| Splice junction sequence |
ATCATGTCATTCTTGTTTCAGTATAGAGTTTGATCGTGATGACGAGTTCTTTGCAACTGCTGGT GTCTCACGTTGTATCAAGGTTTTTGAGTTTAGCTCGatacaagctgatcttcactacattaagg aagacattagctctgtggagaagcagagattggaactatataggtctaaagaaaggtattcggg aaaaatga
|
| Assembled circRNA sequence |
Yes
The sequence of a circRNA based on assembly using circseq-cup (Ye et al., 2016) or CIRI-full (Zheng and Zhao, 2018) or CIRCexplorer2 (Zhang et al., 2016).
|
| Full-length trsnacripts |
Transcript length: 660 Transcript exons: 28137040-28137396,28139345-28139502,28139605-28139670,28 140098-28140176 ATACAAGCTGATCTTCACTACATTAAGGAAGACATTAGCTCTGTGGAGAAGCAGAGATTGGAAC TATATAGGTCTAAAGAAAGGTATTCGGGAAAAATGAAAATGCTCGCCGATGACACCGTATCCAC AAAATCACGGTCTTCCTTAATCGACAAGCATGGAAATGGAATTAATAGTGGCGCCCAACGGTCA CAAGGCTGGATGAGTTCTGGGAATTCCCCCAATCCTAGAGCAGATGCAAAGATACAATTAAGCT CCCAGGGACCACTTAGAAAAGATGCTTATTGTAGTTCAGATTTGCATTCTGTTGCACAATCTGG ACTAACTGTAGCAAATAAAAGGAGGGTTCATACACAGTTTAATGAATTGCAAGATTGCTATCTG CAAAAACGACGAAATTGGAGGAAACAATTGTATAAACAAGAAGATAGGGACATAAAGTTTAGTG GCGGAGAAAGTTATAATCCATCTCTTGAAGATTTTCAATCTGTGCTAACTTCTTTTATGCGATA CAGCCGATTGAGGGTCATTGCGGAACTTCCACACGGCGATCTTTTTCATTCACCAAATATTGTA TCGAGTATAGAGTTTGATCGTGATGACGAGTTCTTTGCAACTGCTGGTGTCTCACGTTGTATCA AGGTTTTTGAGTTTAGCTCG
|
| Genomic sequence |
ATACAAGCTGATCTTCACTACATTAAGGAAGACATTAGCTCTGTGGAGAAGCAGAGATTGGAAC TATATAGGTCTAAAGAAAGGTATTCGGGAAAAATGAAAATGCTCGCCGATGACACCGTATCCAC AAAATCACGGTCTTCCTTAATCGACAAGCATGGAAATGGAATTAATAGTGGCGCCCAACGGTCA CAAGGCTGGATGAGTTCTGGGAATTCCCCCAATCCTAGAGCAGATGCAAAGATACAATTAAGCT CCCAGGGACCACTTAGAAAAGATGCTTATTGTAGTTCAGATTTGCATTCTGTTGCACAATCTGG ACTAACTGTAGCAAATAAAAGGAGGGTTCATACACAGGTAAAACTTTTATTTCAATTTAAATTT CACTTTACAGAAAAGTTATCACAATGGTGCTAATCACAGTCTGGCTTATTAGTCAGCAAAATTG CAATGATGGAGATTTAATTAGTATACTCTGAAACAACAATCGAGGTTATTGTGAAGATTGTAGA TATTTGCTTCTTGGTTCTAGTGATGTTACTTTTACAAATATCATTATGACTCTCAAGCTCTTAA GTAATCATCTTTCTATTCCATATTTTAACCAATGAATACAGTGATACTCTAGTTTTTGATTGCA TACACTTAAAAATTATGTTTGTCTTTCATTTTTCCGCACTTATATAGTAAGAGGCCTCGTTGCT ATTTGCCTCCTTACTGGATTTTATGAACAATGTACTGGTGAAACTCTGGAGTCTGGATTGTTAT TTCTTCATTATGGTTTTGGTATGTCCATGTGGAATAAACTCCTTTTTGAAACTTTAAGTTCAAT CTTCTTTCCCTAAAGTCGAGTCTTCTTTTTGTTAGATTTTGGCCTAGGACTCCTGAAAACAGCA TTCCTTTTAAGGATATGTCCAATTTCAGCTATTTTGTAGGTATTATGGATTTAGCAGGATAGAA ATATTTGGGAGTTGTAATAATGCTTAGGCCAAAGTCTCGGTTTCTTACCAATAAACAAGAAAAT AGCTTAAGCTGAAGTGGGCAGTTAGCTTTTTTGTTTCTATCTTTTCCTGGTACGAGGAATTGAC AGTCTGTTCTGCTTCTGTTGAAAGCTTCTGTTGGAGATCTTGTATTGTTGATTCTCTTTCTGTT GCTTAACCTATTTATTAATATTTGTGATATGAAAACCCAACTAATTGGAATTGAAAACCCTTTT GGGATGAGAAATCACTAAAACCCCCCAAATTAACTCGATTTCAACCTTAAGGACTGGGTTAGAC ATTGATTGCCTTAAAGATCAAATATCTTAAGACAAATAACACATTTCTCAATCCAAGATTCGAA TACTCCACCAGATAAGATGATCAGTCTCATTTAAATGTTCTTGGAATGCAACTCAATACATGAG TTACAAAATTTAAGAAGCTCTGCTGGCTAAACTTGAAAGAAACACAAATAATCTCTCTCCAAAC AACCTAATAGCAAGGCTGAAATGGCCTCCTATCATAGTGAAAAGATAAAATCCCTTACTTAATA AGTCAAAAAAAGGATATAATTGGAAAAATATTAAAATTATATCAAAATTGTTAAATTAAAATTT ATTTAATAATTTGATGCTTGAGTGGTTCATATCAATTTGTTATCTGTTTTACGTTTCTATAAAC AAAATATGTATTACTTTTGAATTTTGATTAAAGGATAAAATGAAGATTAAGGCATTTAATTTCT CTTTTTTTTTTTTTGAGAAAAAGAGAGGGATTAGGAAAATAATTTGTCACCTAAAGCAATGAGT GAGCAGGTCAGGACTTTTTGTACAATAAGGAAAGTTCGGTCAGCCTATCAGAAAAGAGCTCTTC CTAGTTTGCTCATGTCAACATCTAGTTTGGAGGAGCTGTACATTAATTTGTTTTCTTTTTCTTT CATATTGATTTATTTTGTGAAATTAGGAAACTTTTAGCTTGTCTGTGCTGATTAAATCCATCTA CTGATGTTATTTTGTCAACTGTTCTTAAGTTAAAGTGCAGTCAGCCGATTAGAAAAGAGTTCTT CCTTGTTTGCTTAAGTTATGTCAACATCTTTCAAAACTTAATGGTCATTTAGTTGGGGGAGCTG TACATTAATTTATTTTCTATTTCTTTGATATTGATTTTTTTTGTGAAATTAGGCAAATTTTAGC TTGTCTGCGCTGATTAAATCCATCTAGTGATGTTATTTTGTCAACCTTTCTTAAGTTAAGAAAT AGCGTTGTTAACGTGAAATGGAATGCCTACAATTATTGACATTCAATTTTTATCCTTTTCTATA GTTTAATGAATTGCAAGATTGCTATCTGCAAAAACGACGAAATTGGAGGAAACAATTGTATAAA CAAGAAGATAGGGACATAAAGTTTAGTGGCGGAGAAAGTTATAATCCATCTCTTGAAGATTTTC AATCTGTGCTAACTTCTTTTATGCGATACAGGTACAATTTTTATTTACTTATTTTAATTATTTG GCATTGGTTCTCTCGTGAGTGTTAGCTGACATAATTTACTTCTGTCTTATCACATGGCTTATGG ATTAGCCGATTGAGGGTCATTGCGGAACTTCCACACGGCGATCTTTTTCATTCACCAAATATTG TATCGAGGTGAGGGATTGATATTACATTATACATTCCTTTGGTTGGGAGTTCTGCTGGGGCAGT TATTTTACTTGATCATTCTATTTATTCAATCATAATGCACTTTAATTTTGATAAATCATGGTAC AATTTAGCCTATAGTAGATATCTGGTTTAAGTTAAAAAATAAGTTTAGTTGAATTTGTAGTTAC TTTTTGTCCTAAGCTACCTGAAACCTTTTGTCAACAATGTCAAGGATGTCCCCAATTGTTACAG ATTTTGAATTAATGAGATTCTTTTGACTGACATTTATTTTTATAAATTACTTTGAGCCTTCTCC AATCACCATTTTGTCTTTCACTGAGAGTCTGAGATAAATACATGTCCATTATTTTTAGGATTTG TCCTCAGTTGTAAAATTTCAGAAATGATAATCATGTCATTCTTGTTTCAGTATAGAGTTTGATC GTGATGACGAGTTCTTTGCAACTGCTGGTGTCTCACGTTGTATCAAGGTTTTTGAGTTTAGCTC G |