Splice junction sequence |
AGGTTCTAATTTCCTTGTGACCGTGTATGCATGCAACAGATAGCAGCTGGGCTATAACAGACGA AATAGAGATGCGTCTGTAAAGCAGGTTGCAAGGTACctcagtagaatgttctggagatgtagtc atccatatctgcttgagtgtactcagcaagcatgaccggttcttgatgtggctccgccatctcc tcgtcatt
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Assembled circRNA sequence |
Yes
The sequence of a circRNA based on assembly using circseq-cup (Ye et al., 2016) or CIRI-full (Zheng and Zhao, 2018) or CIRCexplorer2 (Zhang et al., 2016).
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Full-length trsnacripts |
Transcript length: 243 Transcript exons: 5059540-5059625,5059660-5059760,5063319-5063374 CTCAGTAGAATGTTCTGGAGATGTAGTCATCCATATCTGCTTGAGTGTACTCAGCAAGCATGAC CGGTTCTTGATGTGGCTCCGCCCAGGTTGTGAAGCACGTCGCTCATGTGTTCTACGACCCGACA TTATTCGACCCTTAATTGATGAATGTACAGTTCTAGCACTCTTCCTCCTCTTGTGTTCCAGCTG GGCTATAACAGACGAAATAGAGATGCGTCTGTAAAGCAGGTTGCAAGGTAC
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Genomic sequence |
CTCAGTAGAATGTTCTGGAGATGTAGTCATCCATATCTGCTTGAGTGTACTCAGCAAGCATGAC CGGTTCTTGATGTGGCTCCGCCATCTCCTCGTCATTATGCTCGATCGCAACCCCAGCAGGTTGT GAAGCACGTCGCTCATGTGTTCTACGACCCGACATTATTCGACCCTTAATTGATGAATGTACAG TTCTAGCACTCTTCCTCCTCTTGTGTTCCATTGGCTCATGAGACGAGTGCCTTGCGGAAACTTG TGGAACGGTGTGGTCCCTTTGTTGATAGGTGGATTGCCTTGGTGGGAGAAAGTCGTGGCAGCTG GATGGCATGTCTTCAGGCGGGTTGTCATTGAAGTCCTGTCGGGCATTTTCACTTCTCCTTGCGA TTGAGTGGTTTGGGCAATTCCACTAAGAGACCACTCGATCACACCACTTCCATGTTGCGATCGA GTAGTTTGACATTTTTGTTGAGAAAGATGTTGTCCCAAAACCAGTAGATCGCACTCTCGAGCTT TTACTCTCATCATGCGATCGAGTAATTCATAAAAAAAATTGATTTTTTTTATTTGAACACCGGT TGCATCCCTGCTGTTACTCCAGCTGTTATTCATTTCCTGAGAATCAAAACCAAAACCAAAACAA ATCAAAAGTAAAAAAAAAAAAAAAAAACTATATACATGGATAGGCATGGGACTTCCTCCCAAGT GAGCTTGTTTTAAGTCTCTAGCTTGACTCCTCACACTCATTAGGCTCAAGGAGGGTGATAGAGT AGAGTTGACGTCTCCTCTGCTTCCTTAGTAGATACAACATCAAATTCAGCATGCTCTCGTGAAA GGTCTGTAATTGAGTACTCAATGGCCCTTTCTTGGTAAGCTCCTTTTTCATCATCTGGATAGTC GTCTTTTCTAGACAGTTCTAATGTGAATTCACATCCTTCTTTTCTAACCATAGGAATAACTTCA TCATTTGGGAAGTCCTTGATGTCGAGTGGTGCTTTGTTGGCTTTCCCATGGAGCTCCTTGACTT GATCTTTCAGCTCTTTCACAGTGTGTGTTAGCTCTCTTATAGCTCTATTATGCCATTTAGATCT CTCCTTGAGTTCTAACCAATCATATGATGTCCTCATGCTTGACTTTAGCTGTTTGGTTGAGCAC TCTAGTCGAGTATCAATTGAGCCTTCCTCGTTCAATGCAACATCCTCTCTTTCTAACACAATGA CACCTTTAAAGATCTCTGATCCTGGTACTCTGTTGTGTGAGTCTAATGACATCTCATAGCTCAA GGTCTCACTGGAGAGAAATCCAGCTTCACTACTTTTGGTCAAAGCAGTTTGAAGGTGATCTTTG TCAGTAAGTTCCTCTAACAGTTCATTAGCTAGCTGACCCATTTCTTCAACTAAGAAGGTTTGTC CTTCTATTGTTGGCTTCTTCATAGTGTCCCTGATTTCAAACTTCATTTTGAAATCCTCCCCCAG ATTAAGATTAATTTTTCCTTTCTTAACATCTATGACTGCTCCACCTGAAGCTAAGAAAGGTCTT CCTAAGATCAGAGGATCCTTAGATTCTTCATCCATCTCAAGCACAACAAAATCAGTAGAGACCT CTACTCCATTAATCATTACTGACACACCCTCTAACAGGCCAAAAGGTCTCCTTGAAGTCCTATC AGCAAGAATCAAGGTTAGGTCACAAGGCTTGTACTGAACGAATCCTAGCTTCCTTGCCACAAAG AGCGGCATTATGCTGACTGAGGCTCCTAGATCACATAGACAATTGTTGAAAGGCAATTGTCTAA TGGAGGATGGTAGAGTAAAAGATCCTGGATCTTCCAACTTTTCTTGAACAATCTTCTTTTGAGT GATTGCACTACACTTATGACTTAATACCACCATTCCTTGGACTTCTTTGATCCTTTCTGTAATC AGGTCTTTCACGTACTTGTGCTTGTTAGGTACTAGCGCGAGACAGTCCACTAAAGGCATATCCT TTATCTGTTTTTCCAGGAGGTCTCGATATTTCGCAACCAGAACTTTCTTAAATCGACCAGGGAA TGGAAGCGGAGGTTTGTAAGGTGGTGGCACGAAGACTGTATCTTTGGTCTTTTGCTGCTGTCGG TTTTGCAACGAAGGTAGTAGCTGGAGGAGCTTGTGGTCGAGTGCTTTGACTGTCAAGGATGGCC TCTTCGATTGTTTTCTCAGCCAAAACATCATCTTGATAAAAATCCTCCCCCTCTAGAATCACAC TGTCCTCAGTGTTTAATGTAGGGACATGTCGAGTTGGCAGCTCTCGATCATTTCTGATAGTGAT GGCATGGGCAGTGGCATACTCCTTTGGATTCCGGATTGCTTTCCCTGGAAGCTGGCATGGGTTG TTGTTAACAGATGGTGAAGCGAGGATGCCTTCCACATATCTCATCCTAGTGCCTAGTGATTCAA ACTTACTGTTCAGTTTGACACCTTGTCGGTCGACTTTGTTGTTTAATTCAGCCAGGTTCTTAGC GATTTCCATTGCTCATGTGGCTTGTCCTTGAATGAGTTGCTGGAGCATAGTCATTATGTCTAAA TTCTGAGGCCAAGGTGCTTGTTGTTGTTGTGGTGTGAAACCAGGTGGTGGCTGTTGTTGTTGAT ATCCTCCCTGAAACTGCTGCTTTGGAATGAACCCTTGGCTTTGGTTGTAAGTAACAAACGGTTT GGGTTGGTTCTGCTGCTGCTGCTGATGAGGGTAGACTTGGTCCTGAGGGTTGGCGACACTGGTG CTTCTATATGACAGATTAGGGTTGGGTCTGTAATTATTGTACCCTTGTTGTAGCCACCTTTATT CTGAACATAGCTGATTTCAGCACACTGATCATTCTCCCCCTCTTGTACTTGGAATGATTCATCT TCAGAGATGAAGTGAACATGTTTCTGCTACATTTGGACAATTTTGTCTAGTTTGTCATTGAGAG CTCTCATCTCTCTATGGTGCTTGTAATCAAAGTCAGAACTGGTGTGGATGCTTCTGTCATAGTC TTCATTGTAATTGCCATCTGACTGAGTAAAGTTTTCAACTAGCTCCCACCCGTGTTCAACATCC TTCTTCAGGAAATTCCCATTTAAAGCGATGTCAAGCAACATCCTTATCTTAGGCAAGACGCCTC TGTAGAGTGTGCTGAGAAGAGAAGCTTGCTTAAATCCGTGATGAGGGCATTTGGTTTGATAACC CTTAAATCGCTCTCAAGCTTCACAGAAGCTTTCATTTTGCTTCTGAATAAATCCGAATATCTCA TTCCGGAGTCTTGCAGTTCTGGAGTTGGAGAAGAATTTTGTTAAGAAAGCCTTTTTGCAGTCAT CCCAGGTCGTGATTGAATTCTGGGGTACCGTCTTTTCCCAAAGATGGGCTTTATCTCGAAGTGA GAATGGAAACAAGCGAAGCTTGAAACCATCTTTACTAACTCCATTGATTTTAGTAAGGCCACAT AGCATTTCAAACTCATCAAGATGATCTAGCGGATCCTCCATTGGCAGGCCATGAAACTTGTTCC CCTGAACCATTGCAATGAAACCACTTTTGATCTCAAAGTTGTTGTTCTGTACTGGAGGTGGAAC AATTCCATGACGCCGGTTGTGGTTGTGAGGGAAGTCACCAGCACCAATGTTGGTAGGTTGCTCT TGCTCATCTACAATGTCAGCCATTGTGTCTGTTTCTGTCTGTTCTCTAAGTTGGCGAGCAATAC GGTCGATGTTATCGTTGAATAGGAGGTTCTAATTTCCTTGTGACCGTGTATGCATGCAACAGAT AGCAGCTGGGCTATAACAGACGAAATAGAGATGCGTCTGTAAAGCAGGTTGCAAGGTAC |