| Splice junction sequence |
ACATATGCACATGATGATGTTAGTGTAGGATCATGGTTAATTGGTCTTGCTGTGAAGCATGTAA ATGAAGCAAAACTATGTTGTTCATCCTGGCCCTCAGtctgtggcaggatgcgcagagtagggtt tacctgattaaagagctcgacaggcgaaccggccaggttggtgccttcagatctaccctcttct actatatc
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| Assembled circRNA sequence |
Yes
The sequence of a circRNA based on assembly using circseq-cup (Ye et al., 2016) or CIRI-full (Zheng and Zhao, 2018) or CIRCexplorer2 (Zhang et al., 2016).
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| Full-length trsnacripts |
Transcript length: 893 Transcript exons: 18244407-18244470,18244575-18244624,18244829-18245022,18 245564-18245627,18245700-18245772,18246123-18246246,1824 6732-18246819,18246905-18246955,18247059-18247130,182472 40-18247352 TCTGTGGCAGGATGCGCAGAGTAGGGTTTACCTGATTAAAGAGCTCGACAGGCGAACCGGCCAG GGCCATTCGACGATATCGGTGGATGATACCTTGAAGGTTGTCGCATGCAGGCAGCAAGGAAAGA GGCTGGCCTCACTTGAGATGGAGCTGGCTGCAGCAAAGCATGAAGGTTTCGTGGGGAAATATAC CTATGAGACAAATGGAACTAACTCTAGAAAGAGGCCACTGATTGTTATTGGAATAATGACAAGC TTTGGGAGGAAAAACTACCGTGATGCTGTCAGGAAGTCATGGCTTCCGACAGGTTCAATGCTGA AGAAACTAGAAGAAGAAAAAGGCATTGTAGTGCGCTTCATAGTTGGAAGAAGTGTGAACCGAGG AGATGCTTCAGACAGGGAGATTGATGAAGAAAATAGAAGTACAAAAGATTTCATGATCTTGGAT GATCATACAGAGTCTGAAGAGGAGAGTCCTAAAAAGACAAAAAGTTTCTTTGCTAATGCTGCAG AGTCATTTGATGCTGAATTCTATGCTAAGGTCAATGATGATATATACATAAATGTTGACACTTT GAGTGCAATGCTCAAAGAACACTGGGACAAGCCTCGTGTCTACATTGGCTGTATGAAATCCGGC GAGGTCTTCTCTGAATCAACTCATAAGTGGTATGAACCAGAATGGTGGAAATTTGGTGATGGGA AAACGTACTTCCGCCATGCTTCTGGTGAAATGTTTGTCATCTCAAAGGCTGTAGCTCAATTCAT CTCTATAAACAGGTCTGTTCTCCGGACATATGCACATGATGATGTTAGTGTAGGATCATGGTTA ATTGGTCTTGCTGTGAAGCATGTAAATGAAGCAAAACTATGTTGTTCATCCTGGCCCTCAG
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| Genomic sequence |
TCTGTGGCAGGATGCGCAGAGTAGGGTTTACCTGATTAAAGAGCTCGACAGGCGAACCGGCCAG GTTGGTGCCTTCAGATCTACCCTCTTCTACTATATCAATTACAACTAGCTAGCTTCAATTGAGA GTAAAGAATAACAGGAACTTCTTTGTTGTGCAAAATTCAGGGCCATTCGACGATATCGGTGGAT GATACCTTGAAGGTTGTCGCATGCAGGTAATTCTGATCTCTACTGTATGACTACAATATAGTAA AACTGAGATGTTGTTGCAAAATTTGTTCTTTCTTTTCCCCAATTATTTTTGGCTCTATGTTGAT TCGGGTGCTCTAAATTTGCGCGGCTTGTTTAGTTTGAGACTTCAGAGTTGTAGTGAATGCTCTG TGCTAATTGCTGAACATCTGAACATCATTATGTTTTAGGCAGCAAGGAAAGAGGCTGGCCTCAC TTGAGATGGAGCTGGCTGCAGCAAAGCATGAAGGTTTCGTGGGGAAATATACCTATGAGACAAA TGGAACTAACTCTAGAAAGAGGCCACTGATTGTTATTGGAATAATGACAAGCTTTGGGAGGAAA AACTACCGTGATGCTGTCAGGAAGTCATGGCTTCCGACAGGTACCATTTCGTACTTGCGTTCCT CACTACCTGTGGCACTTTTATATCCTATAATTATAAATAAATTAATACGGTCACCTTTACCCTT GATATTTGGTGGTCATAATTGACTTTCGAAGTCCTTAAAAGTTACTACTTTTTTTTATCATGGG GCATGGGTTTTTTCCTCAAACGTACAAGAGAATGGCGCGCGTCATTAAGAAGAGAAGAGGTATA CAAGGGGAGGAAAATAATCCCATTATAAGGGGCAGAAAGTACAATGCATGGGGCATGGGTTTTT GTAGCTGTCTATTTATAATATTAATCACTAGAATGTTCGGCACTCTAGTTCATAATCTGGACTC ATAGGTGGCTGAATGAACATGGAGAATAAAATGTATTTCTGTTGCTGCATAATAAAGTGGCACC TTTTTTTTTTGTTGACGGTTATCAGTTGATGTAAATAAAAATGAGTTGGCTTCATTTCATTGTT TTTCCGTCTTACTGTTGCATTAAAATGATGTCTGTTTTTTGGGTGATTTTAATTTTCTTCTCTG TACAGGTTCAATGCTGAAGAAACTAGAAGAAGAAAAAGGCATTGTAGTGCGCTTCATAGTTGGA AGAAGGTACCACAGGACTCCTTGCTAATAGAATGACTATATGAGGTCTAGATATCTGATAGTTC CTTATCCATGTAGTGTGAACCGAGGAGATGCTTCAGACAGGGAGATTGATGAAGAAAATAGAAG TACAAAAGATTTCATGATCTTGGTAAGCCTGATTGATCAATCAAACATGTGGTAGTACATATTT ACAACATTGAATGTGTATATAAAATATTTTTCATCATAATTGTTCACCTTATTCATGTTGATTA CATGTTGCTTGAAAACCAGATAAACGATGTGTGTGCATACTTGATTATATACGCCTTCTAGTAC AACAACATCTGCCTTTAATCCCAAGCAAGTTGGGTAGGCTTATTGTGTATGCTTTTTTAGTATA TGTTAAAAAAATCGTGCGCTGTGACTTGTAACAATGAGACTCCATGTTCATATTTTCAGATTAC TCGTTTGGCCTGTTGATTTACTTCAGTTTTTTACTATTAAATGACATTGCAGGATGATCATACA GAGTCTGAAGAGGAGAGTCCTAAAAAGACAAAAAGTTTCTTTGCTAATGCTGCAGAGTCATTTG ATGCTGAATTCTATGCTAAGGTCAATGATGATATATACATAAATGTTGGTACGTAGCATCTCTT CATATCATAGCTGTACTTATCCAATTTGGTATAGTTTTGTTTGATCAATGGTGCTTCTTTCTGT TCAAAATATTTGACACAGTATGGATGTGCATGAGATATTGTACTAGTGGCAGAAGTTAAGAAAT GGTTGACCAGTATGCATCCTTCAATACAAAAGTGACAACTAATTTTGGTTAAAGGGAGTTTTAG CCATCCGCATATGGTGTTTCTATTAGCCCTTTTGTTATTGCTGACAGTGTTCCAACGTATTTTG TTGTTATGTGATCATGATGATAATGAATTTGGGGGGTTGGAGCACGGTTTCAATTAGCTGTGGT GCATGCCTCAATCTTGTGATCCTCACTGACCTGAATAAAAGGTCAATGTACACGTTCTAGGATG CTGGATGGCAATGGCTGTATAGGTGCTATAATTTTGAAATGTTGCACAAACTATTAATAACATT GAACAATTTGGGTTTGTGCAGACACTTTGAGTGCAATGCTCAAAGAACACTGGGACAAGCCTCG TGTCTACATTGGCTGTATGAAATCCGGCGAGGTCTTCTCTGAATCGTGAGTGCTTTCAGCAATT CTTTCTGGGGATATTGGTGCTGTATTTTTCCTTTGCACATTTTTCTAACAGCTTCCCCAAAAAC AGAACTCATAAGTGGTATGAACCAGAATGGTGGAAATTTGGTGATGGGAAAACGTAAGTAATTT ACATTAGGAAAACATTTATTGCGCATTTGCTAGTTGGGACATTTAAAAAAATTACTATTTTGGC TTATCTATTTCAATTTATCAACTAATAGGTACTTCCGCCATGCTTCTGGTGAAATGTTTGTCAT CTCAAAGGCTGTAGCTCAATTCATCTCTATAAACAGGTAAGCAATGTATGTAGTTTGTACTTTC AACAAGGGTCTAATAGGTGGAAACAAAGAGAAGTTTCAGTAAGTACTTTTGGTGATGTATCTTT GACACTTCTGTATGTAGGTCTGTTCTCCGGACATATGCACATGATGATGTTAGTGTAGGATCAT GGTTAATTGGTCTTGCTGTGAAGCATGTAAATGAAGCAAAACTATGTTGTTCATCCTGGCCCTC AG |