Splice junction sequence |
CTTTGACTTTTTTTTCAGGGGCTTCACGAAGTTTAACAGAGCTGACTTCACCAAGTTGAGGCAA GAGAAGCGTGTTGTCCCTGATGGTGTCAACGCTAAGgacctgcgaggtgttaccgtcagatcaa gggtaagccatacccaaagtctcgctactgtcgtggtgtgccagatccaaaaatcaggatctac gatgttgg
|
Assembled circRNA sequence |
Yes
The sequence of a circRNA based on assembly using circseq-cup (Ye et al., 2016) or CIRI-full (Zheng and Zhao, 2018) or CIRCexplorer2 (Zhang et al., 2016).
|
Full-length trsnacripts |
Transcript length: 584 Transcript exons: 4888549-4889050,4889146-4889227 GACCTGCGAGGTGTTACCGTCAGATCAAGGGTAAGCCATACCCAAAGTCTCGCTACTGTCGTGG TGTGCCAGATCCAAAAATCAGGATCTACGATGTTGGTATGAAGAGGAAGGGTGTTGATGAGTTT CCATTCTGTGTCCATTTGGTGTCATGGGAGAAGGAGAATGTGTCAAGTGAAGCACTTGAAGCTG CCCGTATTGCTTGCAACAAGTACATGGTGAAGTCTGCTGGAAAAGATGCTTTTCATTTGAGGAT TAGGGTTCATCCTTTCCATGTTCTCAGGATTAACAAGATGCTTTCGTGTGCTGGAGCTGATAGG CTTCAGACTGGTATGAGAGGTGCTTTTGGTAAAGCTTTGGGTACTTGTGCTCGTGTTGCTATTG GACAGGTTCTTTTGTCTGTTCGTTGCAAGGATGCCCATGGTCACCATGCTCAAGAGGCTCTTCG TCGTGCTAAGTTCAAGTTCCCTGGTCGTCAAAAGATTATTGTCAGCAGGAAATGGGGCTTCACG AAGTTTAACAGAGCTGACTTCACCAAGTTGAGGCAAGAGAAGCGTGTTGTCCCTGATGGTGTCA ACGCTAAG
|
Genomic sequence |
GACCTGCGAGGTGTTACCGTCAGATCAAGGGTAAGCCATACCCAAAGTCTCGCTACTGTCGTGG TGTGCCAGATCCAAAAATCAGGATCTACGATGTTGGTATGAAGAGGAAGGGTGTTGATGAGTTT CCATTCTGTGTCCATTTGGTGTCATGGGAGAAGGAGAATGTGTCAAGTGAAGCACTTGAAGCTG CCCGTATTGCTTGCAACAAGTACATGGTGAAGTCTGCTGGAAAAGATGCTTTTCATTTGAGGAT TAGGGTTCATCCTTTCCATGTTCTCAGGATTAACAAGATGCTTTCGTGTGCTGGAGCTGATAGG CTTCAGACTGGTATGAGAGGTGCTTTTGGTAAAGCTTTGGGTACTTGTGCTCGTGTTGCTATTG GACAGGTTCTTTTGTCTGTTCGTTGCAAGGATGCCCATGGTCACCATGCTCAAGAGGCTCTTCG TCGTGCTAAGTTCAAGTTCCCTGGTCGTCAAAAGATTATTGTCAGCAGGAAATGGTATGTTCAA AGATTGATCCTTGAATCATTTTGTTGTTTGATTGTTTTATGGATACAAGTAAGCTAACTCATCA AGTCTTTGACTTTTTTTTCAGGGGCTTCACGAAGTTTAACAGAGCTGACTTCACCAAGTTGAGG CAAGAGAAGCGTGTTGTCCCTGATGGTGTCAACGCTAAG |