Splice junction sequence |
GGAATTTTTGGGTATTCCGGATCGTCGTTGTGTTCAATATGTGAAGCATCCAGTTCCTCTCAGG CAAAGAAAGCTCCAATTCAACTGGCAAGCACCGCAGgacatgttcctcagatgctgccggccag acctgatattcacacatttaattgctggaggccttcgtaatgaaatttcacaaattgaactcct tgctcgtg
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Assembled circRNA sequence |
Yes
The sequence of a circRNA based on assembly using circseq-cup (Ye et al., 2016) or CIRI-full (Zheng and Zhao, 2018) or CIRCexplorer2 (Zhang et al., 2016).
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Full-length trsnacripts |
Transcript length: 161 Transcript exons: 43389-43453,45621-45716 GACATGTTCCTCAGATGCTGCCGGCCAGACCTGATATTCACACATTTAATTGCTGGAGGCCTTC GTTTTTGGGTATTCCGGATCGTCGTTGTGTTCAATATGTGAAGCATCCAGTTCCTCTCAGGCAA AGAAAGCTCCAATTCAACTGGCAAGCACCGCAG
Transcript length: 175 Transcript exons: 43389-43443,45597-45716 GACATGTTCCTCAGATGCTGCCGGCCAGACCTGATATTCACACATTTAATTGCTGCGATTGGGA GAGGCAATGATGGAATTTTTGGGTATTCCGGATCGTCGTTGTGTTCAATATGTGAAGCATCCAG TTCCTCTCAGGCAAAGAAAGCTCCAATTCAACTGGCAAGCACCGCAG
Transcript length: 188 Transcript exons: 43389-43438,45579-45716 GACATGTTCCTCAGATGCTGCCGGCCAGACCTGATATTCACACATTTAATCAAAAAAAAAATGC TAACCGATTGGGAGAGGCAATGATGGAATTTTTGGGTATTCCGGATCGTCGTTGTGTTCAATAT GTGAAGCATCCAGTTCCTCTCAGGCAAAGAAAGCTCCAATTCAACTGGCAAGCACCGCAG
Transcript length: 189 Transcript exons: 43389-43467,45607-45716 GACATGTTCCTCAGATGCTGCCGGCCAGACCTGATATTCACACATTTAATTGCTGGAGGCCTTC GTAATGAAATTTCACAGGCAATGATGGAATTTTTGGGTATTCCGGATCGTCGTTGTGTTCAATA TGTGAAGCATCCAGTTCCTCTCAGGCAAAGAAAGCTCCAATTCAACTGGCAAGCACCGCAG
Transcript length: 211 Transcript exons: 43389-43464,45582-45716 GACATGTTCCTCAGATGCTGCCGGCCAGACCTGATATTCACACATTTAATTGCTGGAGGCCTTC GTAATGAAATTTAAAAAAAATGCTAACCGATTGGGAGAGGCAATGATGGAATTTTTGGGTATTC CGGATCGTCGTTGTGTTCAATATGTGAAGCATCCAGTTCCTCTCAGGCAAAGAAAGCTCCAATT CAACTGGCAAGCACCGCAG
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Transcript length: 223 Transcript exons: 43389-43476,45582-45716 GACATGTTCCTCAGATGCTGCCGGCCAGACCTGATATTCACACATTTAATTGCTGGAGGCCTTC GTAATGAAATTTCACAAATTGAACAAAAAAAATGCTAACCGATTGGGAGAGGCAATGATGGAAT TTTTGGGTATTCCGGATCGTCGTTGTGTTCAATATGTGAAGCATCCAGTTCCTCTCAGGCAAAG AAAGCTCCAATTCAACTGGCAAGCACCGCAG
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Transcript length: 287 Transcript exons: 43389-43469,45511-45716 GACATGTTCCTCAGATGCTGCCGGCCAGACCTGATATTCACACATTTAATTGCTGGAGGCCTTC GTAATGAAATTTCACAAGTAGTCCCTTGGCACAAGCTAGGGATGATGGATATGATTTTTTTTAA CCTTTTTTGGTTGGATAACTGCAAAAAAAAAATGCTAACCGATTGGGAGAGGCAATGATGGAAT TTTTGGGTATTCCGGATCGTCGTTGTGTTCAATATGTGAAGCATCCAGTTCCTCTCAGGCAAAG AAAGCTCCAATTCAACTGGCAAGCACCGCAG
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Genomic sequence |
GACATGTTCCTCAGATGCTGCCGGCCAGACCTGATATTCACACATTTAATTGCTGGAGGCCTTC GTAATGAAATTTCACAAATTGAACTCCTTGCTCGTGGTATGCGGATACTCTCCTCTCTTATTCT TATTGTATTTCTCTCTTTTATTTTAGGAATGCTCTCTTCAGGTTATTTGTCTAAGAGTCCTCCA TCGTAAGTTTATTTTTCTAATATAAACTTATGATCCCCCCTTCTCAATTATTGTTTGTTGTATG CAGGGTTTTCACATGGGAAATTGGGATTGCCAGAAGCCGTTTCAATTCAACTTGCAACAAGAGG TGCTTATGCTAGTCTGTTTTGTGATGAAGATGCACTTTTGCTTATGAAGGCATGATGAAATCTT ACATAGTATTTGGAATGAACGTTTTACATTGTAATTAGTCTTGGCAACAGCATCCAGCAGACTA ATCTTAGTGTAAGCACATGTTTTACATGAAACAAAGTCGTCTCTGTTCATGTTGCTTCTGGTGT GTTCTTTTTGAGGACTGCAAACTGTGTTTAACTGTTTATTGTATCATGCTCAGAAGGCATTAGT CATAAGCAGCGAGTCCAGTAGAAATGTTGGAAGTTAATCATACCAGGGCATTCCATCTATGGTA TTTTATGCAGTTTTACTTGGACTATTGTGTCCACTGTGAATCATCACTAAGTTCAACTAGATAG ACATATCTAAGCTCACAATAAAAATCTCAAGCACACTGTTCTTACCGTATTGAGTTTCCTTGAG TTTATTTTTCAATGAATTTCAGTCTGGACCCTCTCTTTTTTGCCAGTGTTTCATTTTGGACACC ATTTAGCCCATAGTTTCACTTTGTCCCCCTCTTTTTACTTGTTTGTTTCTCTTTGGACCCTTTC CCTCAACATTGTTGCCATCTCCGGGTAGGCGGTGGTGGAGACATGGCTAGGGAGGAGATCGCCG ATGGCACCCGGACTTAACCTTGAGAAAAAGAGTGTAAAGGGTCCAAAGTGAAAACTAAAGGTAA GAAAAAGCGGTCCGAAGGGAAAATATGGACCAAAGGGGGTCCAATGTGAAACTATGAAGAAGGG GTCCAAACTGAAAATCCCTCTTATATATTAAACCACATAAGTTTATCTTATCTAATGATGGGGT GGCAGGCATGATTATATCACTCTAAATATGTTTGAATTTATTAGAGGGGAAATGGTGGGGTGTT TTATTTGCAGAAAAAACAATAAAGAGGAAATTTGCAAGGTCGAGTTAAGTTTTAAAAGATGGCT GGAATTAGTTGTATGCTGATAATCTTTTCATAGAGAAACTGTTTGGTGCCTGTAAGTGCATTAT GCACGCTTCAAAAAGTCTGAAAATATTGATTGGATGCTTTCATTTGATGTTTTGCAAACATACT GAATTTTATGGTAAAGTTCGTCCATTCAACATAATAATGGGAAAAAAACACATCATCAAGCACT GCTTCTGTTAAATGGTTCTTTGCATTATGGAAAATTTTGAACCTTGGAATTTTGCATATACGCA TAACATACTCTATCCTTGAAATCAAGGTTGCCCTGCAGGATATATTAACTTGATTATGTTATCC TTTGAACAGAACTAAAAGCTGCTGGAAAGTTATGGAACTTTGAACTATCAATATCTTCTTACTT CAAGTCTGATTTATGTCCTGTTCCGAATTTCCATTGATGCACATGGCTATTATTTGGTTTTGTG GTTTGTAATTTAGTCTTTGTGCAAATTGGTAGCATTGTCTGAATTCTGTAAAGCATTGCTCCTT CCATTTTTATGTGTGCAAAGAAGTATAGAGGGCTAATATGTGGCTAAACTGCACTTGTTGCCTT GTTGGTAATCATGGTGCTATATTTTCTGGAATTTGCCTTTGCTTAGCTTAACTTCGTTTGTCAC TATGACAGGTCTAAACAATTTCTGTTACTGAAAGGCAAGGGGTTTCTTCTGGCTTGTTTGGTAT GGCCGTTGGTTACTCTGATGAAGTTGAGGGGAGCTTCTGTGGCAAGTTCAATGCCAATGCTGGA TTGAAGAGGCAAAATGTAGATTTGTACAAAGAAAGAGGGTACTCCATGTACAGTTGATAACATT ATTATGCGTTGTAGTCCCTTGGCACAAGCTAGGGATGATGGATATGATTTTTTTTAACCTTTTT TGGTTGGATAACTGCAAAAAAAAAATGCTAACCGATTGGGAGAGGCAATGATGGAATTTTTGGG TATTCCGGATCGTCGTTGTGTTCAATATGTGAAGCATCCAGTTCCTCTCAGGCAAAGAAAGCTC CAATTCAACTGGCAAGCACCGCAG |