Splice junction sequence |
AGTGACAATCTGTTCTTTGTGGAAGTCAAATGTATGGGAAAAGGAAATTATGAAGAAATGGTGG TCAGCTGTTTCTGCGTGATTAATCCTATTGATAATGatatcaggaggaggaacatgtggttgag actgcatctgcaaaagcgcgcgccgatccgctgtatgaccaccgcagtccttctcccttatcat tctttttg
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Assembled circRNA sequence |
Yes
The sequence of a circRNA based on assembly using circseq-cup (Ye et al., 2016) or CIRI-full (Zheng and Zhao, 2018) or CIRCexplorer2 (Zhang et al., 2016).
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Full-length trsnacripts |
Transcript length: 1035 Transcript exons: 24408121-24408180,24409519-24409818,24410539-24411213 ATATCAGGAGGAGGAACATGTGGTTGAGACTGCATCTGCAAAAGCGCGCGCCGATCCGCTGTAT GCAAAGGAGGGGCATGTGCCATCTTACATCGCTGCTACTTCCTCATCCTGTCAGCAAGCAGATG CAGTAGCTCAGGACACCGAGGTCTTGCCACCATCAGGAAGCTGCCTTTCCTCATCTCCGGCATC ACACGTCTGGGCCCGACATGTGAAAGATTGGGGACTCATATTTTACATCAGGGTTGATCTTCAG GGATCTTTCCACACATATCCTGATGTGGGTGGGCCATTTCAAAGCTCACAGGAAGCTGACAAGG CTATTGATCGCTATCTTGAGGACCATCGGGATCCAAAAATGCACATAGGGCAAAATGATGATAT CTCTTCAATGGAGAATGTTATACGGCGATGCCTTTACTGGCCTGATGGCACAATTAAGAGGCGT ACAAAATCATTTGCGACTTGGGAAGCCAAAAAGAGAATGCACCAATTCATCCAAGCATTAGTGG ACAAGTATAATGATGATCACAATCTTTTGGGGGTTTGCTTTCTCTCTATCTCATTCTCTGTCCT TCTGCCTTGGTTGCACTGTCTTATTTATCTTATTATGTACTCCCTCCGTTTCATATTATAAGAC TTTCTAGTATTGCCCACATTCATACATATGTTAATGAATCTATACACTTATGAATCTATACACT TATATGTCTAGATTCGTTAACATCTATAAGAATGTGGATAATGCTAGAAAGTCTTATAATATGA AACGGAGGAAGTAGGATTGCCTATCTGATCCATCCTTTTTATTTTAGGATTTGGCACTTAAACT CAAAGACGTTTTGCACTACCAACCACTTTGTGAGAACCATATGTGGTACTATCATCTCAATTTC ACTGCAAAGACTAAAGAAGATGATGGTTTCGACTCTACTAGTGACAATCTGTTCTTTGTGGAAG TCAAATGTATGGGAAAAGGAAATTATGAAGAAATGGTGGTCAGCTGTTTCTGCGTGATTAATCC TATTGATAATG
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Genomic sequence |
ATATCAGGAGGAGGAACATGTGGTTGAGACTGCATCTGCAAAAGCGCGCGCCGATCCGCTGTAT GACCACCGCAGTCCTTCTCCCTTATCATTCTTTTTGTGTTGCTGATCTAGTCCAAGGGTATACT TAGGTCTTTTTCTGTTGCTGATCTAGTCGAAGGTTATACATAGGCCAAATGGTTATGAAGGGTC TTGCTTACTTGATTTGGATTCTTGGATGGTTAGGGAGAGAGGGCTTACTTGATTTTGATTCTTG GATGGTTAGGGAGAGAGGGCTATCGTATTGATCTCTATGTATTTCAGTCCGATATAGTTACCAG AAGATTTTTTTGTCCTACACCATTTTTTCTGTACAAAGCTAGGAAATTCTTTTTCTTTTCCTCG TGGGGCTCTATCAATCCAACTTCGAATTATGAATGCATTTTCTACATTCCTCAACACTGTTTTT TTCATTAATAATGAATGTTACTCCCTCCGTCCCATTTACAGGGTGTGATATTTTTTTTATATAA GACCAAGAAAACTGGTCGTGAGGAAAACAAATACTCTCTTACCCCTAATAAATCGCAAGCATGC AACAATTGATTCATGGCATGCATGCAAAAATTCTGTTGGTAATGCATATTTGATTTGCGCAACT AATTAGTTCTTCCCATCTTCCCAAAGCATTCAACGGTGAGTGCAAAAGGATAAGATCGTGCACC CTCTGTTTTGGGACGGCATAGAAAAAAAATGTGCGCCCTCTAATCTGCGATGGAGGGAGTACAA GTGACAACTGTTATCACTAGTTTTTCTATACTCTGATTATGGTGGTTTGCTGTTTCTCAGTCTG ATCCAAATCATGGATTTAGCTTCAATTTGTAGGAACTGCTTTTATGAATTTATAGTTATGCATG ATCTATCATGATGACATGTTGCATGCCAAATTGAAATGACACCATAACAGTTAGGCATGAAAAA TTTATTTTGACACTGTAAATTGTGTATTGGGTAAGTGTGATGTTCTGCATTGCAGCCTATTAGT TAGTTTGTATAATATTCCCGCTGTGGATTAGCCACTTATGTTCTTCTCAAATATGGTAATAGGC CAGTAAGAATACCAGAGATATGAAACTGACAAAATGGTCATTGAATGGACAGCTGGCATCTATG AGCCTATTTATGTTTTCTGTGCCTTTTAGTATGCTTTCTTGTTGACAAACCTGATTCATAGGCT TTTAACTGTGCCAAAAAAATATGACTTTATGCCTGCGAAATGTGTGGCAAAATATTTCCTATTT TAGATAGATAGTTCCTTCAACTGTCATCTCACCGTGGTAATATGCCTATGGTTTTTATGTCTCC TAAGATAATAATAAATTCTTCTTCTACTCATTTAGCTTGCTTGTTCCATATCAGGTATGCAAAG GAGGGGCATGTGCCATCTTACATCGCTGCTACTTCCTCATCCTGTCAGCAAGCAGATGCAGTAG CTCAGGACACCGAGGTCTTGCCACCATCAGGAAGCTGCCTTTCCTCATCTCCGGCATCACACGT CTGGGCCCGACATGTGAAAGATTGGGGACTCATATTTTACATCAGGGTTGATCTTCAGGGATCT TTCCACACATATCCTGATGTGGGTGGGCCATTTCAAAGCTCACAGGAAGCTGACAAGGCTATTG ATCGCTATCTTGAGGACCATCGGGATCCAAAAATGTAAAGTTCCTCGACTGCTATTTAGATTTT TATTATTTCATTTCTTTTGTTTGATGTGTATGCTTGCAGCTGATTATATTCAAACAAGGATACA TGGCTGATGCTATAATAGTATAGGTGATGGAACATAATGCAGTTTTAAAAGTATGAATCATGAT AACGACGAATGGCCTTTAGTTAAACTACATATAAATTGACACATTGATTAGAAGAAATACAAGC ATATGTTAGTTTTTAAAATTCTTGTTTTGAGAGTAATTAAAGTTAATGGAAAATTTTATAACTG TATTTCTGTGGGAGTTGCTGAAATAGCACAAGTCATTAGCATAGCTGAGAATTATGAAGTGCAT ATAGATGTTATGAGACCACTTTGTATGTAGCTATATTTTTCTTTTAATTGTAATTTATATGATT GGTTAGCCTTTCCTCAGCAGTAAAGAAAAAAAAGATTTCCTAACAATAGGTTCCAAATGAGCTT GGGGTCTAGAATAACAGAAGGGATATCTTAAAAAATGCCTTGGGAACAGGCTTGTAAACAGTCA TTTCATTCTTTTGTTTCGGTTTCTGTTACCACCTTAATCTATTTTAGAGGGTCACTTGGGAGCT TTTGATGCAAGCTAGGACTGATAACATTGAATGAGTTCTTGGTATTATTTTGTGTTCTCCATTT TTTAGGAAGTACAATCCACTAATCGTATCGGATGCTCTGATTTAAACTAGGCACATAGGGCAAA ATGATGATATCTCTTCAATGGAGAATGTTATACGGCGATGCCTTTACTGGCCTGATGGCACAAT TAAGAGGCGTACAAAATCATTTGCGACTTGGGAAGCCAAAAAGAGAATGCACCAATTCATCCAA GCATTAGTGGACAAGTATAATGATGATCACAATCTTTTGGGGGTTTGCTTTCTCTCTATCTCAT TCTCTGTCCTTCTGCCTTGGTTGCACTGTCTTATTTATCTTATTATGTACTCCCTCCGTTTCAT ATTATAAGACTTTCTAGTATTGCCCACATTCATACATATGTTAATGAATCTATACACTTATGAA TCTATACACTTATATGTCTAGATTCGTTAACATCTATAAGAATGTGGATAATGCTAGAAAGTCT TATAATATGAAACGGAGGAAGTAGGATTGCCTATCTGATCCATCCTTTTTATTTTAGGATTTGG CACTTAAACTCAAAGACGTTTTGCACTACCAACCACTTTGTGAGAACCATATGTGGTACTATCA TCTCAATTTCACTGCAAAGACTAAAGAAGATGATGGTTTCGACTCTACTAGTGACAATCTGTTC TTTGTGGAAGTCAAATGTATGGGAAAAGGAAATTATGAAGAAATGGTGGTCAGCTGTTTCTGCG TGATTAATCCTATTGATAATG |