Splice junction sequence |
TGCTGCAATGTTGGCGATCTTGTCACGTCTTGAACAGAAAGGGGAGTCAGTCTTTGCAAAGAAA GAGTACGCACGAGCAGTCATTTTGGTGGCCAGTCAGgtacctctttctcttgcaaaatacatta gcaatggtgttggggtttccttgcctactgagcaattattcaaaagtcttgtcaccagccttct aatccctc
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Assembled circRNA sequence |
Yes
The sequence of a circRNA based on assembly using circseq-cup (Ye et al., 2016) or CIRI-full (Zheng and Zhao, 2018) or CIRCexplorer2 (Zhang et al., 2016).
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Full-length trsnacripts |
Transcript length: 1488 Transcript exons: 172826877-172828080,172828162-172828229,172828671-172828 756,172829483-172829612 GTACCTCTTTCTCTTGCAAAATACATTAGCAATGGTGTTGGGGTTTCCTTGCCTACTGAGCAAT TATTCAAAAGTCTTGTCACCAGCCTTCTAATCCCTCTTATTATAGGGAAGGTATGTGGTTATTC ATATCTTTGTACTCCATGCCATACCTTACTATTTCATTTCAATACAATAATACTGCACCCATTA TGTTCAGATCTCCTTTCAGTTTAATCTTTGGATGTAAAAACAACAGGGCTTATTCTGAATCTCA TGTAACTACCTTTCATGGGGCCTGTTTGTTTCGGCTTCTGGCAGCTTCTGGTCACCAAAAGCTG CTGCGGACTGCCAAACGCTCAGCTTTTAAGACAGCTTCTATAAAATTCGTTGGGGCAAAAACCA TCCAAAATCAACATAAACACATAATCAGTTGAGTCATTGTGATAGTAGGAATCCGTCACTTTCT AGATCCTGAGCCCTATGAACAACTTTATCTTCCTCCACACGTAATCGTAATGATACTCAGATTC TCCTCACAGCCAGATTCTCCCCACAGCTAGATTTTCAGAAAAGCTGATCAGAAAAAAGCTGAAC CAAACAGGCCTATGATCAACTGATAAGCATGATTTGTTTGTCGAATGTTTAGGAGCACAATTTA GGCAAGTATTCATTTCTTTTAGTAGATTATCAGCCATGAACCACCTAACTACAATATATATAAA TAAAAAACTCGACCTGTGGGGCTAAGACACCCCCCATGACATTATATTAAGAAACACAGATCGA GAAACCCCCTCGAACCCCTGTCCCACCCAGACACAGCGGCACCGTAGCCTGACCGAGGCCGGAC CTTGGACCTGTGCTTTGGTGTGGGACAGATGAGAGGACTTTTTTAACCACAACTAAAATTCGCT CTCACGGAAAGTCGAACCCAGGACCTAAGGAGTGCTACTCGGACCACCTAATCAACTCAACTAG ATGCCCTTTCACATCTGACTACAATATGCAAAGTATAATTTGAACTCCTCTACCCTAAGTGCTT ATAATGTTCTGTTTATTTTGAATTTAGTCCCTCTGTTTCTTAAACAAGAAATAATTAAATTCAC CATATATCCCCCATGTTTTCCTTAAAGACTATAGTGCCATCTTGAAATATCTGAAGCTTCCTGG AGACACTTATGATGGCTTGTTCTTTGTCAGGTTGCTCGAGAAACCTCAAAAGGTATTGCTGATT TTGTTGATGGAAATCGACAAGGCTTTTCAGTTGCAAGTGCTGTTCTCCTCAGCCTAGTTCCATG GATTCAAGTAAGTAGATCAAGACCACTGATCTTATCTGTTCAAGTAAAATCCTTTGCTGTTGCC GTTACTATTGGAGTGCTTCTTCATCTTGCTCTGCTGGCTTTCAATGCTGCAATGTTGGCGATCT TGTCACGTCTTGAACAGAAAGGGGAGTCAGTCTTTGCAAAGAAAGAGTACGCACGAGCAGTCAT TTTGGTGGCCAGTCAG
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Genomic sequence |
GTACCTCTTTCTCTTGCAAAATACATTAGCAATGGTGTTGGGGTTTCCTTGCCTACTGAGCAAT TATTCAAAAGTCTTGTCACCAGCCTTCTAATCCCTCTTATTATAGGGAAGGTATGTGGTTATTC ATATCTTTGTACTCCATGCCATACCTTACTATTTCATTTCAATACAATAATACTGCACCCATTA TGTTCAGATCTCCTTTCAGTTTAATCTTTGGATGTAAAAACAACAGGGCTTATTCTGAATCTCA TGTAACTACCTTTCATGGGGCCTGTTTGTTTCGGCTTCTGGCAGCTTCTGGTCACCAAAAGCTG CTGCGGACTGCCAAACGCTCAGCTTTTAAGACAGCTTCTATAAAATTCGTTGGGGCAAAAACCA TCCAAAATCAACATAAACACATAATCAGTTGAGTCATTGTGATAGTAGGAATCCGTCACTTTCT AGATCCTGAGCCCTATGAACAACTTTATCTTCCTCCACACGTAATCGTAATGATACTCAGATTC TCCTCACAGCCAGATTCTCCCCACAGCTAGATTTTCAGAAAAGCTGATCAGAAAAAAGCTGAAC CAAACAGGCCTATGATCAACTGATAAGCATGATTTGTTTGTCGAATGTTTAGGAGCACAATTTA GGCAAGTATTCATTTCTTTTAGTAGATTATCAGCCATGAACCACCTAACTACAATATATATAAA TAAAAAACTCGACCTGTGGGGCTAAGACACCCCCCATGACATTATATTAAGAAACACAGATCGA GAAACCCCCTCGAACCCCTGTCCCACCCAGACACAGCGGCACCGTAGCCTGACCGAGGCCGGAC CTTGGACCTGTGCTTTGGTGTGGGACAGATGAGAGGACTTTTTTAACCACAACTAAAATTCGCT CTCACGGAAAGTCGAACCCAGGACCTAAGGAGTGCTACTCGGACCACCTAATCAACTCAACTAG ATGCCCTTTCACATCTGACTACAATATGCAAAGTATAATTTGAACTCCTCTACCCTAAGTGCTT ATAATGTTCTGTTTATTTTGAATTTAGTCCCTCTGTTTCTTAAACAAGAAATAATTAAATTCAC CATATATCCCCCATGTTTTCCTTAAAGACTATAGTGCCATCTTGAAATATCTGAAGCTTCCTGG AGACACTTATGATGGCTTGTTCTTTGTCAGGTTGCTCGAGAAACCTCAAAAGGTGTGCAAAGTT TAATATCTTCCTTTTGACAGTCACTCCAGGTTATTAATGTTAATTATCATTCATTTATCTCTTA TCTAGGTATTGCTGATTTTGTTGATGGAAATCGACAAGGCTTTTCAGTTGCAAGTGCTGTTCTC CTCAGCCTAGTATGTCTCTAATTTGAACATATGCCAGTTGACATGTTATTTACTTGCTCTGTAG CTCCCTTGATTTGTCCTTCAGCATGTCATGCTTTTGGGTCCATATATATAGTGCTTCACTGCTT CCAGCCCAATTACCCATCCCTTTTGGCGAAGCGGGTACAAGAGGGAAACTGATGCATGCATAAA CCTATCCTGGATTAAGTTTATCATTAGCGAGTATTTGGGCTCTGTGTTGATCCAATCATATAAC AAGAGCACTACAGAAATCAACTTTCAAGTTCAAATATAGCATAACTGAGAGCGTTTTGGTGTGG GAGAAAAAAATTTAGTGTTGCACTTCAGTTTATGTTGCTTTTGTAGTTTGCATCAATATATTGC AAGTCTGCATGCATGCTCTGTCCCTGTGATCTATGGACTTCAGTTCTGAAACATTTCATTTGAC AGGTTCCATGGATTCAAGTAAGTAGATCAAGACCACTGATCTTATCTGTTCAAGTAAAATCCTT TGCTGTTGCCGTTACTATTGGAGTGTACGTTTACCATCTAAGCTTACCACAGTGAGAATGTTTG TATATCTTGTTATGTGGATGTGGAATCAAATGCTTAAGGGTGGATGAAGATTAATCCAGTTTTT TCTTGTTCTCCTACTTCTCCATCTATGAAAAAGTTCATGCTTTTGTTATGTTTTGCCTTGATTA CTGCACAAGCATTGTACTTGAAGCCTTGAACTGCTATTCTCCTCAATTATCTATCAAACTATTA TTGTTGTTTCAACTTCATGAGAATCTTTATGTTCTAAATTTTCCTACAGAGTTAACTTCAACCT AACATTCAGTGTGATGCATGAGTACACAACTATTTTCCCCAAAACATTCGACTTTACTGATAGG CACGCTTGCTAAGATGTTGATCCAGATGGCTACTGTTATTCAGTGTCTTCTGCCATGTTAAAGT AGTGCTAACTGTATACTTATTCTGTTGTTGCTGTCTTGTTCTGGGTTTCACATTAGATTGTAAC ACTTGCTACTCCAATTTCACAGCCTTACTAAATAACCATCAGTCAGGATTGAGCCAATATTCCC TGTCCCGACAAAACAGAAAAGAACTAATGGGGACTACCCTTCTTCAATTGTTCTTAACTGATTC TTTGCTTGTCAGTGGTGTTGTTTAGTCTTTTCTTTGCCTCCAATATAAACTGCAGCGTTGTGTC CGCAGCTACACCTTAATATCTAACATGAGTACATTTCTTTTTACAGGCTTCTTCATCTTGCTCT GCTGGCTTTCAATGCTGCAATGTTGGCGATCTTGTCACGTCTTGAACAGAAAGGGGAGTCAGTC TTTGCAAAGAAAGAGTACGCACGAGCAGTCATTTTGGTGGCCAGTCAG |