Splice junction sequence |
GCTGCAGAAAAATGTACTTACAGTCAAGATAGCAAGAAGACTACGTGTATCTACTAATTCTGGT GGAAGAGGCCCAGATCAATTATTGTTATCAACAAGGcttaatatacttcttgcgttatcctatg cagcacagtgttggaagtagagatggcaatttgtccaaagcagaaatctccataaaccctagaa caagcaaa
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Assembled circRNA sequence |
Yes
The sequence of a circRNA based on assembly using circseq-cup (Ye et al., 2016) or CIRI-full (Zheng and Zhao, 2018) or CIRCexplorer2 (Zhang et al., 2016).
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Full-length trsnacripts |
Transcript length: 2955 Transcript exons: 162755320-162755872,162756287-162756531,162756594-162758 671,162758942-162759020 CTTAATATACTTCTTGCGTTATCCTATGCAGCACAGTGTTGGAAGTAGAGATGGCAATTTGTCC AAAGCAGAAATCTCCATAAACCCTAGAACAAGCAAACACATTGAAGTGCACAGAGAGAGTAGAA GGCAAAGTGCGCACCTGCACTCCAAAAACCAGGGCACCAGCAAAAACGCCAGAGAGAGTCTCGA TGCCAAAGAGGTTCCATCAATGAGGGAGTCAGCATGACCAGAGCACCCCAAGGAATCATCTCCT TGATGGAAGAAGCATCAGTGCAAATCTTCACATAGGTTGCATAGTCAGGCTTGCTTGTTCACTC CATCAACCCAAGAATGGTGTTGAACTGCCTGCGAACCTCCTCCACCATCTTTAGGGCGACACTT CCAACACTCTTCATGGTCATGACAGAGAACCAGTACAAAAACATGTCTCCAACAATCAAACCAA TGAAAACCTTCAGGAGAGAACATCGACAACCTTCACTCCAGCTCTGCTAACGAAGGCACCAAAC AGCACCAGGGACACAAGAGCACCTGAACCAATGGCAAATCCCTTTCTAATAGCAACAGTTGTGT TGTCAGCAGCACCAAGAGCATAAGTTCTCTCAGATTTTGTGGCTCATTCCTGCCATCTCAACAA TACCACCAGCATTGTCACTGATTGGACCATCTCAGCAATATCATAGTGATGTTTGACCTTGACA GTGAATCAGTTAATTCTAGCAGAGCTGCTTTATGGAGCCTCTGATGCTAATGATATGGCAAGTC ATTGGAAATTTGGATTGGATAAAAAATAATCTTAAGCATATCTTGTACATGCCGACCATCCTGC ATTGCATATATCACGGCAAATCGATTGGAATGAAATAAAAAATCAATGGAAGCATGCAGGGAGA GGGCTCGGACTGGATCACCTTGTACATGTTGATCTTGGTGATCTGGTAGGAGACATCGCGCCAG GTGGTCTTGGCGACATTGTCGCTACTTCCTCTCCTCCCTTCTTTAGAGCAGCAGCACACCACCT CACTCGATGTTCTTGATGGAGCACGTGAGCGACACCCGCCCTGTGGACCCACCTATGTCGCGCA TGTCGAAGGTGACGGCGATGTAACCCCGCAGCGCAATGCCCTCCGCCATCCCCCTCAATATTAG TACTAAAATATTTGACAACTAATATCCTGATGTGAATTGAGTAGCGGATTTCTCACTCTAAAAT GAAGATACAATACTAAAAGCATTTAATAAATAATATTGGGAAAACATATGTTTTTGAAAGGCTG CAAGTTAATGTAAAAGGATAATTTATGATTGTAAGATGTCCAAAAACCGAGAAAGGAAACATTG CATTTAATCTGGACTTACAAGTACCCAAATTTAGGTATGACACTCAAATCTGGAACAACCCAAA CTATAGTTTCTTAGACTCCTGGTAACATGTAAAAGGATGGTTTACTCAACACGTCTTGATTTGA GTTTAAACATGATGTTGATTGTGTGGTGCTTGTCCTTGAATGAATATAATGAAGTAATTGTTGT TTCAGTTATCAGTGAAAATGATCTCCACAGAATGAAAGAAGACTACCTATAAAATTTTAAATGT AATGTTTTTCGATATTTTTTTAAATATAAATATTTCCAGATAAATGGACCAGTTGCATCCAACT ATTTGGCAGCTATAGGCTGCAATAGAAGAGGAGTCAGTGTAAAAACGAGCTTTTTGTTGCACAC GGAGCAAATTCGTTCTTATCTATGTGATGCCCTGAACTTTGATATACTACCTATCTCAACTAAA AGCATAAGCCATTTGGCAAATACAAACACTTTTATTCAAAATATTCTTCTTTTAACCTTAGGTT TGTACTCACCAATGCCTACACTTTTAATCAAGGTTATTAAAACGACGAAACGTTGAAACGCTCA TGGGTAAGTTTTAACTTTTAAACGGTTTAAACAAAGTTTAAATGTAGTTTTAAACAACATAGGG AAATTTCAATATATCATAATTTCAGGCAATTATATCAAGTCAAATACCAAACAGTGGGACAGTC AGTCTCTGTACTCTGTAGTCCTGCCGCAGTGGGACAGCAGAGGCGGGGCTGGAGGGGCTGGCAG CCGGACAGGCGGCGCAGGAGGGAGGACGGCCTGGAGCGCGGCGGCCTGGAGCGGTGGCACGCAG AGGCTCTGAGGCGGGGCTGGAGGACGGCCTTGAGAGCAGCGGCCTGGAGCGGCCTGGAGAGCAG CGGCCTGGAGGGAGGACGGCCTGGAGAGCAGCTGACTGGAGCGGCGGCGGCCTGGAGCAGCGGC ACGCAGAGGCGGGCCTGGCGGCGCCGGACGGGCGGCGCAGGAGGGTTGGAGCAGCGGCGGCCTG GAGGCTGGAGCGCGCCCTGGAGTGCGACGGCTGGTGAGAACGCGAGTTACTAATTGGGCTGGTG AAAGTGCGGCTTGTAGCGGCGGTCTGGGTGGGCTGGGCGGGAGTTTCTAATTGGGCTGGGCCAA TTACTAGCAGCAGACGCATTAAACGCGGCGTTTCACTCTATACCGCGTTTAAACGTCAAAACGC GACGTTTAAACGACGTTAAACAACGTTTTACGACGAATCGTAAAACGTTTTGTCGTTTCACTTC CTGTCAGCGTTTTATAGTTTAAACGACGTTTAAACGTCGTTTTAACGTCGTTTTAATAAGCATG CTTTTAATGATTGTTCTCAATAACAGAAGTTGTAATAGCTGTTAAATTCTTTTGCCCTCATCTA CCTCAAATTCTGAAAAGAGAGAACATGAGCGAAAAGGTTGTTACACTCACAGCTTTAGAAGTGT TTGTATGTTGTTGTATTCAGCAGGATGGAGCTTCCACTGAAGTTGTTATTATCAGCCTGAAGTC AAGATAGCAAGAAGACTACGTGTATCTACTAATTCTGGTGGAAGAGGCCCAGATCAATTATTGT TATCAACAAGG
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Genomic sequence |
CTTAATATACTTCTTGCGTTATCCTATGCAGCACAGTGTTGGAAGTAGAGATGGCAATTTGTCC AAAGCAGAAATCTCCATAAACCCTAGAACAAGCAAACACATTGAAGTGCACAGAGAGAGTAGAA GGCAAAGTGCGCACCTGCACTCCAAAAACCAGGGCACCAGCAAAAACGCCAGAGAGAGTCTCGA TGCCAAAGAGGTTCCATCAATGAGGGAGTCAGCATGACCAGAGCACCCCAAGGAATCATCTCCT TGATGGAAGAAGCATCAGTGCAAATCTTCACATAGGTTGCATAGTCAGGCTTGCTTGTTCACTC CATCAACCCAAGAATGGTGTTGAACTGCCTGCGAACCTCCTCCACCATCTTTAGGGCGACACTT CCAACACTCTTCATGGTCATGACAGAGAACCAGTACAAAAACATGTCTCCAACAATCAAACCAA TGAAAACCTTCAGGAGAGAACATCGACAACCTTCACTCCAGCTCTGCTAACGAAGGCACCAAAC AGCACCAGGGACACAAGAGCACCTGAACCAATGGCAAATCCCTGCAAAAGGAAACAGATGAATT AAGTTACCAGAGGCGTACAATAGTTCTTTTGTTGCAGATTATCTACTATTCCCTCAATTCCAAA TTATAAGATGTTTTGGCTCTTCAAGATAGGTAGCTTTTGCCATGCATTTGAATATATATTATGT CTAGGTACATAACAAAAACAACGCATATACCAAAACGTCTAATAGTAGTTTGGAATAGAGGGAG TACTACATAGAGATAAAGATGAATTAGGTTACCAGACGAGTACAATGGTTCTTTTGTTGTATAT TATCCGCTACTACTACTTCATTAGTTCATTCTCATATGTTAAAATATTAAGAAATACATACCCT ACCAATAGTGCCAATGATGGCAGTGACAAATGAACACATTGAGCCAACAAATGGATAAAAAGCA TGTCTACCTTTCTAATAGCAACAGTTGTGTTGTCAGCAGCACCAAGAGCATAAGTTCTCTCAGA TTTTGTGGCTCATTCCTGCCATCTCAACAATACCACCAGCATTGTCACTGATTGGACCATCTCA GCAATATCATAGTGATGTTTGACCTTGACAGTGAATCAGTTAATTCTAGCAGAGCTGCTTTATG GAGCCTCTGATGCTAATGATATGGCAAGTCATTGGAAATTTGGATTGGATAAAAAATAATCTAT TTAGATTAAACAAATTCAAGCCCAAGAAATATATGCACATCCTGAATTACAACCTCACCTTAAG CATATCTTGTACATGCCGACCATCCTGCATTGCATATATCACGGCAAATCGATTGGAATGAAAT AAAAAATCAATGGAAGCATGCAGGGAGAGGGCTCGGACTGGATCACCTTGTACATGTTGATCTT GGTGATCTGGTAGGAGACATCGCGCCAGGTGGTCTTGGCGACATTGTCGCTACTTCCTCTCCTC CCTTCTTTAGAGCAGCAGCACACCACCTCACTCGATGTTCTTGATGGAGCACGTGAGCGACACC CGCCCTGTGGACCCACCTATGTCGCGCATGTCGAAGGTGACGGCGATGTAACCCCGCAGCGCAA TGCCCTCCGCCATCCCCCTCAATATTAGTACTAAAATATTTGACAACTAATATCCTGATGTGAA TTGAGTAGCGGATTTCTCACTCTAAAATGAAGATACAATACTAAAAGCATTTAATAAATAATAT TGGGAAAACATATGTTTTTGAAAGGCTGCAAGTTAATGTAAAAGGATAATTTATGATTGTAAGA TGTCCAAAAACCGAGAAAGGAAACATTGCATTTAATCTGGACTTACAAGTACCCAAATTTAGGT ATGACACTCAAATCTGGAACAACCCAAACTATAGTTTCTTAGACTCCTGGTAACATGTAAAAGG ATGGTTTACTCAACACGTCTTGATTTGAGTTTAAACATGATGTTGATTGTGTGGTGCTTGTCCT TGAATGAATATAATGAAGTAATTGTTGTTTCAGTTATCAGTGAAAATGATCTCCACAGAATGAA AGAAGACTACCTATAAAATTTTAAATGTAATGTTTTTCGATATTTTTTTAAATATAAATATTTC CAGATAAATGGACCAGTTGCATCCAACTATTTGGCAGCTATAGGCTGCAATAGAAGAGGAGTCA GTGTAAAAACGAGCTTTTTGTTGCACACGGAGCAAATTCGTTCTTATCTATGTGATGCCCTGAA CTTTGATATACTACCTATCTCAACTAAAAGCATAAGCCATTTGGCAAATACAAACACTTTTATT CAAAATATTCTTCTTTTAACCTTAGGTTTGTACTCACCAATGCCTACACTTTTAATCAAGGTTA TTAAAACGACGAAACGTTGAAACGCTCATGGGTAAGTTTTAACTTTTAAACGGTTTAAACAAAG TTTAAATGTAGTTTTAAACAACATAGGGAAATTTCAATATATCATAATTTCAGGCAATTATATC AAGTCAAATACCAAACAGTGGGACAGTCAGTCTCTGTACTCTGTAGTCCTGCCGCAGTGGGACA GCAGAGGCGGGGCTGGAGGGGCTGGCAGCCGGACAGGCGGCGCAGGAGGGAGGACGGCCTGGAG CGCGGCGGCCTGGAGCGGTGGCACGCAGAGGCTCTGAGGCGGGGCTGGAGGACGGCCTTGAGAG CAGCGGCCTGGAGCGGCCTGGAGAGCAGCGGCCTGGAGGGAGGACGGCCTGGAGAGCAGCTGAC TGGAGCGGCGGCGGCCTGGAGCAGCGGCACGCAGAGGCGGGCCTGGCGGCGCCGGACGGGCGGC GCAGGAGGGTTGGAGCAGCGGCGGCCTGGAGGCTGGAGCGCGCCCTGGAGTGCGACGGCTGGTG AGAACGCGAGTTACTAATTGGGCTGGTGAAAGTGCGGCTTGTAGCGGCGGTCTGGGTGGGCTGG GCGGGAGTTTCTAATTGGGCTGGGCCAATTACTAGCAGCAGACGCATTAAACGCGGCGTTTCAC TCTATACCGCGTTTAAACGTCAAAACGCGACGTTTAAACGACGTTAAACAACGTTTTACGACGA ATCGTAAAACGTTTTGTCGTTTCACTTCCTGTCAGCGTTTTATAGTTTAAACGACGTTTAAACG TCGTTTTAACGTCGTTTTAATAAGCATGCTTTTAATGATTGTTCTCAATAACAGAAGTTGTAAT AGCTGTTAAATTCTTTTGCCCTCATCTACCTCAAATTCTGAAAAGAGAGAACATGAGCGAAAAG GTTGTTACACTCACAGCTTTAGAAGTGTTTGTATGTTGTTGTATTCAGCAGGATGGAGCTTCCA CTGAAGTTGTTATTATCAGCCTGACTATAAGTACACAGATACATAGATATGAGAAATATTTGTC ATAGATAACAAAAAAGTCTAATCTATACAGAATAAACAAAAAAAATCAAAGACAAAGGCCTGGA TCATTATCTCCTTAGCATGCCATTAGATTTACATAAGCAAGTGAAGTGTACTCATGAAATTGGT GTATATTACTTAAATTTCTTAAACATCTAGAGCCAGAGGAACCTCAAGATATCATGAACAAGTA CAAATCCTTAACATTGTGCTGCAGAAAAATGTACTTACAGTCAAGATAGCAAGAAGACTACGTG TATCTACTAATTCTGGTGGAAGAGGCCCAGATCAATTATTGTTATCAACAAGG |