Splice junction sequence |
GATTGTTATTGATGAGTAAAGTTCCTAAACGGTTGAGGTATGGGAAGTTTTCTAGCTTAACTAT CTCGTTATCAGACAGATCAATGGTATCGAACTGGTCcttggctttgattttaatgaaatccagt actcgaagtgattttagcttgtgaatcacataaaggcgataatttgcctttttggtgatattat tatccaac
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Assembled circRNA sequence |
Yes
The sequence of a circRNA based on assembly using circseq-cup (Ye et al., 2016) or CIRI-full (Zheng and Zhao, 2018) or CIRCexplorer2 (Zhang et al., 2016).
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Full-length trsnacripts |
Transcript length: 336 Transcript exons: 3160582-3160787,3160888-3161017 CTTGGCTTTGATTTTAATGAAATCCAGTACTCGAAGTGATTTTAGCTTGTGAATCACATAAAGG CGATAATTTGCCTTTTTGGTGATATTATTATCCAACAAACTAAGGTACTGCAGCTTGGGAATGG AGGCAAGGGGATCAATCTCAACCAAATTCACAAGCCTGTTATTTGTAAGAACCAAAGAGTGAAG CTTCGGTAGGAATTCTCCAAGGTTAGGATTTATCCGGGTGATACGATTGTTATTGATGAGTAAA GTTCCTAAACGGTTGAGGTATGGGAAGTTTTCTAGCTTAACTATCTCGTTATCAGACAGATCAA TGGTATCGAACTGGTC
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Genomic sequence |
CTTGGCTTTGATTTTAATGAAATCCAGTACTCGAAGTGATTTTAGCTTGTGAATCACATAAAGG CGATAATTTGCCTTTTTGGTGATATTATTATCCAACAAACTAAGGTACTGCAGCTTGGGAATGG AGGCAAGGGGATCAATCTCAACCAAATTCACAAGCCTGTTATTTGTAAGAACCAAAGAGTGAAG CTTCGGTAGGAATTCTGCAGATGTACAACCATACGATAAATACAACACAGGTAACCAACAAAGC AAACAATGTGTTTGAATTGACATTTCTTACAACACACAGATAGATGTTACCTCCAAGGTTAGGA TTTATCCGGGTGATACGATTGTTATTGATGAGTAAAGTTCCTAAACGGTTGAGGTATGGGAAGT TTTCTAGCTTAACTATCTCGTTATCAGACAGATCAATGGTATCGAACTGGTC |