Splice junction sequence |
GGATGGTGTGAGAATATCAGTGATGATGGGGTAATGAGTTTAGCTTATGGCTGTCCAGATCTCA GGACCCTTGACCTCTGCGGCTGTGTTCTTATTACAGgatcaagttcaccgcttcattttagtca ttaaacaaagatggtgatgggaggagaagcatccatggaactggaccagtgttttcagaagatg aagatgga
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Assembled circRNA sequence |
Yes
The sequence of a circRNA based on assembly using circseq-cup (Ye et al., 2016) or CIRI-full (Zheng and Zhao, 2018) or CIRCexplorer2 (Zhang et al., 2016).
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Full-length trsnacripts |
Transcript length: 747 Transcript exons: 7497441-7497696,7498245-7498593,7498698-7498839 GATCAAGTTCACCGCTTCATTTTAGTCATTAAACAAAGATGGTGATGGGAGGAGAAGCATCCAT GGAACTGGACCAGTGTTTTCAGAAGATGAAGATGGAAGGAATCTCGATCAAAGAGTGGAAAGAT ATCCCTGTGGAGCTTCTGATGAGGATCCTTTCCCTTGTTGATGATCGTAATGTCATTGTTGCTT CTGGTGTTTGCACTGGCTGGAGAGATGCTATCTCTTTTGGCCTCACTCGTCTCCGTCTATCTTG GTGCAACAACAACATGAACAGCTTGGTTCTTTCTCTTGTTCCCAAGTTTGTAAAGCTGCAGACT TTAAATCTAAGGCAGGACAAACCGCAACTAGAGGACAATGCAGTGGAGGCCATAGCAAATCACT GCCATGAGTTACAAGAACTTGATCTCAGCAAAAGCTTGAAAATTACAGACCGTTCACTTTATGC ACTTGCTCATGGTTGCCCAGACCTCACAAAACTCAACCTTAGTGGCTGCACTTCATTCAGCGAC ACTGCTATTGCGTATTTGACCAGATTCTGCAGAAAGCTTAAAGTTTTGAATCTTTGCGGATGTG TCAAAGCTGTAACTGACAATGCCTTGGAGGCTATTGGGAATAACTGCAATCAGATGCAGTCACT AAACTTGGGATGGTGTGAGAATATCAGTGATGATGGGGTAATGAGTTTAGCTTATGGCTGTCCA GATCTCAGGACCCTTGACCTCTGCGGCTGTGTTCTTATTACAG
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Genomic sequence |
GATCAAGTTCACCGCTTCATTTTAGTCATTAAACAAAGATGGTGATGGGAGGAGAAGCATCCAT GGAACTGGACCAGTGTTTTCAGAAGATGAAGATGGAAGGAATCTCGATCAAAGAGTGGAAAGAT ATCCCTGTGGAGCTTCTGATGAGGATCCTTTCCCTTGTTGATGATCGTAATGTCATTGTTGCTT CTGGTGTTTGCACTGGCTGGAGAGATGCTATCTCTTTTGGCCTCACTCGTCTCCGTCTATCTTG GTAAGAATTTCTATCTAACTTATAAACCCTTTTTGTATTTAGGACTCTTCTCTGTGTTGGTGTT TTGGATTTGAAGTAGGAGTTGAGTTTCTAGAGTCTTTATTGTATCTTGTGCTTAGGGTCATGTT GATTTATTGTCTATTTGTGTAAGATCAGATCTTTTTTTGTTGCTTTTGTTTTGAGGAACATTTT AGCAGTCTATATATGATTGATTTGGCTAGATTGAAGAAAGTGAAAAAGCTGTTTAAATTTTTGA TGGAACTCTTTTAAGATGATAGATCAGTTTTCAATAGGAGGTGAAACCAAGTTCTTTAATCCAG AAGAGTGGTCTGAAGATGACTCTTAAATCTTTGAACCACTAGAAGCTTGTTCTTGTCACTTCCA GTGTATTCAGATTGATCTCTGTCTACTACACTCTTTGATGTTGTTTCTTATTTTTATACTAGGT GCAACAACAACATGAACAGCTTGTTCTTGTCACTTCCAGTGTATTCAGATTGATCTCTGTCTAC TACACTCTTTGATGTTGTTTCTTATTTTTATACTAGGTGCAACAACAACATGAACAGCTTGGTT CTTTCTCTTGTTCCCAAGTTTGTAAAGCTGCAGACTTTAAATCTAAGGCAGGACAAACCGCAAC TAGAGGACAATGCAGTGGAGGCCATAGCAAATCACTGCCATGAGTTACAAGAACTTGATCTCAG CAAAAGCTTGAAAATTACAGACCGTTCACTTTATGCACTTGCTCATGGTTGCCCAGACCTCACA AAACTCAACCTTAGTGGCTGCACTTCATTCAGCGACACTGCTATTGCGTATTTGACCAGATTCT GCAGAAAGCTTAAAGTTTTGAATCTTTGCGGATGTGTCAAAGCTGTAACTGACAATGCCTTGGA GGTGAATCTTTGTTTTTCTTTAATGTTCTCTCCCAAACTTGGTTTTACTCCTTTGGTCATAAGT GTGGCAGAGTTGATAGAATTTGTTCATGTTGTTGTGTGCAGGCTATTGGGAATAACTGCAATCA GATGCAGTCACTAAACTTGGGATGGTGTGAGAATATCAGTGATGATGGGGTAATGAGTTTAGCT TATGGCTGTCCAGATCTCAGGACCCTTGACCTCTGCGGCTGTGTTCTTATTACAG |