| Splice junction sequence |
GATAATTGTTGAGCATTATGGACTCCAAGTTGATCAGTCTGCTATAACGGTTTTTGTCTGCCTG ATTCCGGTTGTTATTGATGCTTGTGTGAAGCTTTGGgttagacttacgagacgagttcagatta gagaaccgtaaagcatttgccaacatatggtcagatatggtatttggcatttcactgttccttg tcttacac
|
| Assembled circRNA sequence |
Yes
The sequence of a circRNA based on assembly using circseq-cup (Ye et al., 2016) or CIRI-full (Zheng and Zhao, 2018) or CIRCexplorer2 (Zhang et al., 2016).
|
| Full-length trsnacripts |
Transcript length: 349 Transcript exons: 100015-100129,103319-103416,103899-104034 GTTAGACTTACGAGACGAGTTCAGATTAGAGAACCGTAAAGCATTTGCCAACATATGGTCAGAT ATGGTATTTGGCATTTCACTGTTCCTTGTCTTACACCTCAATCAAAGTAAGGTGGCTTTGCTGA AATTTGCAGGTTACAAAATAATAAGTAATATTTCAGATACTGGAAAGGCATTTCTCATTATACT GATTACAGACATTTTTTTAGGGTATCATTCTGAATCGGGTTGGCAGACTTTGCTTGAGATAATT GTTGAGCATTATGGACTCCAAGTTGATCAGTCTGCTATAACGGTTTTTGTCTGCCTGATTCCGG TTGTTATTGATGCTTGTGTGAAGCTTTGG
|
| Genomic sequence |
GTTAGACTTACGAGACGAGTTCAGATTAGAGAACCGTAAAGCATTTGCCAACATATGGTCAGAT ATGGTATTTGGCATTTCACTGTTCCTTGTCTTACACCTCAATCAAAGTAAGGTAAATATTCCTT CACAGTCTCTACATGATGGTTTTCCCACATCTAATATTACTGTTTTGGTTTATTACAAATAAAA TATTTTCTACACAATCTGGCAATCAATTTGGGGATTCATTATCTTTAATCAATAAACATAGGCA ACATTCTTTTCTGCATAAGTTTGCAATATTCTCTCTTTTTATCCAAAAATACTGTTTCCTTTAG ATTTACAAATTATTATAAATTGGTAACTCTGCACCAACACTGGCACTTGATTAAAGCTGTAGCA TGCATGTAGAGAAGTAGAACAAAGATCAACAAAGTTCCTCTTTTTTTCATTAAAAAATGTTCTG AAAATGTTGTTTCTCCTTTACTCTTTTTTCTCAATAGAAAGGAATTTTTTTGAAGTTTAGCCAG GTTAAGATATACTTTTTGTAACATAAAAATCCAGTGGAAAACATATAATTTTAGATGGAACCAG GGGTTTGGATTTCCATTAAAGGTGCTGTTTCTCTCTTGATCAATTTACTGATAGGATATTATTA TTTTCATCATCATCATCATCACCATCTAAACACATACTTCCTAGGTCCCAATACCAGTCACATT TTGATTCTTATGGGTAAATATTTCTGACTTTAACCTCTTATTATTTTATATTCATCATTTATAA AATTACAACAAAAAAGAAGATCTTTTAAAAGTTTTGAATGAAATTGTTACTAAAACTATATTTT ATAGAACTTAATTCATTAAAATGTTAAAAATGATAGATGTTAATTTTAGAAAATTTAACAAAAA GAAAAGTCATTTGTGATAATTTAATTGGGATAGAGATAAGTTTTCCTTGATTTATATTGTATAG AAGTATGTCAAACATATAGAGCATGTTTGGTTTCTTGTAATCCCTATTCAATACAGTTCTTATT AGGTGGAGTTCATCTGTTTATTTGTTTGGTTTAACCTTTTCGCCAAAAGAGTCATCCCTTGTTC CAAGACTATTCGTTGAATGGCGTGAATAGCCATTTAGAGACCCTCCCATTGAATGGCTATTCGG CTGTAGATTTTCCTTTTTTTGGTCAAAATTGCCCTTTTTACAAATCTTTTGCAGTCTCCCTTTT GATCAAGAAAAACATAATTCTTGTCTTTTATTAAGACCTGTTTTCCTTTCATATATATATTTTC ATAATAATACATCAAACACGGTAGCATAACAACCCAAAGATCACTTTTTTTATACTTTATATTG ATGACATATTATGACGTGAGATGACAAAGAAGAGATGGCTTAGTTAAAGAAACAATTGACTCAG GAATTTGAAATTAAGGATTTGGGGAAATTTCAATATTTCCTTGGAATTAAAGTTGTTAGATCAA GAAAAATAATCTTCATCTCCCATCTCTTGACAAAAATAGGTATGATAGTTGCAAACTATCAAAA TCACTTATTGAAAGCCATCAAAAGCTGCAAGCAAAGATTGAAGAATCTGTGAATAGTGAGAGAT ATCAGAGATTGGTTGGACAACCAATTTCTCTCGCTCACACTAGATCAAATATAACATATGCAGT CAGTTTGATAAGCTAGTTCAGGCATGATGATCGAGAATCTCACATGCATGTCATTTTTTACATT TTATGTTATCTAAAATCTGCCCCGAGAAAGGGTCTCCTTTTCTCCAAGCATGGTCACCTTCGGA GTGAGGCCTTTAAAGATGCAGGTTGGGTTGGATCTCCAAATTATAAGAGATCTACCTTTAGATA TTACACATTTGTAGGAGAAAACCTAGTTATTTGGGGTAGCAAGATGCAAAGTGTAGCTGATCAA TCAAGTGTGGAAGCAGAGTATAGGGTTACGGCTTAGGGTGTCTGTAAGCTTTTGTGGTTCATGA AAAGTATTGGAAGAATTAAATTTTTCATAAGATGGATTGTCCTTGTACTATGACAACATGGCTG CCATCAGCATAACCAAAAATTTGTTGCAACATGATTGAACTAAACACATTTAAACTGATCCATA CTTTATCAAAGAAAGTGAACTACCAATATCTTGAGCTTTTTTCATTTGATATTCGACAAGCAAT TAGATAACATTTTCACTAATGGACTTAGCAATAAGATCTATCACAATTTGGTTTGCATGTTGGG CATATGTGATTTTATGCACCAGCTTGAAGGGGAGTTTTGACCTATCAAAATCCACAACCTTATT ATAGAAAGATTGATGGACACAATCCTAAATCAACCTTCAAATTTATTTTTGAAACTTGATAGAT TAAAAATCAAAATATATTCATTACAAAACTCTATCATCTAGCAAACTTAGGAGTGAGGTGGTGT TGTTAATAAGGAAACCTTAGAGCTAAATGATTAGAGTACTGCAAACTCTTAAGAGCTGCTATAG AACCTTTAATAACAAACGTTATTTTCCTTAGGTGTGCCACTTTCAATAATGTTTTTTTTTATGG AATGCCTATTTCTACCCTTAAGCCCCCCAACCCTTAAATTGGATGGAAAATGCGGTTAAATGTG CTTAATCGACGTCCTCCTTGTTGTTGCAATAGGAACTATGCCAATCAAGTTAAGAGTTAAGACT CAATTGGCACTTACAATGTTAGTTTCTTATTTAAAAGAAGGTCGTAAAATGAGCTTCTTGTCTT GATACCCATTATGTCTATCCCAGAAGCATCACATGCTAGTTCCAAAATTCTAGATCCAATAATA TAAGAGCCTCAATTAGTCTCTTCTTGGGATTCATGTTAAGGTATAGCAATTGGTTTAGTAAAAG TCAAAGCTAAACGCACTGCACTGGAACGCATTGTCCATCCGAAGGGCCCCTCTATCACCAAGGC TTGTCGTTTTCATGGCTTGGTTTCTGTATATTGGAAAGTCCATAAAAATAAAGCCCACCTAAAT ACCAAATGAAATCCGATACAATAAACAAGCCCACAAGACCTATTTCCTAAAGTTCGGCAGACTG TTAGAGATAATTGTTGAGCATTATATCTATATCCAGGTTATTGTTATGTATATATCCAGATTAG TGATTTGGTTATTTCTGTTGTTTAATGTTATGTCTATATCCAAATTATTGTTCTTGCAGAAGCA TGCATGAGAATGTTACTTGCTTTTTGTATCATTCTATGCATCCTGATTTTGTGTACTTTTACTA AGTGCATATTTCATCTAATTTTTCTCACAACCTTCTTCAGGTGGCTTTGCTGAAATTTGCAGGT TACAAAATAATAAGTAATATTTCAGATACTGGAAAGGCATTTCTCATTATACTGATTACAGACA TTTTTTTAGGGTAATGTGCTTTTATATCGTAGTTTTAAGTGCTACTTATATATTTATATGTTTA TGTACTGAGTTAATATTGAATGTTTTAAACAATAGTAGCTTCTATGAGAGAGAATATAATTAAT GTTTTTTACTGCTTTAGATTAAATTTGTATTTTTTTAAAATCTATATGTGTGTAAATATACATT GAGCAGCTTCTTATATCATTTGATAGACACATCCAAGTCTTAATCAGAAGAAACCAAAGTCATA TTACCTGCAGATATGCCAGTTATAAGCTATGCTTTTGGTCTCTAGTCAAAATGGCCAAATGCCA AGAATTCTATCATGCTAATTAATTTTTCTTATTGAAGGTTTCTCCTAATTTCATTTTCGTCTTC TTGACCCCAAACTTGCCCTTGTTTACTAAAAAAACATAGTATAGAAAAGGTGAGTTTTGCAGTT CCTTTTTATTTCTAAAGTATAGCTTATGACTGGCCCATCTGCAGGTATCATTCTGAATCGGGTT GGCAGACTTTGCTTGAGATAATTGTTGAGCATTATGGACTCCAAGTTGATCAGTCTGCTATAAC GGTTTTTGTCTGCCTGATTCCGGTTGTTATTGATGCTTGTGTGAAGCTTTGG |