Plant Circular RNA Database

Detail information of Os05g0422900_circ_g.1

			
						 General Information
					
						CircRNA Name
						Os05g0422900_circ_g.1
					
						ID in PlantcircBase
						osa_circ_027959
					
						Alias
						Os05circ11195/Os_ciR86, 
					
						Organism
						
							Oryza sativa						
					
						Position
						
							chr5: 20738743-20740923  JBrowse»						
					
						Reference genome
						
							IRGSP-1.0.38						
					
						Type  
						
							ue-circRNA							
									
						Identification method
						CIRI, SMALT, Segemehl, circRNA_finder, find_circ, CIRI-long
					
						Parent gene
						
							Os05g0422900						
					
						Parent gene annotation
						
							Similar to helicase. (Os05t0422900-01)
							
						Parent gene strand
						+
					
						Alternative splicing
						
							NA						
					
						Support reads
						46/600/13
					
						Tissues
						leaf and panicle/root/shoot, anther, seed, pistil, root, leaf
					
						Exon boundary  
						
							No-No							"Exon boundary" shows whether the splicing sites are on the boundary of exons or not. For example, "Yes-No" represents the donor splicing site is on the exon boundary and the accepter is not on the exon boundary.

						Splicing signals  
						
							GT-AG							The splicing signals of the circRNA. For example, "AG-GT" represents that the donor and the accepter splicing signal is "AG" and "GT", respectively.

						Number of exons covered
						Os05t0422900-01:3

General Information
CircRNA Name	Os05g0422900_circ_g.1
ID in PlantcircBase	osa_circ_027959
Alias	Os05circ11195/Os_ciR86,
Organism	Oryza sativa
Position	chr5: 20738743-20740923 JBrowse»
Reference genome	IRGSP-1.0.38
Type	ue-circRNA
Identification method	CIRI, SMALT, Segemehl, circRNA_finder, find_circ, CIRI-long
Parent gene	Os05g0422900
Parent gene annotation	Similar to helicase. (Os05t0422900-01)
Parent gene strand	+
Alternative splicing	NA
Support reads	46/600/13
Tissues	leaf and panicle/root/shoot, anther, seed, pistil, root, leaf
Exon boundary	No-No "Exon boundary" shows whether the splicing sites are on the boundary of exons or not. For example, "Yes-No" represents the donor splicing site is on the exon boundary and the accepter is not on the exon boundary.
Splicing signals	GT-AG The splicing signals of the circRNA. For example, "AG-GT" represents that the donor and the accepter splicing signal is "AG" and "GT", respectively.
Number of exons covered	Os05t0422900-01:3

			
						 Experimental Information
					
						Sanger sequencing for BSS  
						
							NA							Sanger sequencing for back-splicing site (BSS) validation. "Yes" represents Sanger sequencing has been performed to valid the back-splicing site, "No" represents the opposite, "NA" represents "not available".

						PCR primers for BSS   
						
							NA							PCR primers used in back-splicing site (BSS) validation.

						Sanger sequencing for FL   
						
							NA							Sanger sequencing for full-length (FL) sequence validation of circRNAs. "Yes" represents Sanger sequencing has been performed to valid the full-length of circRNA, "No" represents the opposite.

						PCR primers for FL   
						
							NA							 PCR primers used in full-length (FL) sequence validation.

Experimental Information
Sanger sequencing for BSS	NA Sanger sequencing for back-splicing site (BSS) validation. "Yes" represents Sanger sequencing has been performed to valid the back-splicing site, "No" represents the opposite, "NA" represents "not available".
PCR primers for BSS	NA PCR primers used in back-splicing site (BSS) validation.
Sanger sequencing for FL	NA Sanger sequencing for full-length (FL) sequence validation of circRNAs. "Yes" represents Sanger sequencing has been performed to valid the full-length of circRNA, "No" represents the opposite.
PCR primers for FL	NA PCR primers used in full-length (FL) sequence validation.

			
				
						 Sequences
					

				
						Splice junction sequence  
						
							TGTTTTGATTTATGCAGCACCATCGGTGCCTTTTTGGTGTGGGCTGTCAAGACCATCGACAGCT
TCCTCCCTTGTCCCCACCGGCCATCCGCTCCGCAAGgtgcctgcaatgattttatctagacata
tgctggtgctgagtccattgcttgccttgatgtcggatcaactgaggaagctccctgcatttat
gcaagatg

									
								

					

						Assembled circRNA sequence  
						
							Yes
The sequence of a circRNA based on assembly using circseq-cup (Ye et al., 2016) or CIRI-full (Zheng and Zhao, 2018) or CIRCexplorer2 (Zhang et al., 2016).

					

						Full-length trsnacripts
						
							Transcript length: 128
Transcript exons: 20738743-20738826,20740880-20740923
GTGCCTGCAATGATTTTATCTAGACATATGCTGGTGCTGAGTCCATTGCTTGCCTTGATGTCGG
ATCAACTGAGGAAGCTCCCTCGACAGCTTCCTCCCTTGTCCCCACCGGCCATCCGCTCCGCAAG
Transcript length: 154
Transcript exons: 20738743-20738817,20740845-20740923
GTGCCTGCAATGATTTTATCTAGACATATGCTGGTGCTGAGTCCATTGCTTGCCTTGATGTCGG
ATCAACTGAGGATCGGTGCCTTTTTGGTGTGGGCTGTCAAGACCATCGACAGCTTCCTCCCTTG
TCCCCACCGGCCATCCGCTCCGCAAG
Transcript length: 157
Transcript exons: 20738743-20738851,20740876-20740923
GTGCCTGCAATGATTTTATCTAGACATATGCTGGTGCTGAGTCCATTGCTTGCCTTGATGTCGG
ATCAACTGAGGAAGCTCCCTGCATTTATGCAAGATGGCCTTTTTGCCATCGACAGCTTCCTCCC
TTGTCCCCACCGGCCATCCGCTCCGCAAG
Transcript length: 157
Transcript exons: 20738743-20738855,20740880-20740923
GTGCCTGCAATGATTTTATCTAGACATATGCTGGTGCTGAGTCCATTGCTTGCCTTGATGTCGG
ATCAACTGAGGAAGCTCCCTGCATTTATGCAAGATGGCCTTTTTGCGAGCGACAGCTTCCTCCC
TTGTCCCCACCGGCCATCCGCTCCGCAAG
Transcript length: 159
Transcript exons: 20738743-20738846,20740869-20740923
GTGCCTGCAATGATTTTATCTAGACATATGCTGGTGCTGAGTCCATTGCTTGCCTTGATGTCGG
ATCAACTGAGGAAGCTCCCTGCATTTATGCAAGATGGCCTGTCAAGACCATCGACAGCTTCCTC
CCTTGTCCCCACCGGCCATCCGCTCCGCAAG
Transcript length: 159
Transcript exons: 20738743-20738853,20740876-20740923
GTGCCTGCAATGATTTTATCTAGACATATGCTGGTGCTGAGTCCATTGCTTGCCTTGATGTCGG
ATCAACTGAGGAAGCTCCCTGCATTTATGCAAGATGGCCTTTTTGCGCCATCGACAGCTTCCTC
CCTTGTCCCCACCGGCCATCCGCTCCGCAAG
Transcript length: 166
Transcript exons: 20738743-20738853,20740869-20740923
GTGCCTGCAATGATTTTATCTAGACATATGCTGGTGCTGAGTCCATTGCTTGCCTTGATGTCGG
ATCAACTGAGGAAGCTCCCTGCATTTATGCAAGATGGCCTTTTTGCGGTCAAGACCATCGACAG
CTTCCTCCCTTGTCCCCACCGGCCATCCGCTCCGCAAG
Transcript length: 168
Transcript exons: 20738743-20738857,20740871-20740923
GTGCCTGCAATGATTTTATCTAGACATATGCTGGTGCTGAGTCCATTGCTTGCCTTGATGTCGG
ATCAACTGAGGAAGCTCCCTGCATTTATGCAAGATGGCCTTTTTGCGAGCACAAGACCATCGAC
AGCTTCCTCCCTTGTCCCCACCGGCCATCCGCTCCGCAAG
Transcript length: 169
Transcript exons: 20738743-20738853,20740866-20740923
GTGCCTGCAATGATTTTATCTAGACATATGCTGGTGCTGAGTCCATTGCTTGCCTTGATGTCGG
ATCAACTGAGGAAGCTCCCTGCATTTATGCAAGATGGCCTTTTTGCGGCTGTCAAGACCATCGA
CAGCTTCCTCCCTTGTCCCCACCGGCCATCCGCTCCGCAAG
Transcript length: 170
Transcript exons: 20738743-20738840,20740852-20740923
GTGCCTGCAATGATTTTATCTAGACATATGCTGGTGCTGAGTCCATTGCTTGCCTTGATGTCGG
ATCAACTGAGGAAGCTCCCTGCATTTATGCAAGACCTTTTTGGTGTGGGCTGTCAAGACCATCG
ACAGCTTCCTCCCTTGTCCCCACCGGCCATCCGCTCCGCAAG
Transcript length: 171
Transcript exons: 20738743-20738844,20740855-20740923
GTGCCTGCAATGATTTTATCTAGACATATGCTGGTGCTGAGTCCATTGCTTGCCTTGATGTCGG
ATCAACTGAGGAAGCTCCCTGCATTTATGCAAGATGGCTTTTGGTGTGGGCTGTCAAGACCATC
GACAGCTTCCTCCCTTGTCCCCACCGGCCATCCGCTCCGCAAG
Transcript length: 172
Transcript exons: 20738743-20738869,20740879-20740923
GTGCCTGCAATGATTTTATCTAGACATATGCTGGTGCTGAGTCCATTGCTTGCCTTGATGTCGG
ATCAACTGAGGAAGCTCCCTGCATTTATGCAAGATGGCCTTTTTGCGAGCAGTTAGGTAAGGGT
CGACAGCTTCCTCCCTTGTCCCCACCGGCCATCCGCTCCGCAAG
Transcript length: 173
Transcript exons: 20738743-20738846,20740855-20740923
GTGCCTGCAATGATTTTATCTAGACATATGCTGGTGCTGAGTCCATTGCTTGCCTTGATGTCGG
ATCAACTGAGGAAGCTCCCTGCATTTATGCAAGATGGCCTTTTTGGTGTGGGCTGTCAAGACCA
TCGACAGCTTCCTCCCTTGTCCCCACCGGCCATCCGCTCCGCAAG
Transcript length: 173
Transcript exons: 20738743-20738853,20740862-20740923
GTGCCTGCAATGATTTTATCTAGACATATGCTGGTGCTGAGTCCATTGCTTGCCTTGATGTCGG
ATCAACTGAGGAAGCTCCCTGCATTTATGCAAGATGGCCTTTTTGCGGTGGGCTGTCAAGACCA
TCGACAGCTTCCTCCCTTGTCCCCACCGGCCATCCGCTCCGCAAG
Transcript length: 175
Transcript exons: 20738743-20738844,20740851-20740923
GTGCCTGCAATGATTTTATCTAGACATATGCTGGTGCTGAGTCCATTGCTTGCCTTGATGTCGG
ATCAACTGAGGAAGCTCCCTGCATTTATGCAAGATGGCGCCTTTTTGGTGTGGGCTGTCAAGAC
CATCGACAGCTTCCTCCCTTGTCCCCACCGGCCATCCGCTCCGCAAG
Transcript length: 175
Transcript exons: 20738743-20738853,20740860-20740923
GTGCCTGCAATGATTTTATCTAGACATATGCTGGTGCTGAGTCCATTGCTTGCCTTGATGTCGG
ATCAACTGAGGAAGCTCCCTGCATTTATGCAAGATGGCCTTTTTGCGGTGTGGGCTGTCAAGAC
CATCGACAGCTTCCTCCCTTGTCCCCACCGGCCATCCGCTCCGCAAG
Transcript length: 175
Transcript exons: 20738743-20738857,20740864-20740923
GTGCCTGCAATGATTTTATCTAGACATATGCTGGTGCTGAGTCCATTGCTTGCCTTGATGTCGG
ATCAACTGAGGAAGCTCCCTGCATTTATGCAAGATGGCCTTTTTGCGAGCAGGGCTGTCAAGAC
CATCGACAGCTTCCTCCCTTGTCCCCACCGGCCATCCGCTCCGCAAG
Transcript length: 175
Transcript exons: 20738743-20738873,20740880-20740923
GTGCCTGCAATGATTTTATCTAGACATATGCTGGTGCTGAGTCCATTGCTTGCCTTGATGTCGG
ATCAACTGAGGAAGCTCCCTGCATTTATGCAAGATGGCCTTTTTGCGAGCAGTTAGGTAAGGGC
AGACGACAGCTTCCTCCCTTGTCCCCACCGGCCATCCGCTCCGCAAG
Transcript length: 177
Transcript exons: 20738743-20738863,20740868-20740923
GTGCCTGCAATGATTTTATCTAGACATATGCTGGTGCTGAGTCCATTGCTTGCCTTGATGTCGG
ATCAACTGAGGAAGCTCCCTGCATTTATGCAAGATGGCCTTTTTGCGAGCAGTTAGGTGTCAAG
ACCATCGACAGCTTCCTCCCTTGTCCCCACCGGCCATCCGCTCCGCAAG
Transcript length: 178
Transcript exons: 20738743-20738851,20740855-20740923
GTGCCTGCAATGATTTTATCTAGACATATGCTGGTGCTGAGTCCATTGCTTGCCTTGATGTCGG
ATCAACTGAGGAAGCTCCCTGCATTTATGCAAGATGGCCTTTTTGTTTTGGTGTGGGCTGTCAA
GACCATCGACAGCTTCCTCCCTTGTCCCCACCGGCCATCCGCTCCGCAAG
Transcript length: 180
Transcript exons: 20738743-20738852,20740854-20740923
GTGCCTGCAATGATTTTATCTAGACATATGCTGGTGCTGAGTCCATTGCTTGCCTTGATGTCGG
ATCAACTGAGGAAGCTCCCTGCATTTATGCAAGATGGCCTTTTTGCTTTTTGGTGTGGGCTGTC
AAGACCATCGACAGCTTCCTCCCTTGTCCCCACCGGCCATCCGCTCCGCAAG
Transcript length: 181
Transcript exons: 20738743-20738839,20740840-20740923
GTGCCTGCAATGATTTTATCTAGACATATGCTGGTGCTGAGTCCATTGCTTGCCTTGATGTCGG
ATCAACTGAGGAAGCTCCCTGCATTTATGCAAGGCACCATCGGTGCCTTTTTGGTGTGGGCTGT
CAAGACCATCGACAGCTTCCTCCCTTGTCCCCACCGGCCATCCGCTCCGCAAG
Transcript length: 181
Transcript exons: 20738743-20738850,20740851-20740923
GTGCCTGCAATGATTTTATCTAGACATATGCTGGTGCTGAGTCCATTGCTTGCCTTGATGTCGG
ATCAACTGAGGAAGCTCCCTGCATTTATGCAAGATGGCCTTTTTGCCTTTTTGGTGTGGGCTGT
CAAGACCATCGACAGCTTCCTCCCTTGTCCCCACCGGCCATCCGCTCCGCAAG
Transcript length: 181
Transcript exons: 20738743-20738869,20740870-20740923
GTGCCTGCAATGATTTTATCTAGACATATGCTGGTGCTGAGTCCATTGCTTGCCTTGATGTCGG
ATCAACTGAGGAAGCTCCCTGCATTTATGCAAGATGGCCTTTTTGCGAGCAGTTAGGTAAGGGT
CAAGACCATCGACAGCTTCCTCCCTTGTCCCCACCGGCCATCCGCTCCGCAAG
Transcript length: 182
Transcript exons: 20738743-20738846,20740846-20740923
GTGCCTGCAATGATTTTATCTAGACATATGCTGGTGCTGAGTCCATTGCTTGCCTTGATGTCGG
ATCAACTGAGGAAGCTCCCTGCATTTATGCAAGATGGCCTTCGGTGCCTTTTTGGTGTGGGCTG
TCAAGACCATCGACAGCTTCCTCCCTTGTCCCCACCGGCCATCCGCTCCGCAAG
Transcript length: 183
Transcript exons: 20738743-20738863,20740862-20740923
GTGCCTGCAATGATTTTATCTAGACATATGCTGGTGCTGAGTCCATTGCTTGCCTTGATGTCGG
ATCAACTGAGGAAGCTCCCTGCATTTATGCAAGATGGCCTTTTTGCGAGCAGTTAGGGTGGGCT
GTCAAGACCATCGACAGCTTCCTCCCTTGTCCCCACCGGCCATCCGCTCCGCAAG
Transcript length: 185
Transcript exons: 20738743-20738845,20740842-20740923
GTGCCTGCAATGATTTTATCTAGACATATGCTGGTGCTGAGTCCATTGCTTGCCTTGATGTCGG
ATCAACTGAGGAAGCTCCCTGCATTTATGCAAGATGGCCACCATCGGTGCCTTTTTGGTGTGGG
CTGTCAAGACCATCGACAGCTTCCTCCCTTGTCCCCACCGGCCATCCGCTCCGCAAG
Transcript length: 185
Transcript exons: 20738743-20738853,20740850-20740923
GTGCCTGCAATGATTTTATCTAGACATATGCTGGTGCTGAGTCCATTGCTTGCCTTGATGTCGG
ATCAACTGAGGAAGCTCCCTGCATTTATGCAAGATGGCCTTTTTGCGTGCCTTTTTGGTGTGGG
CTGTCAAGACCATCGACAGCTTCCTCCCTTGTCCCCACCGGCCATCCGCTCCGCAAG
Transcript length: 188
Transcript exons: 20738743-20738853,20740847-20740923
GTGCCTGCAATGATTTTATCTAGACATATGCTGGTGCTGAGTCCATTGCTTGCCTTGATGTCGG
ATCAACTGAGGAAGCTCCCTGCATTTATGCAAGATGGCCTTTTTGCGCGGTGCCTTTTTGGTGT
GGGCTGTCAAGACCATCGACAGCTTCCTCCCTTGTCCCCACCGGCCATCCGCTCCGCAAG
Transcript length: 188
Transcript exons: 20738743-20738861,20740855-20740923
GTGCCTGCAATGATTTTATCTAGACATATGCTGGTGCTGAGTCCATTGCTTGCCTTGATGTCGG
ATCAACTGAGGAAGCTCCCTGCATTTATGCAAGATGGCCTTTTTGCGAGCAGTTATTTTGGTGT
GGGCTGTCAAGACCATCGACAGCTTCCTCCCTTGTCCCCACCGGCCATCCGCTCCGCAAG
Transcript length: 189
Transcript exons: 20738743-20738863,20740856-20740923
GTGCCTGCAATGATTTTATCTAGACATATGCTGGTGCTGAGTCCATTGCTTGCCTTGATGTCGG
ATCAACTGAGGAAGCTCCCTGCATTTATGCAAGATGGCCTTTTTGCGAGCAGTTAGGTTTGGTG
TGGGCTGTCAAGACCATCGACAGCTTCCTCCCTTGTCCCCACCGGCCATCCGCTCCGCAAG
Transcript length: 190
Transcript exons: 20738743-20738863,20740855-20740923
GTGCCTGCAATGATTTTATCTAGACATATGCTGGTGCTGAGTCCATTGCTTGCCTTGATGTCGG
ATCAACTGAGGAAGCTCCCTGCATTTATGCAAGATGGCCTTTTTGCGAGCAGTTAGGTTTTGGT
GTGGGCTGTCAAGACCATCGACAGCTTCCTCCCTTGTCCCCACCGGCCATCCGCTCCGCAAG
Transcript length: 191
Transcript exons: 20738743-20738849,20740840-20740923
GTGCCTGCAATGATTTTATCTAGACATATGCTGGTGCTGAGTCCATTGCTTGCCTTGATGTCGG
ATCAACTGAGGAAGCTCCCTGCATTTATGCAAGATGGCCTTTTGCACCATCGGTGCCTTTTTGG
TGTGGGCTGTCAAGACCATCGACAGCTTCCTCCCTTGTCCCCACCGGCCATCCGCTCCGCAAG
Transcript length: 191
Transcript exons: 20738743-20738855,20740846-20740923
GTGCCTGCAATGATTTTATCTAGACATATGCTGGTGCTGAGTCCATTGCTTGCCTTGATGTCGG
ATCAACTGAGGAAGCTCCCTGCATTTATGCAAGATGGCCTTTTTGCGAGTCGGTGCCTTTTTGG
TGTGGGCTGTCAAGACCATCGACAGCTTCCTCCCTTGTCCCCACCGGCCATCCGCTCCGCAAG
Transcript length: 192
Transcript exons: 20738743-20738849,20740839-20740923
GTGCCTGCAATGATTTTATCTAGACATATGCTGGTGCTGAGTCCATTGCTTGCCTTGATGTCGG
ATCAACTGAGGAAGCTCCCTGCATTTATGCAAGATGGCCTTTTAGCACCATCGGTGCCTTTTTG
GTGTGGGCTGTCAAGACCATCGACAGCTTCCTCCCTTGTCCCCACCGGCCATCCGCTCCGCAAG
Transcript length: 192
Transcript exons: 20738743-20738863,20740853-20740923
GTGCCTGCAATGATTTTATCTAGACATATGCTGGTGCTGAGTCCATTGCTTGCCTTGATGTCGG
ATCAACTGAGGAAGCTCCCTGCATTTATGCAAGATGGCCTTTTTGCGAGCAGTTAGGCTTTTTG
GTGTGGGCTGTCAAGACCATCGACAGCTTCCTCCCTTGTCCCCACCGGCCATCCGCTCCGCAAG
Transcript length: 194
Transcript exons: 20738743-20738850,20740838-20740923
GTGCCTGCAATGATTTTATCTAGACATATGCTGGTGCTGAGTCCATTGCTTGCCTTGATGTCGG
ATCAACTGAGGAAGCTCCCTGCATTTATGCAAGATGGCCTTTTTCAGCACCATCGGTGCCTTTT
TGGTGTGGGCTGTCAAGACCATCGACAGCTTCCTCCCTTGTCCCCACCGGCCATCCGCTCCGCA
AG
Transcript length: 197
Transcript exons: 20738743-20738853,20740838-20740923
GTGCCTGCAATGATTTTATCTAGACATATGCTGGTGCTGAGTCCATTGCTTGCCTTGATGTCGG
ATCAACTGAGGAAGCTCCCTGCATTTATGCAAGATGGCCTTTTTGCGCAGCACCATCGGTGCCT
TTTTGGTGTGGGCTGTCAAGACCATCGACAGCTTCCTCCCTTGTCCCCACCGGCCATCCGCTCC
GCAAG
Transcript length: 197
Transcript exons: 20738743-20738862,20740847-20740923
GTGCCTGCAATGATTTTATCTAGACATATGCTGGTGCTGAGTCCATTGCTTGCCTTGATGTCGG
ATCAACTGAGGAAGCTCCCTGCATTTATGCAAGATGGCCTTTTTGCGAGCAGTTAGCGGTGCCT
TTTTGGTGTGGGCTGTCAAGACCATCGACAGCTTCCTCCCTTGTCCCCACCGGCCATCCGCTCC
GCAAG
Transcript length: 199
Transcript exons: 20738743-20738862,20740845-20740923
GTGCCTGCAATGATTTTATCTAGACATATGCTGGTGCTGAGTCCATTGCTTGCCTTGATGTCGG
ATCAACTGAGGAAGCTCCCTGCATTTATGCAAGATGGCCTTTTTGCGAGCAGTTAGATCGGTGC
CTTTTTGGTGTGGGCTGTCAAGACCATCGACAGCTTCCTCCCTTGTCCCCACCGGCCATCCGCT
CCGCAAG
Transcript length: 200
Transcript exons: 20738743-20738886,20740868-20740923
GTGCCTGCAATGATTTTATCTAGACATATGCTGGTGCTGAGTCCATTGCTTGCCTTGATGTCGG
ATCAACTGAGGAAGCTCCCTGCATTTATGCAAGATGGCCTTTTTGCGAGCAGTTAGGTAAGGGC
AGAATGTTCACAGTTGTGTCAAGACCATCGACAGCTTCCTCCCTTGTCCCCACCGGCCATCCGC
TCCGCAAG
Transcript length: 201
Transcript exons: 20738743-20738862,20740843-20740923
GTGCCTGCAATGATTTTATCTAGACATATGCTGGTGCTGAGTCCATTGCTTGCCTTGATGTCGG
ATCAACTGAGGAAGCTCCCTGCATTTATGCAAGATGGCCTTTTTGCGAGCAGTTAGCCATCGGT
GCCTTTTTGGTGTGGGCTGTCAAGACCATCGACAGCTTCCTCCCTTGTCCCCACCGGCCATCCG
CTCCGCAAG
Transcript length: 203
Transcript exons: 20738743-20738863,20740842-20740923
GTGCCTGCAATGATTTTATCTAGACATATGCTGGTGCTGAGTCCATTGCTTGCCTTGATGTCGG
ATCAACTGAGGAAGCTCCCTGCATTTATGCAAGATGGCCTTTTTGCGAGCAGTTAGGACCATCG
GTGCCTTTTTGGTGTGGGCTGTCAAGACCATCGACAGCTTCCTCCCTTGTCCCCACCGGCCATC
CGCTCCGCAAG
Transcript length: 204
Transcript exons: 20738743-20738862,20740840-20740923
GTGCCTGCAATGATTTTATCTAGACATATGCTGGTGCTGAGTCCATTGCTTGCCTTGATGTCGG
ATCAACTGAGGAAGCTCCCTGCATTTATGCAAGATGGCCTTTTTGCGAGCAGTTAGGCACCATC
GGTGCCTTTTTGGTGTGGGCTGTCAAGACCATCGACAGCTTCCTCCCTTGTCCCCACCGGCCAT
CCGCTCCGCAAG
Transcript length: 204
Transcript exons: 20738743-20738863,20740841-20740923
GTGCCTGCAATGATTTTATCTAGACATATGCTGGTGCTGAGTCCATTGCTTGCCTTGATGTCGG
ATCAACTGAGGAAGCTCCCTGCATTTATGCAAGATGGCCTTTTTGCGAGCAGTTAGGCACCATC
GGTGCCTTTTTGGTGTGGGCTGTCAAGACCATCGACAGCTTCCTCCCTTGTCCCCACCGGCCAT
CCGCTCCGCAAG
Transcript length: 205
Transcript exons: 20738743-20738862,20740839-20740923
GTGCCTGCAATGATTTTATCTAGACATATGCTGGTGCTGAGTCCATTGCTTGCCTTGATGTCGG
ATCAACTGAGGAAGCTCCCTGCATTTATGCAAGATGGCCTTTTTGCGAGCAGTTAGAGCACCAT
CGGTGCCTTTTTGGTGTGGGCTGTCAAGACCATCGACAGCTTCCTCCCTTGTCCCCACCGGCCA
TCCGCTCCGCAAG
Transcript length: 206
Transcript exons: 20738743-20738863,20740839-20740923
GTGCCTGCAATGATTTTATCTAGACATATGCTGGTGCTGAGTCCATTGCTTGCCTTGATGTCGG
ATCAACTGAGGAAGCTCCCTGCATTTATGCAAGATGGCCTTTTTGCGAGCAGTTAGGAGCACCA
TCGGTGCCTTTTTGGTGTGGGCTGTCAAGACCATCGACAGCTTCCTCCCTTGTCCCCACCGGCC
ATCCGCTCCGCAAG
Transcript length: 206
Transcript exons: 20738743-20738873,20740849-20740923
GTGCCTGCAATGATTTTATCTAGACATATGCTGGTGCTGAGTCCATTGCTTGCCTTGATGTCGG
ATCAACTGAGGAAGCTCCCTGCATTTATGCAAGATGGCCTTTTTGCGAGCAGTTAGGTAAGGGC
AGAGTGCCTTTTTGGTGTGGGCTGTCAAGACCATCGACAGCTTCCTCCCTTGTCCCCACCGGCC
ATCCGCTCCGCAAG
Transcript length: 212
Transcript exons: 20738743-20738868,20740838-20740923
GTGCCTGCAATGATTTTATCTAGACATATGCTGGTGCTGAGTCCATTGCTTGCCTTGATGTCGG
ATCAACTGAGGAAGCTCCCTGCATTTATGCAAGATGGCCTTTTTGCGAGCAGTTAGGTAAGGCA
GCACCATCGGTGCCTTTTTGGTGTGGGCTGTCAAGACCATCGACAGCTTCCTCCCTTGTCCCCA
CCGGCCATCCGCTCCGCAAG
Transcript length: 296
Transcript exons: 20738743-20738957,20740843-20740923
GTGCCTGCAATGATTTTATCTAGACATATGCTGGTGCTGAGTCCATTGCTTGCCTTGATGTCGG
ATCAACTGAGGAAGCTCCCTGCATTTATGCAAGATGGCCTTTTTGCGAGCAGTTAGGTAAGGGC
AGAATGTTCACAGTTGCTGCTTGTGCTATTAATTCTAATTTTGATCATTATGTTACACTAATGA
CTATGGGAGCAGCCGCATTCTGCCCATCGGTGCCTTTTTGGTGTGGGCTGTCAAGACCATCGAC
AGCTTCCTCCCTTGTCCCCACCGGCCATCCGCTCCGCAAG

Transcript length: 332
Transcript exons: 20738743-20738862,20740387-20740515,20740841-20740923
GTGCCTGCAATGATTTTATCTAGACATATGCTGGTGCTGAGTCCATTGCTTGCCTTGATGTCGG
ATCAACTGAGGAAGCTCCCTGCATTTATGCAAGATGGCCTTTTTGCGAGCAGTTAGGAGCACAA
GTGGACTAGGACTGAGCATGCTAATTCAAACAGGCATCCAGTGTGAACTATGTGGGGCTGTGGG
CAAATTCAGTAAATAACCTGCTCGTGGCAAATTGAGGACTAAAATTTTGATTTTGAGCACCATC
GGTGCCTTTTTGGTGTGGGCTGTCAAGACCATCGACAGCTTCCTCCCTTGTCCCCACCGGCCAT
CCGCTCCGCAAG
						
					

						Genomic sequence
						
							GTGCCTGCAATGATTTTATCTAGACATATGCTGGTGCTGAGTCCATTGCTTGCCTTGATGTCGG
ATCAACTGAGGAAGCTCCCTGCATTTATGCAAGATGGCCTTTTTGCGAGCAGTTAGGTAAGGGC
AGAATGTTCACAGTTGCTGCTTGTGCTATTAATTCTAATTTTGATCATTATGTTACACTAATGA
CTATGGGAGCAGCCGCATTCTGCATCGCACCGTTGGGTCGGATGCTTTCTGCACGCAGCATAGG
GGCCCATATGCTTCCAGACAACTTGCTATCACCTAATCCCATTATTCTAGACAACTGCATTATA
ATTTGACTTTGTGTTGTTTGACAAATTTGTCAGATTTAGGCATGAGTTATGAACTCCTTGTATG
GTGCTAAAAAATTTTGGGCATATATATGACGTGCAAAGAGTAGTTTAGACCCAATGAAACTTTG
TAGAGTATTATTGTTTATGCCTGCAGTTGCTTCAAAGAGAACAAATTCAATCTATCTCTGTTGA
TTGTGTTTCTTTTCAAGCCACCTTATAATTTTTAGCACCTAATGAAGCCAACTCTTCTATTGGG
TATTTCAAGGAAGATATGTGGATCTAGCTTTCAAAATAGAAATTGTTTCTGGTGGCTGTGCCTG
TGTATCCTTAGTTGCTGCTTAGGATAAATAAGTCTGCATGGCTCATATCATCATCTGGAATATT
TTTGTTTCATATCATCTGAATTTCAATTAATAAAGTCTGCATCCGGTTCTATTTCACTATTGGT
GGTTTCTAACAGTCAATGATACTTGAAATCGAGTTTGTAGTCTGCATCTGGTTCTACATTCTTT
GGTGGCCTCAAATTGTTATCACATATGCAGATTCACTATTGGTGGCCTCAAAGTGTTATCACAT
ATGCAGATTCACTATTGAGTCTGTGATAATTAATTATTTGTTATGACATTTCTGTTATATCTTA
TATACTCCCTTCTTTGTAATTAACAGTAATGGAATTATTGTTAGTTCAATTTGAACCAACCAAC
ATATCATATAATAAAAACAAATGGAGCATGAAAATAGCATTTTTCGAGGTTGTGACTAAATCCC
TTGAACAAAGAACTTTAAAATAGAAAGGGAAACAAGAACTAATTCAGCTTATGTGACTGCTTGT
TGCAGGCCGTTGATGTTTTGTGAGTAAGAGCTGGAGATAAAATTTGAACTTGTCAGTGCTGTTT
TTTCCGTTTTGCTATTTGCCCAGCCAGTGCCCAATGCTGTTAATTGTACTGTTCAATGCTGATT
TGTTAAAAACCATAAATTTAACTAACACAATTTTTTTGGAGACAATGATTTTTTTCTAAAGTAG
GGGAATGACACCCTAGAGTGAGTTTGTTTTTCTATGTATGACATCACTCACCAGAGTCATCTTA
TATGATTATGAGTTAATCACGATATCTTTTTTATAGATCAGGAGAACATATTCTTATCATCTCT
ATGGTTAATCTGTATAGTTATAGATAATAGAGGGTTTGTCCATATTCCACATATAGGAAGTTAT
TTTTATTTTCATTTTACTTCTCAGTATTAGCTGAAATGTTAATTTATTTGGCTGCTTCAAAGTG
AGTCTGACTGGTGTGTACAAATTTACATAAAACTGAATATGAAGGAGCACAAGTGGACTAGGAC
TGAGCATGCTAATTCAAACAGGCATCCAGTGTGAACTATGTGGGGCTGTGGGCAAATTCAGTAA
ATAACCTGCTCGTGGCAAATTGAGGACTAAAATTTTGATTTTGAGGTATACGATCTGATCTCTT
CGCACCTTCAATTTTGTCTTCTTAGGTGTGTCATGTAAGTACCAGATTAATACGTGATAGATTG
AGGTATAGTCATTGACAGTTTGCCACTGAAATGGAGTCTTTTGGGTGATGGCTTGCATTTCAAA
ATGCACTGGTATAATATGAAAATTGCACAGAACAAGCATTGACATTTTTCATGTACAAACAAGT
TTAAAAATGTTATGCAGCTATGTTGTTTCCAAGTTTAGCATATGTATCTAAGAAAGCTATGTTA
TTACTTATTGTAAATTGTGGAGATAACATGTAATGTTTTGATTTATGCAGCACCATCGGTGCCT
TTTTGGTGTGGGCTGTCAAGACCATCGACAGCTTCCTCCCTTGTCCCCACCGGCCATCCGCTCC
GCAAG
						
					

			
		

Sequences
Splice junction sequence	TGTTTTGATTTATGCAGCACCATCGGTGCCTTTTTGGTGTGGGCTGTCAAGACCATCGACAGCT TCCTCCCTTGTCCCCACCGGCCATCCGCTCCGCAAGgtgcctgcaatgattttatctagacata tgctggtgctgagtccattgcttgccttgatgtcggatcaactgaggaagctccctgcatttat gcaagatg
Assembled circRNA sequence	Yes The sequence of a circRNA based on assembly using circseq-cup (Ye et al., 2016) or CIRI-full (Zheng and Zhao, 2018) or CIRCexplorer2 (Zhang et al., 2016).
Full-length trsnacripts	Transcript length: 128 Transcript exons: 20738743-20738826,20740880-20740923 GTGCCTGCAATGATTTTATCTAGACATATGCTGGTGCTGAGTCCATTGCTTGCCTTGATGTCGG ATCAACTGAGGAAGCTCCCTCGACAGCTTCCTCCCTTGTCCCCACCGGCCATCCGCTCCGCAAG Transcript length: 154 Transcript exons: 20738743-20738817,20740845-20740923 GTGCCTGCAATGATTTTATCTAGACATATGCTGGTGCTGAGTCCATTGCTTGCCTTGATGTCGG ATCAACTGAGGATCGGTGCCTTTTTGGTGTGGGCTGTCAAGACCATCGACAGCTTCCTCCCTTG TCCCCACCGGCCATCCGCTCCGCAAG Transcript length: 157 Transcript exons: 20738743-20738851,20740876-20740923 GTGCCTGCAATGATTTTATCTAGACATATGCTGGTGCTGAGTCCATTGCTTGCCTTGATGTCGG ATCAACTGAGGAAGCTCCCTGCATTTATGCAAGATGGCCTTTTTGCCATCGACAGCTTCCTCCC TTGTCCCCACCGGCCATCCGCTCCGCAAG Transcript length: 157 Transcript exons: 20738743-20738855,20740880-20740923 GTGCCTGCAATGATTTTATCTAGACATATGCTGGTGCTGAGTCCATTGCTTGCCTTGATGTCGG ATCAACTGAGGAAGCTCCCTGCATTTATGCAAGATGGCCTTTTTGCGAGCGACAGCTTCCTCCC TTGTCCCCACCGGCCATCCGCTCCGCAAG Transcript length: 159 Transcript exons: 20738743-20738846,20740869-20740923 GTGCCTGCAATGATTTTATCTAGACATATGCTGGTGCTGAGTCCATTGCTTGCCTTGATGTCGG ATCAACTGAGGAAGCTCCCTGCATTTATGCAAGATGGCCTGTCAAGACCATCGACAGCTTCCTC CCTTGTCCCCACCGGCCATCCGCTCCGCAAG Transcript length: 159 Transcript exons: 20738743-20738853,20740876-20740923 GTGCCTGCAATGATTTTATCTAGACATATGCTGGTGCTGAGTCCATTGCTTGCCTTGATGTCGG ATCAACTGAGGAAGCTCCCTGCATTTATGCAAGATGGCCTTTTTGCGCCATCGACAGCTTCCTC CCTTGTCCCCACCGGCCATCCGCTCCGCAAG Transcript length: 166 Transcript exons: 20738743-20738853,20740869-20740923 GTGCCTGCAATGATTTTATCTAGACATATGCTGGTGCTGAGTCCATTGCTTGCCTTGATGTCGG ATCAACTGAGGAAGCTCCCTGCATTTATGCAAGATGGCCTTTTTGCGGTCAAGACCATCGACAG CTTCCTCCCTTGTCCCCACCGGCCATCCGCTCCGCAAG Transcript length: 168 Transcript exons: 20738743-20738857,20740871-20740923 GTGCCTGCAATGATTTTATCTAGACATATGCTGGTGCTGAGTCCATTGCTTGCCTTGATGTCGG ATCAACTGAGGAAGCTCCCTGCATTTATGCAAGATGGCCTTTTTGCGAGCACAAGACCATCGAC AGCTTCCTCCCTTGTCCCCACCGGCCATCCGCTCCGCAAG Transcript length: 169 Transcript exons: 20738743-20738853,20740866-20740923 GTGCCTGCAATGATTTTATCTAGACATATGCTGGTGCTGAGTCCATTGCTTGCCTTGATGTCGG ATCAACTGAGGAAGCTCCCTGCATTTATGCAAGATGGCCTTTTTGCGGCTGTCAAGACCATCGA CAGCTTCCTCCCTTGTCCCCACCGGCCATCCGCTCCGCAAG Transcript length: 170 Transcript exons: 20738743-20738840,20740852-20740923 GTGCCTGCAATGATTTTATCTAGACATATGCTGGTGCTGAGTCCATTGCTTGCCTTGATGTCGG ATCAACTGAGGAAGCTCCCTGCATTTATGCAAGACCTTTTTGGTGTGGGCTGTCAAGACCATCG ACAGCTTCCTCCCTTGTCCCCACCGGCCATCCGCTCCGCAAG Transcript length: 171 Transcript exons: 20738743-20738844,20740855-20740923 GTGCCTGCAATGATTTTATCTAGACATATGCTGGTGCTGAGTCCATTGCTTGCCTTGATGTCGG ATCAACTGAGGAAGCTCCCTGCATTTATGCAAGATGGCTTTTGGTGTGGGCTGTCAAGACCATC GACAGCTTCCTCCCTTGTCCCCACCGGCCATCCGCTCCGCAAG Transcript length: 172 Transcript exons: 20738743-20738869,20740879-20740923 GTGCCTGCAATGATTTTATCTAGACATATGCTGGTGCTGAGTCCATTGCTTGCCTTGATGTCGG ATCAACTGAGGAAGCTCCCTGCATTTATGCAAGATGGCCTTTTTGCGAGCAGTTAGGTAAGGGT CGACAGCTTCCTCCCTTGTCCCCACCGGCCATCCGCTCCGCAAG Transcript length: 173 Transcript exons: 20738743-20738846,20740855-20740923 GTGCCTGCAATGATTTTATCTAGACATATGCTGGTGCTGAGTCCATTGCTTGCCTTGATGTCGG ATCAACTGAGGAAGCTCCCTGCATTTATGCAAGATGGCCTTTTTGGTGTGGGCTGTCAAGACCA TCGACAGCTTCCTCCCTTGTCCCCACCGGCCATCCGCTCCGCAAG Transcript length: 173 Transcript exons: 20738743-20738853,20740862-20740923 GTGCCTGCAATGATTTTATCTAGACATATGCTGGTGCTGAGTCCATTGCTTGCCTTGATGTCGG ATCAACTGAGGAAGCTCCCTGCATTTATGCAAGATGGCCTTTTTGCGGTGGGCTGTCAAGACCA TCGACAGCTTCCTCCCTTGTCCCCACCGGCCATCCGCTCCGCAAG Transcript length: 175 Transcript exons: 20738743-20738844,20740851-20740923 GTGCCTGCAATGATTTTATCTAGACATATGCTGGTGCTGAGTCCATTGCTTGCCTTGATGTCGG ATCAACTGAGGAAGCTCCCTGCATTTATGCAAGATGGCGCCTTTTTGGTGTGGGCTGTCAAGAC CATCGACAGCTTCCTCCCTTGTCCCCACCGGCCATCCGCTCCGCAAG Transcript length: 175 Transcript exons: 20738743-20738853,20740860-20740923 GTGCCTGCAATGATTTTATCTAGACATATGCTGGTGCTGAGTCCATTGCTTGCCTTGATGTCGG ATCAACTGAGGAAGCTCCCTGCATTTATGCAAGATGGCCTTTTTGCGGTGTGGGCTGTCAAGAC CATCGACAGCTTCCTCCCTTGTCCCCACCGGCCATCCGCTCCGCAAG Transcript length: 175 Transcript exons: 20738743-20738857,20740864-20740923 GTGCCTGCAATGATTTTATCTAGACATATGCTGGTGCTGAGTCCATTGCTTGCCTTGATGTCGG ATCAACTGAGGAAGCTCCCTGCATTTATGCAAGATGGCCTTTTTGCGAGCAGGGCTGTCAAGAC CATCGACAGCTTCCTCCCTTGTCCCCACCGGCCATCCGCTCCGCAAG Transcript length: 175 Transcript exons: 20738743-20738873,20740880-20740923 GTGCCTGCAATGATTTTATCTAGACATATGCTGGTGCTGAGTCCATTGCTTGCCTTGATGTCGG ATCAACTGAGGAAGCTCCCTGCATTTATGCAAGATGGCCTTTTTGCGAGCAGTTAGGTAAGGGC AGACGACAGCTTCCTCCCTTGTCCCCACCGGCCATCCGCTCCGCAAG Transcript length: 177 Transcript exons: 20738743-20738863,20740868-20740923 GTGCCTGCAATGATTTTATCTAGACATATGCTGGTGCTGAGTCCATTGCTTGCCTTGATGTCGG ATCAACTGAGGAAGCTCCCTGCATTTATGCAAGATGGCCTTTTTGCGAGCAGTTAGGTGTCAAG ACCATCGACAGCTTCCTCCCTTGTCCCCACCGGCCATCCGCTCCGCAAG Transcript length: 178 Transcript exons: 20738743-20738851,20740855-20740923 GTGCCTGCAATGATTTTATCTAGACATATGCTGGTGCTGAGTCCATTGCTTGCCTTGATGTCGG ATCAACTGAGGAAGCTCCCTGCATTTATGCAAGATGGCCTTTTTGTTTTGGTGTGGGCTGTCAA GACCATCGACAGCTTCCTCCCTTGTCCCCACCGGCCATCCGCTCCGCAAG Transcript length: 180 Transcript exons: 20738743-20738852,20740854-20740923 GTGCCTGCAATGATTTTATCTAGACATATGCTGGTGCTGAGTCCATTGCTTGCCTTGATGTCGG ATCAACTGAGGAAGCTCCCTGCATTTATGCAAGATGGCCTTTTTGCTTTTTGGTGTGGGCTGTC AAGACCATCGACAGCTTCCTCCCTTGTCCCCACCGGCCATCCGCTCCGCAAG Transcript length: 181 Transcript exons: 20738743-20738839,20740840-20740923 GTGCCTGCAATGATTTTATCTAGACATATGCTGGTGCTGAGTCCATTGCTTGCCTTGATGTCGG ATCAACTGAGGAAGCTCCCTGCATTTATGCAAGGCACCATCGGTGCCTTTTTGGTGTGGGCTGT CAAGACCATCGACAGCTTCCTCCCTTGTCCCCACCGGCCATCCGCTCCGCAAG Transcript length: 181 Transcript exons: 20738743-20738850,20740851-20740923 GTGCCTGCAATGATTTTATCTAGACATATGCTGGTGCTGAGTCCATTGCTTGCCTTGATGTCGG ATCAACTGAGGAAGCTCCCTGCATTTATGCAAGATGGCCTTTTTGCCTTTTTGGTGTGGGCTGT CAAGACCATCGACAGCTTCCTCCCTTGTCCCCACCGGCCATCCGCTCCGCAAG Transcript length: 181 Transcript exons: 20738743-20738869,20740870-20740923 GTGCCTGCAATGATTTTATCTAGACATATGCTGGTGCTGAGTCCATTGCTTGCCTTGATGTCGG ATCAACTGAGGAAGCTCCCTGCATTTATGCAAGATGGCCTTTTTGCGAGCAGTTAGGTAAGGGT CAAGACCATCGACAGCTTCCTCCCTTGTCCCCACCGGCCATCCGCTCCGCAAG Transcript length: 182 Transcript exons: 20738743-20738846,20740846-20740923 GTGCCTGCAATGATTTTATCTAGACATATGCTGGTGCTGAGTCCATTGCTTGCCTTGATGTCGG ATCAACTGAGGAAGCTCCCTGCATTTATGCAAGATGGCCTTCGGTGCCTTTTTGGTGTGGGCTG TCAAGACCATCGACAGCTTCCTCCCTTGTCCCCACCGGCCATCCGCTCCGCAAG Transcript length: 183 Transcript exons: 20738743-20738863,20740862-20740923 GTGCCTGCAATGATTTTATCTAGACATATGCTGGTGCTGAGTCCATTGCTTGCCTTGATGTCGG ATCAACTGAGGAAGCTCCCTGCATTTATGCAAGATGGCCTTTTTGCGAGCAGTTAGGGTGGGCT GTCAAGACCATCGACAGCTTCCTCCCTTGTCCCCACCGGCCATCCGCTCCGCAAG Transcript length: 185 Transcript exons: 20738743-20738845,20740842-20740923 GTGCCTGCAATGATTTTATCTAGACATATGCTGGTGCTGAGTCCATTGCTTGCCTTGATGTCGG ATCAACTGAGGAAGCTCCCTGCATTTATGCAAGATGGCCACCATCGGTGCCTTTTTGGTGTGGG CTGTCAAGACCATCGACAGCTTCCTCCCTTGTCCCCACCGGCCATCCGCTCCGCAAG Transcript length: 185 Transcript exons: 20738743-20738853,20740850-20740923 GTGCCTGCAATGATTTTATCTAGACATATGCTGGTGCTGAGTCCATTGCTTGCCTTGATGTCGG ATCAACTGAGGAAGCTCCCTGCATTTATGCAAGATGGCCTTTTTGCGTGCCTTTTTGGTGTGGG CTGTCAAGACCATCGACAGCTTCCTCCCTTGTCCCCACCGGCCATCCGCTCCGCAAG Transcript length: 188 Transcript exons: 20738743-20738853,20740847-20740923 GTGCCTGCAATGATTTTATCTAGACATATGCTGGTGCTGAGTCCATTGCTTGCCTTGATGTCGG ATCAACTGAGGAAGCTCCCTGCATTTATGCAAGATGGCCTTTTTGCGCGGTGCCTTTTTGGTGT GGGCTGTCAAGACCATCGACAGCTTCCTCCCTTGTCCCCACCGGCCATCCGCTCCGCAAG Transcript length: 188 Transcript exons: 20738743-20738861,20740855-20740923 GTGCCTGCAATGATTTTATCTAGACATATGCTGGTGCTGAGTCCATTGCTTGCCTTGATGTCGG ATCAACTGAGGAAGCTCCCTGCATTTATGCAAGATGGCCTTTTTGCGAGCAGTTATTTTGGTGT GGGCTGTCAAGACCATCGACAGCTTCCTCCCTTGTCCCCACCGGCCATCCGCTCCGCAAG Transcript length: 189 Transcript exons: 20738743-20738863,20740856-20740923 GTGCCTGCAATGATTTTATCTAGACATATGCTGGTGCTGAGTCCATTGCTTGCCTTGATGTCGG ATCAACTGAGGAAGCTCCCTGCATTTATGCAAGATGGCCTTTTTGCGAGCAGTTAGGTTTGGTG TGGGCTGTCAAGACCATCGACAGCTTCCTCCCTTGTCCCCACCGGCCATCCGCTCCGCAAG Transcript length: 190 Transcript exons: 20738743-20738863,20740855-20740923 GTGCCTGCAATGATTTTATCTAGACATATGCTGGTGCTGAGTCCATTGCTTGCCTTGATGTCGG ATCAACTGAGGAAGCTCCCTGCATTTATGCAAGATGGCCTTTTTGCGAGCAGTTAGGTTTTGGT GTGGGCTGTCAAGACCATCGACAGCTTCCTCCCTTGTCCCCACCGGCCATCCGCTCCGCAAG Transcript length: 191 Transcript exons: 20738743-20738849,20740840-20740923 GTGCCTGCAATGATTTTATCTAGACATATGCTGGTGCTGAGTCCATTGCTTGCCTTGATGTCGG ATCAACTGAGGAAGCTCCCTGCATTTATGCAAGATGGCCTTTTGCACCATCGGTGCCTTTTTGG TGTGGGCTGTCAAGACCATCGACAGCTTCCTCCCTTGTCCCCACCGGCCATCCGCTCCGCAAG Transcript length: 191 Transcript exons: 20738743-20738855,20740846-20740923 GTGCCTGCAATGATTTTATCTAGACATATGCTGGTGCTGAGTCCATTGCTTGCCTTGATGTCGG ATCAACTGAGGAAGCTCCCTGCATTTATGCAAGATGGCCTTTTTGCGAGTCGGTGCCTTTTTGG TGTGGGCTGTCAAGACCATCGACAGCTTCCTCCCTTGTCCCCACCGGCCATCCGCTCCGCAAG Transcript length: 192 Transcript exons: 20738743-20738849,20740839-20740923 GTGCCTGCAATGATTTTATCTAGACATATGCTGGTGCTGAGTCCATTGCTTGCCTTGATGTCGG ATCAACTGAGGAAGCTCCCTGCATTTATGCAAGATGGCCTTTTAGCACCATCGGTGCCTTTTTG GTGTGGGCTGTCAAGACCATCGACAGCTTCCTCCCTTGTCCCCACCGGCCATCCGCTCCGCAAG Transcript length: 192 Transcript exons: 20738743-20738863,20740853-20740923 GTGCCTGCAATGATTTTATCTAGACATATGCTGGTGCTGAGTCCATTGCTTGCCTTGATGTCGG ATCAACTGAGGAAGCTCCCTGCATTTATGCAAGATGGCCTTTTTGCGAGCAGTTAGGCTTTTTG GTGTGGGCTGTCAAGACCATCGACAGCTTCCTCCCTTGTCCCCACCGGCCATCCGCTCCGCAAG Transcript length: 194 Transcript exons: 20738743-20738850,20740838-20740923 GTGCCTGCAATGATTTTATCTAGACATATGCTGGTGCTGAGTCCATTGCTTGCCTTGATGTCGG ATCAACTGAGGAAGCTCCCTGCATTTATGCAAGATGGCCTTTTTCAGCACCATCGGTGCCTTTT TGGTGTGGGCTGTCAAGACCATCGACAGCTTCCTCCCTTGTCCCCACCGGCCATCCGCTCCGCA AG Transcript length: 197 Transcript exons: 20738743-20738853,20740838-20740923 GTGCCTGCAATGATTTTATCTAGACATATGCTGGTGCTGAGTCCATTGCTTGCCTTGATGTCGG ATCAACTGAGGAAGCTCCCTGCATTTATGCAAGATGGCCTTTTTGCGCAGCACCATCGGTGCCT TTTTGGTGTGGGCTGTCAAGACCATCGACAGCTTCCTCCCTTGTCCCCACCGGCCATCCGCTCC GCAAG Transcript length: 197 Transcript exons: 20738743-20738862,20740847-20740923 GTGCCTGCAATGATTTTATCTAGACATATGCTGGTGCTGAGTCCATTGCTTGCCTTGATGTCGG ATCAACTGAGGAAGCTCCCTGCATTTATGCAAGATGGCCTTTTTGCGAGCAGTTAGCGGTGCCT TTTTGGTGTGGGCTGTCAAGACCATCGACAGCTTCCTCCCTTGTCCCCACCGGCCATCCGCTCC GCAAG Transcript length: 199 Transcript exons: 20738743-20738862,20740845-20740923 GTGCCTGCAATGATTTTATCTAGACATATGCTGGTGCTGAGTCCATTGCTTGCCTTGATGTCGG ATCAACTGAGGAAGCTCCCTGCATTTATGCAAGATGGCCTTTTTGCGAGCAGTTAGATCGGTGC CTTTTTGGTGTGGGCTGTCAAGACCATCGACAGCTTCCTCCCTTGTCCCCACCGGCCATCCGCT CCGCAAG Transcript length: 200 Transcript exons: 20738743-20738886,20740868-20740923 GTGCCTGCAATGATTTTATCTAGACATATGCTGGTGCTGAGTCCATTGCTTGCCTTGATGTCGG ATCAACTGAGGAAGCTCCCTGCATTTATGCAAGATGGCCTTTTTGCGAGCAGTTAGGTAAGGGC AGAATGTTCACAGTTGTGTCAAGACCATCGACAGCTTCCTCCCTTGTCCCCACCGGCCATCCGC TCCGCAAG Transcript length: 201 Transcript exons: 20738743-20738862,20740843-20740923 GTGCCTGCAATGATTTTATCTAGACATATGCTGGTGCTGAGTCCATTGCTTGCCTTGATGTCGG ATCAACTGAGGAAGCTCCCTGCATTTATGCAAGATGGCCTTTTTGCGAGCAGTTAGCCATCGGT GCCTTTTTGGTGTGGGCTGTCAAGACCATCGACAGCTTCCTCCCTTGTCCCCACCGGCCATCCG CTCCGCAAG Transcript length: 203 Transcript exons: 20738743-20738863,20740842-20740923 GTGCCTGCAATGATTTTATCTAGACATATGCTGGTGCTGAGTCCATTGCTTGCCTTGATGTCGG ATCAACTGAGGAAGCTCCCTGCATTTATGCAAGATGGCCTTTTTGCGAGCAGTTAGGACCATCG GTGCCTTTTTGGTGTGGGCTGTCAAGACCATCGACAGCTTCCTCCCTTGTCCCCACCGGCCATC CGCTCCGCAAG Transcript length: 204 Transcript exons: 20738743-20738862,20740840-20740923 GTGCCTGCAATGATTTTATCTAGACATATGCTGGTGCTGAGTCCATTGCTTGCCTTGATGTCGG ATCAACTGAGGAAGCTCCCTGCATTTATGCAAGATGGCCTTTTTGCGAGCAGTTAGGCACCATC GGTGCCTTTTTGGTGTGGGCTGTCAAGACCATCGACAGCTTCCTCCCTTGTCCCCACCGGCCAT CCGCTCCGCAAG Transcript length: 204 Transcript exons: 20738743-20738863,20740841-20740923 GTGCCTGCAATGATTTTATCTAGACATATGCTGGTGCTGAGTCCATTGCTTGCCTTGATGTCGG ATCAACTGAGGAAGCTCCCTGCATTTATGCAAGATGGCCTTTTTGCGAGCAGTTAGGCACCATC GGTGCCTTTTTGGTGTGGGCTGTCAAGACCATCGACAGCTTCCTCCCTTGTCCCCACCGGCCAT CCGCTCCGCAAG Transcript length: 205 Transcript exons: 20738743-20738862,20740839-20740923 GTGCCTGCAATGATTTTATCTAGACATATGCTGGTGCTGAGTCCATTGCTTGCCTTGATGTCGG ATCAACTGAGGAAGCTCCCTGCATTTATGCAAGATGGCCTTTTTGCGAGCAGTTAGAGCACCAT CGGTGCCTTTTTGGTGTGGGCTGTCAAGACCATCGACAGCTTCCTCCCTTGTCCCCACCGGCCA TCCGCTCCGCAAG Transcript length: 206 Transcript exons: 20738743-20738863,20740839-20740923 GTGCCTGCAATGATTTTATCTAGACATATGCTGGTGCTGAGTCCATTGCTTGCCTTGATGTCGG ATCAACTGAGGAAGCTCCCTGCATTTATGCAAGATGGCCTTTTTGCGAGCAGTTAGGAGCACCA TCGGTGCCTTTTTGGTGTGGGCTGTCAAGACCATCGACAGCTTCCTCCCTTGTCCCCACCGGCC ATCCGCTCCGCAAG Transcript length: 206 Transcript exons: 20738743-20738873,20740849-20740923 GTGCCTGCAATGATTTTATCTAGACATATGCTGGTGCTGAGTCCATTGCTTGCCTTGATGTCGG ATCAACTGAGGAAGCTCCCTGCATTTATGCAAGATGGCCTTTTTGCGAGCAGTTAGGTAAGGGC AGAGTGCCTTTTTGGTGTGGGCTGTCAAGACCATCGACAGCTTCCTCCCTTGTCCCCACCGGCC ATCCGCTCCGCAAG Transcript length: 212 Transcript exons: 20738743-20738868,20740838-20740923 GTGCCTGCAATGATTTTATCTAGACATATGCTGGTGCTGAGTCCATTGCTTGCCTTGATGTCGG ATCAACTGAGGAAGCTCCCTGCATTTATGCAAGATGGCCTTTTTGCGAGCAGTTAGGTAAGGCA GCACCATCGGTGCCTTTTTGGTGTGGGCTGTCAAGACCATCGACAGCTTCCTCCCTTGTCCCCA CCGGCCATCCGCTCCGCAAG Transcript length: 296 Transcript exons: 20738743-20738957,20740843-20740923 GTGCCTGCAATGATTTTATCTAGACATATGCTGGTGCTGAGTCCATTGCTTGCCTTGATGTCGG ATCAACTGAGGAAGCTCCCTGCATTTATGCAAGATGGCCTTTTTGCGAGCAGTTAGGTAAGGGC AGAATGTTCACAGTTGCTGCTTGTGCTATTAATTCTAATTTTGATCATTATGTTACACTAATGA CTATGGGAGCAGCCGCATTCTGCCCATCGGTGCCTTTTTGGTGTGGGCTGTCAAGACCATCGAC AGCTTCCTCCCTTGTCCCCACCGGCCATCCGCTCCGCAAG Transcript length: 332 Transcript exons: 20738743-20738862,20740387-20740515,20740841-20740923 GTGCCTGCAATGATTTTATCTAGACATATGCTGGTGCTGAGTCCATTGCTTGCCTTGATGTCGG ATCAACTGAGGAAGCTCCCTGCATTTATGCAAGATGGCCTTTTTGCGAGCAGTTAGGAGCACAA GTGGACTAGGACTGAGCATGCTAATTCAAACAGGCATCCAGTGTGAACTATGTGGGGCTGTGGG CAAATTCAGTAAATAACCTGCTCGTGGCAAATTGAGGACTAAAATTTTGATTTTGAGCACCATC GGTGCCTTTTTGGTGTGGGCTGTCAAGACCATCGACAGCTTCCTCCCTTGTCCCCACCGGCCAT CCGCTCCGCAAG
Genomic sequence	GTGCCTGCAATGATTTTATCTAGACATATGCTGGTGCTGAGTCCATTGCTTGCCTTGATGTCGG ATCAACTGAGGAAGCTCCCTGCATTTATGCAAGATGGCCTTTTTGCGAGCAGTTAGGTAAGGGC AGAATGTTCACAGTTGCTGCTTGTGCTATTAATTCTAATTTTGATCATTATGTTACACTAATGA CTATGGGAGCAGCCGCATTCTGCATCGCACCGTTGGGTCGGATGCTTTCTGCACGCAGCATAGG GGCCCATATGCTTCCAGACAACTTGCTATCACCTAATCCCATTATTCTAGACAACTGCATTATA ATTTGACTTTGTGTTGTTTGACAAATTTGTCAGATTTAGGCATGAGTTATGAACTCCTTGTATG GTGCTAAAAAATTTTGGGCATATATATGACGTGCAAAGAGTAGTTTAGACCCAATGAAACTTTG TAGAGTATTATTGTTTATGCCTGCAGTTGCTTCAAAGAGAACAAATTCAATCTATCTCTGTTGA TTGTGTTTCTTTTCAAGCCACCTTATAATTTTTAGCACCTAATGAAGCCAACTCTTCTATTGGG TATTTCAAGGAAGATATGTGGATCTAGCTTTCAAAATAGAAATTGTTTCTGGTGGCTGTGCCTG TGTATCCTTAGTTGCTGCTTAGGATAAATAAGTCTGCATGGCTCATATCATCATCTGGAATATT TTTGTTTCATATCATCTGAATTTCAATTAATAAAGTCTGCATCCGGTTCTATTTCACTATTGGT GGTTTCTAACAGTCAATGATACTTGAAATCGAGTTTGTAGTCTGCATCTGGTTCTACATTCTTT GGTGGCCTCAAATTGTTATCACATATGCAGATTCACTATTGGTGGCCTCAAAGTGTTATCACAT ATGCAGATTCACTATTGAGTCTGTGATAATTAATTATTTGTTATGACATTTCTGTTATATCTTA TATACTCCCTTCTTTGTAATTAACAGTAATGGAATTATTGTTAGTTCAATTTGAACCAACCAAC ATATCATATAATAAAAACAAATGGAGCATGAAAATAGCATTTTTCGAGGTTGTGACTAAATCCC TTGAACAAAGAACTTTAAAATAGAAAGGGAAACAAGAACTAATTCAGCTTATGTGACTGCTTGT TGCAGGCCGTTGATGTTTTGTGAGTAAGAGCTGGAGATAAAATTTGAACTTGTCAGTGCTGTTT TTTCCGTTTTGCTATTTGCCCAGCCAGTGCCCAATGCTGTTAATTGTACTGTTCAATGCTGATT TGTTAAAAACCATAAATTTAACTAACACAATTTTTTTGGAGACAATGATTTTTTTCTAAAGTAG GGGAATGACACCCTAGAGTGAGTTTGTTTTTCTATGTATGACATCACTCACCAGAGTCATCTTA TATGATTATGAGTTAATCACGATATCTTTTTTATAGATCAGGAGAACATATTCTTATCATCTCT ATGGTTAATCTGTATAGTTATAGATAATAGAGGGTTTGTCCATATTCCACATATAGGAAGTTAT TTTTATTTTCATTTTACTTCTCAGTATTAGCTGAAATGTTAATTTATTTGGCTGCTTCAAAGTG AGTCTGACTGGTGTGTACAAATTTACATAAAACTGAATATGAAGGAGCACAAGTGGACTAGGAC TGAGCATGCTAATTCAAACAGGCATCCAGTGTGAACTATGTGGGGCTGTGGGCAAATTCAGTAA ATAACCTGCTCGTGGCAAATTGAGGACTAAAATTTTGATTTTGAGGTATACGATCTGATCTCTT CGCACCTTCAATTTTGTCTTCTTAGGTGTGTCATGTAAGTACCAGATTAATACGTGATAGATTG AGGTATAGTCATTGACAGTTTGCCACTGAAATGGAGTCTTTTGGGTGATGGCTTGCATTTCAAA ATGCACTGGTATAATATGAAAATTGCACAGAACAAGCATTGACATTTTTCATGTACAAACAAGT TTAAAAATGTTATGCAGCTATGTTGTTTCCAAGTTTAGCATATGTATCTAAGAAAGCTATGTTA TTACTTATTGTAAATTGTGGAGATAACATGTAATGTTTTGATTTATGCAGCACCATCGGTGCCT TTTTGGTGTGGGCTGTCAAGACCATCGACAGCTTCCTCCCTTGTCCCCACCGGCCATCCGCTCC GCAAG

			
						 Conservation Information
					
						Conserved circRNAs
						
							osi_circ_006256* osi_circ_000659 osi_circ_015495 osi_circ_015494 
						
						PMCS
						0.493503657

Conservation Information
Conserved circRNAs	osi_circ_006256* osi_circ_000659 osi_circ_015495 osi_circ_015494
PMCS	0.493503657

			
						 Functional Information
					
						Coding potential
						N
					
						Potential coding position
						
							NA
						
						Potential amino acid sequence
						
							NA
						
						Sponge-miRNAs
						
							NA						
					
						circRNA-miRNA-mRNA network
						 VISUALIZATION
					
						Potential function description
						responsive to Pi-starvation

Functional Information
Coding potential	N
Potential coding position	NA
Potential amino acid sequence	NA
Sponge-miRNAs	NA
circRNA-miRNA-mRNA network	VISUALIZATION
Potential function description	responsive to Pi-starvation

			
						 Other Information
					
						References
						Lu et al., 2015;Ye et al., 2015;Chu et al., 2017; this study

circRNA

Detail information of Os05g0422900_circ_g.1

Address

Any questions?

Supported by