Splice junction sequence |
GTGATCTTTACTGAGCAGACAGTGCAGTGAGAGTGTGACACTGAACAGCGTTGTAGTGCTCATT GGGCAAAGCTTTTGCATTCTGGCTTGTGCGGTGCAGggtgatgttggttgtggtaaaaccgtag ttgctttccttgcatgcatggaggtcattagctcaggatttcaggtatctatactacaaaccaa catccttg
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Assembled circRNA sequence |
Yes
The sequence of a circRNA based on assembly using circseq-cup (Ye et al., 2016) or CIRI-full (Zheng and Zhao, 2018) or CIRCexplorer2 (Zhang et al., 2016).
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Full-length trsnacripts |
Transcript length: 166 Transcript exons: 29447854-29447923,29451200-29451295 GGTGATGTTGGTTGTGGTAAAACCGTAGTTGCTTTCCTTGCATGCATGGAGGTCATTAGCTCAG GATTTCTCTTTACTGAGCAGACAGTGCAGTGAGAGTGTGACACTGAACAGCGTTGTAGTGCTCA TTGGGCAAAGCTTTTGCATTCTGGCTTGTGCGGTGCAG
Transcript length: 167 Transcript exons: 29447854-29447925,29451201-29451295 GGTGATGTTGGTTGTGGTAAAACCGTAGTTGCTTTCCTTGCATGCATGGAGGTCATTAGCTCAG GATTTCAGCTTTACTGAGCAGACAGTGCAGTGAGAGTGTGACACTGAACAGCGTTGTAGTGCTC ATTGGGCAAAGCTTTTGCATTCTGGCTTGTGCGGTGCAG
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Transcript length: 228 Transcript exons: 29447854-29447925,29451121-29451221,29451241-29451295 GGTGATGTTGGTTGTGGTAAAACCGTAGTTGCTTTCCTTGCATGCATGGAGGTCATTAGCTCAG GATTTCAGGACCTTGCACAATTTCCAGGACTAAAAGTTGAGCTCAGCATGAGACAACCGCTGTG CATTCTTGGAGATTGACCTGTGATCTTTACTGAGCAGACAGTGCACAGCGTTGTAGTGCTCATT GGGCAAAGCTTTTGCATTCTGGCTTGTGCGGTGCAG
Transcript length: 245 Transcript exons: 29447854-29447925,29451123-29451295 GGTGATGTTGGTTGTGGTAAAACCGTAGTTGCTTTCCTTGCATGCATGGAGGTCATTAGCTCAG GATTTCAGCCTTGCACAATTTCCAGGACTAAAAGTTGAGCTCAGCATGAGACAACCGCTGTGCA TTCTTGGAGATTGACCTGTGATCTTTACTGAGCAGACAGTGCAGTGAGAGTGTGACACTGAACA GCGTTGTAGTGCTCATTGGGCAAAGCTTTTGCATTCTGGCTTGTGCGGTGCAG
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Genomic sequence |
GGTGATGTTGGTTGTGGTAAAACCGTAGTTGCTTTCCTTGCATGCATGGAGGTCATTAGCTCAG GATTTCAGGTATCTATACTACAAACCAACATCCTTGCCTTATGTACTGTATATAAAAGGATTTT ATCAACTAAAAGGACAGCTTACTGAAGCAAACTAGATGCTTAATCCAAATAGGATATACACGAA AAATGATTATCTTCCTCCTAGTTGTACTCTTCAGTTCTTCATTAATGAGATGTTAGTCTAACAT ATACCTTGTAAAATTATTTCTAGGCTGCTTTCATGGTTCCAACGGAGGTTCTTGCCCTCCAGCA TTATGAACATCTAACTTCATTGCTGGAGAAGTTTGATGGAGATGAATGCAAACCAAACATTGCT TTACTAACTGGTTCAACTTCCACGAGGGAATCAAGGATTATTCGAAATGCAAGCATTCTTTCTA GACTCTCAAGTTCCCATACGCATAGATTCATATATTTATGTGTTATTGTTATTCTATGGCAGGG TCTCAAGACAGGAGAAATAGCAATGGTCATTGGAACACACAGCTTAATTGGTGATAAAACCGAA TTCTCAGCTTTGCGCATCTCTGTTATAGATGAGCAGCAGCGCTTTGGTGTTGTTCAAAGAGGAA GGTTTAATAGTAAGGTAATTTGCTGAGCATTTGCTATTTACATTGAATAAAAACCATACACGTC CTTTTTGACTGTTACTTTTTTTGCGGGGACTTTTTGACTGTTACTTTGCTCCTGCATTGTCACT CATTCTGTAAACCTTGTTGTTGAATAAAATCACACACATCCTTCGTTTACTTACTTTGCTCCAG GATTGTCACCCATTCTGTAAACTTTGTTGGCAAACTTAGAAAGAAAATTGCTAATTACTACTCC TTCCATCCTAAAACATAGCAGCTTTTAGCGTTCAAAATTTGTCCCAAAACATAGCAACTTCTCC ATGTACTTCATCATCTGAACCAATCACAACCATCTCTCATTTAATTTCCCCACCTACTTCCTCA TCAAAACCAATCCTAACCATCTCTCATTTAATTTCACCTCTCTCCTTAATCTCCATGAAAAACT CTAGAAGTGCTTATATTTTGGGGCTTAGGGAGTAAGAAGTATGCCTCTGGATTTCCATGTTCGT GTATCTTATTTTGTGGTAAGATGGGCCAGAGCGTTCCTACTGACTTTTTTCTTCTTTCTGTTCT TACAAACTAGCATATCACTGCAGAAAATGACCCATCATTACAATTTGCTATTCTTGCTGTTATT ACAATAGCTAGCATATCATTGCAGAAAATGATGGTAATAACGGGTTAATGATAATTTTATTTAA TAAAAATCCCAATTCAATGGGTAATATGCTAGTGATTATATAAAATGCTATGGTGAAAGCCTTC AAGGAGTGTGCTGTAGTTCTCAAGGCTGCCTAATTGTCCAAAACAAAAGATAATGTATCTGGTA CTTACACTTGAGTATTTGATATCCAAACCTCGTTGCATAATTCATGTCTTTCTTATTTTGGTTT CAAATTTAACATAGTTAACATTTGTTTGTTAATACAAATTACTGCCATTCATTACAGCTATATA CCCCTTCCACGAAATCGAGTGATGATGATACAATCTCAGACGAGAATTCCGCTTCTGAAATATT TATGGCTCCCCATGTTCTTGCTATGTCCGCTACTCCAATCCCAAGAACGTTGGCTCTTGCTCTG TATGGGGACATGTCCCTTACACAGGTATTTTACAGGCTTATGGCATATAAGGCTTCGTTCGTTT CTTCTGTTTGGTAGTTGATTTTCTGCACACGCCAAACGAGAAAGCTCATTAGTACATGATTAAT TAAGTTTTAACTATTATAAACTTGAAAAATGGTTTTCTTTGATTTTTTAAACAACTCCTATATA GAAAACTTTTATAAAAACACAGCATTTAATAGTTTAAAAAACATGCTAACAGAAAACGAGGAAG TTGAAGTTTTGAGTTGAAGAAAAGAACATAGCCTAAATTGAGTATTCCAAATACTTACTCATTG GAAGTAAAATGTCATATCGCGTACTATGTGGGGCACAGGGTGAAAACTACATACATCGAGGGAC TAATTCTAGGCTAGCACAATTATATCTTTAACAACTAGTAGTCCACCCTGTTGTTTTCCAGGAT CCGCTACTTTATGACTTCACATATTGGATAGGATATAGTGCAAAAATGTTCTTGCATTTTTCAT TTTTCATGTTCCAGGACCTGTTACTTTAACAACTAGTAGGGTCTTTCATTTTTCACAGCTATTT CAAATCTTTACAATTGTGATCCACGTTTCTTATAGATCACGGACTTGCCTCCAGGAAGACAACC TATAGAAACTCTTGCTCTTGAAGGAAATGATGCTGGTTTTGAATCTGTCTTCCAGGTGATGACA TGACTTCATTCAATATTTTTTCTTTTTGTTTCAGATCTTTGTTGTTTTCCTTTTCTGTCCCAAT CTGCACTTGGATATGGTTGGGATCAATTTGCTTATCATTTTTAAATACTTATGGCTTGAAGATG ATGAGTGATGAACTGGTTGATGGAGGCAAGGTCTACCTCGTATATCCTATCATAGAAGAATCAG AGCAGCTACCACAACTTCATGCAGCAAAAGCCGAGTTTGATTCCATAAAGCAAAAATTTGAAGG TTATCCCTGTGGGCTGTTGCACGGTCGCATGAGGAGCGATGAGAAGGATGGAGCCCTCAGCAGT TTTAGATCCGGGGAAACACGTATTCTCCTCTCAACACAAGTGATTGAGATTGGAGTCGATGTTC CTGATGCTTCCATGATGGTTGTCATGAATGCTGAGAGATTTGGAATGTCTCAGCTGCACCAGTT AAGGGGTCGGGTAGGGCGTGGCGAAAGGAAATCCAGATGTGTGTTCCTATGCTCCACTCCTAGC GCGCTGCCAAGGTTGAAGGTGCTTGAGAAGTCATCCGATGGATTCTACTTGGCTAACGCCGACC TGCTACTGCGTGGCCCTGGTGATCTACTCGGCAAGAAACAGTCAGGGCATCTTCCAGAGTTTCC AATAGCTAGACTGGAGATTGATGGCAGTATTCTACAAGAAGCTCATCTTGCTGCACTTGTAAGT TCATTTGCTAAACCCCAATTCGTGTTGCTATTAATGATCAGACAACTCTTCTATCACTGTAGTA TATAACTTATTTGTTCATGTTTTTAAAAGTAGCTTTTTTGTGGCAGAACGTTTTGGGAACAAGC AACGACCTTGCACAATTTCCAGGACTAAAAGTTGAGCTCAGCATGAGACAACCGCTGTGCATTC TTGGAGATTGACCTGTGATCTTTACTGAGCAGACAGTGCAGTGAGAGTGTGACACTGAACAGCG TTGTAGTGCTCATTGGGCAAAGCTTTTGCATTCTGGCTTGTGCGGTGCAG |