Splice junction sequence |
GCTATCTATTTGGCTGCTAAATTTCTCAAAGTGAATCTCCCATCTGATGGTGATAAGATTTGGT GGCAGGATTTTGATGTCACGCCACGACAACTTGAAGgtgcactttctctattcagagactgatt aggagttcgaggagcaaatcaattcgtaccaaatataaccaagcttacatggctaagccaagtg attcatca
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Assembled circRNA sequence |
Yes
The sequence of a circRNA based on assembly using circseq-cup (Ye et al., 2016) or CIRI-full (Zheng and Zhao, 2018) or CIRCexplorer2 (Zhang et al., 2016).
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Full-length trsnacripts |
Transcript length: 857 Transcript exons: 13577692-13577997,13578583-13578664,13579063-13579200,13 579876-13580054,13580139-13580290 GTGCACTTTCTCTATTCAGAGACTGATTAGGAGTTCGAGGAGCAAATCAATTCGTACCAAATAT AACCAAGCTTACATGGCTAAGCCAAGTGATTCATCACATCATGGAGTTGTGGACAATAGCTCCA ATGGATCCCAGGCTAGGCGTGAGGAAGCTGGGAAACTTGGTCCATCGTGGTATTTCAGTAGAAG GGAAATAGAGGAAAACTCTCCATCCAGGAGGGATGGCATCGATTTGAAGAAAGAGTCTAGCATT CGGAAGTTATATTGCAAGTTTCTACAAGAGTTGGGCATGGCGCTTAAAATGCCCCAAGTGACGA TTGCCACAGCAATGGTATTCTGTCATCGTTTTTACCTTCGTCAATCCCTTGCAAAAAATGATAG ACGAATAATCGCTACTGTTTGTATATTCTTGGCTGGAAAAGTTGAAGAAACACCTAAACCTTTG AAGGATGTCATCGTGGTTTCTTACGGGATTATTAATAAGAATGATCCTAAGGCTAGTCAGAGAA TCAAGCAACAGAAGGAAATCTATGATAAACAAAAAGAACTTATTTTACTTGGAGAGCGAGTTGT ACTTGTAACACTTGGGTTTGACCTTAATATTAACCATGCCTATAAGCCCTTGGTTGAAGCAATA AGGAGATTCAATATTGATAAAAGAAGTCCACTTCCTCAGGTTGCCTGGAATTTTGTAAATGATG GGCTGCGTACTTCGCTTTGCCTGCAGTTTGAGCCTCATCATATTGCAGCTGGTGCTATCTATTT GGCTGCTAAATTTCTCAAAGTGAATCTCCCATCTGATGGTGATAAGATTTGGTGGCAGGATTTT GATGTCACGCCACGACAACTTGAAG
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Genomic sequence |
GTGCACTTTCTCTATTCAGAGACTGATTAGGAGTTCGAGGAGCAAATCAATTCGTACCAAATAT AACCAAGCTTACATGGCTAAGCCAAGTGATTCATCACATCATGGAGTTGTGGACAATAGCTCCA ATGGATCCCAGGCTAGGCGTGAGGAAGCTGGGAAACTTGGTCCATCGTGGTATTTCAGTAGAAG GGAAATAGAGGAAAACTCTCCATCCAGGAGGGATGGCATCGATTTGAAGAAAGAGTCTAGCATT CGGAAGTTATATTGCAAGTTTCTACAAGAGTTGGGCATGGCGCTTAAAATGTAAGATTGGGACA TTTATTTTCTTATCTTATATATTGTTGGCTGTTCTTTGTGTTCCACTTTCTACAAATTCTAATA ACACTATTTAAAATGAAGTGCTACTTTGACGTTTCCGTGATGCTGATTATTTTCAAAATATGTG TTCTATATCAGCTTATGTTTGCTCATTTTTATATAGTTACTTGTGTGGTGAGATGAACATATCT ACAATTATTTGTGGTAACGATGTATAAATATCTTTTTCCCAATAAATAGCTGTGTAAGTTTGAC TAAGGATGTTCATACTATAATCAAGAAGAGAAATTTGTATAGTTGTTATTGCATAATTTAAATT TTGGCATACTTGAGATTTTGCTGGTGTTTATTTGTGTGTGTGTGGTTGATCTTGGTTGTTATTG CTAAAGTATGCCATTTCCTCAGTGGTTATATAACCTTAATGCAACTTGCATTCCTTGTGTGAAT CCTTCAGTTTTTTAAGTTTTATTATATTTAATGGATCCTGCATTCACACCAAGTTTGTCAAAGT AAATACTTTTCGCTCATCCTTTTATCTCGTAAAATCTACCTTACCTGTGCTGTTTTTAGGCCCC AAGTGACGATTGCCACAGCAATGGTATTCTGTCATCGTTTTTACCTTCGTCAATCCCTTGCAAA AAATGATAGACGAGTAAGTCTAATTCGATGATTGTCTCTAGTTTTGGTTGTCCATGGTTGCCAA CATTTCCTTTAAGCTTTATAAGTTATAACTGCATTGCCATAGAAACTTTTATATTTTGATATAA TTTCATTTTTGCCAAGTTTTCAATTATTTGGCTTTTCCATTTTGTATCCCAGACTACTAACAGG ATCTTAGTAATTGATAAGAGAAACTACAGGTTCATTTTTCACATTTTCTCTTGCATTCGTGTTA GAAACCAAATTCTTCTAGTATCTACTATGATGTGAACTCTTTGATAGTGAGATACTTAGATATA GATTTACTCCTTCAAGCTAGGTATCACCATGTGGAATGTATTTTGTTTCTAAAGAAAGGTACCA ATACTTTTGAATCTAATATCCACACAGATAATCGCTACTGTTTGTATATTCTTGGCTGGAAAAG TTGAAGAAACACCTAAACCTTTGAAGGATGTCATCGTGGTTTCTTACGGGATTATTAATAAGAA TGATCCTAAGGCTAGTCAGAGAATCAAGCAACAGAAGGTAATGGTGTAAGTTGTTTCTTATTTT GCTCCAGAAGTCCTGATACTGTCTAGTTTTAACCGCATGATTATTATGGTTCAGCTAATATTGT TTCATACTCTTTATTTTGGAACTAGTTTTTTTAACTTTGTAACCCATTGTGTTGTACACCTCTA GGATGTGGTTGTATTCTTGTATAGTTATTTATGCAAGAAAACGTTAGGTTTTAGCCCCATTTTA ATATGTAGATTCAAATCTTGCTACAAAATCTTAATGCAAAAGTAGTTGAGATCCACTTATCATC CTGAGTTTGATTGCACATGCTACTAGTATCAATGCTTAACGGTTTATGATGCTTAACAACCTTC ACTTACAAAATGATAATGGCCATCAATAGCTGCCATTGTATAATTGTATGCCCCCATTATCAGC TTATGGTTGCTCAAATCATCCCAAGGTGCTATCTAAGCTGAACTGTCTAATCCTGAAAATGTTT TTTTATAAAAAAAGTTATGCTCCTTTGTGTCGAGCAGTCGAGCATGAACGTTATTGACAGTGTT ATTCTTTTGCGCTTCCTGCTTCGGAATCTACATAGAGTTTATTTTCTGCATGCACCAGTTTCTA TTTGGTTCAAAAGAAAGCCATTTATGTAAGAGTTGTTTCAACTGATATTAGTGCTTGTACTGCC TATTGCAGGAAATCTATGATAAACAAAAAGAACTTATTTTACTTGGAGAGCGAGTTGTACTTGT AACACTTGGGTTTGACCTTAATATTAACCATGCCTATAAGCCCTTGGTTGAAGCAATAAGGAGA TTCAATATTGATAAAAGAAGTCCACTTCCTCAGGTTGCCTGGAATTTTGTAAATGATGGGTATG CTAGTGCTACCCTTTCTGTCTTTTGAAATTACAGTTCACAGTTGTGTATCTACTACACTTAATG TTGTGCACTGTACAGGCTGCGTACTTCGCTTTGCCTGCAGTTTGAGCCTCATCATATTGCAGCT GGTGCTATCTATTTGGCTGCTAAATTTCTCAAAGTGAATCTCCCATCTGATGGTGATAAGATTT GGTGGCAGGATTTTGATGTCACGCCACGACAACTTGAAG |