Splice junction sequence |
TTGGCAAACCCGAGATCTCTCAAGCAAGTAAGTTCTAATGGCAGCACCAGATATCTTACCACTC TTGTCAAACTGGATTTCAACAAATTTACCAAATCGActtaaagcgagttgcaattgatgatttt gatgattttgtgttctcttctgttgctggtggaaataatcctgatacaaaagagcacttagaac cattaagt
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Assembled circRNA sequence |
Yes
The sequence of a circRNA based on assembly using circseq-cup (Ye et al., 2016) or CIRI-full (Zheng and Zhao, 2018) or CIRCexplorer2 (Zhang et al., 2016).
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Full-length trsnacripts |
Transcript length: 1087 Transcript exons: 159566345-159566512,159566631-159566757,159566863-159566 900,159568473-159568530,159568626-159568727,159568802-15 9568948,159569049-159569185,159569293-159569442,15956954 1-159569700 CTTAAAGCGAGTTGCAATTGATGATTTTGATGATTTTGTGTTCTCTTCTGTTGCTGGTGGAAAT AATCCTGATACAAAAGAGCACTTAGAACCATTAAGTAATTCTTGATGCTCTGCAACCACGTAGT CCTTGTTCTTGTCCAGGAATTGATCAGATTGATATGTTACATCCCCAGCATAATGTTGAATTGT AAATGCAGTACGAGAAAGCTTTGGTTTGGTAAATCTTTTGTGGGTCTTGAACTTTTCATACAGC TTCTGAGACAATGTCTCGTGTGTGGACTTTGGAAACATGCAGGCTTCATCAAGAAGTGCAATAA TGCCACCTGGTTTCTGATTAAAATGTTGCTGGAGTTTTTCATTGGTAAAATTGATGCACAGTTG TTCAAAACTGTTGGTTTTAAAACTTTCAAAACCATATATATCAAGTACTCCAATCAGTTTGTTA GAGTCTGGGTCTTGTCCTATTGATGCATTTATTCTGTTTACAAGCCACTCAAATAATCGAGAGT ATATCTGCTTTGCTAAACCATCCCGGCTAATAGTAGCAGAATTTGGACCAACTGTTGTGGTAAT CACTCCTTCGGGTGTATTAATTTCCCTTTTTATCAAGGCATTCTCTAACTTCTCACAATCACAC ATCAAGAGCTCTCCTGCTGTCTTAAGATGGAATCTAGATTTGTCATCCTTTATTATGGATGAAT CTACCTCTCTCCCTTTTGCAAAATTTATGTTTCCAAGATGAAGCACAGCAGCAACAACACGGAA TATAGCTTCCTGTTCTTGATCAGTGATTCCAACAGTATCCATTGCATTTCTTGTTGCAAGGTAC TCCTCAGCGTCATTGATTCCATCAACTTGAATGCAAGCTGACTGGTTGAGATAGTGAAAGGACG ATGGGTCCCCGAGCTTATACTTCTTAAGATCCTCCGATGGAGCTGCACATAGGAAGTAAAAGCA ATGGTAGTTCCTCTCTGGACTATTAATTTGGCAAACCCGAGATCTCTCAAGCAAGTAAGTTCTA ATGGCAGCACCAGATATCTTACCACTCTTGTCAAACTGGATTTCAACAAATTTACCAAATCGA
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Genomic sequence |
CTTAAAGCGAGTTGCAATTGATGATTTTGATGATTTTGTGTTCTCTTCTGTTGCTGGTGGAAAT AATCCTGATACAAAAGAGCACTTAGAACCATTAAGTAATTCTTGATGCTCTGCAACCACGTAGT CCTTGTTCTTGTCCAGGAATTGATCAGATTGATATGTTACCTAGGAAATAAAGAAGAAAAATGA TCATACTCATGCAAAAACATGAAAACTGAACAACAAGGAGTCGTATATATGGGTCAATATGTTT TTTTCTAAAATATGAGTGGGAAATACTTACATCCCCAGCATAATGTTGAATTGTAAATGCAGTA CGAGAAAGCTTTGGTTTGGTAAATCTTTTGTGGGTCTTGAACTTTTCATACAGCTTCTGAGACA ATGTCTCGTGTGTGGACTTTGGAAACATGCTGATGGATGCATTTCAGCACAGAAAGAAGGTAAC TGTCGTTAGATGCATGTATTCACAAAACTGATGCAAGAATGAAAATCATTGATTAATATGTGAA ACTCACCAGGCTTCATCAAGAAGTGCAATAATGCCACCTGGTTTCTGGACACAGAAAAACAATA GCTGACAATGAGAATGTGAAGGATAATAGGTGGAAATAAATAAGAATGAACAGAAAGAAGTCAA GAACACAAGTGTGTTGGTTACTGTCATGTGTAGGGCATTAGGTTTTTCTTCTCGGACACGCAGG AGAGCTGCGTACCTTTAATTAAAGAGAGGAAACAGACAGCGCCTTATTCTTGACCCCAGGGGAT CAAAAAGGGGTGGGGTGAATTTATCTGACAAAAGCTATGAATATAGTTCCCAAGTGTAGGGCAT TGTAGCCCTATGTAATACAGCTAGGCTGGGATAAACCAATACCATAGTAACCGCAAAGGCAATA CAACAACAACAACATAGCCTTTGTCCCAAGCAAGTTGGAGCAGGCTAAAGATGAAACCCACAAG AAACAAGGATAGAAAAAAAAAGACATCGAAAGGATAAAAGAAATACGGTAGAGTTAAGGGTAAA CAAAAAAATAGACAAACGTCCTGGTCGATATTCCACTCCTTAAGATCACCTATCCTTAGCTAAT TTCTTGGAGATATTCCACTCCTTAAGATCTCTCTTAACTGCCTCATCCCAAGTTAATTTAGGTC GACCCCTACCTCTTTTTACATTATCGACTCACTCTAAAACCCCTCTACGCACTAGCGCCACAGA AGGTCTTCTATGAACATGTCCAAAAAATCTCAACCGATGTTGAATCAATTTCTTCAATTTCTCC TCAATTGGTGCCACCCTGGTCCTATCCCGAATATCTTCGTTTCAGACTCTATCCCTTCTTGTGT GCCCACAAAACCAATGTAACATACACATCTCTGCTACACTCAGTTGCTGGACATGTCACCTTTT GTCGGCCAACATTCAGCACCGTATAACATTGCTGGACGAATCAACGTCCTATAGAACTTACCTT TAAGCTTATGTAGCACCCACTTGTCATAGAGGACACAAGAAGCATGACGCCATTTCAACCAACC GGCTGAAACTCTATGCCTAACATCTTCATCAATGTCACCATCTTTTTTTCCAATACGAGGTTCA ATGCAATATGCGAAAGGGCCTCTAGTCGAGTTGGTTAGGTGGTCCGAATAGCACTCCTCAGGTC CTGAATTCGACTCCCCATAGGAGCGAATTTCAGGTTGTGGTTAAAAAAATCCTCTCGTTTGTCC CACACCAAAGCAAAGGTCTAAGGCCCGGTCGTGGTCGCGATCGTTTCTCACATGGGCTACGGTG GCCGCTGTATATGGGTGGGGCAGGGGTTCGGGGGTTTTCTCGACCTGCGTGAGAATGTCTTCTT AATATAATGCTCGGGGGCTGTCTTAACCCCCGCAGGTCGAGTTTTTAGGTTCAATGCAATGTGT CTTATACAATAACCATTTCATACCTTTTCAATCAGGTCAAGTACATCTTGATTGTCAACAAACT CTATGTAACTCCAATTAATTTGCTCCCTTGTGTATTCCTCTTGTTCCATTTTGAAGACATTCTA CATAACAAGCACAAAGTATTAATTGGCTCATTCAAGCAATAAAAAGAAAGGTTCCACCAAAAAT ATAAGTTCCATAATACCTGATTAAAATGTTGCTGGAGTTTTTCATTGGTAAAATTGATGCACAG TTGTTCAAAACTGTTGGTACAGTCACATAAAAGTAGGAGTAAGCACCCCTCAAAAAGGTATTTT ATAGTACAAATTTGCTGCTCTTTTTAGAACTAATCAATTACCTGTTGGTTTTAAAACTTTCAAA ACCATATATATCAAGTACTCCAATCAGTTTGTTAGAGTCTGGGTCTTGTCCTATTGATGCATTT ATTCTGTTTACAAGCCTGCAATAGTATAAGTGTATGTACTTATAAAACAACTGCATAATTAGTA TGGAATACATTGCTAAGTCTATTACCACTCAAATAATCGAGAGTATATCTGCTTTGCTAAACCA TCCCGGCTAATAGTAGCAGAATTTGGACCAACTGTTGTGGTAATCACTCCTTCGGGTGTATTAA TTTCCCTTTTTATCAAGGCATTCTCTAACTTCTCACAATCACACCTGTAATGGGCATTCCAAGT GTAACATGGAATATAGATATGTACTATATAACATTAAAGTTTTGTGATGAGAAGTGGAGAACGG AAAACACTAGTCATACATCAAGAGCTCTCCTGCTGTCTTAAGATGGAATCTAGATTTGTCATCC TTTATTATGGATGAATCTACCTCTCTCCCTTTTGCAAAATTTATGTTTCCAAGATGAAGCACAG CAGCAACAACACGGAATATAGCTTCCTGTAAACAGTCATGCCAAGAAAAAGGAATTACTTACTG TCTAGCTCCTTTATCCACCCTGGAAGAACATTTTCTTACTGAACTGAAGTAGGAGGAATTTTTT AAACCTGTTCTTGATCAGTGATTCCAACAGTATCCATTGCATTTCTTGTTGCAAGGTACTCCTC AGCGTCATTGATTCCATCAACTTGAATGCAAGCTGACTGGTTGAGATAGTGAAAGGACGATGGG TCCCCGAGCTTATACTTCTTAAGATCCTGCAGCCACACATTTTCCGTGGAAACATGGCACGTGT AACAAGCTTGGGTAGAAGATCCGAAACAAATAATTACACCAAGGTTGGGAAAAAATTTACCTCC GATGGAGCTGCACATAGGAAGTAAAAGCAATGGTAGTTCCTCTCTGGACTATTAATTTGGCAAA CCCGAGATCTCTCAAGCAAGTAAGTTCTAATGGCAGCACCAGATATCTTACCACTCTTGTCAAA CTGGATTTCAACAAATTTACCAAATCGA |