Splice junction sequence |
GTTTCCATCAAAAGCAGCCAACAATTTAGACAAAATATTACAGCACTGGCCTTGCAGTGGTTTT TGCTGAATATAGTTCCCCACTATAGAAATAATATAGcctcagtgtttgtgaagcagcatctatt atttcaacagattcatcagataaataagtcttcaagagtttcaaaagcccaaccagaacatcat cagaaata
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Assembled circRNA sequence |
Yes
The sequence of a circRNA based on assembly using circseq-cup (Ye et al., 2016) or CIRI-full (Zheng and Zhao, 2018) or CIRCexplorer2 (Zhang et al., 2016).
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Full-length trsnacripts |
Transcript length: 847 Transcript exons: 30117881-30118099,30118195-30118393,30120450-30120496,30 120579-30120677,30120792-30120932,30121016-30121157 CCTCAGTGTTTGTGAAGCAGCATCTATTATTTCAACAGATTCATCAGATAAATAAGTCTTCAAG AGTTTCAAAAGCCCAACCAGAACATCATCAGAAATACCATAGTTTGTGGATAATTTATCCTCCT TGGAAGCAGAACCAGTATGTAGTTGTAAAGAATAATTTTCGGTGGTAGTTGGCAGACGGAATAT TACTTGATGTGCATCAGATATACCAGCCCTAGAGATAAAATCAGCAAGCACCCAAGAAGCTTCA TTTGCTACAGATGATGAGCTACAAATGTCAACAAGAGCCCATACAGCAGAAATGACATCTGGGT CACTATGCCAGCAGCTAACCATGTTTGTATCAGCCGCAGATAGGTCACTTCTACGAATGATTTC TCCCAAAAATAACTTTTTGTGATACGCACGAAGACTCAACAAAAATAGTTCTGGTGGTAAATAA GGAGCCTTATTAACAAACTTTAAGAACTGATTCCTTGAAGAATGTGAGGCAGAAAGTGAAGCAT GAAACTCCTGTACATCTTTCAAGCAATCAAGATCAGGAAGTGGTTCTAACTCTCTTATGTAATC ATAAAGCAGAGGATCAATCTCCACTGTCAATTGATGGAGTAAAGAAAGAACTCTTGATGAATCT TCAGTACCACTTCTTTCTTCTTTCTCATTAATTAGGCAGGAAAAAATTAATTTTGGAACTACTA CCTGAAGCTGTCTGCCAAGCACTTGCAGGGTTTCAGCAGAGGTGTTTCCATCAAAAGCAGCCAA CAATTTAGACAAAATATTACAGCACTGGCCTTGCAGTGGTTTTTGCTGAATATAGTTCCCCACT ATAGAAATAATATAG
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Genomic sequence |
CCTCAGTGTTTGTGAAGCAGCATCTATTATTTCAACAGATTCATCAGATAAATAAGTCTTCAAG AGTTTCAAAAGCCCAACCAGAACATCATCAGAAATACCATAGTTTGTGGATAATTTATCCTCCT TGGAAGCAGAACCAGTATGTAGTTGTAAAGAATAATTTTCGGTGGTAGTTGGCAGACGGAATAT TACTTGATGTGCATCAGATATACCAGCCTGCGCTAGCATTAAAGAAATCAACTGACTGAGATGA AAAATTGTACATCACCAACATACTGTAGCATCAGAAAAGATTAAGGCCAAAAACATACCCTAGA GATAAAATCAGCAAGCACCCAAGAAGCTTCATTTGCTACAGATGATGAGCTACAAATGTCAACA AGAGCCCATACAGCAGAAATGACATCTGGGTCACTATGCCAGCAGCTAACCATGTTTGTATCAG CCGCAGATAGGTCACTTCTACGAATGATTTCTCCCAAAAATAACTTTTTGTGATACGCACGAAG ACTGAAAGTATAAGAAATGAAAGAAGTGTTATAACAATAGAAACGTGTTTGGAAAAGAAAAATA ATAATACAATACCATAAGGGTCTAGGCTAACATAATTTGCATTGGAAAAGAAAAATAATAATAC AAAATATAGGAAGTGTTATATTTTGAAAGTATAAGAAATGAAAGAAGTGTGAGGTCACAATTTT GGCCAGCTTGTTTGGAAATAAAACAACGCTATCTTATGGGTTCATTTAAGAATGTGAGAAGAGC TTTAAGGAACAGGTTTTCGGAATACACGTGGTTAGGTTATCTCAACCAAATCGTGCATATGATC GGTAGACTGCACTGTTCATATAGTGATGTTTGAATTAGGAGATGTAATGAGAGATAGGATGGAT AAGCCTTAGTACAATTTCGAGCTGGGTCCAAACATTTATTTGGAATTTGTTCTAACACTAATAT TTGAGTGGCTAAATCTAAGGTATCAATTACTTCCTCGCCGTGCAGATGAATGAGTTAAAGTTGG GTCATTTTGCTTGTGTGTTAAGGGTGTGTGTGTGTGTTCTATTAGTTCATAGTTATTACCCCAT TTTCCTTCTTAATATAATGAATAATGATACATGGCTCTCATTTGTGTTTGCTAAAAAAAGTGGC AAACACTATAAAAATATAGATGGACATTAAGCATTAGAAGAACACTGGCCATGTGGAGATGGTC GAATGGAAAGAAATGATACAAAAGTTGGAACATGTCAATTTGACAGATGGTCTGAGATCAAGTG CTAGCTAGAAAAATCTGTGAAATTCAGTACAAGATCGTTGTATAGAGACAGAGTTATGACCTTT GGAAGGTAGCAATCAATAAATGATGGGGTAGAGGACTAAAATTCCCACGAGTTCTAAATTTTCT AACCGTCTTTCATGATAAAATTCAATCAGCTGGACATCTCACAAGGAGGAAATCAACAGGTAAT GAAATATGCAGGCTATGTGGGCAGAGAGGAACAACTGATTGTGTTACATTTCAACTCCAGTCTG ATGCCACTTCCTTTGATGACTGGTGGGATCTATTAAGTTGCATGCACCAACCACTTTAACGCAA AAGCTTAAGCTGATAGAAAGAGCTAGGCAACTCATATTCTCTAACACTCTCCCTCACATCGAGC CTCTCTTAGGTCCCAGACATGGAATACGAGCGAGCAACAATTATTTTATTTTAGTGCTAACCAG GATTCAAACTCGAAACCTTTGGTTCTTATACCATTTTAAGTCGCATGCACCAACTAGTTCAATC CAAAAGGCTAAGCTAATAGGAACAGCTAGGGGGCAATTCACTTATATTCTCCAACAGGCTCAAA CGAATGACAAAGTAGAAGAAATGAGCTTTACTTTTTTGGGTTGGGTTGATCTATTCTGTATCGC CAAGAGAAAGGGCCTCTAGCTGAGTTGGTGAGGTGTTCTGAGTAACAGTCCTTAGGAACTGAGT TCAAATCCCAGTGGGAGCGAATTTCAGGCTGAGGTTAAAAAAGGTCACTCGCTGGTTCCCTCGG TTGTGTGCACATGAGAGGGATTGACCTACGGGGGCGGATCCTCGTGTAGGGGCTGGGAAGGCTC AAAGCACGAGTAAAACTCCGACCTATAGGGAGCAGACTCTCTTGCTGCACGGAGGGCCAGATTT CGTGACCTTTCTCGGTCAGGGCTCCGATTGAGCTTCCTCTTAATATAATACCGTGGGGGCGGTC TTTCCCCTACCAGTCGAGTTTTTATTCTGTATCGCCAAATGTGTATGTTCTTGAGTTGTCCTAG GAGTGTGTGTGTGTTTTTTGTATGGGGTTTTTAAACCCTAGCGCCTTTCTTGATATAAAGATAT GCAAATCTCATGCATGTTTGAGGGGAAAAAAACTGCACTGAAATGGTGGTATGGATGCAAATAC CACACAACACGCTACATGTAGGACCATAACCCACATGTACAACATGCTACATGTAGAACCAGAC CCCTACATGTCACTGACACAGACTGGTGGTATCAAATGATGGTATGGATGAAATTACACCAAGG AAATATTACCTCAACAAAAATAGTTCTGGTGGTAAATAAGGAGCCTTATTAACAAACTACAGGA AGTCAAAAGTGATGAGTCAGCTCATAATGAACATAAATTAAAAAAAGAAAAGAAAGGAATGGGA AAAATAAGACCTTTAAGAACTGATTCCTTGAAGAATGTGAGGCAGAAAGTGAAGCATGAAACTC CTGTACATCTTTCAAGCAATCAAGATCAGGAAGTGGTTCTAACTCCTGTACGACCAGTCAAAAC AAAATAAACCAAACATAAATTACGCTTAATAACAACACACAGATACCAGTAAGAACTAAGAATG CAATTATATATGTAGAGAAGATGAAGCATACTCTTATGTAATCATAAAGCAGAGGATCAATCTC CACTGTCAATTGATGGAGTAAAGAAAGAACTCTTGATGAATCTTCAGTACCACTTCTTTCTTCT TTCTCATTAATTAGGCAGGAAAAAATTAATTTTGGAACTACTACCTGTGACAGTTCAGTTGTAA GTGCTGAGCAAACAGAAGTTCATTAAACAATTGTTTTTTCGGATTAGTGTTTGTAAAATCCACC TGAAGCTGTCTGCCAAGCACTTGCAGGGTTTCAGCAGAGGTGTTTCCATCAAAAGCAGCCAACA ATTTAGACAAAATATTACAGCACTGGCCTTGCAGTGGTTTTTGCTGAATATAGTTCCCCACTAT AGAAATAATATAG |