Splice junction sequence |
AGGTGACGTACAAAACTCTCCTGGCAGCACGCATCAATTATGGATCACTACAGGAGGTCCAACA GTGTTTAGCGATATATCAGGAGATGAGGAAAGCAGGgatatggattctatgttcaagacatcgt gaaccccatggatgtactgaaaatatttgtcaagcagcgtgacccagatatagctataaggtga tcttatca
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Assembled circRNA sequence |
Yes
The sequence of a circRNA based on assembly using circseq-cup (Ye et al., 2016) or CIRI-full (Zheng and Zhao, 2018) or CIRCexplorer2 (Zhang et al., 2016).
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Full-length trsnacripts |
Transcript length: 1356 Transcript exons: 141093149-141093236,141093467-141093671,141094237-141094 344,141094680-141094844,141094931-141095475,141096409-14 1096474,141096575-141096655,141097345-141097442 GATATGGATTCTATGTTCAAGACATCGTGAACCCCATGGATGTACTGAAAATATTTGTCAAGCA GCGTGACCCAGATATAGCTATAAGGTATGCACGCATATTTCCTAGTTCCCAACTTTTACTCTGC AATACCATGGAAGCTTTTGGAAAAAGAAAGGAGTTGAAAAATGCTTTATTGATCTTTGGAGCCC TTAAGAATCAGCTTGGAGGCATCAATATGTTTGCATGCCGAAGTATAATAGATATATGTGGCCA TTGTGGCTCTTCTGTACAGGCTCGAATTATATTTGAGGGGCTGCTTGCTGATAAGATTACTCCA AATACCTATGTCTTCAACAGCCTAATGAATGTTAATGCCCATAGCTTGAGCTACAACTTTTCAG TCTACAAGCATATGCAAAATCTTGGTGTCCCTCCTGATTTGACTTCATATAATATTCTTCTCAA GACATGCTGCAGTGTCAGAGAATTCAACTTGGCTCAAGAAATTTATGAGGAAATGAAGAAAAAG GAACGTGATGGCCTTTTAAAGCTAGATGTTTTCACATATAGTACAATGATGAAGATGCAAAAAT GTGGAAGATGGCTTCCAACATCAAAGAGGATATGCAAGCAAACGGGGTTCGTCTTAACCTAGTA ACATGGTCATCGTTAATCAATGCTTATGCAAATTCTGGTCTGGTTGATCGTGCAATAGAGATCC TCAAAGAAATGATAAGGGATGGCTGCCAACCTACTGCCCCATGCTTCAATATTATCCTTACTGC ATGTGTCAAGTCATGCCAATATGATAGAGCTTTCCGCTTGTTCTACAGTTGGAAGGAGTCTGGT ATCAAGATCTCTCTATCCTCTGAACAGAAGAGAGTTATTGATGGTGGCTTTACATTCTGTAAAG AGTATCCTAATAATGACAGTACTATATTGGTGGTTCCATTCAGGCCAACAGTCACAACCTATAA CATCTTAATGAAGGCTTGTGGTACTAATGCAGAACGTGCAAAGTCTACCATGAACGAAATGAGG CGGAATGGCCTTTGTCCTGATCTTATTAGCTGGTCTATACTCATAGATATTTATGGATCTTCTC AAAATAGGGATGGAGCTGTTCAGGCACTAAGGAGAATGCAGCGAGTTGGGATGAGACTTAATGT CTCTGCATATACTGTTGCTATTAAGGCGTGTGTTGAAAACAAAGATTTGAAGTTAGCACTGCAC TTATTTGAAGAAATGAAAACACACCAACTGAAGCCCAATTTGGTGACGTACAAAACTCTCCTGG CAGCACGCATCAATTATGGATCACTACAGGAGGTCCAACAGTGTTTAGCGATATATCAGGAGAT GAGGAAAGCAGG
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Genomic sequence |
GATATGGATTCTATGTTCAAGACATCGTGAACCCCATGGATGTACTGAAAATATTTGTCAAGCA GCGTGACCCAGATATAGCTATAAGGTGATCTTATCACATCTTCATTTAACATGTCAAATTCTGT CAACTAACTACATGATGATTACTTCAAGGATGTTAGTGTTTGCATGGCATGTTTCTTGCGGGAG ATTTAAGCTTTATGCAATACATAGTAGTGGGTTTCATTCTTGGATCATACTCTTGAGATTTGTT AAAATTTCATATTCTTTCCATCAATCTTGATACCTGCAATGCATTGTTTTTTTGACATGAAGGT ATGCACGCATATTTCCTAGTTCCCAACTTTTACTCTGCAATACCATGGAAGCTTTTGGAAAAAG AAAGGAGTTGAAAAATGCTTTATTGATCTTTGGAGCCCTTAAGAATCAGCTTGGAGGCATCAAT ATGTTTGCATGCCGAAGTATAATAGATATATGTGGCCATTGTGGCTCTTCTGTACAGGCTCGAA TTATATTTGAGGTACTTGATATCCCTCACTGACTACAGTTATTTTGACTGTTTGCTGAGTTTGC TGCTTTACATTCATAGATATATTCATTGAATTAGAAATAGGTTCCCTAAGTTTAGAGAGTTCCA TATATTTAAAGCTAATAAGGTGTGTCTAAAAGGGATATCTTTGTAGTCATTGCTAATTAAGAAA AATCAAATTAAATCCCTTATTCGTTAAAGTTCTCTCTCTCTAAGATGAAAGAATGTAAGATTTG GCACAAAGATAGTAGATTGATTATTAGGGATATGAGGTTACACATGTATAGGCAAGGATGACCT AGGTTTATAGAAACAGAACCAGTGGTGATCCTTGCCTAGTAGATATCAATCTATCTACCCTAAC CATGTAGGCAATAGGCCCAATAGGATGCACAGGCCCATAGGGTCGCTGGCTCGCTGCATCTTTG TCTAACAAAGAGGAATACACAAATTTTATCCAACTAAGTACCTTTTGTTCACCTGCTGTAGACA GGTGCTCTAATACTCAGGCGGTTCCAGACTTCACTCATATATCATACATGTGAATCATGTGCAG GGGCTGCTTGCTGATAAGATTACTCCAAATACCTATGTCTTCAACAGCCTAATGAATGTTAATG CCCATAGCTTGAGCTACAACTTTTCAGTCTACAAGCATATGCAAGTAATGCATTTTCTACTTTA TTGTTGCTGTTCATAGGTAGGCTGTTTTAGCTTCATCAGATTGATTCTGTTGCATCACATTTTG CCTTTTTTGTGGCCGGCCTAATGTATCTAGTTCTTCTAATTTGCTATGTTCTGCCCAATTTCTG TCTGCTATTGCATGGTTGTTCATGTTGTTTTAAATTATATTCACTAAAACAATATTTACACTGC TTTTGGTTGTTCCTTTGATTCACTTTTCCTTCATCCATGACCGAATATGTTTTATAATCTTATG CACAGTGCAGACACACAGTGACCTTAAGCTACTGTTTACACCATTTTGTGTTTTTGCAGAATCT TGGTGTCCCTCCTGATTTGACTTCATATAATATTCTTCTCAAGACATGCTGCAGTGTCAGAGAA TTCAACTTGGCTCAAGAAATTTATGAGGAAATGAAGAAAAAGGAACGTGATGGCCTTTTAAAGC TAGATGTTTTCACATATAGTACAATGATGAAGGTATGGGGGCTCTTGTTGTTGTCCATGCATTA TGGCTTTTTATGGTTTCCAGAATTCTTTTCTCTTTAAATTCCAGGTGTTTGCAGATGCAAAAAT GTGGAAGATGGCTTCCAACATCAAAGAGGATATGCAAGCAAACGGGGTTCGTCTTAACCTAGTA ACATGGTCATCGTTAATCAATGCTTATGCAAATTCTGGTCTGGTTGATCGTGCAATAGAGATCC TCAAAGAAATGATAAGGGATGGCTGCCAACCTACTGCCCCATGCTTCAATATTATCCTTACTGC ATGTGTCAAGTCATGCCAATATGATAGAGCTTTCCGCTTGTTCTACAGTTGGAAGGAGTCTGGT ATCAAGATCTCTCTATCCTCTGAACAGAAGAGAGTTATTGATGGTGGCTTTACATTCTGTAAAG AGTATCCTAATAATGACAGTACTATATTGGTGGTTCCATTCAGGCCAACAGTCACAACCTATAA CATCTTAATGAAGGCTTGTGGTACTAATGCAGAACGTGCAAAGTCTACCATGAACGAAATGAGG CGGAATGGCCTTTGTCCTGATCTTATTAGCTGGTCTATACTCATAGATATTTATGGATCTTCTC AAAATAGGGATGGAGCTGTTCAGGTTTCACGCTTCAAAGTTTTATGTTGATATCTTTTGCACAA TATAATCTGCTATGACATTTGGCCTTATATCAACTTTTGTGTCAACTAAATATGCCTTTGTCGT TTGTATTATGTTCAAGTATTCAACTTTATAAGAGTTTGATATACCTCTTGTGGACATAGAATCA AAGAACTAAAAGATTTAGATGATACAACATATACTGAATTATTTTATGAACCCACTTAGCTTGT GGAGTTCTGGCTGCAAAAATAAAAAGGGTAGACCTAGTGCCAGAAGCTCCCACATAAGGGCTTG TTCGGTTTCATCAAAATCCATATGGATTGGAGGGGATTAGGTAGGTTTCAATCCATAGTAAGTC AAACTTCTTCATAAATTTTTCCGATCCCTCCCAATCCATGAGGCATAGAAATAACCGAACAAGG CCTAAGGGCTTGTTCGGTCTTACCCCAATCCATATGGATTGAGGGGGATTGAGAGGGTTTCAAT CCCTAATAAGTCAAAATCCCCTCCAATCCGTATCAATCCCCTCCGATCCATATGGATTGAAAAT AACCGAACAAGCCCTAAGTGGGGTCTGGGAATGGGATAAGCCGAGGCGAGCCTTTTTCTTGAAA ATGCGGAGAGGCTGATCCGAACCCATGGTCCGGTGACTTAGTGAGACAGCTCTCGTCACTGCAC TAGGCCTACCCTTAATTTGCATTCCATGGTAATTCAATTTCTCAGTATCACAGTTGCAGAAGAT GCTCATATCTATGTAGTATGCCTTTCCATTTTCTGTACTGTCCTCGCACTGTTGACAATGTTCA TGTGATTTTTTTTATCTGGATAAACATAGGACGGCACTTATTTCTTAATGTGGATTGTTACGGT TTTAGTTTTTCCCTAATAAATAATAAATTAATTATTGTTATCGTTTTCATTTTGACATAGGCAC TAAGGAGAATGCAGCGAGTTGGGATGAGACTTAATGTCTCTGCATATACTGTTGCTATTAAGGT TGGTCACTGGACAACACCTTTTACTTGATTAATCGGCACTTCTTTTTTATTTATAGACTTATTG TCTGCCAGTAAGTTTTTGCTACAATATCCTCCAGGCGTGTGTTGAAAACAAAGATTTGAAGTTA GCACTGCACTTATTTGAAGAAATGAAAACACACCAACTGAAGCCCAATTTGGTGAGTTTTATCT AAAACTTAGGTACAAAACTTTGATGCTTTGCTTTTTCTTAACTATAAGATTTGGTGCTTCCTAT GAGCTATTTGGCACCTGGCAGCATTTAAGGTTCAGATGAAAGCTTAGGCTTTATACATTGTACT CCATTTGTTCCAAATTATAAGATGTTTTTACTTTTCTAGATACATTTTTTGCTATGCATCTAGC TATACATTATGTTTACATACAAAGTAAAAGAAATGTATCTAAGAATGCCAAAACATCTTATAAT TTGGAACGGAGTGATTACTAAAGTGTTGTTAATTTCATCCAGAGTAGCTTGTGCCTATTGTTGA CTGCTAAATGCCTCAGATGCATGCATAATTTATTTGTGTCAGTTATTTGGGTTGATTAGTTGGA TAGCCCCTGTAGCCTGTTGATGTTAGACATTATGATACAACACATGCACGGTTAGGGGTGATAA TGGATCACGATTCAAATATTTGTTCACAGTAAGTTAGGATCCTTAATTAATTTTAGTTCAAAAA TGAATAGGAATAGAGCTTGATCCTAATCCGATTTGATCCTTAAATTTTGTAGTATAAAATCTAG AGCCCATTACCACCCCTATGCACAGCCCAATGGTTTGCTCTACATCAACCTGCAAACATTCCGT CGATGTAATTGCATTGACATAGGAGTTCATTTTCAGGTGACGTACAAAACTCTCCTGGCAGCAC GCATCAATTATGGATCACTACAGGAGGTCCAACAGTGTTTAGCGATATATCAGGAGATGAGGAA AGCAGG |