Splice junction sequence |
AGGATGCAAGACTCCTCTTTATAAATCAACCACGAAGTTCGATTCCGGATGTGGCTGGCCAGCT TTCTTTGAAGGACTCCCTGGTGCCATAAACCGAACCcctgatccagatgggagaagaactgaga tcacttgtgccgtatgtgatggacatttaggccatgttcataaaggtgaaggttatagtactcc aaccgatg
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Assembled circRNA sequence |
Yes
The sequence of a circRNA based on assembly using circseq-cup (Ye et al., 2016) or CIRI-full (Zheng and Zhao, 2018) or CIRCexplorer2 (Zhang et al., 2016).
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Full-length trsnacripts |
Transcript length: 198 Transcript exons: 2442403-2442442,2446451-2446608 CCTGATCCAGATGGGAGAAGAACTGAGATCACTTGTGCCGGAAAGCCAGGAACTGGAGAATATG ACAAGTTTTTCGAGGAAGGAATCTTCGATTGCGTAGGATGCAAGACTCCTCTTTATAAATCAAC CACGAAGTTCGATTCCGGATGTGGCTGGCCAGCTTTCTTTGAAGGACTCCCTGGTGCCATAAAC CGAACC
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Transcript length: 394 Transcript exons: 2442403-2442639,2446452-2446608 CCTGATCCAGATGGGAGAAGAACTGAGATCACTTGTGCCGTATGTGATGGACATTTAGGCCATG TTCATAAAGGTGAAGGTTATAGTACTCCAACCGATGAACGCCTTTGTGTTAACAGCGTTTCGAT CAATTTTAACCCGGCCAAACCTTCCTCTATAACCTGAGGACTAGTTGATCGTACATTACTTTCA AATCAGATTGTGGTGTTCAATTGTAGAATCATCATCACGTTACAAAAAGCCAGGAACTGGAGAA TATGACAAGTTTTTCGAGGAAGGAATCTTCGATTGCGTAGGATGCAAGACTCCTCTTTATAAAT CAACCACGAAGTTCGATTCCGGATGTGGCTGGCCAGCTTTCTTTGAAGGACTCCCTGGTGCCAT AAACCGAACC
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Genomic sequence |
CCTGATCCAGATGGGAGAAGAACTGAGATCACTTGTGCCGTATGTGATGGACATTTAGGCCATG TTCATAAAGGTGAAGGTTATAGTACTCCAACCGATGAACGCCTTTGTGTTAACAGCGTTTCGAT CAATTTTAACCCGGCCAAACCTTCCTCTATAACCTGAGGACTAGTTGATCGTACATTACTTTCA AATCAGATTGTGGTGTTCAATTGTAGAATCATCATCACGTTACAAGGATCAATGTAACAGATAA TAAGAATCATTAGTGGTTCTTAAAATATGTCTGTTTAGAAAATATATATATATATATATGTATC CTGTTTATAACGACAATTCTCATTTTAATACATTTTAGTAAAAATGTTCAGCTTAATTTCCCCA CTACAAAAGTTTCCACTAAAGAAAACAGATAATATCAAATTAATGGAATAAATAAGCCTAATTT TCTTTAAAAATTGTAATGTCATTTAATAATTATTGTGTAATACTAAGAAAAGATAGCCCAACAA AAAAATCAAAATATACTGAAGACGAATACGACGAAGGAAAATAACAGATTAATGAATCTGTTCG CGTGTAAAGCTTACCAACATTCGGAAGCAACATGTTTTTTTACACTTTTTCGTGCTACTTAAGT ATTGGTTGTATGGTTTGCTGAGGTTTAATGTATATGTTCATTGATACATTTGTATTATTGATTT CAAATTAATAAAGAATGAAGATGTTAAATAAAAAAATATTGCGTAATACATTTGCATATATTTT TTTCTCGAAAAGTGGAAGCACGACTCTGTTGCGCAAGCCATACTCTTTTGGCATTCTCTTTTCT TAATGATAAGAAGATAAGAATTCGTGTCGTCTTTTCTTTTCTTTTTCAAAAGAATTCGTGTAAT GGTCTAGTCACAAATCCATAAACAAGATTAGGTTTCTGATTAAAAAAATCTTGTAATTTTTAGA AATAAATATCTGATCTCTTCCCAATAACAATTTTTGTCCCATTAGTATGTTTAACTCAGCGATC ACTTAATATAACTCAGTCGTCACTTAAGCTAACTCAACCATTACAGAACATATCTCAGTCGTCA CTTAATATAACTCAGCCATTATAGAACATAACTCGGTCGTCACATAACATATTTGCCAAAAAAA AAGAGAACATAACTCAGCCTTTACAGAAAAAATCAAAACATTAACTCAGCCGTAACATAAATAT TGATAAAAAACAGAACATAACAGAGCCGAAACCGTACCTCACCACCATTCGCTTTAATATCTTC AGCAATGACCTATTCTATAGTTGCACGGGTACGGCTACCACCCCATCTAAGCAACGGAATCTCA TCCGTGTTAACAACGTTCCCAAAACGCTCGGCGATGGTGATGATTGACTCATACGCCCAAGCCT GCAACACGAAAACCAGACCACTGACGGTGTACGTCTTGCCAATAGGCCTCAGCAACTTTATAGA AACGACAAGGGCTTCATATGCTGCCCGACCCCATGGATAAGTCTTCATGGCTTCGTCGTCGAAA ACTCTTTTGGCACTCTCAAATGGTATCCTAGAGTTAGTATGCAAGCCAAAAAGTCCAATGGATA GAAGAGTCAATAACCCAAACCATCTACGCTTTTCAGGAGGCCAAGCTCTGCACGTTACTAAGCC CTGCCTAAGTTCATCTAGATTATGACCTTCACCGGTTGGCACACGCAATTCACTGAAGAACGCT TTGTAGTCAGCTTCAGGCTCAAACTTTTCTGTAGGCAGTTGATCTATATTTAAACCCGTGATAT GATGAAATTCGTTCAATCCAAACCGGATGGGTTTACCAGCCACGATACACCAAAGCTCCTTCTT CAGTATTCTCAGCTGTCTGCATAGTAGATAATGTACGGTCTTACCAGACCATAGAAAATGACTA TCAACAAGCTTAGCAATTAATCCAAGCTCTGTCTCTTTCAGTTCTGCCCATATTTCTTTTCCTA TTGATTCTCTAATTGCAGGGAACTCTCCCAGCTTTATATTATGATTAATGCCTTTACCCTCCAG ATTAGAATCCCCCTCTTGGTAAAGTCTTGGAGGGTACTCCCTTGCTTGGTCTTCAGACATCTGT ATAACCATAAATCAGCCGTAAGCATTCCATAACTCAGTGATAACATAAAACAAACTCATCCACA GATACCATAACTCAGGCAAAACATAAATCTAACTCAGCCATAGATAACATAACTACGTCATAAC ATAAACCTATCTCAGCCACACATAACATAACTCAGCCATAAGATAAATCTAACTCAGCCATATT TTAACAGAAACTCAGTCAAACCATAACATAACAACAGCTCAGTTAAAACATAAACCAGACTCAG CTATATCAAAACAGAAACTCAGCCATAACATAAACAAACTCAGCCGTCATATAACAGAAACTCA GACATCGATGTAAGGTTAAACCATAACTCAGTCACAACATAAAACAAACTCAGACACAGATGAA TTGATAAATCATAAATCAGTCGGCAAACAAACAATAACTCAGCCGTCAAATCAAATAGATCTTA GAAATCGGCCACCATATGTCAATCAACGACGACGTTAAAACCCAGCTTTAAAAACTATCGTTAC GCATCGGAAAACGATTTCAGTGACGGGAATCACTTGCGATTGAACTTAGATGTCAGAGTCTTAC TTAATGGAAACATACTCACCGGAACTTAGATGTCGAATGTGACTTCGCGCTTACGGAAATGCGA CTGCGGCGTCTGAATTTCGGCCGGAACAGACGAGAAAAGAGCAAAACGGCGAAAGAAATCGATT TCGTTCCGTCGAGAGAGAAAGAGGAAGAAAGCGACAGTTTTTTTTTTTTGGGAGATGATGAACA GTAAAGCCAAGAAATAAGAAACCCAAACGTTATGCGGTTTGGAGATGATTAATGACGTGGATTA TGGTAATGACATGGAATGATGACATGTATAATCACTGTTTTTTTATTTAATTTTTAGTTAAAAA CGAATTAAATAATAATAATTAATTAAAACTAGTTAGGGGTGTTAATTGTAATTACACAATTACT AAAAACATCTGAGTAATAAAAAAAAGATGTGTTCTATTTTAGGAATAAACATACAAATGTGTTT TATCTTAGGAATTATTTCTTAAAAAATCTTGTAATTTTTAGAAATAAATATCTGATCTCTTCCC AATAACAATTTTTGTCCCATTAGTACCAAAACCATATTTCAATTTGGGATTTATTTCTATAATA TCAAACCCGAATTTTGTAAACCGAACCGGGACAGGATAATGGGACAAATGAGCACTTGTATTAT CACGTGCATTAATCATTCACCAGTTTTATAGTAGATCACAGTGGTTCATATGTATCTAGACGCA AACTTTGAATCATTCATCAACGCAATCTAAGTACAAATATAGATCTCACTGCAATGTTTCAAGC ACCAACCTGATCATCATCAAAACCATTTCATCCGTAGTGGTCAATGGCGGCTTCTCCGTTGGTG GTTCAGAAAACAGAGGAGGAGTGGCGTGCGGTTCTTTCTCCGGAGCAGTTTCGTATTCTTCGTC AAAAAGGCACTGAGTACGTTTTTGTTTTGTTTTTCTTTCCCTTTTGGTATAATTTCTTTTAATG AAATTTTGGGAATGATTTTGATAGTGCCCTTACGTATGTTGGATTAGCCATTAGACTTGAGTAA TTTAGGGTTTCATAATTAGCATCATACATGTGAGTATGTGACCTTTTGATTTGAGTCTTTTTAC CCAAGAATACCTACGTGGCTTGGATTCAGAACATTGTTGCTCGTTTAATATATTAATTAGGCTG CAAGCAACCGTTGAAAGATTATTATAGATGTAGAACCAATTAGGGAAATTGGATGATGTTTTGT TTTTGGAATTTGGTTTTGTTTGTATCATATATAAGGAGAGTATTGATTCAGTGTTTCACTGTTT CATATAAGTAGTTTATTGAAGTATGTAATGATCTCAATGTTCTTAAGGTTTGTTGTGTTTTTGT TGTTCAAAATATTTTAGAAAGCCAGGAACTGGAGAATATGACAAGTTTTTCGAGGAAGGAATCT TCGATTGCGTAGGATGCAAGACTCCTCTTTATAAATCAACCACGAAGTTCGATTCCGGATGTGG CTGGCCAGCTTTCTTTGAAGGACTCCCTGGTGCCATAAACCGAACC |