTCGTGATCCTGGGAATAGT GTCTCCTTGCTTCGAGTCAATAGTGGGAACTCAGGGCAGAGCAACATGTTGATCTTACAAGAAA GTTGTACGGACGCATCAGGGTCCTATGTGATATACGCACCAGTTGATATAATAGCTATGAACGT TGTCCTGAGTGGTGGTGATCCGGATTATGTCGCTTTGTTACCATCCGGATTCGCTATTTTGCCG GATGGCTCTGCTAGAGGAGGAGGAGGTAGTGCTAATGCCAGTGCTGGAGCCGGAGTTGAAGGAG GAGGAGAGGGGAATAATCTTGAAGTGGTTACTACTACTGGGAGTTGTGGCGGTTCACTACTCAC AGTTGCGTTTCAGATACTTGTTGACTCTGTTCCTACCGCTAAACTCTCTCTCGGTTCAGTTGCT ACAGTCAATAGTCTGATCAAATGCACTGTCGAGCGGATTAAAGCCGCTCTGGCCTGCGACGGAG CCTAATCGATGTTTTCGG
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Genomic sequence |
GTTCTTCAAGGAATGTCCTCATCCAGACGATAAGCAAAGAAAGGAGCTGAGTCGCGAGCTAAGC TTAGAACCTCTTCAAGTCAAGTTTTGGTTCCAAAACAAACGCACTCAAATGAAGGTATTTTTAC TATATAGTATATATATACTTCGGCCAATTTTGATTATTAATTCTATTATTTTCATTTACCGGTC TCGAATCTTCAAGAGAGTTATATATATATTTTTCAGAATAATCAAATGAATTTGATGTGTATTT CCAACCACATTTTGATTTAGATACTACGAAGCCTTATTTAAACACATGTACTTAGCTAGTTCCA AGATTAAGTTCATTTTGTCAAAAGATCTATCCATTTGTTTTGGTATATACTCTTGATGAGACCA AACATAAGAAGATATATAACATTGGGACTTGTATAGGCACAACATGAGAGGCACGAGAACCAGA TACTGAAGTCAGAAAATGACAAGCTCCGAGCAGAGAACAATAGGTACAAGGATGCTCTAAGCAA CGCAACATGCCCAAACTGTGGTGGTCCGGCAGCTATAGGAGAAATGTCCTTCGACGAACAGCAT TTAAGGATCGAAAATGCTCGTTTACGCGAAGAGATTGACAGAATCTCTGCCATAGCTGCTAAAT ACGTAGGGAAGCCTTTAATGGCTAATTCCTCTTCTTTCCCTCAGCTCTCTTCTTCACACCACAT TCCCTCGCGCTCGCTTGATCTTGAAGTTGGGAACTTTGGGAACAATAACAATAGCCACACTGGT TTCGTTGGGGAAATGTTTGGAAGCAGCGACATTTTGAGGTCGGTTTCGATACCTTCTGAGGCTG ATAAGCCTATGATTGTTGAGTTAGCTGTTGCAGCAATGGAAGAGCTTGTGAGAATGGCTCAAAC TGGTGATCCCTTATGGGTTTCAAGCGATAATTCTGTTGAGATTCTCAATGAAGAAGAGTATTTT AGGACGTTTCCTAGAGGAATTGGACCGAAACCTATCGGTTTGAGATCAGAAGCTTCAAGAGAGT CTACTGTTGTTATCATGAATCATATCAATCTCATTGAGATTCTAATGGATGTGGTATAATTCTG TTACTCTAACTCTGATTTTTAAAATTTTAACAAAGGTTCTAACTTATAGTTGACACTTTTGCTG TTCTTTCTCTGTATAGAATCAATGGTCTAGTGTGTTCTGCGGGATTGTATCAAGAGCATTGACT CTAGAAGTTCTCTCAACTGGCGTAGCAGGGAACTACAATGGGGCATTGCAAGTGGTATGACACT CAAAGACCTTGATTTGGTTACTTGCTTTACAAGGTATTATTCTTAATCATGTAGTGAGATTTCT CATGTGTTTGATCTTTGTTTTCTTGGTATGCAAAAGATGACAGCAGAGTTCCAAGTCCCATCGC CGCTTGTCCCTACTCGTGAGAACTACTTTGTAAGGTACTGTAAACAGCACAGTGACGGTATTTG GGCGGTTGTGGATGTCTCTTTGGACAGCCTAAGACCAAGTCCGATCACTAGAAGCAGAAGAAGA CCCTCTGGTTGTCTGATTCAAGAATTGCAGAATGGTTACTCCAAGGTAAACTTAAGGTCTAAAT TGATAATTTTAAAAGTATGAGGTTGAGAATTTGAAAAGAAGAGAAATGATTAGGTGATGGTTTT GTTTTGTTTGAAGGTGACATGGGTAGAGCATATTGAGGTGGATGATAGATCGGTTCACAACATG TATAAACCGTTGGTTAATACCGGTTTAGCTTTCGGTGCAAAACGTTGGGTGGCTACACTTGACC GCCAATGTGAGCGGCTCGCCAGTTCCATGGCCAGCAACATTCCGGCTTGTGATCTTTCCGGTAT GTACACCACACCATCAAATGAAAATATTTTTAGGGTCATTTTGATCAATTTGTTAATATTGGTA TTAAATTGAAAAATATTAATTTACTAATTGAGTCCCTTAACTTTATGGTAATTATGAAAGTGAT AACGAGTCCTGAGGGGAGAAAGAGCATGCTGAAACTAGCGGAGAGAATGGTGATGAGCTTCTGT ACCGGAGTCGGCGCGTCAACTGCGCATGCCTGGACTACATTGTCGACCACAGGATCCGACGACG TTCGGGTCATGACCCGAAAGAGCATGGATGATCCGGGAAGACCTCCAGGCATCGTTCTCAGCGC CGCTACTTCTTTCTGGATCCCTGTAGCTCCAAAACGAGTGTTCGATTTTCTCAGAGATGAAAAC TCAAGAAGCGAGGTAATTAATACTCAAGTCATAAAGAGGCCCTTTTTGAAAAAAAGATCGATAA GTTACTTATTCTTGAGTTCAATTTTTGCAGTGGGATATACTTTCCAATGGAGGCTTGGTTCAAG AAATGGCTCATATCGCAAATGGTCGTGATCCTGGGAATAGTGTCTCCTTGCTTCGAGTCAATGT AAGTAATGTTCTTGAAATCTAGTAGTTTCTGTATAACCCCACTGTTGCTTGTGTTCAAAGTCTC AACATTTTGTTTGTTTAAAAACAGAGTGGGAACTCAGGGCAGAGCAACATGTTGATCTTACAAG AAAGTTGTACGGACGCATCAGGGTCCTATGTGATATACGCACCAGTTGATATAATAGCTATGAA CGTTGTCCTGAGTGGTGGTGATCCGGATTATGTCGCTTTGTTACCATCCGGATTCGCTATTTTG CCGGATGGCTCTGCTAGAGGAGGAGGAGGTAGTGCTAATGCCAGTGCTGGAGCCGGAGTTGAAG GAGGAGGAGAGGGGAATAATCTTGAAGTGGTTACTACTACTGGGAGTTGTGGCGGTTCACTACT CACAGTTGCGTTTCAGATACTTGTTGACTCTGTTCCTACCGCTAAACTCTCTCTCGGTTCAGTT GCTACAGTCAATAGTCTGATCAAATGCACTGTCGAGCGGATTAAAGCCGCTCTGGCCTGCGACG GAGCCTAATCGATGTTTTCGG |