Splice junction sequence |
AACAGATTCCTCACCGCAATATACAGAATTTCAAAAGTCCACTGTTGTTTGGGAATTCCTCAAA GGAAGGATATTGCCTGGTATAGCAGCATTGGATAAAagtacatgtcatcccttcttcaagtaga agtcatcccagtagatggtgcacctagttcaacatcatttaagcaagaagagtgggctcagaac agtattat
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Assembled circRNA sequence |
Yes
The sequence of a circRNA based on assembly using circseq-cup (Ye et al., 2016) or CIRI-full (Zheng and Zhao, 2018) or CIRCexplorer2 (Zhang et al., 2016).
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Full-length trsnacripts |
Transcript length: 950 Transcript exons: 240870323-240870666,240871443-240871728,240872557-240872 624,240873060-240873311 AGTACATGTCATCCCTTCTTCAAGTAGAAGTCATCCCAGTAGATGGTGCACCTAGTTCAACATC ATTTAAGCAAGAAGAGTGGGCTCAGAACAGTATTATTTTGTTTGAAAATCTTCTGAACTTCACA GGAGAAGTTGCTAATTGCAAAGATTTTTCTCAGAAGCTTGCTTCAGGTGCCATGATATTTGTCA ATGATTCTTTCTCACTGTCTCATAAGATTCTTGCATCAACTGTTGGGATCACGTGCTTCTGCTA TGCGTCTCTTGCTGGTTTCCATTTTGAAGAGGAGCTTATGAAATTGATAAAGATCACGGACTCC ACGAGGCGCCCATATATTGCCATTATTGGAGGCAGTAATTTCTTGAGAAAAGCACCTGCTCTTC AGACGTTAACCTGTCTATGCGATGGGTTGTTCTTTGTTGGAAAATTATCATTTCAAATAATGAA TGGTTTTGGAATGACAGTGCCCTCTCAATTCATAGAAAGAAATGCAGTTAAGGAAGTACTACAA ATTATTCAAGTTGCTAGGGATAGGAATATTCCTATTTATTATCCAACAGATCTCTGGTGCTTGA AAAATGGCGACAGTGAAATATCAGGGGTCATCAACTCTACCGGACAATTGGCTGGCTGGACACC AGCTGATATAGGACCATCGACATTGGAGAAGATTTCTTCTATAATTACATCATACAAGAAGATA CTGTGGATTGGCCCTACAAACTACGGTTTGACAGAAAAAAATTCAGTTGGTGGAACACAGTTGG GTGAAATACTGGAAAGTGCAAGCTCTGATGGCTGTGATGTTATTTTAGTGGGGGATGCAGCATG CAAGGCAGTAAAAAGAAAAACAGATTCCTCACCGCAATATACAGAATTTCAAAAGTCCACTGTT GTTTGGGAATTCCTCAAAGGAAGGATATTGCCTGGTATAGCAGCATTGGATAAA
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Genomic sequence |
AGTACATGTCATCCCTTCTTCAAGTAGAAGTCATCCCAGTAGATGGTGCACCTAGTTCAACATC ATTTAAGCAAGAAGAGTGGGCTCAGAACAGTATTATTTTGTTTGAAAATCTTCTGAACTTCACA GGAGAAGTTGCTAATTGCAAAGATTTTTCTCAGAAGCTTGCTTCAGGTGCCATGATATTTGTCA ATGATTCTTTCTCACTGTCTCATAAGATTCTTGCATCAACTGTTGGGATCACGTGCTTCTGCTA TGCGTCTCTTGCTGGTTTCCATTTTGAAGAGGAGCTTATGAAATTGATAAAGATCACGGACTCC ACGAGGCGCCCATATATTGCCATTGTAATCATTAACCTATTTTTTCCCGATGTATATGTAGCTG ACAGTCTTTATTCAAGATCTAGCTATCAAAAAGCAGTTGCCTATTGTTTTTTAATGAAATATGT TGCAGCTTTACTTCCAGTATTCTATCAATGTCTGTAAAGTATGCTAATTCAGGCTGTAAAGATG AATGACTTATTAAGAACAACCAAAATTTCATTTTCTTATCCTTCACATATCATAAGTCTCTGGA ATTAGACAACAAGTACTACTAATGTGCGACCCCCACTGTGTACTTATATAGAGTAGAATTTCCC TGAGGCTCTGTGAAGTACCCAATTAGCCAGAAGTATTGTATACTGGTGTTGTTTTTCTTTTAAG TGAGTGAATGCCACTTTAGGCATTATAGCGTAGTTCATATGCTAATAAGATAATAGCATTCTTT TTCTTAAGTTTTTGTTAGAAAGACCGATGCTATGAAATGGTATAATACATTTTTTCCTTCTGCA TTCTCAAGCTCATCTGCTAATGGGTAAAAAATAGCTAAATAAGTAAATATCCTCCGCTGTCACT TTCAGTTATGCTGGAGATTTATTCACCTGAAAACAATTGATTACTGATTACAGTAGATGAATAA TGGCAATTAAAAAAAGCCGTCCTAGCAGCTTGTGCTCCATATGAAGCATGTGCAACTAGAGGAT CCATATGTCACTACGAAGTACCATTTATAGCCAAAATCATGTAATCGCCTCCTATTTCCTGGAT TCTTTATTTCTGATTCCTTCTGGTTATTGCAGATTGGAGGCAGTAATTTCTTGAGAAAAGCACC TGCTCTTCAGACGTTAACCTGTCTATGCGATGGGTTGTTCTTTGTTGGAAAATTATCATTTCAA ATAATGAATGGTTTTGGAATGACAGTGCCCTCTCAATTCATAGAAAGAAATGCAGTTAAGGAAG TACTACAAATTATTCAAGTTGCTAGGGATAGGAATATTCCTATTTATTATCCAACAGATCTCTG GTGCTTGAAAAATGGCGACAGTGAAATATCAGGGGTCATCAACTCTACCGGACAATTGGCTGGT GAGAATTACTAGCAACTTTTCATGTCATTCACATATCTCAACTAACTTTCCTCTTGTAACATCT CTGAAATTGTGCTTCCCTTTAGTTTAGGACACCCGGTTTGCAAAACTACCTGTCAAAGTATATA TACTAGTAAAAGTGGAGCTCTATTGCATGCTGGCAAATTACACCATGCAGAAACATGCTGAATT GGATAGTTTGCAGCAACATGTTTATAATACTGACTTCTAGGAACTGAGCCTAATGCAATTTCCT TTTTCTTTATCTCTCTCTCTCCCTCCCTCTAAAAAAAATGAGCTACCAGTTGCCAAAGGGAGTA AGGGATCTGCATTTTGCAATGAGTTAAATGCATCGGTAGCCCCTGAACTTGTCAAGGAATGTCA CTTAGATCCATAAACTTTAAAAATGCATTTTTAGATCCTTAAACTTGTTAAGTGATATACCTCA CATCCCTAAACTTGTAAAAATGGTGCATCACAGGTCTATTTCTGAACCATACCGACTACTGCAG TGTGCCATTTAACAAGTTCAATGACCTAGAAATGCATTTTCAAAGTTTGTAGATCTAAGAGGCA CCACTTGATAAATTTAGGGACCGTTCATGCATTTAACTCCTTTTTGCAATTTATAGATCTGCAT GTGTCTCAGTGAGTCAGTGTCTGTAGAGTTTTTTCCATCTGCAAATTCTAGCATTTCCATTGCC CTTTAGCCATTTATTAAAAACACCTCAAGGGGTGATTGTGTTAAGAGTTGAAGTTGGAAGGGGC AGATAAACAATTACTTGAAGCAGTTCTAATACCTGTGATTTTTCAACACTTTGTTTAGGCTGGA CACCAGCTGATATAGGACCATCGACATTGGAGAAGATTTCTTCTATAATTACATCATACAAGGT AAGAAAATGGTATTACGGGAAACGTTGTTTCAGTTAGTTTCTGGGTTTTGTGCAATCGTCGTAA TTAGTTTTTACTTAAAAGCATTAGTTATTTCATATTTTTTTTTGCTTCTCGTGTAACTGCAATA TTTTTGTCAGTAATGAACTATGTGGTGTAAGGGAAATATTCAAGATAAAAAATATATCCAGATT AATTTGAAGGCTTCATTTTGATCGATGTGATAATTTGTGCTTGTGAACTGCCATGGATTGGATT TCACCTTCATTCCTTTCTTTTTGTGAGAACCCAAGCTATGGAATTGGCATGCAATTGGACCTTT TATCTTCCCTATTAATCAATGACATGCAGTTCTCTTATGTTTTTGTTTGAGAAATAACCATAAT CTTTTGCAGCCTGGACAACTTATGACATTTTTACATTTTTTTTGTACAGAAGATACTGTGGATT GGCCCTACAAACTACGGTTTGACAGAAAAAAATTCAGTTGGTGGAACACAGTTGGGTGAAATAC TGGAAAGTGCAAGCTCTGATGGCTGTGATGTTATTTTAGTGGGGGATGCAGCATGCAAGGCAGT AAAAAGAAAAACAGATTCCTCACCGCAATATACAGAATTTCAAAAGTCCACTGTTGTTTGGGAA TTCCTCAAAGGAAGGATATTGCCTGGTATAGCAGCATTGGATAAA |