Splice junction sequence |
CACATATAGTAAAGAAAACAAACCTCAAGTACTGCGCCGGATGAATACTTCAATACTCGGAGAA AAGCTTTGGCTGCCTCACCTTTTGTCGATTGTTTAActcctgtggaattcgcaagcgatcaagc aacttttctagttcttcaacgagtcctttgttatttacggactgcatctccaagccattgttgc gtgattca
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Assembled circRNA sequence |
Yes
The sequence of a circRNA based on assembly using circseq-cup (Ye et al., 2016) or CIRI-full (Zheng and Zhao, 2018) or CIRCexplorer2 (Zhang et al., 2016).
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Full-length trsnacripts |
Transcript length: 812 Transcript exons: 23802942-23803043,23803441-23803545,23803715-23803832,23 805185-23805342,23805592-23805694,23805948-23806015,2380 6116-23806196,23806373-23806449 CTCCTGTGGAATTCGCAAGCGATCAAGCAACTTTTCTAGTTCTTCAACGAGTCCTTTGTTATTT ACGGACTGCATCTCCAAGCCATTGTTGCGTGATTCAATCGATGCAATATCTTCTCTCATATGCC TGAGCTTCATATTAAAAATGCGTAACCACTCATCCATATCATCTACGGTTGCACTAGCAGCATC CAGACCCTGCAAAACCTCATCTATTAAAGGTTCACTCTGCAGTAGTTGATAGACATTGGCTGCT TCCAAAGCAACAAGTTCCTGTTTCAATCTCTCAGAGAAAGCATCTGCTTCACCTATGCCCATGA CATATGTGTCAAGAAGTGCCTCCATGTCTTCCTCTTCATCCTTTGCTTGGGACACAAGATCATT TTCAACAGTTACAGTTACTTTCCTCTCAGTTTGAGTTGTGACAGATTTTTCTTGTCCATCTTGG GTGCTCGATTGGTTGTCCAGAGTCACTGTATTTTCCTTGGCCCAGAGGGCTAGCTCCACAAAAT CAATTCCAACGACTTTTGGAAGATAGCTAAGTATCTCTTTGCACATGGTCAGGATAGAAAAAAG TAGGCGGTTTCTGTCATCAATGTTGCGCATTGTCCATTGTGGAGGGGCAACACTCTGACTTCTA AGGTTATCAAACCCCAATACAAACGTGCAACCACTAGGATCATTCGAAATAACCTCAACCTTTG TGAGATGTTTCAACTTGTAAAGCTTGGCTGGCTCAAGTACTGCGCCGGATGAATACTTCAATAC TCGGAGAAAAGCTTTGGCTGCCTCACCTTTTGTCGATTGTTTAA
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Genomic sequence |
CTCCTGTGGAATTCGCAAGCGATCAAGCAACTTTTCTAGTTCTTCAACGAGTCCTTTGTTATTT ACGGACTGCATCTCCAAGCCATTGTTGCGTGATTCAATCTGCAAAATATGAACATGTATAGTTT GAATACCAAGAATATAAGGAACTTTGGCAAAGAGTAAAAAGTAATACTACCTCCGTCCCATATT ATAGCTATTTCTATTAAGGTTGAGTTGGTTGATATGAGAAAGTACGTGAAGAAAAAATTAAATG AGAGATGGCTGTGATTGGTTGAGATGGAGAAGTAGGTGGAGAAGTAGCTACATTTGGGACAAAA TAGCTATAATATGGGACTGAGGTAGTATGTATTATAAACACGTGAACTTGTGGGGAGAGGTGTT CTTTAACTATCATTAGACATGTGTAACTATAGGCAAGAAGATATTTAATTTCTAGATGTTGGTA AGAGAATTTCATAACTTCTACATAATATCAAACATGTAACCATAAGCATACCGATGCAATATCT TCTCTCATATGCCTGAGCTTCATATTAAAAATGCGTAACCACTCATCCATATCATCTACGGTTG CACTAGCAGCATCCAGACCCTGCAAAACCTGAAAATCCAATAATTGTATCAGTCAATGAAATAT AGTTAGTGCCAAGAAAATACATAATCATCATTTGAAGAACTAAAGGTTAAATGCAGACAGCAGT GCAATCAGATACCCATTACTGTTCATTGCCAAAAAAAAAGAGCCACATCAAGTATAAAGAATGC AGTACCTCATCTATTAAAGGTTCACTCTGCAGTAGTTGATAGACATTGGCTGCTTCCAAAGCAA CAAGTTCCTGTTTCAATCTCTCAGAGAAAGCATCTGCTTCACCTATGCCCATGACATATCTGCA TTGTTTACAACAGTAAAATGTTTGCTGCCAAAGGATTGATGCTAAAAGGTTGAAGTGAGAGATA ACGGAGTGGTGGACTGAAATTAATTTCAACATATGCAAGTATAAAGTATGAATTGTGTAAGAGT AATTGCATTTGCACCACAGGTCGTCAAAGTTGTATGGTTTGTTTAACTAGGTCACTGAACTTTC AAAATGTGTATATGACTAAACCTGTTTGATGCTTTAAGACTTGTCATGTTGACTTATCCCCTCA AGGCAGCAATTGCACCTTGGTGACACATGATGACAGCAATGGCTACAATAAATTGTGATTCGCC CATGAGTTTTGATCTTTCAAGATTTCCTCTCTCCATATAAAATACATATGAGAAGTAATGATTG ATGCAATCAGGATATGGCTCATGTAAGTATTGTAACTTGTGATAGTGATTGTTGGAGTCAAGGA CTCAAGGGCAATTAAGAAGGTTTAGCTAACCTTATCTCCAATCTAATGCAACTTTTACGATTAC ATATGAGTCAGCATTCCATGTCATTAGTCATAGCCTGACTTGTAATGACCCAAAGTGATCCACT TAACAGGTTTAGTGACCTAGATATAAACAAGTTAGTGACTTAGATAGTCTTGGGTCTTTGGTGC AAACTAATCAACACTGTTCAATTATGTCTGGAATTCCTGGAACATTCTGTTTCGTTAAGAAAAA TGGTATGTAGAGGCATTAATACTGTTAAAAATCTCTAATTCCGTTGAGTTCCACACTTTCTGGT TGATACCGCCTATCCCGCTGGAATTTACTCTTCCGAGCATCTAGGTAAGCACTTGAACCAAGAA GCACAGGAGAACCGCACGCTCCTGTATGGGAATACCTAGCCAAGCATGATTTCTAGTACTAATC GTCTAATCCGATATTATATGATATGTTTGCATTTGTTTCTTTACATGTTCATTCACTTGGCCAC AGCTAGATATTATTCTTTGCATCACACTATTTGGCTGTTTGCAAAGGTTATAACATGTATGACC ACATATACATTTTTGAAATATTAATTATTATATACACCATAATGGTACACTGGGATAGTAAGGT ACTGAAAATTTCCATACCAATATGCAAACCAGAATGACTATCAGATTGATCATGGTAAGTTTAG TCTAAGTCACCTATTTGAACTAGCTGAACAAGCTAAGTGACTGAGTATGTGCAATTTACTCAGA AGAGTAAATATGAAAGTAGAGTTAAAAGTTAAAACAATAGTAGAATAATAAAATGGTATAGTCA CAATTAGTCCTTTGTAGTTTGTAATAACTAGACAATAAAGCGCACATACGGCATCACCCATACT TACGTGTCAAGAAGTGCCTCCATGTCTTCCTCTTCATCCTTTGCTTGGGACACAAGATCATTTT CAACAGTTACAGTTACTTTCCTCTCAGTTTGAGTTGTGACAGATTTTTCTTGTCCATCTTGGGT GCTCGATTGGTTGTCCAGAGTCACTGTATTTTCCTGGAAAAGGTTAATTAGAAATTATCTAGCC AACAATCCATTGAAGTCATTTAATATGCAAAAGGTACGCCAGCAGCTTGAAAAACTAAACTTAT AACCCCCCCCCCTTCCAATTTGAAGTGTTTTAGGCCAAAATGGGTTGGATTTCAACTACCCACT AATTAAACCAGTAAATTGGGAGGGAGTGGTCGAGTCAGGGGGAAGTCAAAAGACAGTTTTATGT AATGAAAGGCAAAGTTATATATGCACCTTGGCCCAGAGGGCTAGCTCCACAAAATCAATTCCAA CGACTTTTGGAAGATAGCTAAGTATCTCTTTGCACATGGTCAGGATAGAAAAAAGTAGGCGGTT TCTGTAAAAAAAACGAATAGAAAAAATTTGTTAAGAGCCTGCAAATAAACATATCAATGTATTC TCCCGCAACATGCAAACAGACTCATGCCAATGCAATGAATGACTTAACATAACGATAGAAGGTA GATAGACACTACACATACACATAGAAGTATGTATACATTTGCAAAGTTTGTAAATTCATTAAGG CATGTAAATTACATAAATAAAAGTAGCAGTTCAGTACTACAGAAATGTTTCTAGGCAATAACCT GTCATCAATGTTGCGCATTGTCCATTGTGGAGGGGCAACACTCTGACTTCTAAGGTTATCAAAC CCCTGCAATCCAGCCCATAACAACAAGTTAGAAGAGGATAAGCCATTAGCTTTTATTAACTATT ACAGAAAGACAATGCAAATGAGGGATCAAAGTAAGTACCAATACAAACGTGCAACCACTAGGAT CATTCGAAATAACCTCAACCTTTGTGAGATGTTTCAACTTGTAAAGCTTGGCTGGCTGAAACAA AAGGAAGATATTATGTTTCTAAAGGGAGACTAAAGAGAACTGCAGAAAGTGGTAAGAAGAAAAA TACAAAGTGTGATTTGTTTATTGAAGTAGTTGATAATGAAGGCAAGTTACAATAGTAAACATAA GCTAGATGCAGATGCTCACATATAGTAAAGAAAACAAACCTCAAGTACTGCGCCGGATGAATAC TTCAATACTCGGAGAAAAGCTTTGGCTGCCTCACCTTTTGTCGATTGTTTAA |