Splice junction sequence |
AGTTTGGTGCTGGATTTTTCCTGCTTGTTCAAGTTGTACTTCTTTTGGATTTTGTTCATGGATG GAATGACACATGGGTTGGCTACGACGAGCAGTTCTGggattaaccattttcacaagacacctga tcgtgaatggtttgagactgatgctgtgttgcgtgtcagcttagggaatttcttgtttttctct attctatc
|
Assembled circRNA sequence |
Yes
The sequence of a circRNA based on assembly using circseq-cup (Ye et al., 2016) or CIRI-full (Zheng and Zhao, 2018) or CIRCexplorer2 (Zhang et al., 2016).
|
Full-length trsnacripts |
Transcript length: 352 Transcript exons: 5541163-5541402,5541484-5541595 GGATTAACCATTTTCACAAGACACCTGATCGTGAATGGTTTGAGACTGATGCTGTGTTGCGTGT CAGCTTAGGGAATTTCTTGTTTTTCTCTATTCTATCGGTTATGATGATCGGTGTGAAAAATCAG AAAGACCCTCGTGATGGTATACACCATGGTGGTTGGATGATGAAAATAATCTGTTGGTGCATTT TAGTCATCTTTATGTTCTTCCTTCCAAATGAAATCATCAGTTTCTATGAGTCGATGTCAAAGTT TGGTGCTGGATTTTTCCTGCTTGTTCAAGTTGTACTTCTTTTGGATTTTGTTCATGGATGGAAT GACACATGGGTTGGCTACGACGAGCAGTTCTG
|
Genomic sequence |
GGATTAACCATTTTCACAAGACACCTGATCGTGAATGGTTTGAGACTGATGCTGTGTTGCGTGT CAGCTTAGGGAATTTCTTGTTTTTCTCTATTCTATCGGTTATGATGATCGGTGTGAAAAATCAG AAAGACCCTCGTGATGGTATACACCATGGTGGTTGGATGATGAAAATAATCTGTTGGTGCATTT TAGTCATCTTTATGTTCTTCCTTCCAAATGAAATCATCAGTTTCTATGGTAAGTTTCTGTTTAT CATTGCAAAGTGATTAGTGAATCGATTAACTTGGAACTAATGGGAATCAATTTTACATCTTGCA GAGTCGATGTCAAAGTTTGGTGCTGGATTTTTCCTGCTTGTTCAAGTTGTACTTCTTTTGGATT TTGTTCATGGATGGAATGACACATGGGTTGGCTACGACGAGCAGTTCTG |