Splice junction sequence |
ATGGGAAATGGGTGCAACTGCAAGGAGAACAGATTAACATCACATCAGTGGTCAGCAACAAGAT CCATTAACACCACGCAAGGTCCACAAAAGCCTTTAGgtgctggaaaggtgaggagtatgtcctc gatacgatttggatttgttagaagccagctcctctgttctggtaattatattctgaaggacttc ttattttc
|
Assembled circRNA sequence |
Yes
The sequence of a circRNA based on assembly using circseq-cup (Ye et al., 2016) or CIRI-full (Zheng and Zhao, 2018) or CIRCexplorer2 (Zhang et al., 2016).
|
Full-length trsnacripts |
Transcript length: 193 Transcript exons: 170590745-170590813,170593541-170593664 GTGCTGGAAAGGTGAGGAGTATGTCCTCGATACGATTTGGATTTGTTAGAAGCCAGCTCCTCTG TTCTGAACAGAAGATGGACATCAGACACAATGGGAAATGGGTGCAACTGCAAGGAGAACAGATT AACATCACATCAGTGGTCAGCAACAAGATCCATTAACACCACGCAAGGTCCACAAAAGCCTTTA G
|
Genomic sequence |
GTGCTGGAAAGGTGAGGAGTATGTCCTCGATACGATTTGGATTTGTTAGAAGCCAGCTCCTCTG TTCTGGTAATTATATTCTGAAGGACTTCTTATTTTCCAGTTTCTGCTTGTCAAATCCTTGGGTT ATTTCTTACTGCATTTTATCTAGAAGTATGATACACTGGTTCTATGAATTTCAAAATTCATAGA GTAGCGGTATTGCTACAATGGCACTAAATATTAGGAGGCGTGTTATATTGTTATGGTAAAAATC CCCAAAAATGTTCTAAGATATGGTTTTATCTAGTTATATGTCTTGAGTGGGGTTTGTACTCAGA ATTTCTAGCATTACAGGACAGTTGTATGATGAACTTCAACTGTATCCTAAAATGTCAGGTCACA GTTCAAGCAGAGTTACAAGGGATATATAGCTGCAACTAAAAGCAGAGCAACAAAGAGTAGACCG TCAAATCAACTTGTCTTTGAAAGCCCCAGTGTAAAAAGGCTGTAGGTTATTCAAATATCACACT TTGCAACAAAAAAAAACTTTATTGAAGTTCTTGATGTCTAATATTACGTCACTATTCTCATAGC ATGTGTATTACCAGCCAGCCTTCAGAATTCAGATTCTCATTCTGTCATTGAAGCTTGCATCATG TATGACTAATTAGGTAACATATCATGTGCAACCATATAAATGGATGCAACTACTCAATCAAGAG TCCAAGACACAAGAATAGAGGTGGGAGGACCTTTTGGTTTCATCTGATATGTTCCTGAATAAGG GTTTGTTTGGTTCCAGGGACTAAAGATTAGTCCCTACATTTTAATCTTTAAATTGACAAACAGT GGGACTAAGTGACTAAACTGTTTTAGTCCCTAGTTCATCATGGGTGACTAAAATGGACTAAACC ATATTGATTACACCGGTTGTCTCTCATTTATTTCCGTCGCCGCAGGAGAATAGTAGTGGTAGAA GAATGATAAATGATATTTTGATCTTCTTACAAGTCATTTAATAAGTTATGTACACTTTTAGTCT CTGAAACCAAACAGAGTAGGGACTAAACTTTAGTCCCTAGACTAAATGAACCGTACATGCCCTA ATTAACCCACTGTGATCAGTAGAGCATACTTTGCTACCGAATTGGACCATTTTATTAAATTTCT TGTTGTAACAGCAAAATAATATAAGAGGTACTGTAATTCACTTGACCTTTGCAATGTCCCGTGC AGTGTACTGCTAACTACTATCCAAAATTAGTGGGTACTATAGTTTATGAATATATTGATATTTA AAGCACCTATCTTCACTGCCAATTTTAGAACAGATGGTCTATATACCTTTTATGAGAGGAACCT TAAATGTGTATATGTGATAGTCAACTGATACTCCAACTTTGTGGCTTGATTTGGGTTTGGAAAT GTTTGGGCTACATTACAACATAATGTGCACCAGATAAGTTGAACTAGCTCTATTGCCTCTAGAT CATAAATCATGCTTCATGTATTCTTAAACTCGACCTACGGGGTAAGACCGCCTCTAGGCATTTC ATTTAAGAAGAATACCTTCTCACGTAGGTCGAGAAAACTTCTGAACCTCTGTCCTACTCATACA CAGCAGCACCGTAGCCCATATGAGAATGACCACAACCTGGACCGAGCTTTAGACCTGTGTTTTG GTGTGGAACAGACGAAGAGATTTTTGTTAACTTGATATTCGCTCCAACGGGGAGTCAAACTCAG GACGTTAGGAGTGCTAGTCATACCAGCTGACTAACTCAGCTAGAAGCCCTATCACGCTTCAGAT ATTCTTGTACACATGGTTTTAATCTACATATGTATTTGGTAAGATCTATTTGTTCATGGAGCCT TATTAACAAATCACAGGGTGAAATAGTTTTTATAACATGTATAACTTAGTATGGTGATTTTACT GACATATTGACACTAGTTATTCACTCATCAACTCCGCTTTTCAGTTTTGTCTCACTTGTATTTC CATGTGCTTCTTACAATCGAAGTTTTTTATTGATATTTGCAGGCACCATTTGCTAGGATTTTGT TATGGTGTTTATTAGGCAGCCATGAAAAGTCTGATATGCTTCGGTAATTAAGTCTAACCTTGTA TACTAATTAAGTCTTAACCTTGCATACATGAAATGGAAGTTTGAACATTGTTAATTACTTGTTT TGATACACTTTGTAAGTTCTGTGTTTTACATTAGTCCAGTTGGGTTAAGTTTTTACTTCGAAAG GACAGGCCCAAACTGATGTAAAACAGTTTGAATCTATACCGTCTTTACATTAGTCTAACCTTTG GAAGTTTGTATTGATAATAAACACCGTATGGATTTTTTCTGCAAGATAACCATTATCTTGATAG CGTATTGTTATTTACTTATTTTTCCAGTTTGAATCTGTGAAGCTTGTGGTTATTGACACTAAAG TGGGGTGTCATTCTTGGTCAATATAGGGTTGTCCATCAAATCCATTTTATTTAAAACGGGAGTG CATATGACCGTACAAAATATTGTTTTTACACTGTAGACAACTCTGCATATATAGAGTACAAAAT ATTATTTTTACACCGTAGACAACATTGCATATAGAGTAGAGTTTAGAATAGAAGGTCGGATAAG AGATCAAATAGGTGAAATGTTGGAGATAGCCTAACTGCGATGAAATGGCCTATCCAAAGAATGG CAAATCGTATTAGGAAGTCTTGATGTATGGTTGATTGCTATGTTTTATGTATTGCAGCAATTTT AGCTTCATGTTTTGATCTGACAATTATGTAATTGTGCGATGCAGAACAGAAGATGGACATCAGA CACAATGGGAAATGGGTGCAACTGCAAGGAGAACAGATTAACATCACATCAGTGGTCAGCAACA AGATCCATTAACACCACGCAAGGTCCACAAAAGCCTTTAG |