Splice junction sequence |
GAAGGGTTATTTTCAGCATTTTGGGGATATTCATGGCTGCGGTTGTCACATATACTGTCATCAC TGATGGACTACCTTTTAGGAAGGAATTGTTGACACCgcttgggttatctacaaggaagcaaact gggttagttctgctgtgtgggtggttctgttgttttgctttggcaggtatttgactccttatat ttaatatt
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Assembled circRNA sequence |
Yes
The sequence of a circRNA based on assembly using circseq-cup (Ye et al., 2016) or CIRI-full (Zheng and Zhao, 2018) or CIRCexplorer2 (Zhang et al., 2016).
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Full-length trsnacripts |
Transcript length: 308 Transcript exons: 86537433-86537506,86537641-86537730,86537990-86538133 GCTTGGGTTATCTACAAGGAAGCAAACTGGGTTAGTTCTGCTGTGTGGGTGGTTCTGTTGTTTT GCTTTGGCAGTGCTGTCACTTGCGCTTATATTGTTAAGAAACTTCTTGAAGTAACATCTGCAGG GTCATCCCAAGATCCTCTTGACCTTCTATTTATCAGGCAAGGTAATCTATCCCAAAGAAAGTGC TCTTATGTTGTAATTGGAAGGGTTATTTTCAGCATTTTGGGGATATTCATGGCTGCGGTTGTCA CATATACTGTCATCACTGATGGACTACCTTTTAGGAAGGAATTGTTGACACC
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Genomic sequence |
GCTTGGGTTATCTACAAGGAAGCAAACTGGGTTAGTTCTGCTGTGTGGGTGGTTCTGTTGTTTT GCTTTGGCAGGTATTTGACTCCTTATATTTAATATTTTTGGACTCATTTTATAGCTTCTTTGTG TGCTTCTATACTTCTGTTTGACTGGATGGGTATTGTCGACTTGATGGTATCCACCCTTTTTTAT TCTTTTATTTTTTCAGTGCTGTCACTTGCGCTTATATTGTTAAGAAACTTCTTGAAGTAACATC TGCAGGGTCATCCCAAGATCCTCTTGACCTTCTATTTATCAGGTAGAGTGCCAAAATCTTCACG ACTAGTTATTTAGATTTATATACCTTGGGCTACTTAGCTAGCATACTTAAAGCCCCAGGTTAGA TGCTTCTAAATGTTGTCTGATATACTGAAGCAGCAAATTTTGTTCCACCATATTCCTTTCTGCT ACTCTGCATATTGTAGTCCCACATGTTGACCCTGTTGATTGAATGAGATATCCAACAAAATTAA GTCCTTGCTAATTTGTCTTGACATTTGTTCTTGAAACATTTTCAGGCAAGGTAATCTATCCCAA AGAAAGTGCTCTTATGTTGTAATTGGAAGGGTTATTTTCAGCATTTTGGGGATATTCATGGCTG CGGTTGTCACATATACTGTCATCACTGATGGACTACCTTTTAGGAAGGAATTGTTGACACC |