Splice junction sequence |
TTGAGTATTCATGCTTCAGTTTTGGTCTTTCTTTGCAGCAATGCATCTTGCACCACCAACTGTT TGGCACCTTTTGCTAAAGTCTTGGATGAAGAATTTGgcatcccacttgcttaagtatgactcca tgcttggaaccttcaaggctgaagtgaaaattgtggacaatgaaactattagtgttgatggtaa gctcatca
|
Assembled circRNA sequence |
Yes
The sequence of a circRNA based on assembly using circseq-cup (Ye et al., 2016) or CIRI-full (Zheng and Zhao, 2018) or CIRCexplorer2 (Zhang et al., 2016).
|
Full-length trsnacripts |
Transcript length: 391 Transcript exons: 16128153-16128320,16128412-16128572,16128657-16128718 GCATCCCACTTGCTTAAGTATGACTCCATGCTTGGAACCTTCAAGGCTGAAGTGAAAATTGTGG ACAATGAAACTATTAGTGTTGATGGTAAGCTCATCAAAGTTGTCTCCAACAGAGACCCTCTTAA GCTTCCATGGGCTGAGCTCGGCATTGACATTGTTATCGAGGGAACAGGAGTGTTTGTTGATGGG CCAGGAGCAGGGAAGCATATCCAAGCCGGAGCCTCGAAAGTTATCATCACTGCACCAGCCAAAG GTGCTGATATCCCTACCTATGTTATGGGAGTCAATGAGCAAGACTATGGTCACGATGTCGCTAA CATTATTAGCAATGCATCTTGCACCACCAACTGTTTGGCACCTTTTGCTAAAGTCTTGGATGAA GAATTTG
|
Genomic sequence |
GCATCCCACTTGCTTAAGTATGACTCCATGCTTGGAACCTTCAAGGCTGAAGTGAAAATTGTGG ACAATGAAACTATTAGTGTTGATGGTAAGCTCATCAAAGTTGTCTCCAACAGAGACCCTCTTAA GCTTCCATGGGCTGAGCTCGGCATTGACATTGTTATCGAGGTGAAATTTCTACCGAAAACTGCT TATTATGATGGCAAATCGCGCTACGGAACTTAGTTAATCGAAAACTGTATATGGTTATGATCAT CAGGGAACAGGAGTGTTTGTTGATGGGCCAGGAGCAGGGAAGCATATCCAAGCCGGAGCCTCGA AAGTTATCATCACTGCACCAGCCAAAGGTGCTGATATCCCTACCTATGTTATGGGAGTCAATGA GCAAGACTATGGTCACGATGTCGCTAACATTATTAGGTCCGTTTAAAGTTAAACCTTTGATCTC ATTAAAGCATGAACGAGTTTGAGTATTCATGCTTCAGTTTTGGTCTTTCTTTGCAGCAATGCAT CTTGCACCACCAACTGTTTGGCACCTTTTGCTAAAGTCTTGGATGAAGAATTTG |