Splice junction sequence |
TTTGCTTGCACAAACGTACTGAATCTACATATAGTGGCTCTATCTTCCAGTTACCTTCGAAAAC TTTCATGAACATCATTTTCTCTTTTTTATATTTTGCtgtaaattctttttggttttcatccaca attagttctatcgggatagctccagaccaccaaaggaagtcccatgccaaagcttgctccacct tcacgatc
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Assembled circRNA sequence |
Yes
The sequence of a circRNA based on assembly using circseq-cup (Ye et al., 2016) or CIRI-full (Zheng and Zhao, 2018) or CIRCexplorer2 (Zhang et al., 2016).
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Full-length trsnacripts |
Transcript length: 239 Transcript exons: 8365170-8365388,8367927-8367946 TGTAAATTCTTTTTGGTTTTCATCCACAATTAGTTCTATCGGGATAGCTCCAGACCACCAAAGG AAGTCCCATGCCAAAGCTTGCTCCACCTTCACGATCTGCCTCCGTCCATCTTTCTTTAAAACCT TTCTTGATTTGTATTCCTTCATCAGAAAAATATCACACTCTCAAGGACTACTATCAATAATACC ACATTCGAAACATACAATGATAGGGAACTTTTTTGTTGTCACCTTAA
Transcript length: 406 Transcript exons: 8365170-8365368,8367927-8367946,8369236-8369422 TGTAAATTCTTTTTGGTTTTCATCCACAATTAGTTCTATCGGGATAGCTCCAGACCACCAAAGG AAGTCCCATGCCAAAGCTTGCTCCACCTTCACGATCTGCCTCCGTCCATCTTTCTTTAAAACCT TTCTTGATTTGTATTCCTTCATCAGAAAAATATCACACTCTCAAGGACTACTATCAATAATACC ACATTCGCTTTTTTGTTGTCACCTTAAGAAAATATTGGTCCATTGTTACTTTCGATCCAACCCT TCCTTGTCCGCCACTACATTTTTTGTATTCTTGTAGACTCTTCGGCTCCCTTTGCTTGCACAAA CGTACTGAATCTACATATAGTGGCTCTATCTTCCAGTTACCTTCGAAAACTTTCATGAACATCA TTTTCTCTTTTTTATATTTTGC
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Genomic sequence |
TGTAAATTCTTTTTGGTTTTCATCCACAATTAGTTCTATCGGGATAGCTCCAGACCACCAAAGG AAGTCCCATGCCAAAGCTTGCTCCACCTTCACGATCTGCCTCCGTCCATCTTTCTTTAAAACCT TTCTTGATTTGTATTCCTTCATCAGAAAAATATCACACTCTCAAGGACTACTATCAATAATACC ACATTCGAAACATACAATGATAGGGAACAAAATCCAGAAGTTGACGCCCATGCTTGTTCATATC GAAGAAGAGTGGGCCATCATTTGGATTAGTGAAAAGTTCGAAGACTCCATTAGGATTCCAGCCT AATGTCAGTTCTATGTTCATATGGCATAGTCCCTTTTTTGTTGTCACCTTCAAAATAAACAAAA CAAATTAAGATTGTTGTTCTTTAGAAAAGAGCTTTCGTCAAGCCTAGGTAGTTTCCTTGCCAAT TTCTTTTTTTTTTTCAAAAACAAGGCCATCTAAAGTGCAGTTGATTTCTCAGACCCTTTCAAGC CAAATATACATAAAATCCGAGAATCCTTTCCTCCGTTTTTTTTTTTTTGCGAGAATTGTTTCTC GGATGTTGAATCTACCAATTCGTTTTAGGAATCCTAGCTAGTAAAAAAAAGAAAAGAAATTGAA CTCATTTTCTTAGGGAAGTTAACATATTTTCGAGGTCACTCCTAGTATTATCTCTTGTGTTAAT ACTATTAACATACATCAATAAACTCAATACTTTCAAGTTCACAATATTGGCATGGTTTTAGAGC CAAGTTTAACCCTAGAGAATATGCTAACTTCCGTAATAAGATAAGTAAATTTTCTTTTCTTTTT TTTTACTAGGATTCTCCTAGTAATTCTTTCTAAAATAAGTATTGAGATGTTGTTAGGCTATTTG CTTTTGTTACCTTGACCTTCGGAGGGGCATCATACCATGGATGCTTCTTCTCTGAAGCACTCCA AAGTTCATATTGCTTCTTCATTTCCTCTTTGTCATAGACTAGTTCTTGATTATTACTATCTTTC TCTGACTCTGAATTAGTATTAACATCCACAAATCTTTTGGACTCACCCTACAATAACGAACATA ATTTATAATAGTTTATACTAATTTGACTTGTCGAGTTCTAAGAATGATGGAAATGAAACTGACC TTAGGAGGTTCTTGAATGTTCTGATTTATCCAGCCATCAAATCCAGAAAATACCCTCATTTTGC TCTGAAGTTTTGGTCCACAAACGATGTTTACCTAATCAGACAGAACAAGAGCATAAAATAGTAC GTTTGTATATATTGTGGATTGAGTAATAAAAGTTTGGTTCAAATTTAGAAAATTTCAATATAAA ACTGAAATAATGGTGTACGTTAGGTTTTACGTGTGGAGAAACAAAGTAGTAGGCAGCTTCATTC TCGTGAGTTTTACGTATTGAATAAACAAAGAAGTTATTTCCCTTATTTTGTATGTATTTAGTAG TCGAGAGGTCGATAAATTGAAGACTGATGCGTGCCCTCGCGGAATCAGGATTAGTCAACTTGAC TTACTAGTCGGATTGCTTTGATCGGAATTTCTTTTTCTAAAGATGATCCGTCGGGATCAAATAT GGACCGCTCCACTCTGCTTAATATTCCGGTTAATTTAGGTATTGACTGCTTTAAATTTAATTAC CTGGCGGTGGGTACTAGTTTGTGTTGTATTTGCCATGTTAGCTGCTTGAGATCTTTATGATATT GTTTGAGTATATTGAATGACGAGTGTCAAGTATCCACATTAGCTGTCCCAAAGGCTTGTTCAGT TTATTTTATTAGTTTAATGGTAACCTTTTTACCAAAAAAACAACAAAAATATTCACATAAACAA GATACCTAAAAATATACTTGATATGGTTTTGTAGTACTAAAAAATTATGAATTTTATATTTTCC CCTATTAGAATTCCCTTTTGAATAAACTGTTTACCGAGATAAGTTTTATATTGTTTTGTTTATT TCGATTTTGGGGCTTTTCAAACTTCTCGTAAAGTGGTACCCGCTTTTCTAAGATCTTCGAGCAG AATCTTGGTGGTTCTGATGGTGATCCCACGAATGATCCAAGAAACCGGTGGTCGATTAAGAAGA GAAGAAGGCTCAAAAATCTGCTCCATTGTAACTTTTGACCCAACTTTTCCTTGTCCACCGCTAC ATATTTTGTATTCTTCTCGACTTTTTGGCGACCTTGACTTGCACAAGCGTTCCTGATCTACGTA ATCTGGCTCAACTTTCCAGCTACCCTTGAACACTTTCATTAACATCATTTTCTTTGTCGTATAT TTTGCCTATATGCAAGATTTATTGATCAAACACTAGTTAATACATCCAAAACTGAACAAATTAA ACAACTGATTTTCTTAGAGGATATCTGTAAGCTTTCTTACTGTTAGATTCTTATGGTTTTCGTG AATTATAAGATGTATTGGGATATCTACTGAACACCCAAGAAAGTTCCAGGACAAAGCTTTTTCC ACCTCCGTGGTCTGCCTTGGTCCATCCTTCTTCAAAACCTTTGTTGATTTGTTTTCCTTCATTA GAAAAAAGACCACACTCTCAATTCTTGCTTCAATTAACTAATACTCAGTTTACAACTATATTAA AATGACATACCAAACGTTGGCGCCCGGCCTTATCCTCTTTGAAGAAAGGAAAGTTGTTTGGATT AGTGAACATCTCATAGACTGCTTCAGGAGGCAATCCCAATTTGAATTCTATGTTCAAATGGCAA AGACACTTTTTTGTTGTCACCTTAAAACATCCAAAAATGTAACAAACTTTTTAGATATTTTCTC TTAATGTTAGTAACTCCTCTTAAAGGCAATAAAAAACTAAAAGGTATTGAGATTTTGTTTGCAA ATTTGGTCTTTACCTTCACCTTAGCTGGAGCATCATACCATGGATGTTTTTTCTCAGCAGCTCT CCAAAGTCTTGATTCCTTCTTTACCTCAGCTAAGTCATAATATTTAGGATCTACCGCCCACACA GAATTAGATGCAGGGCTCTTGGACTCGACCTACAACAACAAACACTATTCTACATTTGATTTGA CTTCCTTGAGTTCTGTGATTATAGAAATGAAACTGACCTCATGAGGCTCTTCAACATGAGGATT GATCGACCCACTAAATCTAGGAGTTACACTCATTTTGTTTCTCAAAGTTTAGTCCAAAACTATA TTATCCTAATCAGAGTAATAGAAAATGAAAGAGAACTCGAAAGAAACGTATAAGAAGGCACAAG GGAAAACTAAAACGTGCAGCTCAAATTTTATGAGTTTCTGACGTACAGGGCTCCTACATGAATC CTAAATTCTAAATTTTCCTCTTGTCCCTTCAAGTCAAATTATTTCACAATTTAGAAAAATTAAA TGGAATCATTTATTTTCAATATTCAGAAGATTTAAAAACTTATTTCCGTCTACTCACAAAAGAA GCTATCATCCCATGATTGAAGTTACCTTTAAAAAATTTTGACTTTTTTTTTTTTTTGGACATCA CTACAATTGGTTTATAGGTTATAGGTTTTTGGGTTATTTAGAATTCTTCGTTGTTTTTGAACTC TATTTATTTTTATTTATTTGGGAATTAAGAGTTTTGTCCTTAATTTCAGTTGGTTTTATTTGAG TATATAGAGATCAAAGGGTGTTGAGATGAAACATTTTTGTGATCATTAAAAACATGCTTTTGAC AAGAAGCAGTTTCCGTACCATTCACGTCGTGACTCATTCACGTCGTGACTCATTCACGTCGTGA CTCATTCACGTCGCGACTCATCCGGTTGAACCGTTTACATGCTTTGACGTTGTATAAGATATAT TGGTAAAGAGCTTTGTTAGAACTTACAACATACTTATGTGTGACCATTTAGGTTAGCGTTTTTC ATCTTTGTTGCTTGATGTCTTTATAACATCGTTATCTAGAGACTCACTCTCGTAGTACAACACT CGCATGTTGAAGCATTTTGAGCAGGGTTTTTGTGGTCCTGATGGTGATATCACGAATGAACCAA GAAATTGGTGGCAGATTAAAAGGAGGATATGGCTGAAAATATTGGTCCATTGTTACTTTCGATC CAACCCTTCCTTGTCCGCCACTACATTTTTTGTATTCTTGTAGACTCTTCGGCTCCCTTTGCTT GCACAAACGTACTGAATCTACATATAGTGGCTCTATCTTCCAGTTACCTTCGAAAACTTTCATG AACATCATTTTCTCTTTTTTATATTTTGC |