Splice junction sequence |
CAAAGAATTAATTAAATGGGTTGATGCCAAAACTACAAAATACGGCTCTTTAACTGTCCTGCGT GAGAGGCGCTGTGGAAGACTTGGCACTGCATTGAAGgcatgacaatgtgcagttattggagaaa ctgaagcagttggttctatttatcgagaggaagctagagaaaaaggtattgtgtcctatattgt taatgagt
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Assembled circRNA sequence |
Yes
The sequence of a circRNA based on assembly using circseq-cup (Ye et al., 2016) or CIRI-full (Zheng and Zhao, 2018) or CIRCexplorer2 (Zhang et al., 2016).
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Full-length trsnacripts |
Transcript length: 943 Transcript exons: 26964737-26964809,26965372-26965457,26965532-26965583,26 965728-26965859,26966067-26966135,26966419-26966511,2696 7313-26967408,26968217-26968315,26968401-26968493,269689 66-26969115 GCATGACAATGTGCAGTTATTGGAGAAACTGAAGCAGTTGGTTCTATTTATCGAGAGGAAGCTA GAGAAAAAGGATTTCATTCAATTGAGTTTCTACTCTGAACCTGATGGCCCTACAGTTGGAAATG GCACCTTCAAATCCTCTATTTTAGTTCCAGGAGAACCAGAAGCATTCTATGTGGGTCCACCATC TAGAGAAAAACTTCCAAAGAATGTTCTACCTGGGTCTGTTTTGGTTGGGTCAATTACCTATGGT GCGGTAAGCTCTTTCAGCAAGAAAGATGACCAAAACCAGCATGCTCCAGCATCTTATAGTATCT CGTATCTCATTCCACCATCAAAGGTTGATAATGATAAAGAAAAGGGAGTTTCATCTGGAAGAAA GAGTATTTCAGAGAGATTGGATGACGAGGTTCGAGACACCAAGATAAAGTTCCTTTCTGGCTTT AATCAAGAAACTGAGGATGACAAGTCTTCTTGGACGGCACTTGTTGCTTCTCTTAAGCCAGAGT ATCCCAAGTATACACCTTTGCTTGCCAAAATTTTGGAATGCATAGTTCAGAAAGCAACTTCAGA TGATAAGTTTAGCCATCAAAAAGAGATTATAGCTGCAGCTGATGAGGTTGTGGACAGTATTGAT AAAGAGGATCTGGCAAAGTCTTTGTCCCTTAAACCAGATCCTGAAGATGAAGAGGCACAGAAAA ATAAGAAAAAGATGGAAGAAACACGAGACCAGTTGGCTGATGCACTATACCAAAAGGGTCTTGC ATTGGCAGAGATTGAGTCGCTAAAGACTGATGAGTCAACTGAGGCATCTGCTAAAGATGTTTTT GAAGAGAATTACAAAGAATTAATTAAATGGGTTGATGCCAAAACTACAAAATACGGCTCTTTAA CTGTCCTGCGTGAGAGGCGCTGTGGAAGACTTGGCACTGCATTGAAG
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Genomic sequence |
GCATGACAATGTGCAGTTATTGGAGAAACTGAAGCAGTTGGTTCTATTTATCGAGAGGAAGCTA GAGAAAAAGGTATTGTGTCCTATATTGTTAATGAGTACGAGACTCATTTCATATTTTAATTGCA TGCTTTATTGAGGGCATGTAAATGTTGTTGATTATAAATAACATCATCTCTTTCACCAAACAAA CCCCATGTCATTTCAGTTTTGGGGGTATGGGTGGTAACTATGGAAATTTAGCCAGTCAAAAATG CTGTGAAGTGTGAATTATCATGTGTAAGCACTAGAGTTGTGTACATTAACATCTAATATTATCC TGTGATTTGTGCATATTGCACCACCACCAAAACTTCTATCATTATTATGTAGGTTGCACATATG CAATTGCAGTCCTATAGAGGAGTATTGTACTAATCAGGTTATTGTGGAAACAGGGATAGAGCAT AAGTTCTTCTGGAATGTTTTGAAACATTTTCTTGTTACTGTTAAATTTTGTTGGGGGGGGGGGA TGGGGATCGCTCTCTCGCTTGTTTAGATATTATGCAAGCTATTTGGTGCTTATCACAGATTGTG CACATTTATTTTTAAAAGTCACCTATCCAGTATTGATGTATATGTTAATCTTATTGCAGGATTT CATTCAATTGAGTTTCTACTCTGAACCTGATGGCCCTACAGTTGGAAATGGCACCTTCAAATCC TCTATTTTAGTTCCAGGGTACTTCCTATTCAAATGTTCACTACTCTATTATTAGAATAACACTT TGACACCACCAATGTTTAATTTTTTAGAGAACCAGAAGCATTCTATGTGGGTCCACCATCTAGA GAAAAACTTCCAAAGGTACAGTGTCTTGATGGTGTATAACTTGATTAGATTTTTTTTTTACGAT GTATCAGTCTCTGTATTTAGATGACCAGTTAACCACCATATCTGTCTTAAACTTTTTGGTTTAA TATGCTGAATTGTACCATATTTGTATGGCAGAATGTTCTACCTGGGTCTGTTTTGGTTGGGTCA ATTACCTATGGTGCGGTAAGCTCTTTCAGCAAGAAAGATGACCAAAACCAGCATGCTCCAGCAT CTTATAGTATCTCGTATCTCATTCCACCATCAAAGGTCAGTGTACCAGATGCTGGTTCCCTTTT TGTTTCACTATCAGCATTGCTGTTTTTGTGGTCTTGTATAATATGCTATACTGCAAGTTCAGGT TTAAATCCATATTCAAGATCATCATAGGACCCTAAGTATTTTCCCTCTGTATATTTTCACTCTC ATCATTCTATTTCATATTCAACTTATATGATGATTGTCTAAGACTTGCAGGTTGATAATGATAA AGAAAAGGGAGTTTCATCTGGAAGAAAGAGTATTTCAGAGAGATTGGATGACGAGGTAGGAGCA CTTTAGTCCTTAAGGTCCTTTGAACTCATTATCTTATATGAAGTGTTCTTTTCGGAAGATGTTT CTTGGTAGAAAGTAAATAAATTCTATATGCATGCAACTGATCATTAATGACGAATTTGTGTTGG ATAGATTGTTGTGGACTTAAGCTACTTAGAAAGAATCATAACTTCTACCTGTTTTAAGTTAATT TATTTTAGGTAAAATGGTATTTCTGATTGCAATATAAAATCGTAGGGAATAATACTGTCTTGAC ATTAAATTGATTGATCAGGTTCGAGACACCAAGATAAAGTTCCTTTCTGGCTTTAATCAAGAAA CTGAGGATGACAAGTCTTCTTGGACGGCACTTGTTGCTTCTCTTAAGGTAGCAACAGCTTCTCT TCCTTAGTCATATTTATCCTATGATTTGTTATCACACTAAGAAAGACCAGACATGATTATTTTA TTGTTATATACATGGTGTTAAACTTAAATGCATCACTTTGTTAACAATATGCCAAAAAAGTGGT CCTTTAGCATCCAAAGGTCACAATTTTAATTTTATAATACTGAAAGCTTGCAGTTCGCCTTATT AGCACCAAAGGTTACCTTCGTTCTTCTATTTAGCATTCCGTCAAAATCAAAACTTCTGTTGGTT TTCTCTTTTTTTTTTATCTGGAAAGAAAGATGTGGAATACCAACAGTACCCTTTGCTTTCTTCC TCCTACAACCCATTCCCTATCTCAAATGAGATCAGCCATGGTTGCCATGGAGACTCTCGCCACC CCATTGAGCTCACCAGGCATGACCAGTCAGGTCTCAGGTCTTGAGCTTGCCCAGCCGCTGCAGT TCGAGCCTCAATCTCGTCTGACTGCTGGAAATATTTGTAGTTTGCAGATTCATAACAAAACTTG ATGTCGACTCTAGTTTGTTTTCCTTATTTATTAGTTTTATTTATGAGCATCTGTAGTTTGCAGA ATTGTGATTACAGTGGTACATGTAATCTTAGTTATTTTTAATTAATGCTAAGATGTTACAATAA AGAAAGACAATGATATCAATGTAATTTGAATTTTTATTGCCTAACATGTTAAATTGTGCCATTT TATTATAAAAATTATGAGCTACATTTGTTTATATTCTCCAATGTCAATTAAATCACCTTAACCA TTATTGCATATTGCAGCCAGAGTATCCCAAGTATACACCTTTGCTTGCCAAAATTTTGGAATGC ATAGTTCAGAAAGCAACTTCAGATGATAAGTTTAGCCATCAAAAAGAGGTAATTAATATTTCCT TTTCATTTTATGTTTCCCTGCATCTTACTATGTTGAATAAAAAAAATGTTCAAACAATTTTACC ACATCTATGGCTGGACAACATTGAGCAGGTTTTTGGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTAAATCAT TACTATGTCCAATGCTCCAAATTCCAATGTCTTTTACTAAATGAGCTGATTAGTTAGTTGATAC AGTCTTTATGCAATAGAATGTTACCGTGTGTCTAATTCTTTCCAGTAGAGGATACTCCTGTGGA AAAACAGGCATCAGGCATGCTGCCAAGACTCAGCAATGTTTGATCTGAAAATCAGGAGCCTTTA CTGTTTTAAGTCTATCAAACCAACTTGTGTGCACTGGTATTAGCCAACACTCAGTCAATGGTTT GCGTCTTTCACATGAAGCATAGCTATATATCTGTTTGATAAAATTGCCAAGGTCATTTATTAAC CATATTTTGAAAGACAAAGGGCTATTGAGAACTCGAAATCTATGTTCAAACTTGTTTCTTTTCC ACGTCAGAGCCTGGTAGCTAAAGATAATTCAATCTCTTCACTATTCCTTCAGGCAGTTTTGACA TTTGGGAGGAGATTAGTACATTACTCTGTCAGATTAAATTATATCATATCATTTATTGCTAGAA AAACCCAAAACTGTAGATAAATATTAATTACTTCTACATCGAAGTGAATTTTCACTTGACTTTC AGTAATCGTTGCCACACAATACATCTATTGTATTTTGACTTTTTTAAATGAACCCTTCTGAAAT TTTTTTTATGTTCCTGGTCTTAAGATTATAGCTGCAGCTGATGAGGTTGTGGACAGTATTGATA AAGAGGATCTGGCAAAGTCTTTGTCCCTTAAACCAGATCCTGAAGATGAAGAGGCACAGGTAAA TAGATTATTTAATTACTAGCATTTGTAATCAAATGTGCTCGCACTGTTCTGCTTAGCTGAAATC TGCTGCTGACTGATAGAAAAATAAGAAAAAGATGGAAGAAACACGAGACCAGTTGGCTGATGCA CTATACCAAAAGGGTCTTGCATTGGCAGAGATTGAGTCGCTAAAGGTCAGCATCTTCCATGTAC TTTATACATATATTCACCTTATTGTCATATCTTTATAGTACAATTATGTAATAGTGTCAATTGC CATAAGTAGACCAATCTGCCACCTGGGCCTGGCTTCACCAGAGTACTCTTATATAATACATTTC TAATGCTTGAAAACCTTGTGCCAGCTTTGTAAGCTAAATTGTGGCTTAACATACTACTTGTTCT AAGCCAGTATGTAAATTTAATACCACCGTGACAAATATTCCTTCACTTTATTCTTTCCTTGCCC TTCTTAGGATGGTAAGATTTATGTTAAGTATGGTTTGCTTGGGCCTATTACGTTCTCAGACCCC TCGAGAACCTTGCCTAGTCTATATATGTATACAACTGTTTATGTATTGACACTATTGAGGTACT TTGTGTTCTCCAAGCATAGAAGTTTTGCTTTGTGTAAAGTAAGATTCTTAATTCTTTATTTGAT GACAGACTGATGAGTCAACTGAGGCATCTGCTAAAGATGTTTTTGAAGAGAATTACAAAGAATT AATTAAATGGGTTGATGCCAAAACTACAAAATACGGCTCTTTAACTGTCCTGCGTGAGAGGCGC TGTGGAAGACTTGGCACTGCATTGAAG |