Splice junction sequence |
CGAAAGCATTTTGATTCCATTTGACCTGTACAATGACTCTGCTCAACATGCACTAACTTCTCTC AAGCAGAGATTTCTTTATGATGAAATTGAAGCTGAGatttttctgagcaccagatgggccatct tgttaaatttgcatgctgagatgtttcggacaaatacgtatcccactttctgtgtttgaacatc acaattgt
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Assembled circRNA sequence |
Yes
The sequence of a circRNA based on assembly using circseq-cup (Ye et al., 2016) or CIRI-full (Zheng and Zhao, 2018) or CIRCexplorer2 (Zhang et al., 2016).
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Full-length trsnacripts |
Transcript length: 1485 Transcript exons: 9579415-9579479,9579867-9580062,9580195-9580353,9580775- 9580861,9581182-9581382,9582360-9582571,9582797-9582944, 9583523-9583691,9583910-9583986,9584141-9584311 ATTTTTCTGAGCACCAGATGGGCCATCTTGTTAAATTTGCATGCTGAGATGTTTCGGACAAATA CCGTTGAGGATATTCTACAGGTTCTTATAGTATTTTGTGTGGAGTCATTGGAATTGGACTTTGC TCTTCTTTTTCCTGAGCGCCATACCCTACTTCGTGTCCTCCCAGTTTTGGTTGTCCTAGCAACC TCATCAGAGAAGGAGAGTGAGTCACTTTATAAAAGGGTGAAGATAAATCGTCTTCTCAATGTTT TTAAGAATGATCCAGTGATCCCGGCATTTCCAGATCTGCATCTTTCTCCTGCTGCAATTTTGAA GGAATTGTCATCATATTTTCAAAATTTTTCCAGTCAAACTCGTCTCCTTGCTCTTCAAGCGCCT CATGAAATTCAGGGTCGTGAGCTACAAGAATATCCTAGGCATTACTTGATTTTGAATCACATGG GAACTATCAGAGCTGATCATGACGACTTCTCTATACGTTTTGCCTCTGCTATGGATCAGATGAT AAGGTTGAAGTCATCAGATGGTGTGTATAATGACTGGTCCCGCGATATCAAAGGGAACATGTAT GATATTGTTGTTGAAGGCTTCCAGCTTCTTAGTCGTTGGACTGGCAGGATTTGGGAACAATGTG CATGGAAATTCTCTCGCCCTATTTCAGATTCTCAACAAAACTCCATGACATGTTTTGACTATGA AAAGGTAGTACGCTATAACTATACTGCTGAAGAACGAAGGGCTCTGCTTGAATTAATTGGTTAC ATAAAGAGTATTGGATTGATGATGCAGCATTGTGATACTTTAGTGTCTGAAGCTTTGTGGGAAA CGATACACATGGAGGTCCAAGATTTTGTACAGGATAAACTTGATACTATGCTTCGTACAACATT TAGAAAGAAGAAGGACCTTTCCCGGATTCTCTCTGATATGCGGACCCTCTCAGCAGATTGGATG GCCAGCACTAGTAAAGCAGACCCAGAGCAGCACTCGCTACACCAAGAAACTGAGGAAATGAGAC AAAACACATTTTACCCAAGACCAGTTGCACCAACAGCTGCACAGATTCATTGTTTGCAATTTCT TATATGTGAACTTGTATCTGGTGGTAATCTGAGAAAAGTTGGAGGACTATTTGGGAATAGTGGC TCTGGCATACCTGTGGAAGATCTTAAACAACTAGAGACATTTTTCTACAAGCTTAGTTTTTTCT TGCATATTTTGGATTATACAGCGACTATTGGTACTCTAACTGATCTTGGATTTCTTTGGTTCAG AGAATTTTACCTTGAATCTTCTCGTGTCATTCAGTTTCCAATTGAATGCTCGCTCCCGTGGATG CTGGTGGGCCATGTCATTGAATCAGAAGATGCTGGTCTTCTCGAAAGCATTTTGATTCCATTTG ACCTGTACAATGACTCTGCTCAACATGCACTAACTTCTCTCAAGCAGAGATTTCTTTATGATGA AATTGAAGCTGAG
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Genomic sequence |
ATTTTTCTGAGCACCAGATGGGCCATCTTGTTAAATTTGCATGCTGAGATGTTTCGGACAAATA CGTATCCCACTTTCTGTGTTTGAACATCACAATTGTTTGCTTTTTATAAGCATTCTATATGAGC TCTTTCAGATGATTCTGTTGCTAGTTATAGGAAAAATATGCACTTCCAAAATTGATAAGTTTTG ATACATTTACAACAAAAATCCTGTTTCTTGTAAGTTCTCTTGCTGTTCATAATATGAATCTGCA CACCAGTATCGTAGATTGTGTGCTTTTACCTGAGTTTTCTAAGTAGCTGATTGTTAGTTCATGT AAGGTTTCAGATGGCTATAAAATCGGCTTGCTGCTATGCACCTGTTATGCTAAAACAGATTAAT TTTCACAGCTGTGGTTGCTTCATTTTATTTGTCAATCTCTTGTTGATGTCCTTATCTTAAAACA ACAGCGTTGAGGATATTCTACAGGTTCTTATAGTATTTTGTGTGGAGTCATTGGAATTGGACTT TGCTCTTCTTTTTCCTGAGCGCCATACCCTACTTCGTGTCCTCCCAGTTTTGGTTGTCCTAGCA ACCTCATCAGAGAAGGAGAGTGAGTCACTTTATAAAAGGGTGAAGATAAATCGTCTTCTCAATG TTTTTAAGGTCTGGTCATCTCCTTGTAAATATCCACTTAAGTTTACTTATAATTAGAATTTTTG GAGGAGTTGATGTTTACCTGATTATGCTACTTCATATTTTTAAACTTCTTGTTGCTCTTACCTA TTTATTTTACAGAATGATCCAGTGATCCCGGCATTTCCAGATCTGCATCTTTCTCCTGCTGCAA TTTTGAAGGAATTGTCATCATATTTTCAAAATTTTTCCAGTCAAACTCGTCTCCTTGCTCTTCA AGCGCCTCATGAAATTCAGGGTCGTGAGCTACAAGAATATCCTTTCTGCTGAGTTTTCTAAATA ATTTTCACAAATGGGTTCAAACAAACGTTGGTTTCTTACCTGGACAGAATCCCTATTATGTACC AAAAACAGATCCCCATGATTTACTCCACATAAAGGCAAATGCAATTTCGTTAGAGCAGACAGCG CGGCCAGAATGAACTAAATTTGCATATGGTAGGTGAGAGTCATAGAGAATTAGGGAACTCATAC CCGTTAATGGAGGGGTGACTTTCAACCTGGGCGTCTGATACCATGTAGAGAATTAGGGAACATC TCACACCCCATTAAGGGAGGGGTGACTTTCATATAGTCAAGATACAATTTGGAGTACAACTAAA GTACATACACATCTCTAGGCTATACAGATTAATAGTAGGTCATAGTATGCTTGAAATTCCTTAA CTAAACCACTTATCAGAGGCATTACTTGATTTTGAATCACATGGGAACTATCAGAGCTGATCAT GACGACTTCTCTATACGTTTTGCCTCTGCTATGGATCAGGTAAAACTTACAATTTTTTTTCATT GCATCAGTATATTAATATTTTTTCCAAAATAACTGCAAAAATGATATTGCATGTCATGAACCAT CACTATCGGTCCTTATGGATGATAATCGCTGACTGAACATTGTTTCCACCATTGCTCCCAACTG AAGTCTCTACCTTTGGTTTGATGAAACATATATTTGCAATATACCATATTCCTTGAGTCATCAA AAGGAAAAGAACTCAAAAAAGTATTTCATTTGACACTGAGATAGTAACACTTCTTTGTCTTTGG TGTGCTCTTTCATCCATTGATATTGATTTGTTCTTTCAGATGATAAGGTTGAAGTCATCAGATG GTGTGTATAATGACTGGTCCCGCGATATCAAAGGGAACATGTATGATATTGTTGTTGAAGGCTT CCAGCTTCTTAGTCGTTGGACTGGCAGGATTTGGGAACAATGTGCATGGAAATTCTCTCGCCCT ATTTCAGATTCTCAACAAAACTCCATGACATGTTTTGACTATGAAAAGGTCTTATCTGCTTCAC TTAAAGCAGTTCTCACTTTTCTACAACTTCTGATTCCTTCTTGACTATTGGAGGCTTTTATTAG TTACATCATTCCATTTCCTTTTGTTGCTGCTTGTTTAAGTGGAGATCTTTTGTAAAGAAAATAA CGGTGTACTACTGTACTATAGCAGTATAACCATTCGGTTTCCTTGTAGTCAATGCTGCTGTGAA TTAGATTATGGCACCCTACTGTTCATTTTGGACCGACCAGGCGGTGCTAATTGGTAATTAGATT CTTAGTGTTTAGTTTCCTAATCTATCAGGTTTGTTTCGCTGTAAATATATTACATGTATTTTAT GTAAATCTTTTAAGTTAGGTCTATGAATGGGTAACATTCCACTGGTATTGAGAAAGAATTCCTT CTCTTTTATTTGTTATCTTTCAATCTCTTAGTTCTTTTATCTGAATATGTGCCTCTTGAGTCTT GAGGCCTCGGCAAATTTCAATATTTTATGAACCTTGGGGGTTATGTACATAGGGGTGGTAATGG ATCGCGATCCAAATGCTTCTTCACAAAATGGTAGGACCGTAAATAAATTTTAGTTCAAAAATGA ATAGAAATAGAGCTGATCCTAATCCAATCCGATCCTTAAATCTTATAGTGTAAAATTTAGAGCC CATTGTCACCCCTATATGTATATGAATGATTTTATCTTCAGTAAATGCCGCCTCATAACATTTT AGATGTTCTGTCACTCTGCTGCTTATAGTTCTCTTTATTACAATGTAAGCTTTGTTATTTAAGC ATGCATCATGGTGGAAATTGGAAAAGTTATGTTAGTAATCCGTTAGCATTGTGAAATTCTCTTT TGTTTTCCTTGATTTGTTTTTGGTCTTGTGATAAATCATTCCTTTATAACTTCAAAACTCATAA TGACTATACATTTTCACCTTTTTTTGTGTTCATGACTCGATGTTTATTGCTTATTTGCATTGCA GGTAGTACGCTATAACTATACTGCTGAAGAACGAAGGGCTCTGCTTGAATTAATTGGTTACATA AAGAGTATTGGATTGATGATGCAGCATTGTGATACTTTAGTGTCTGAAGCTTTGTGGGAAACGA TACACATGGAGGTCCAAGATTTTGTACAGGATAAACTTGATACTATGCTTCGTACAACATTTAG AAAGAAGAAGGACCTTTCCCGGTAAATAATTCTGTCTCTTGCAACCATCCTGTTATTTACTTCA CAGTGGACATTGTATATGTGCTATCCAAAGTTCCAATGGGTTCAGACATTTCTGATTCTCTGTT TTATTGATTTTGTGAATGGTAATCGTTGAACTGGTTCTTGTGTGACAATGTACTCCTATTTTGG GAATGGATTTGGAAAACTAAAAAGTTTTGCTCATTTTCCTTTGCATTCTTTCAGGATTCTCTCT GATATGCGGACCCTCTCAGCAGATTGGATGGCCAGCACTAGTAAAGCAGACCCAGAGCAGCACT CGCTACACCAAGAAACTGAGGAAATGAGACAAAACACATTTTACCCAAGACCAGTTGCACCAAC AGCTGCACAGGTTTCATTCATGTTTTTGAATTTTGAGTATGCAATGATCTATCAATTTAAGTTC TTAGCCCCTGCATTGCCTGACAGTTTGCGTTCGAACATTTCCCTCTGGTGCTCATACAATCATC TTCAAGACTGTAGAAGGCTAGGTGACAATGTTTTAGCTTTTAGGACAAACTGCATTGTTACTTT GTTGATATCAGTAGTATAAAATGGGAAAAGTACACAAGGAAATCATCTAGACTTGACTCATCTT TTCTGATTATTGACTTCAGTTTTGGAAAACTATCTTCACTGTTGAATTCAATAATGAACATCAT TATTGCACTCTCTTGAAAAGTAAATAAAAGGGTTTGTCTACAACTTTTATTCTTTGGAACATTT GTATTTTTGGCAGGGCGTTTTTGTGTGTGTATGTGTCAGAAAGTATCTCATTTTAACAATTAAC TGGTCTTAACAAACTGTTAAGTTGTCACTTTATTTATTTATTTATGCTGGAACATTTGTTGTAT TCTACTTAGAATGTCTTTTGTTTACTGCACTGCTGACGTAACTATTATTGTTGTACTTTTACCA ATATTTTTACAGATTCATTGTTTGCAATTTCTTATATGTGAACTTGTATCTGGTGGTAATCTGA GAAAAGTTGGAGGACTATTTGGGAATAGTGGCTCTGGCATACCTGTGGAAGATCTTAAACAACT AGAGACATTTTTCTACAAGCTTAGTTTTTTCTTGCATATTTTGGATTATACAGGTGCGTACTTG ATCTGAGTCAGTCTTAAAGGTAGCAATTCGCATGCACTTAAGAGTTCTGTGGTAACATTTCATA TGTTTCATATTTAAATTCAGGGGATATATTCAACTATCCTTCATTTCACTACTCTGAATTTCAG AAATTCATATTTACTGTTTGTTTATCCTGTTGCTTTGGAGACTACAATTAACTGCTACCCTTTT TTGGTATATATGCAGCGACTATTGGTACTCTAACTGATCTTGGATTTCTTTGGTTCAGAGAATT TTACCTTGAATCTTCTCGTGTCATTCAGGTGAGCATTTTTGTTTTCCTCTATTGAGTATAATGA AATTGTAGATGGGAGGAACTAGTAGTGAGAATTCGGATGTAGAATTTTTTAAGCAGCTTGTTGT AAATACTAACAGAGTAATAGTGCAGGCTAATACTAATTTATGCCTTGGTGACAGTTTCCAATTG AATGCTCGCTCCCGTGGATGCTGGTGGGCCATGTCATTGAATCAGAAGATGCTGGTCTTCTCGA AAGCATTTTGATTCCATTTGACCTGTACAATGACTCTGCTCAACATGCACTAACTTCTCTCAAG CAGAGATTTCTTTATGATGAAATTGAAGCTGAG |