Splice junction sequence |
GATGGGTGCGACACTTCTTGATGGGGTCGTTGTTGAAAAGCATGGGATGGTTGCTGCTGGTGCA CTTGTACGACAAAACACCAGAATTCCTTCTGGAGAGtgtcaaggcatcggacactgatgaatgt atttgataaggctccgattgtggacaaggaagcttttgtggcaccaagcgcctcagttattggg gacgttca
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Assembled circRNA sequence |
Yes
The sequence of a circRNA based on assembly using circseq-cup (Ye et al., 2016) or CIRI-full (Zheng and Zhao, 2018) or CIRCexplorer2 (Zhang et al., 2016).
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Full-length trsnacripts |
Transcript length: 422 Transcript exons: 6775306-6775449,6776015-6776140,6776243-6776394 TGTCAAGGCATCGGACACTGATGAATGTATTTGATAAGGCTCCGATTGTGGACAAGGAAGCTTT TGTGGCACCAAGCGCCTCAGTTATTGGGGACGTTCACATTGGAAGAGGATCGTCCATTTGGTAT GGATGCGTATTACGAGGCGATGTGAACACCGTAAGTGTTGGGTCAGGAACTAATATTCAGGACA ACTCACTTGTGCATGTGGCAAAATCAAACTTAAGCGGGAAGGTGCACCCAACCATAATTGGAGA CAATGTAACCATTGGTCATAGTGCTGTTTTACATGGATGTACTGTTGAGGATGAGACCTTTATT GGGATGGGTGCGACACTTCTTGATGGGGTCGTTGTTGAAAAGCATGGGATGGTTGCTGCTGGTG CACTTGTACGACAAAACACCAGAATTCCTTCTGGAGAG
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Genomic sequence |
TGTCAAGGCATCGGACACTGATGAATGTATTTGATAAGGCTCCGATTGTGGACAAGGAAGCTTT TGTGGCACCAAGCGCCTCAGTTATTGGGGACGTTCACATTGGAAGAGGATCGTCCATTTGGTAT GGATGCGTATTACGAGGTGAGCTAGCTACTAAGCCTCAATGTTTGGTGTTTGGTGGTTGACTAT TTTAGTGACTGAAGTTTTGTTTGAAATAGTATCTACTTCTGTATCCTTAGCTGTGTCAACTCTT ACGATAGAAAATAGTGAACGAATATCTGTTTTTTACTCTTCTGGTTAAGCGATGAACAAGACTA CTACTCAAAATGGAGCTTTCTAGCTTTATTGAAGGATCTTAAACAGATCATTACTACATATCGT ATCTTGATGATACTGGCAGTTGCTCTAATGGGTGATTGGGTATATGATATCCCCAATCATATAC AGAATGCTTTCATGTCATAACACCAGAATTAGTTGAACGATATCATATACAGATTATTGAGTTT GAGTTGAATCCTTATTGCGAGTATGAGTTGGCTAGTCTGGATTTTTATTTAATGGTGATGAAAT AGGGTTGTCCTTTTTACAGAATGCTTTCATGTCATAACACATTGGTACTGTATGGCTAAGCCTG TTAGTACTTTACCAGGAAACTGGGATAACATACAATCTAAACTTGCTTTCTCTCTTTTTTTCTG CGCAGGCGATGTGAACACCGTAAGTGTTGGGTCAGGAACTAATATTCAGGACAACTCACTTGTG CATGTGGCAAAATCAAACTTAAGCGGGAAGGTGCACCCAACCATAATTGGAGACAATGTAACCA TTGGTTAGTGGGAATCTCTTACTCACTGTTTATTTTGAAAATGTTTAATATGCATACATCTCCA AGAAGCATTTGGGATATAGTCTTAAATTAAATGTGTAACAGGTCATAGTGCTGTTTTACATGGA TGTACTGTTGAGGATGAGACCTTTATTGGGATGGGTGCGACACTTCTTGATGGGGTCGTTGTTG AAAAGCATGGGATGGTTGCTGCTGGTGCACTTGTACGACAAAACACCAGAATTCCTTCTGGAGA G |