Splice junction sequence |
AAAGAATTCTGAATTCTTTGATGACTCGAATTGGGCAAGTGCATTTGACACTAACGATGATGTG GATTCAGTCTGGGGATTTGATGCATCAAAAAGCCAGgggcggaagatggagttgagtcaagcaa ttgtgaacatggagcaaggtggtagtgctgatggtctccttcaggtacatgctattctatatgc ttacgaga
|
Assembled circRNA sequence |
Yes
The sequence of a circRNA based on assembly using circseq-cup (Ye et al., 2016) or CIRI-full (Zheng and Zhao, 2018) or CIRCexplorer2 (Zhang et al., 2016).
|
Full-length trsnacripts |
Transcript length: 615 Transcript exons: 7213030-7213101,7213192-7213306,7213419-7213487,7213586- 7213944 GGGCGGAAGATGGAGTTGAGTCAAGCAATTGTGAACATGGAGCAAGGTGGTAGTGCTGATGGTC TCCTTCAGGTCCGGGCTGACAGAATACAATCAGATCTTGAGGAATTGATGAAGGCTTTAACTGA ACGATGCAAGAAACACGGGTTGGAGGTTAACTCGAAGGCCCTTGTAGACCTTCCAGCTGGCTGG CAACCTGGAATTCAAGAAGGTGCAGCTCTTTGGGATGAGGAATGGGATAAGTTTGAAGATGAAG GTTTTGGCAATGAGATCACTTTTGACAAATCAAAAGAGCAAAACTCGTCTGGTGAGAAGGAAAA TGGTACGGTGGATGATGGTAGTGGGCCACCTGATTCGCCGACCCATGTAGAGGACAACTATGGC CCTTTTTCAGAAACCTCAGACCGCCACCATGAGAGTGAATATGGGACAACTCACAGTGAAGATA GAAGTCCTAGAGACAGTCCTGTCTCTAGGAATGCTACTGAGGTCCCATCTCCAGATTATTCTCA GGGAAAGAATTCTGAATTCTTTGATGACTCGAATTGGGCAAGTGCATTTGACACTAACGATGAT GTGGATTCAGTCTGGGGATTTGATGCATCAAAAAGCCAG
|
Genomic sequence |
GGGCGGAAGATGGAGTTGAGTCAAGCAATTGTGAACATGGAGCAAGGTGGTAGTGCTGATGGTC TCCTTCAGGTACATGCTATTCTATATGCTTACGAGATGCCTTAACTGTCGAGTATCTGCTGTAC ATGCCTGATTTGATGCTGTACTGGGCACATTTAGGTCCGGGCTGACAGAATACAATCAGATCTT GAGGAATTGATGAAGGCTTTAACTGAACGATGCAAGAAACACGGGTTGGAGGTTAACTCGAAGG CCCTTGTAGACCTTCCAGCTGGTATATGATTCCGTTGCCTTGTGACTTCTTGCTTTCGTTGTAG ATGATTGCAAATAACATGTATTTTGTAAACAAACAACTTATGTGGAATTTGCTATGTTGTGACT TACAGGCTGGCAACCTGGAATTCAAGAAGGTGCAGCTCTTTGGGATGAGGAATGGGATAAGTTT GAAGATGAAGGTACAATGTTTTTTCCTATCTTTCTCTTACTAATACACTTAGATATATATAGTT AAGCACATAACAAGGACATTGACTGATAATGTTCCCACTGTTAGGTTTTGGCAATGAGATCACT TTTGACAAATCAAAAGAGCAAAACTCGTCTGGTGAGAAGGAAAATGGTACGGTGGATGATGGTA GTGGGCCACCTGATTCGCCGACCCATGTAGAGGACAACTATGGCCCTTTTTCAGAAACCTCAGA CCGCCACCATGAGAGTGAATATGGGACAACTCACAGTGAAGATAGAAGTCCTAGAGACAGTCCT GTCTCTAGGAATGCTACTGAGGTCCCATCTCCAGATTATTCTCAGGGAAAGAATTCTGAATTCT TTGATGACTCGAATTGGGCAAGTGCATTTGACACTAACGATGATGTGGATTCAGTCTGGGGATT TGATGCATCAAAAAGCCAG |