Splice junction sequence |
TTGTTGGTCAAACCGTATGATGTAGCAAACAGTGTAGACGTAATTAATGTGGCTCCCGCACACT TCCCATTCGCATCTCTGAACCTCTCTTGCGTCTCCTctgatgttcgtatgatggctattgccgc agagagttgtgaacggaatggcaagaaatcgaacaaaccattgcccgatgtgttgaccgctact cggtcatc
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Assembled circRNA sequence |
Yes
The sequence of a circRNA based on assembly using circseq-cup (Ye et al., 2016) or CIRI-full (Zheng and Zhao, 2018) or CIRCexplorer2 (Zhang et al., 2016).
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Full-length trsnacripts |
Transcript length: 385 Transcript exons: 19209860-19210117,19210218-19210296,19213934-19213981 CTGATGTTCGTATGATGGCTATTGCCGCAGAGAGTTGTGAACGGAATGGCAAGAAATCGAACAA ACCATTGCCCGATGTGTTGACCGCTACTCGGTCATCTCTTCGATACACCACTTTTCCTTGGCTT GGTAACCATATGAAATCCGCAAACTCGTGTTTCTTTCCAAAAGTAACGGCTTGATCTTCAAAAT CCGAATCGTTTCTCATAGTATATGTCAGCGATCTCTTGAACATCGGTTGCAATTCAAAAGTTAC CTACCTGAGAGATAACGCCAAGGACGCCAAGAGAAACCTTAGCCGCGTTAAACTCGTTAGGAGT CGTAGTCTCGCTTAAAACTCCCGCACACTTCCCATTCGCATCTCTGAACCTCTCTTGCGTCTCC T
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Genomic sequence |
CTGATGTTCGTATGATGGCTATTGCCGCAGAGAGTTGTGAACGGAATGGCAAGAAATCGAACAA ACCATTGCCCGATGTGTTGACCGCTACTCGGTCATCTCTTCGATACACCACTTTTCCTTGGCTT GGTAACCATATGAAATCCGCAAACTCGTGTTTCTTTCCAAAAGTAACGGCTTGATCTTCAAAAT CCGAATCGTTTCTCATAGTATATGTCAGCGATCTCTTGAACATCGGTTGCAATTCAAAAGTTAC CTTTAAAAAAACAAAAACAAAATGTAAACATCTAAAGAAAATGGCCTAGAAATATGATATAGCT TTGTAGTAAAAACTGAAACTGAAATTTTAAGTTTTCTAACCTGAGAGATAACGCCAAGGACGCC AAGAGAAACCTTAGCCGCGTTAAACTCGTTAGGAGTCGTAGTCTCGCTTAAAATTCTAATCTTT GCAAACCCTTCGTTGACCGAACCAGGACTAACCATCCTGATCTCGGTCACATAATCATGGACTG CACTTCCTTTACCCCACAATGAGCTCCCGTGAGCACCGGTTCCCATCATACCACCAACGGTCAG CCCCCACCAATACGGTGCATAAGGTAACGCCAATCCAACTTTAGCCGCTTCAACGATTAACTGC CTAAGCGTCATGCCACTCTCAACCGTCATGGTCATGGCTGTTGCATCGGCTTGTACCGTATGGT TTAGAAACTTTGTGCTTATGAACAAACCTTCGGTTCCGTCGGTACACACGAGCTTAGTAATGCT ATGGGAATATCGAGTTGTTACACGCATTTTCCGTCCGGCTTGAGTGGCTGCAGCCACGACAGAG ACAAGCTCGGCTTCAGTTTTTGGGTATGCCACGTTGGCGGCTCGACATGTGGACCTGTCTGGGA AGGCTCCGTATGAGTTAGTGACTGTACAGTTCGTGTTTCCTGACACACATTTGACAGGATCATC GGGTGGTGTTGAGACAGCCGTGTGCATAAGTGTAAATATATAATATAACCCGACTAGCGTGCGA TACGAAGGAGGAAAAGTAAATGCCATGGGGTTTGATTCAGTTTTGTTGAATCTTAATTTGTTGT GATTTGTGAATGTCGGCTTTGTAAATATATTTGGTATATATAGATATTGTGTGGCGTTAAGGCG GGTTCAATAGTATTTAAATAAAATATTATGTTTAGTTAAATCAAAAGAGGTTGAGATGAGATGG TTCATGCAATCTTGTACGTAAGAGAGTATTAACCACTAATTAATCATATTCGATTATTTTATAA TATTCCATTCATTTTTATGGACTGTCTTCTTAATTTCATTTCTATTACGTTGTCTTAAAAGACT TGACCATATTCTTATCAAGTATCATAGTCTATGGCAATCTCATTAGTCTTTAATCAAAAAAAAA ATATTCTTGTTTAGTCAAATTATTCACCCGGTGATTTTATGAAAATTGAAAAAACCAACGATGA CTTAGATATTTTAGTGAGCTAATACATGTACACGATAATTTCAACTACTGTAGTAGCATTATAT TAATAACTCAAGTCTGTAATGTCTTGAATTCATATATTAAGCTATATATGGCCTTGAATGTTTG TACGTAGTTTTTGAACTAATTTTTAGTTTTAGTTTTTTTTCCAAAATTTATTTTATAGTCATTC AAGATTTAAATTGAAAACAATTTATTAATCTAAGAAATAAAAAACTAGTTTTTCAGTGTTTAAC TATTTTTCAAAGAAAAACTAAAATCTGTAATTTTTAGGACTTGGGATTTTTCCTCAAAAATCAT CAATCATATTTTTTATTTCTTTTTTTCTAACGAAAATATAATCCATTAACATAAAAATCAAAAA CTAAATAAAGTAGGACACCCAACAAACTACCATTCAAATTTTTAAGAAAAAAAATAATCTAAAA CTAAAAAATAAAAACCAAAAGCCAGAAAACTATTTTAAAATTATAGACATTCATGGCCTATATA CTACACCCACTAGTTGAGTTTTATTATAATAAAAAAACATTAGTTGTGGTTTTGTCCAATATAC AGTGAATAATCAATTTTATTTGAAAGAAGATAAGATCGCCAAGGTACGCACGCCTTTCACAAGC CGTTGCCTTCACACACAAAGTAAATGATTCAATGAAAGTCCATGGGAGTAATCTTAGTAAATGA AAGTCCATGGGAGTAATCTTAATAAATGAAAGTCAGTACTAGTCATAGTTCAAACTTTTCTCCA AATTTTTTGATAAATCCTACAGAATATATATTACTGCATTGTGTAATGATATGTAATCTTCAAA TACATATAATGGTAGCACTAATCTGAAACATAATCTAATGAATTTAAAATCCTATTTAATTTCT AATACAAAAATAAAGTTTTAATAGAAATAGTGTTTGTAAGAAAATAAATATCAGATATTGAAGA AAAAAACTAGTCTTCCTTTTTTTTTTTTGTTAAAGGGTTTTAAACTATTCTTCCTTGCACACAC ATGTCAGTATCTTGAACTTTGCGAATTTTATTTCGTATTCGGTTCAAATTTTGAAGTCCACGAT ACTCAATCCTAAAATTTTATCTTGTTATTTAAGGTATATGTATATCTCACAAGTTTTTTTTTTT TTTTTTTTGGTTTTATATCTCTTAAGTAGTTTATTTGTCGTTTGCTAAAAAAAAAGTACGTAGT TTATTTGTCCTCAATTATTAACATCATTATTGTTTTCGCAACAAAGGGTCTTATTTAAAAAAAA AAAAAAAAAAAACAAAGGGTCTTATTTGTAGCGCAAGGCAGAAAATGACCTAATTAATGATTTA TGAACATGCGCATTTGGTAAAATAAATAATAAACCCATAACCCTCACTCCTCAGTGGAACAAGT TTCAAGATACGACACCTTAAAATGTACTTTGACTTTGATTTTTTTTCTTTCTAATTCCTTTTCA TTAGTCAAAAGTAGAAACTAACCAAGACATCGAAATTATTAGGCATCGTGCCTCACGATTTTTT TTTTTTTTTTTTTCTGCCTCTTACATTTTTATTGCTACCACAACATTAACAATAACTCGTCATG ATAAATATCGACCACATATAAAGAAGATAAGTATCTTATATCTAAAACAAGCAATGAAAAATTA GTAATGAAAAAATAAAAAAGAAGCAATGAAGATTAGTAACTTAGTGATTGAATCACACTTATGT CATCAGCACGTGTACATACCCTAGCTTCTTTGTAGACTTTTCCTGGTCGACAAAAATATCCTTT GGTCGGAGCACAATGAGCATCCTCCGAACATACGCACAAACCCTCTAATGCGCATCCATCTTTT ATTATCGTCACATTTCCTTTGATTCCTAAGATCTGATCAGTCCATTCGCTTGAGAATAAACCCA TTGGATCATAGCTTTCTTTTACTTTCAAGAATGCCGGCACATTCTTGTACTTTTTAATCACTCC ATCAAACGCTAAGTTCCTGTTCTTACCCCAATGCGGCAAGGCGTTATACTTGAACAACGCAATT TGCTCGATTTCTTCGATAAAATCTTCGTATAGTCGCGGTGATAACGGATCTTTGGCTCGGTAAT ACGTGAGGTCAAAGTCCAAAGCCTCTGTTTCTTTCCCGAGATACGCCGGAGAAGATGTGACATA ACGCATTAGAATACCATCGTATAGCTCAAGCACGCACAAAGATTTCGACTCTATCTTGACAAGA GATTTGATGTCGTTGATGAAACTTTTGACTTGCGTGAGCGGAATACTGAAAGTTGTTTGGTGGA AGAATTCACTTTTTATACGTGAGTCCCATGGACACGCTGTGATTAATCCATCATGAAGACTGTC TAGGCATGATCCTGACGACATCATACGGTTCTGGCTTCCAATAACCGGATAACCGGTAAATATC ATGCCTAAAGCCGGTGAATGTTTAAACCATAATAAAGGTAGGAGTGACTTAATATTCGATCGAT GTAAAATGATGCAAATGTACAAGTAAAAATAAACAAAAGTTTAGTTAAATACCATTGTTGGTCA AACCGTATGATGTAGCAAACAGTGTAGACGTAATTAATGTGGCTCCCGCACACTTCCCATTCGC ATCTCTGAACCTCTCTTGCGTCTCCT |