Splice junction sequence |
AGGTCAAGTCGATCATTGGATTGAGCCGTATCTCAGGCTAACAATTGATTGGCTGCGTCGTGCA GTGAAGCCGTATCTGAAAAGCTTACTTGTACAAGTGatgtgtatgaagaagttctggagatagt ctcctatatgacattttactcaccaaccatttcactggaaatgtggggcttgtggcctttgatg atggaggc
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Assembled circRNA sequence |
Yes
The sequence of a circRNA based on assembly using circseq-cup (Ye et al., 2016) or CIRI-full (Zheng and Zhao, 2018) or CIRCexplorer2 (Zhang et al., 2016).
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Full-length trsnacripts |
Transcript length: 416 Transcript exons: 15872776-15872907,15874059-15874162,15874263-15874442 ATGTGTATGAAGAAGTTCTGGAGATAGTCTCCTATATGACATTTTACTCACCAACCATTTCACT GGAAATGTGGGGCTTGTGGCCTTTGATGATGGAGGCCCTTAATGATTGGGCCATTGATTTCTTT GAGAATATTCTGGTACCATTAGACAACTACATTTCCCGTGGCACTGATCAATTTATTGCATGCA AAGATCCTGATTATCAGCAAAGCCTATGGAGAGCACTGTCATCTATTATGACAGACCAAAACAT GGAAGATTCTGACATTATACCTGCTCCCAAGCTGATTGAAGTCGTTTTTCAAAATTGCAAAGGT CAAGTCGATCATTGGATTGAGCCGTATCTCAGGCTAACAATTGATTGGCTGCGTCGTGCAGTGA AGCCGTATCTGAAAAGCTTACTTGTACAAGTG
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Genomic sequence |
ATGTGTATGAAGAAGTTCTGGAGATAGTCTCCTATATGACATTTTACTCACCAACCATTTCACT GGAAATGTGGGGCTTGTGGCCTTTGATGATGGAGGCCCTTAATGATTGGGCCATTGATTTCTTT GAGAGTAAGTCTAGTTTTGAATGGCAAGCAATTATGTTTGTTTTAAACTGAGAGTTCTAGATTA AGCATATTCCTGGGTTTTCTTGCAGTTTTATGTTTGTTATATTTGCTTGTGCTATTTTCCAATG ACAATCTTGTTTAGTTGTATGAATGCTTGTAATTTGGAAAGTCATGCATGATTTAAAATAATAT CTGAATCACCTTGTATTAGTTTCCATGTGCCCACTTCACTAGTTTGTTCAGTTTGCATGTCATA TTATTTTCTGATTATTTTTTTTATTTGGTTCGTGCTCATTTATAAAATTCTTCCAAGTCGCTAA TAAAAAATGATTAGGTTTCCTAACCTTAACCTGGATTTTAGCAGCTCAAACCTTTTTTTTTGTG TCCAGCGACTAATCTAGTTAGTCTCAGATTATGTTTGGCTAGATCTGCTTTGTTGTTTTGATTA TTAGTAAAAGAACAAACTATTATAGTTGAGGTCGGCTTGCTTATTGCTGCACCTATTTTGTGGG TCAACTTATTCCTCACTTAGAATGGTTCGAAAGGCATTTATTGTGTTAAATTAATGCTTCCTAA CGTGCATGTGTTTGCAAGATTAGACCTTCAACCAATCTAATACCTTGGACCAAATGCAGCCTTT GCATTGTCTATTCTTACATTATTCATTCGTCAGGATTATATAAGATGGTTATGCCACTTAGTAA GGAATTGAATTTATGAAACTAGAACCATCTTGTATTGTTAAGATTCTGTTTAATTGAATTGAAA TTATGATTTCTGTGTGATAGTTTAGCATGCCGGTATCTGGTATCCATTATGCAAAAGGAAAATT TTGTATTCACATGTGCATCCAGATTTTAGATAAGAACATCAGGAATAGTTGTGTCATCGTTTGT TCCTTTGAATTGGAATCCTTGTTTTACATATTTGGTATAGTACTAGAAAGTATTGAAATGCCAA CTGCTTGGTTGTCTATCCTTCAGAATTTTTTTTAGTCAGCTGCTAAGACTGTTTCTATCTGTAG AAAATTGCTTGGTTCTACCCTCAGGCCACTAGATGGAACTAATCTCCTACCATCAACTATATTT TCAGAAGCAATTGTATTATCTTTGACATCCTTTTGCTACATTATTCAATGTTCTTATTGCCCTG CAGATATTCTGGTACCATTAGACAACTACATTTCCCGTGGCACTGATCAATTTATTGCATGCAA AGATCCTGATTATCAGCAAAGCCTATGGAGAGCACTGTCATCTGTGAGTGAATTAAATTCATGT TGCATTAAAATTTGCTCTGAAATATTTTGTAAAGTTCCTAGTTCCTGTAATTTTTACAGTTGAT TACAAATAATTGTAGATTATGACAGACCAAAACATGGAAGATTCTGACATTATACCTGCTCCCA AGCTGATTGAAGTCGTTTTTCAAAATTGCAAAGGTCAAGTCGATCATTGGATTGAGCCGTATCT CAGGCTAACAATTGATTGGCTGCGTCGTGCAGTGAAGCCGTATCTGAAAAGCTTACTTGTACAA GTG |