Splice junction sequence |
AGGGATGCGGAGGCATTAGCTGTCAGTATTTTGGATAATTTGGCTCGAGTTCCACGCTTCGACT TGATAATCATGTGCCTTTCATCCATGCACAAATTTGgaatataaggcgagatctactggaactt caggaacttcgtctaaaagtttccgtgatctgtacaatatgaagtactcgagctacttaaacga cgaaccaa
|
Assembled circRNA sequence |
Yes
The sequence of a circRNA based on assembly using circseq-cup (Ye et al., 2016) or CIRI-full (Zheng and Zhao, 2018) or CIRCexplorer2 (Zhang et al., 2016).
|
Full-length trsnacripts |
Transcript length: 1054 Transcript exons: 134634172-134634300,134634399-134634523,134634818-134634 939,134635038-134635120,134635360-134635458,134635536-13 4635649,134636305-134636493,134636575-134636669,13463675 4-134636851 GAATATAAGGCGAGATCTACTGGAACTTCAGGAACTTCGTCTAAAAGTTTCCGTGATCTGTACA ATATGAAGTACTCGAGCTACTTAAACGACGAACCAATGCCGGATGCTACATCGGAAAAGGAGCA GGGAAATGAGTATTTCAAACAGAAGAAGTTCACTGATGCTATTGAATGCTACTCCAGAAGTATT GGGCTGTCTCCTACAGCAGTCACATTTGCAAATAGAGCTATGGCATATCTTAAACTAAGAAGAT TCAAGGAGGCAGAGGACGATTGCACTGAAGCTCTGAATCTGGATGATCGCTATATTAAAGCATA CTCACGCCGAATTACTGCACGAAAAGAACTTGGGAAGCTTAAGGAGGCAATGGATGATGCTGAA TTTGCTATCAGTCTTGATCCAAACAATTCAGAGCTAAGGAAGCAGTATTCTGAGATAAAAGCTT TGCACATGGAGAAAATGGCTAAAAAGGTTCCAGTGCCAGCTAAACGTGCAGTTTCTGGAATTGA TAAAACTGCAGATGTCACTTCTCACCCACCGACTATCTCCCAGAAGGACACTATTATGGAAGTT GATCTGCCTGTTAGAGATGCAATGAAGATCAAAGAGAGTGCAAGCGTCAAGTCTAACGGAGGAC CTGGAGTAATCATCAATGGCAATAACGTGCAGCTCCAAGGTCGAGATGCCAACCAGAAGACTGG GCCAGAAGTTTCAGTCCAAGATCTTGCAGCTCGTGCTGCTTCACGGTATATGGCCGGCACTGTG AAAAGCATTAAGACACCCAAAACAGCTTATGACTTTGAGGTTTCTTGGAGAGCTCTTTCTGATG ACACTGCCCAGCAAATACAGTTACTAAAGTCGATTCCACCAGCAAGCCTACCAGAGATTTTCAA GAACGCACTTTCTGCACCTTTTCTTATTGACATCGTGAAGTGTGCAGCCTCAATTTTCCGGGAT GCGGAGGCATTAGCTGTCAGTATTTTGGATAATTTGGCTCGAGTTCCACGCTTCGACTTGATAA TCATGTGCCTTTCATCCATGCACAAATTTG
|
Genomic sequence |
GAATATAAGGCGAGATCTACTGGAACTTCAGGAACTTCGTCTAAAAGTTTCCGTGATCTGTACA ATATGAAGTACTCGAGCTACTTAAACGACGAACCAATGCCGGATGCTACATCGGAAAAGGAGCA GGTTGTAATACTCAGGCTATTTAGTCCCTGCTTTGTAGGCTGTTTCACAAGCAAGCTTTGGTTA AGCTACACCTGTTGCTTCCTATGTTTTATTTCCAGGGAAATGAGTATTTCAAACAGAAGAAGTT CACTGATGCTATTGAATGCTACTCCAGAAGTATTGGGCTGTCTCCTACAGCAGTCACATTTGCA AATAGAGCTATGGCATATCTTAAACTAAGAAGGCAAGTTACTCTGGGACTGTATGCATCCACTT CACCTTATGCAATATCTTCATTTGTTCTGCTTTTACTAGAAGTACCCCATCTCGATTTAATCTG AAGCCATATATTTTTATTAGCTCCAGCAATTTGAGACTGTAGGATAAGGCATATTTTTTGTATT CTTGGTTCTTGTTATCTGTGCTATTTATAATATATTTTTACCTACCTGCTGTGTCCTGTGGAAC CTGGAAGTTCCGTTTCCAAGAGGTTTTTTTTCCTGCTGTAGTCTTATATTATAGATATGTAATT CATCAGATTCAAGGAGGCAGAGGACGATTGCACTGAAGCTCTGAATCTGGATGATCGCTATATT AAAGCATACTCACGCCGAATTACTGCACGAAAAGAACTTGGGAAGCTTAAGGAGGCAATGGATG GTATTCCATGCTAAAATGCTTCTGTATTTTTCTTTTTTATAATCTTCTTTTTTACTTTCTGAAT ATTGACCTGAATTATACACCGATTATGTGTATAGATGCTGAATTTGCTATCAGTCTTGATCCAA ACAATTCAGAGCTAAGGAAGCAGTATTCTGAGATAAAAGCTTTGCACATGGAGGTGAGGAAACT CAACTTCAAATTGTTTCACCTTACACCTGCTTAGATTTTAGCAATTTACTACTCTTTGGTTATA AATTTCACTTTCGCTCATTTTAACTGGAATAATGACAAAACATGGGCTTTTGAGTTGCATGGCT TATGTGTGATTCAGTGGCATAACCATGTGGATGATCTCTGCAGGGATTGTAAATGTTTTTATCA GTCTCATTAGCACTGATGGGCTTATTAATTCTGCAGAAAATGGCTAAAAAGGTTCCAGTGCCAG CTAAACGTGCAGTTTCTGGAATTGATAAAACTGCAGATGTCACTTCTCACCCACCGACTATCTC CCAGAAGGTAGGTTCAGCTGCAGTTATACAATGCCATGTCATGACTTTGCCCTTTTCAACAGAT GACCGATTTAAATTCTACAGGACACTATTATGGAAGTTGATCTGCCTGTTAGAGATGCAATGAA GATCAAAGAGAGTGCAAGCGTCAAGTCTAACGGAGGACCTGGAGTAATCATCAATGGCAATAAC GTGCAGGTTTTTTTTTTATTTCTGTAGCCTTTCTGACCATTATAATAACCACAATCTGTGGACT GTGGTATCTGTGTTGGTACTAGTTGTCATATTATGGCAAGTAAAAGCACCTATATGTACAATAG GAGGTACTCAGGATGTCGTTTGGGAAGTTTTTCTTGCAATATTTATGAGATACAATGTGTCTTA TTTAATTTGCTTGAAAAAACTGAATCCTTTGGATAAGGGAATAACTTAACATGTATTATTATCA CACACCAATCTGGAACCAAAATAAGTTTGAAATTGCGTACTTGTTAAAACAGGCTTTAACTAGC TTTTAATAGATGGTTTCCCATTTTAATGAGAAAAGAGAAGACCTCTGGAACCTCTGAGCTATGT GCTGTTCACATTGGAGTGGAGCGTGATTGTTTGGGTGATTGGAGATCCTGCCCCAACCCACTGC AAGCTGTAAATACACAACTGAATTCTCTAAGGGTTCTGGATCATGTTTATAAGTTCATTGTTTG ACTGACTTGTTCTGTATCAATTGTCATGTTTTCTGTTTAACATTTTAAGACATCACTGCAATTG CAATGACACATATATGTCTATTTTTCACAATTTGTTGGAAGTATTTCTGTTTCTGTGTCACATG TTTCAACACTTGATGCAGCAGCTCCAAGGTCGAGATGCCAACCAGAAGACTGGGCCAGAAGTTT CAGTCCAAGATCTTGCAGCTCGTGCTGCTTCACGGTATATGGCCGGCACTGTGAAAAGCATTAA GACACCCAAAACAGCTTATGACTTTGAGGTTTCTTGGAGAGCTCTTTCTGATGACACTGCCCAG CAAATACAGTTACTAAAGGTTTATTTCCAGCTACCTGTTTTTTTTTTACTGGCACCATTGTTTT TATGTGTAATTTCCTGCCTGTTTGTTTTCAAGCAGTCGATTCCACCAGCAAGCCTACCAGAGAT TTTCAAGAACGCACTTTCTGCACCTTTTCTTATTGACATCGTGAAGTGTGCAGCCTCAATTTTC CGGTACGCTCACTTGTTATTTGTCCTTTTGCCATATGCCAGACTGGGCCCATGGTTGTTATACG TAACTGTTGTTTACATACTCAGGGATGCGGAGGCATTAGCTGTCAGTATTTTGGATAATTTGGC TCGAGTTCCACGCTTCGACTTGATAATCATGTGCCTTTCATCCATGCACAAATTTG |