Splice junction sequence |
AGAAGTTGGATCCAGTTTTAGCCCTGAGTTCTGATGGGTATGACATGGTGATGCCTATGCCACC TCTATGGCTGGCACCTCTTCAACACCAATATGATAGatggaagtcataagagaatttggggcta tagttcttccaatggtgaaacacccctttgttgttgggttccttgtcgtagagcttccagaatt acatggtg
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Assembled circRNA sequence |
Yes
The sequence of a circRNA based on assembly using circseq-cup (Ye et al., 2016) or CIRI-full (Zheng and Zhao, 2018) or CIRCexplorer2 (Zhang et al., 2016).
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Full-length trsnacripts |
Transcript length: 1116 Transcript exons: 147112072-147112377,147113112-147113177,147113251-147113 319,147113430-147114104 ATGGAAGTCATAAGAGAATTTGGGGCTATAGTTCTTCCAATGGTGAAACACCCCTTTGTTGTTG GGTTCCTTGTCGTAGAGCTTCCAGAATTACATGGTGGACGTGCTATGAACTCTTATACTGCTGA TACTGAGTTACCACCTAACACATTTATGGATAAATCATCTGATGTAACTCCACATACTGCGTGG GATATTCAAACTTATGGTGATCAGGCAAAGGGTTATTCTCAGCTTGTTAATGAATGGAAGAATA GTGCCCTTATGATTTCTCGAACTCTGGCAATGGCTTATGTTATGGATCAGAAAGCATATCTGCT TCAACAAACTTCCTGGCAAAATAATGTTAGAATGAGTGGCTTAGTGGAACAGATTTGGGGCCCC CTCTCTAGCATTCGTGCTCTTGCAAAGATGTTATCCTTTCACACAAAGAGAAGTGAGATCCCCT ATGATATTATTGAAGATATGCTCACCCAAGGTGATCACATGAAAGATGCTCTGCAACAAATTCA AGATGCTGTATATCTGACTAAGGTGTCATTTAAAGTTTTGATTTTTTAGCAAAATTGTGTGGTT CTAATATCTCCCTATGCCCCCCTTGTATGTGTGCACGTGTGTGTGTGTGAGAGAGAGAGACAAA ACATAAATAATTTAGTATAATCTATAATGATTTGATATACAGTTTGTGCTGTCCTATTGACTAG AGCTCTCCTAAAAGAAACATTAAGGGGTGTTGTGCTGAACACATCTGCTACATAGATATCCCAA TATCTTCTTACAATTGTAAAGTCCCTCGATTTATAGCTCTTCATATATTGTGATCGTCTATATT TATCTGAAGGCTACATGGTATCTTTGATTTCTCTCTCCCTGCATTCCCTATCCTGATAAATTAT CCTTATCTGAACAGGCAAACATAGTTAGAAGCAATGAGGAGACTTTAAAGACAATTCAGAGATC ACCACATCCTTCAAGAACTTTATCAGATTATAAATCAGTACCTGGGAATGATTCACAGAAGTTG GATCCAGTTTTAGCCCTGAGTTCTGATGGGTATGACATGGTGATGCCTATGCCACCTCTATGGC TGGCACCTCTTCAACACCAATATGATAG
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Genomic sequence |
ATGGAAGTCATAAGAGAATTTGGGGCTATAGTTCTTCCAATGGTGAAACACCCCTTTGTTGTTG GGTTCCTTGTCGTAGAGCTTCCAGAATTACATGGTGGACGTGCTATGAACTCTTATACTGCTGA TACTGAGTTACCACCTAACACATTTATGGATAAATCATCTGATGTAACTCCACATACTGCGTGG GATATTCAAACTTATGGTGATCAGGCAAAGGGTTATTCTCAGCTTGTTAATGAATGGAAGAATA GTGCCCTTATGATTTCTCGAACTCTGGCAATGGCTTATGTTATGGATCAGGTACTTTGTTCATT TTGGTCATATAATATTCAATGATTACTACTACTGATACATACAAGTTATAGTACTATCTCCATT TTCTTAATGAATGACAGCTTTGACTTTTCAGAATTACGTTTCACCATTCCTATTATCCAAAAAA TTGCAACTATACAAAAATATAAGTCAGGTTTAAATACCATTAATGATGGAACAAGTCACAACAA AATAAATGATACTTGTATAATTTTTCTTTGAACATGAAAATTAGTCAATCATCGTGTCCAAAGT CAACGGTGTGTCGGTGTCATAAATTTAGTAATAGAGGTAGTACTTATGTATGTTAAGTTTCGAT AAAAACATACAAATAACCATTCTATGGACCCCCAAAGACTTATGAACTCATGTAATTGAAACAG GGAAGTGGCTACCAGTGTTTTTAATAAATAACAAACAGACCATTTTACACTCTGTAGCTGCAAA GCGATACTTGTTCTTGTTATGTGGTTTGTTTTACCATAACGGAAAACAAGTAGTTTGCTAATTT GCAGTGCAGTTATAATTTGTCGCCTTCTTTATATCATGGACATACATCAGATGTCCATTTCTAT TCACATAATCATCTGTTTTCATCAGATTTGCTCTGTTGATAAACTAAGGTATTGAGGGTGTTTC TAATCATGATTACTTGTCTTCATATCCTTAAACATGCAAGAAGTCTTATTGTTTAATTGAGAGC TCACCATTCTATGCAGAAAGCATATCTGCTTCAACAAACTTCCTGGCAAAATAATGTTAGAATG AGTGGCTTAGTGGAACAGGTAATTTTCCTATCATAAAAAAGTATTGATTGAAAAATTGCATAGA TATTTATCCTTGAAAAATCATTTGCAGATTTGGGGCCCCCTCTCTAGCATTCGTGCTCTTGCAA AGATGTTATCCTTTCACACAAAGAGAAGTGAGGTCTCTAAAATTAGTTTTCTTTAAGCTGTCCC TTCTTACGAAAGGCATTTTTTTGGTGCCTTGCATTGCATGTATTTGTATAGTTAATCTAATATT GTCTTGCTTTGTAGATCCCCTATGATATTATTGAAGATATGCTCACCCAAGGTGATCACATGAA AGATGCTCTGCAACAAATTCAAGATGCTGTATATCTGACTAAGGTGTCATTTAAAGTTTTGATT TTTTAGCAAAATTGTGTGGTTCTAATATCTCCCTATGCCCCCCTTGTATGTGTGCACGTGTGTG TGTGTGAGAGAGAGAGACAAAACATAAATAATTTAGTATAATCTATAATGATTTGATATACAGT TTGTGCTGTCCTATTGACTAGAGCTCTCCTAAAAGAAACATTAAGGGGTGTTGTGCTGAACACA TCTGCTACATAGATATCCCAATATCTTCTTACAATTGTAAAGTCCCTCGATTTATAGCTCTTCA TATATTGTGATCGTCTATATTTATCTGAAGGCTACATGGTATCTTTGATTTCTCTCTCCCTGCA TTCCCTATCCTGATAAATTATCCTTATCTGAACAGGCAAACATAGTTAGAAGCAATGAGGAGAC TTTAAAGACAATTCAGAGATCACCACATCCTTCAAGAACTTTATCAGATTATAAATCAGTACCT GGGAATGATTCACAGAAGTTGGATCCAGTTTTAGCCCTGAGTTCTGATGGGTATGACATGGTGA TGCCTATGCCACCTCTATGGCTGGCACCTCTTCAACACCAATATGATAG |