Splice junction sequence |
AGAAAAGAAGTTGCTATATGTGTGCTTATACTACCTTATTTGGGGAGAGGCTGCTAACGTACGA TTTCTTCCAGAAGGTTTATGCTATATATTTCATCATatgaaaagagtcatgcaaaaagatgcag aaagaacagaggatgttgtggcttataatattattcctctagatgctttgtctacaactaatga cattgtga
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Assembled circRNA sequence |
Yes
The sequence of a circRNA based on assembly using circseq-cup (Ye et al., 2016) or CIRI-full (Zheng and Zhao, 2018) or CIRCexplorer2 (Zhang et al., 2016).
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Full-length trsnacripts |
Transcript length: 185 Transcript exons: 1052875-1052949,1055299-1055408 ATGAAAAGAGTCATGCAAAAAGATGCAGAAAGAACAGAGGATGTTGTGGCTTATAATATTATTC CTCTAGATGCTCATTGACGAAAGAAAAGAAGTTGCTATATGTGTGCTTATACTACCTTATTTGG GGAGAGGCTGCTAACGTACGATTTCTTCCAGAAGGTTTATGCTATATATTTCATCAT
Transcript length: 207 Transcript exons: 1052875-1052989,1055317-1055408 ATGAAAAGAGTCATGCAAAAAGATGCAGAAAGAACAGAGGATGTTGTGGCTTATAATATTATTC CTCTAGATGCTTTGTCTACAACTAATGACATTGTGAATTTTCCAGAGGTAAAGTTGCTATATGT GTGCTTATACTACCTTATTTGGGGAGAGGCTGCTAACGTACGATTTCTTCCAGAAGGTTTATGC TATATATTTCATCAT
Transcript length: 543 Transcript exons: 1052875-1052985,1053082-1053207,1054762-1054851,1055102- 1055199,1055291-1055408 ATGAAAAGAGTCATGCAAAAAGATGCAGAAAGAACAGAGGATGTTGTGGCTTATAATATTATTC CTCTAGATGCTTTGTCTACAACTAATGACATTGTGAATTTTCCAGAGGTAAGGGCAGCTATATC AGCTTTGCAGTACCATAGGGAACTTCCAAGGCTCCCTGCCACCTTCTCTGTCCCTGATGCTAGG AATTCCGATATGCTGGATCTCTTGCACTGTGTATTTGGTTTTCAGAAAGACAATGTGACTAATC AACGGGAGCATGTTGTTCACCTGTTGGCAAATGAACAGTCCCGACTGGGGAAACTACCAGGGAA TGAACCGAAAATCGACGAGGGAGCTGTGCATGTTGTTTTCTCCAAGTCCCTTGATAACTACATC AAATGGTGTAATTATTTGCCGCTTCCCCCTGTCTGGAACAACACCGAGTCATTGACGAAAGAAA AGAAGTTGCTATATGTGTGCTTATACTACCTTATTTGGGGAGAGGCTGCTAACGTACGATTTCT TCCAGAAGGTTTATGCTATATATTTCATCAT
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Genomic sequence |
ATGAAAAGAGTCATGCAAAAAGATGCAGAAAGAACAGAGGATGTTGTGGCTTATAATATTATTC CTCTAGATGCTTTGTCTACAACTAATGACATTGTGAATTTTCCAGAGGTAAAATTTAGAGTCGA TCCTTTTCGTTAGTATTTACCATTTTTTAGATATAACCGTGGTCTGTGGTTGTACTACTTCCAT GTCGTTTCATCTCAGGTAAGGGCAGCTATATCAGCTTTGCAGTACCATAGGGAACTTCCAAGGC TCCCTGCCACCTTCTCTGTCCCTGATGCTAGGAATTCCGATATGCTGGATCTCTTGCACTGTGT ATTTGGTTTTCAGGTCTGTACCTTTATGACGCACCTACTGTAGTAAACTATATGGATTGTGGTT TCAACCATAACCACAATCATATTGTAGGCTTATAACTTAGTGAGTCCATTGATGATACTGCTAA CAGAAGATATGTTTTAATCACAAACTTAAGTGAAAAAGTTTCTGTTAGTATTAGTAATCACTAC TGTATGTTATGCTGTTACTGACTTACTATCATGCATGATTCAGTTTGTTTTAATTGTAAATATG CTGTTCAATATGATTGAGGAAGTGCAGGTTCTCTCTTTTTTTGTAATTGAGTTTTGCCATTTGC AAAGTACTTCCTCCGTTTCATATTATAAGACTTTCTAGCATTGTCCACATTCATATATATGTTA ATGAATCTAGACATATATGTGTGCCTAGATTCATTAACATCTATATGAATGTGGGCAATGCTAG AAAGTCTTATAACCTGAAATGGAGGTAGTAGTTTTATATTTGGATGCTCTGACTAACTGTTGGA GCATAGGTACCCCTATCCCCTAGACCTAGAGTGTTGGGAGTAGGCTAGAAACCCAATGGGAAAT GTCCAAAGAGTATACTTGGAGGATATACCGATGGAGCATGCCCTGTATTTCGTACGATATACGA AATTATCCTTGCTTGGGCTGTGTAGTCAAGGGGCAGAAGGGGGATTTCCCCTTATGCCAACCTC TCTATGAATATAGGATGGTCGAACCCTAGAATGGGACACTCTCTCACTTTCCACATGACTTGGC TCTGTTCTTTCCCCTAAGTCCAAGGATACATGTACCCATCTGTTGTTTTATGTTACAACAGTAA CCATGAAATTTATGTAGAAATGTGCAGCATATACATTTGAGATAGTTGAAACTGTACATTTCAA CTAATTTCCTACCTGTAGTTTCTTCTTTATTTTGCTCCCTGATCTTGGATATTACATTCTGTCA ACCAATATTATAATGTGATAGAAAACATAATGTAAGTTTCAATAAACCAGACTGTTGTAGAATG TGGTTTCTGAGCATGCCATTCTATATGGTCAGAAATGCTAAGAGCTAATAAACATCCATGGATG TAAACTCACATTTAGTTCAAGATTATGACCAAGATTTTATTAGACTGTTGAAGATGAGGGGAAA AGGAAAAAGAAAGAACATTTGCCGTAATTTCCTTGATCTTGATATTTTTCTTTTATTTTGTTCT CTGACTTGGACAATACATTCCAGCAAGCATTTAATTTTGATATAAAAAGAAAACATAATGTAGA GCGTTCTATATGGTCAGAAATGCTAAGAAGTAATAAAGATCCATGGATGTAAACAGCATCTAGT TAAAAATTATGATTAATATTACAGACGGTTGAAAATGAGGGGAAAAAGACAATAGATGTCAGCC TGTGTTATTCTGAAAATATTTAAGAAGGAAATGCGTCATGGGAGACAACCTTTTAGTGTGGATC TGCAGTTACAACTTCCTGGGTCATTCTTGATACATGCTGCAGTATTTCAGAATCTTGTTGCCTT CATGGAACTGAAATGTCACAATTGGTTGCAGAAAGACAATGTGACTAATCAACGGGAGCATGTT GTTCACCTGTTGGCAAATGAACAGTCCCGACTGGGGAAACTACCAGGGAATGAACCGGTATGCA TACTTTGCACCCTAATTTTTTATGTCGTACAATATTTTTTTTGGGGGTAGAATTGGTTCCATGG CATAGAGTGATCCCTATTCTAGATATTTACTGGCAAAAGTTCTGGGTACTTTTTAATACCACTG AAATATTGCACCGTTTAATACCAGGCCTGGTGCAAAGAGTACTCAATTGCATGTTGCTTTATGT TGTTAATATTTTCATCCTTAGTTCGTTAGCATTGTTGTTATTTGTTGGCAGAAAATCGACGAGG GAGCTGTGCATGTTGTTTTCTCCAAGTCCCTTGATAACTACATCAAATGGTGTAATTATTTGCC GCTTCCCCCTGTCTGGAACAAGTATGATTTGTCATGTTGATCAACATATTTAATTTCTTATTCC TGTCTATATCTTATTTATCACCAAGAGATTTACCTGATTTTCTCTTAGCACCGAGTCATTGACG AAAGAAAAGAAGTTGCTATATGTGTGCTTATACTACCTTATTTGGGGAGAGGCTGCTAACGTAC GATTTCTTCCAGAAGGTTTATGCTATATATTTCATCAT |