Splice junction sequence |
TGAAGTTGTCACAGAACAAGATAAATCATGCTTAATGGAGGCCTTGAAATTTCATCCCAGAGGG TATGACAAGATTGGTGTGGGAATAAGAGAAATCAAGgatttttggaatttaagaatgttaaggt gcaatgtcaagaggataatgaacttgttctgaaagtcggtatgtctgagcattgcaagagtggg aagttctg
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Assembled circRNA sequence |
Yes
The sequence of a circRNA based on assembly using circseq-cup (Ye et al., 2016) or CIRI-full (Zheng and Zhao, 2018) or CIRCexplorer2 (Zhang et al., 2016).
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Full-length trsnacripts |
Transcript length: 911 Transcript exons: 28844126-28844352,28844488-28844661,28844756-28844893,28 845361-28845620,28845727-28845838 GATTTTTGGAATTTAAGAATGTTAAGGTGCAATGTCAAGAGGATAATGAACTTGTTCTGAAAGT CGGTATGTCTGAGCATTGCAAGAGTGGGAAGTTCTGGGCTACCCTACAAAATGCTTGCATCCCA ATAATGGAGTTGATTGATTGGGAGCGGAGCCGACCAGAGAGAGTATATGATAATTTCTGCTCAT ATGGCATAGACTCAGCATGGAAATTCTTTGTCGAATCTTTAAGATCCACAACAGATGCTATTGG AAGGAATATCCATCGACAGCACTTACTGGTTGTGGCAGACTGCCTATCTGTGAGTGGGCAGTTC CATGGGCTAAGCAGTCAAGGTTTAAAGCAGCAAAGGACTTGGTTATCAATCTCCTCTCCATTTT CTGAAGCATGCTTTTCTAGGCCTGCACACAGTTTTATAAATGCTGCAAAGCGAGATTCAGTGGA CAATCTTTCTGGTACTCTAGATGCAATTGCCTGGGGCAAAGAACCTTGTGCAGGGTCGTCAGGT CCTTTCAAGATTCTATATTCTGGGAAGTCACATGAGACAAAACAAAATGAGCACATATATGACT TTCTACATAACCCTGAAGTTCAGGCTCTTGAAAAGAATGTAATGGATACCTACAGAAAAAGGAC TGAAAAAACTTCCAAGCGGAGATCAGCACTCAATTCTGAAGGCAATGCTACCATCAATGGTGGT GCCATATCTTTTAATCAGAAGTTTCTTAATGCTAAAGTTGGTATATGGGAGAACATCATTGACA TGCGCACTTCCTTGCAAAACATGCTTCGGGAGTACACATTAAATGAAGTTGTCACAGAACAAGA TAAATCATGCTTAATGGAGGCCTTGAAATTTCATCCCAGAGGGTATGACAAGATTGGTGTGGGA ATAAGAGAAATCAAG
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Genomic sequence |
GATTTTTGGAATTTAAGAATGTTAAGGTGCAATGTCAAGAGGATAATGAACTTGTTCTGAAAGT CGGTATGTCTGAGCATTGCAAGAGTGGGAAGTTCTGGGCTACCCTACAAAATGCTTGCATCCCA ATAATGGAGTTGATTGATTGGGAGCGGAGCCGACCAGAGAGAGTATATGATAATTTCTGCTCAT ATGGCATAGACTCAGCATGGAAATTCTTTGTCGAAGTATGATACTTGCTACCCTTCATTCTGGC TTCACTGTTTCATTCATTCCTGTGTAAAATGGTTTCAAAGTTTAATTGTTTGTGATAAATTTCT CCTGTAGGTTTATAACATTTTCATTTTCACTTGCTTTTTCAGTCTTTAAGATCCACAACAGATG CTATTGGAAGGAATATCCATCGACAGCACTTACTGGTTGTGGCAGACTGCCTATCTGTGAGTGG GCAGTTCCATGGGCTAAGCAGTCAAGGTTTAAAGCAGCAAAGGACTTGGTTATCAATCTCCTCT CCATTTTCTGAAGCATGCTTTTCTGTGAGAAATCTTAGCTTTCTTACTGATTATTAACTATGAG ATTTCCCTTTTGAAATGTTCTGAACATCTTCTGATTTTATGGCTTTTCCTGCAGAGGCCTGCAC ACAGTTTTATAAATGCTGCAAAGCGAGATTCAGTGGACAATCTTTCTGGTACTCTAGATGCAAT TGCCTGGGGCAAAGAACCTTGTGCAGGGTCGTCAGGTCCTTTCAAGATTCTATATTCTGGGAAG GTGTGTATTGTAACTTCCCTGCTGAATCAAGCACTACTCTTTTAGAGTAACTTTAACGTGCTCC CAAAATGAAAAGAAAATTGAGATCTTGATCAATCACCCCCTATGAATACTCACGATGCATTATA CATGCACAATTTAACTCTTTGGATAGCATAAAGGTACAATACTAAATTTCTTTCCTAATGCTTT GCCTACGAGCCTCTAATGGGCTGCAAGCTAGAGAAATTTGCATTGAGTAAGTATTCACTGAAAT AATTTGTTTTCTGGTTCTGAATAATTGATATAAAATGAAGTGAAGATCTTATATTATCTCTATG ATGTTCATATTATTTATGCTGAGCTGTTGATTGATGATATTCCGTTACATTAATTTTGTACAGA AATTGAATCGCAGTGCCTGCTTCTGTGATAGATGGATGTTCAGATATTTCAAATTGGCTGCTAA CATTTATTCTTTTTTGCAGTCACATGAGACAAAACAAAATGAGCACATATATGACTTTCTACAT AACCCTGAAGTTCAGGCTCTTGAAAAGAATGTAATGGATACCTACAGAAAAAGGACTGAAAAAA CTTCCAAGCGGAGATCAGCACTCAATTCTGAAGGCAATGCTACCATCAATGGTGGTGCCATATC TTTTAATCAGAAGTTTCTTAATGCTAAAGTTGGTATATGGGAGAACATCATTGACATGCGCACT TCCTTGCAAAACATGCTTCGGGAGTATGTTATACCACTATCCATGGAATCGTGACTGATAGTTA TTTTCTTTTTTAAAAAAAAAGCTTTATAATCCTTGGTATTGATGTCATCTTCTACTTTCATGAA GGTACACATTAAATGAAGTTGTCACAGAACAAGATAAATCATGCTTAATGGAGGCCTTGAAATT TCATCCCAGAGGGTATGACAAGATTGGTGTGGGAATAAGAGAAATCAAG |