Splice junction sequence |
TTGGTGCGGATATTAATAAGCAAGACTTCCATGGACGGACACCGTTGCACCATTGTGTCCGAAG GAAAAATGATGCACTTACCAAGCATCTGCTAAAGAGgtgtcgtatggaaatctagaggcggaac atcatggttctgcaaattctgttgattctctctctcttgaggagaacaaaagtccagagggaca tgatgata
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Assembled circRNA sequence |
Yes
The sequence of a circRNA based on assembly using circseq-cup (Ye et al., 2016) or CIRI-full (Zheng and Zhao, 2018) or CIRCexplorer2 (Zhang et al., 2016).
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Full-length trsnacripts |
Transcript length: 878 Transcript exons: 25336766-25337014,25337893-25338014,25338642-25338732,25 339974-25340389 GTGTCGTATGGAAATCTAGAGGCGGAACATCATGGTTCTGCAAATTCTGTTGATTCTCTCTCTC TTGAGGAGAACAAAAGTCCAGAGGGACATGATGATATATTCAATCATCTCAGGAATATTCCTGG AAATGACAGTTGTGCAGAATGTCGTTCACCGGATCCTGATTGGGCATCTCTAAATTTAGGAATT CTTATTTGTATAGAGTGTTCTGGGGCTCACAGGAATCTTGGAGTCCATATTTCGAAGGTTCGAT CCTTGCGATTAGATGTCAAGGTATGGGAGCCAGTGATAATGGACTTGTTCCATGAACTTGGAAA TGACTACACTAATTCCATTTGGGAAGCTATGCTTCCGAAAGAAGATCAAGGAATAAACGAGTTT AATGATGCTATTCTTTTCATTGAAAAGCCTAAACCTACTGATGCTTTTTCAATAAAGGAAAGGT ACATACAGACAAAGTATGTCGACAAGCTTCTTATTGCCAAAGATACCAATCAAATTACCATTGA TATATTGGAGGCTGTAAGGACGAATGATGTGAGGGCAGCATATCGCATTCTTGTGTTGGCTGAT GTGAGCCCTAACATGATATATGATGAGTTAAACAATGATGTTCATCATGATCCTTCAGTAACAG ATGGGAAGTTATTTGATCCAGCATCTTGTGATGTAAAGGATGATTCTGGGAAACCAGAAGGTTG TCTACAAGGCTGTTCCCTGTTGCACATTGCTTGCCAATATGGCCATTCTATAATGGCAGAGCTT CTGCTTCTTTTTGGTGCGGATATTAATAAGCAAGACTTCCATGGACGGACACCGTTGCACCATT GTGTCCGAAGGAAAAATGATGCACTTACCAAGCATCTGCTAAAGAG
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Genomic sequence |
GTGTCGTATGGAAATCTAGAGGCGGAACATCATGGTTCTGCAAATTCTGTTGATTCTCTCTCTC TTGAGGAGAACAAAAGTCCAGAGGGACATGATGATATATTCAATCATCTCAGGAATATTCCTGG AAATGACAGTTGTGCAGAATGTCGTTCACCGGATCCTGATTGGGCATCTCTAAATTTAGGAATT CTTATTTGTATAGAGTGTTCTGGGGCTCACAGGAATCTTGGAGTCCATATTTCGAAGGTGTGAA CTCTGTCACTTGTTCTTTCTTTTTGAGTCTAATTTATGCTACTTCATTGAAAGTTACGTTTTTG GTGACCTGACCCTGTCTTTCACAGGAAAGCACTTCAAAATTTTAAACTCATAAAAGTTATAACT TAGCCACGGTAGTAGTATAAAACTGTAATATAATAGTGGAACCATTTAAAGTTTAATGCTTATG CTATTGCCATTAATCATTACTGAAATGATTGGGGCTTAATGTAATGTTGTAAACTTTGTCAATG TCCAAAACATCGAGTAAAAAGGAATGGTGGATTGGTGGTAATAAATCAAATTAGAAGCAGAAAG CTTGGATAAGATCATAAGAATATCGACTCCAACCTCTGTTAACCTTCGACTCTTAAAATGAGAT CCAGGCTGTGGTACCAACCTAGGCAATTCACAGTATCTAATTCACATGTTTTATCATTATTTTC TGACTATATATTTATAGAAATATTAAAAACATAATTGTATGAAAGTGTTTTTTTTTTCATGAAC AATCTACCAAAACCATTTTCACATATCCTGATACTTATGCATCTATTACCAACTCCATGTAGTT ATCAGTCACAGTTTCTTGTGATAATGCTATATGTACTTGATATAATACCTTAATGATAATTTGA TGGAAAGATTAACTATTTTATTTTAGATTTTTGCTCATTTGTGTTTCTTGTTGTACCTTTCAAT TGTATTTTCTAATGCATATAAGATGGTCAGAGCTAAGAACATTAATTTTGCAATACACTCTCTT GTGACTTTGTGATTTGTAGATTTCAAATATCATTTGATTTTCAGATTTAGCAGTAGTGTGGTCC ATATTTAAGGATTGCTTTTGATGTACTTATTTGATGTAGGTTCGATCCTTGCGATTAGATGTCA AGGTATGGGAGCCAGTGATAATGGACTTGTTCCATGAACTTGGAAATGACTACACTAATTCCAT TTGGGAAGCTATGCTTCCGAAAGAAGATCAAGGGTATGTTGAAGTGTATGTAAATGTATATTTT CTTAACTATGTTTTGCCTTCATGCTTTAGACAATTTTCTTCCTAGTTACACCTCTCTTCTGAAA TTTGTAAGTAGTGGTATATTGACTAATACAAACATCAGCCAATATGCTTTTTGCCAAACTGGAC CATGTGTACCAACTAGTTTTGTACTTCTGCATGTATTGTTTAGTCATTTTATTTTCTTTTATTT TACTCATTGGATTATTGTCAATTTAAGGAGCATAATACTGCACTACCGCATTTGTAATGGACTA TAGCATTCTTGACTTAACTCAGACTTGAAATTTCCAATGGGATATTCTGTCTTGCACTGAAATG GATCAGTTTCATTATGGTAGGTGAATATAATCAGTGTAGCTAAGGAAGGTGTTCTATCATTTAG AAATGTTAATGCTAATAATTTCATTCACACGTTCAAGATAGGTTAGCTTTATTATCTTCTACAG ATGAGTTGGAAGATCTCTCTTTTAATCTGATAGTGCCAATGAATATATTTCATACATTAATGGC ATTGGCATCAGACATGTTCATTGTGTGTGGAAAAACTAAGTTTGCTCCTTTCTCCTATCTATTT TCTTCTTGATGTGTATGCAGAATAAACGAGTTTAATGATGCTATTCTTTTCATTGAAAAGCCTA AACCTACTGATGCTTTTTCAATAAAGGAAAGGTACATACAGACAAAGGTAAATTATTCTGTCCA TCCTTTTATATGCTGAACCTAGCAATGCTTTCTTGATATTGATGTATATCCTTGTTAGTCATGT GCTAGTTGAAGATTGAATTCCAATGTAACCCTTGCCTTTTATTTTATAAATGTGTTGTTTTGCT ATCCAGCTTCAGTTCTGTAGCTACGACTCACATGACTGATATCACATAAATCTTTTGGGAGGCT GGGGATGTTCACATGCACATATATTATATATAGTTAGCAGCAGTTGTATGGATCATGGGAAATC TTTATGATGTAACCATTTTACACTTTACTAGCACAATAGCCATGCGTTGCAGCAGTTTATTTAA TATAAAACATAATTATGAGTTCTCTTAGTAAAAGAATATCTTGCCTCTACTTGGGTGAAGCGAT GTTCTTCATCTTAAAAGGCAAAATTAAAAGAGTGTAGCTTATGTCTTGCTCAAATTTCAAATGG ATGGTAAACAGAAGAGAGCAATCAAATTGCTCGTGTGGGGTCCACCAATCTCATGGGCCCACAT GTTAGTTGGTGGTGGCGGAGGCAAACTCACCACCACCACTATGGTCTTTTATAAGAGCATAGAT ATAATTGGAGCCAGAACTCAGTCTATGGATTGGTTCACAACCAGATTTGTAGTTTGATTTATCA TTTTATTTTCTGACTGTACTGTTTTTTTGACTGAAAGTACTGCCAGGTCTTTGCCCAGCAGTGT GATTTTCAATTATTGAAAGAATAATTATAGGAAATAATTACAGGAAGAAACAAGAGAAAAAAAC AAAAGACCCTATAAAGTTTGTAACCAATTAACAACAGATTGCTTCAGGAGATCCTTCATTCTGC AGAGATGCAGAAGAATCTCATTTGTAAAGAGAGACTTCCAAGAATGGAACTGTTGCGGTCAGGG TACAAATACTGAAGATAATTGATAGAACATGAATGAATTGCATACTTAACAATTAACCCTTGGT ATTTCAACTCTAAAACTTGCATAATTGATCAATGGCTGGCCGGAAACCACAAGCTTTTGTAGTG TGATCCATATGCAACGAAGTGTCGAGTAATGCAGGCTGCAACAACCCTCAAGTTCTTTTTTGCT TCAAATAGTTTCTATTGCTAATTTTGATAGTATTAACTTCATGTATGAATGGAAGATTTAGAGC TCCCTGTTTTCTTGATTCTGATGACCTTCTGTTTGTTGTGCCATCATTAATTACTGTAAATGAT CTATGCAGTATGTCGACAAGCTTCTTATTGCCAAAGATACCAATCAAATTACCATTGATATATT GGAGGCTGTAAGGACGAATGATGTGAGGGCAGCATATCGCATTCTTGTGTTGGCTGATGTGAGC CCTAACATGATATATGATGAGTTAAACAATGATGTTCATCATGATCCTTCAGTAACAGATGGGA AGTTATTTGATCCAGCATCTTGTGATGTAAAGGATGATTCTGGGAAACCAGAAGGTTGTCTACA AGGCTGTTCCCTGTTGCACATTGCTTGCCAATATGGCCATTCTATAATGGCAGAGCTTCTGCTT CTTTTTGGTGCGGATATTAATAAGCAAGACTTCCATGGACGGACACCGTTGCACCATTGTGTCC GAAGGAAAAATGATGCACTTACCAAGCATCTGCTAAAGAG |