Splice junction sequence |
TGCTTATTGAGCGAATTGGGAAACCACTTGAGTTGGATACAGATGGTATATGGTGTTGTCTCCC TGGATCTTTTCCTGAGAACTTTACTTTTAAAACAATgcttataaacgagtacttgacaagccaa ttactgaagttcgtgaagctgggatatgcatgagagaaaaccctttctatgtggatactgttcg gaggtgcg
|
Assembled circRNA sequence |
Yes
The sequence of a circRNA based on assembly using circseq-cup (Ye et al., 2016) or CIRI-full (Zheng and Zhao, 2018) or CIRCexplorer2 (Zhang et al., 2016).
|
Full-length trsnacripts |
Transcript length: 458 Transcript exons: 2596694-2596788,2596944-2597049,2597132-2597211,2597308- 2597484 GCTTATAAACGAGTACTTGACAAGCCAATTACTGAAGTTCGTGAAGCTGGGATATGCATGAGAG AAAACCCTTTCTATGTGGATACTGTTCGGAGCTTTCGAGATAGGAGGTATGAATACAAAACACT TAACAAGGTCTGGAAGGGAAAATTGTCAGAGGCCAAGGCAAGTGGTAATTCAATCAAGATCCAG GAAGCACAGGACATGGTAGTGGTTTACGATTCCTTGCAGCTAGCTCATAAGTGTATACTTAATT CCTTCTATGGATATGTCATGCGAAAGGGTGCAAGATGGTATTCCATGGAAATGGCTGGTGTAGT TACCTATACTGGAGCCAAAATCATACAGAATGCCCGTTTGCTTATTGAGCGAATTGGGAAACCA CTTGAGTTGGATACAGATGGTATATGGTGTTGTCTCCCTGGATCTTTTCCTGAGAACTTTACTT TTAAAACAAT
|
Genomic sequence |
GCTTATAAACGAGTACTTGACAAGCCAATTACTGAAGTTCGTGAAGCTGGGATATGCATGAGAG AAAACCCTTTCTATGTGGATACTGTTCGGAGGTGCGTTTCTTGATTAAGACTCTATTTGTCGTT TAGTCTTTTGGGAAGCATCTCTCTTGGGTGAACATACAACTGCTGATAATGAAACATTTAGACA AGTACTAATTACTTTTTCAAATTGCTTTTTATTTGGTGGTCTTTGTATGTTATTAAAGCTTTCG AGATAGGAGGTATGAATACAAAACACTTAACAAGGTCTGGAAGGGAAAATTGTCAGAGGCCAAG GCAAGTGGTAATTCAATCAAGATCCAGGAAGCACAGGTAAGTTATCGTTTATACTTGCTCATAT ATATGATTTTCAGAATTTCTTTTAGATGGTTATTGACATTAAAATTTGGAACAGGACATGGTAG TGGTTTACGATTCCTTGCAGCTAGCTCATAAGTGTATACTTAATTCCTTCTATGGATATGTCAT GCGAAAGTGAGTCCTCTCTTACAAAGAGCCTGGAATTTGGTGTTATTATCATTGTCTGTTCCAA TTATGTTGACCCAAAGCTTTACTTAAAACTAATTCCAGGGGTGCAAGATGGTATTCCATGGAAA TGGCTGGTGTAGTTACCTATACTGGAGCCAAAATCATACAGAATGCCCGTTTGCTTATTGAGCG AATTGGGAAACCACTTGAGTTGGATACAGATGGTATATGGTGTTGTCTCCCTGGATCTTTTCCT GAGAACTTTACTTTTAAAACAAT |