Splice junction sequence |
TGCTGGTGGTATTGCTGAAATGGCTGGAATGAGCCACCGCATCCGTGAAAGAACTGATGCTCTT GATGCCGCTGGAAACACCACTGCTGCTATTGGAAAGgtgcaacttcattcctattcacggagta caaatatgttggtgtcttcatgattttctttgctgctgttatctttgttttcctcggctctgtt gagggatt
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Assembled circRNA sequence |
Yes
The sequence of a circRNA based on assembly using circseq-cup (Ye et al., 2016) or CIRI-full (Zheng and Zhao, 2018) or CIRCexplorer2 (Zhang et al., 2016).
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Full-length trsnacripts |
Transcript length: 1373 Transcript exons: 5399575-5400149,5400237-5400616,5400717-5400803,5400885- 5401215 GTGCAACTTCATTCCTATTCACGGAGTACAAATATGTTGGTGTCTTCATGATTTTCTTTGCTGC TGTTATCTTTGTTTTCCTCGGCTCTGTTGAGGGATTCAGCACTGATAACAAGCCTTGTACTTAC GACACCACCAGAACCTGCAAGCCTGCATTGGCTACTGCAGCTTTCAGTACCATTGCTTTCGTGC TTGGTGCTGTTACCTCTGTTCTATCTGGTTTCCTTGGGATGAAGATTGCTACATACGCTAATGC TAGGACCACTTTGGAGGCGAGGAAAGGTGTTGGAAAGGCGTTCATTGTTGCATTCAGGTCTGGT GCTGTGATGGGTTTCCTTCTTGCAGCGAGTGGTCTATTGGTGCTTTACATTACTATCAATGTGT TCAAGATCTATTACGGAGATGACTGGGAAGGTCTTTTTGAGGCTATTACTGGTTATGGTCTTGG TGGGTCTTCCATGGCTCTCTTTGGCCGTGTTGGTGGTGGGATCTACACTAAGGCTGCTGATGTC GGCGCTGACCTTGTCGGTAAAATTGAGAGGAATATTCCAGAGGATGATCCAAGAAACCCAGCTG TCATTGCTGATAATGTCGGTGACAATGTTGGTGACATTGCTGGTATGGGATCTGATCTCTTTGG ATCATATGCTGAAGCATCATGCGCTGCTCTTGTTGTTGCCTCGATCTCATCTTTCGGAATCAAC CACGACTTCACTGCCATGTGCTACCCATTGCTCATCAGTTCAATGGGAATCTTGGTTTGTTTGA TCACAACTCTCTTTGCCACTGACTTCTTTGAGATTAAGCTTGTCAAGGAGATTGAACCAGCATT GAAGAACCAGCTCATTATCTCAACTGTTATTATGACTGTTGGTATTGCTATTGTGTCATGGGTT GGCTTACCGACCTCCTTTACCATCTTCAACTTTGGAACACAAAAAGTTGTCAAGAACTGGCAGC TATTCCTTTGTGTTTGTGTTGGTCTTTGGGCTGGACTCATTATTGGTTTCGTCACTGAGTACTA CACTAGTAACGCCTACAGCCCTGTGCAAGATGTTGCAGATTCATGCAGAACTGGTGCAGCTACC AATGTTATCTTCGGCCTTGCTCTTGGTTACAAATCCGTCATTATTCCAATCTTTGCTATTGCTA TCAGTATATTCGTTAGCTTCAGCTTTGCTGCTATGTATGGTGTTGCTGTTGCTGCTCTTGGTAT GCTCAGTACCATTGCCACTGGTTTGGCAATTGATGCTTATGGTCCCATCAGTGACAATGCTGGT GGTATTGCTGAAATGGCTGGAATGAGCCACCGCATCCGTGAAAGAACTGATGCTCTTGATGCCG CTGGAAACACCACTGCTGCTATTGGAAAG
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Genomic sequence |
GTGCAACTTCATTCCTATTCACGGAGTACAAATATGTTGGTGTCTTCATGATTTTCTTTGCTGC TGTTATCTTTGTTTTCCTCGGCTCTGTTGAGGGATTCAGCACTGATAACAAGCCTTGTACTTAC GACACCACCAGAACCTGCAAGCCTGCATTGGCTACTGCAGCTTTCAGTACCATTGCTTTCGTGC TTGGTGCTGTTACCTCTGTTCTATCTGGTTTCCTTGGGATGAAGATTGCTACATACGCTAATGC TAGGACCACTTTGGAGGCGAGGAAAGGTGTTGGAAAGGCGTTCATTGTTGCATTCAGGTCTGGT GCTGTGATGGGTTTCCTTCTTGCAGCGAGTGGTCTATTGGTGCTTTACATTACTATCAATGTGT TCAAGATCTATTACGGAGATGACTGGGAAGGTCTTTTTGAGGCTATTACTGGTTATGGTCTTGG TGGGTCTTCCATGGCTCTCTTTGGCCGTGTTGGTGGTGGGATCTACACTAAGGCTGCTGATGTC GGCGCTGACCTTGTCGGTAAAATTGAGAGGAATATTCCAGAGGATGATCCAAGAAACCCAGCTG TAAGTACACCATTTCACTGTGTGATAACACTTTGCTTTCTTTTTTTCAATAGAAGTTAAGACTT ATTTTGGTTGGTTATGTTACAGGTCATTGCTGATAATGTCGGTGACAATGTTGGTGACATTGCT GGTATGGGATCTGATCTCTTTGGATCATATGCTGAAGCATCATGCGCTGCTCTTGTTGTTGCCT CGATCTCATCTTTCGGAATCAACCACGACTTCACTGCCATGTGCTACCCATTGCTCATCAGTTC AATGGGAATCTTGGTTTGTTTGATCACAACTCTCTTTGCCACTGACTTCTTTGAGATTAAGCTT GTCAAGGAGATTGAACCAGCATTGAAGAACCAGCTCATTATCTCAACTGTTATTATGACTGTTG GTATTGCTATTGTGTCATGGGTTGGCTTACCGACCTCCTTTACCATCTTCAACTTTGGAACACA AAAAGTTGTCAAGAACTGGTAATTTCCTTGTGGATGATTGCTTTTGTTTTTTTCCTGCATTTCT CTATTCAAATTTCTCGTTGCACTTTTTTAAGTCTTGCATTATTTTGGATTTCAGGCAGCTATTC CTTTGTGTTTGTGTTGGTCTTTGGGCTGGACTCATTATTGGTTTCGTCACTGAGTACTACACTA GTAACGCCTACAGGTAAGACTCATTTTAGCTGTATTTAGTCACTAACTTTTCCCAGCTAGTAGA GCTAACTCTTATGTCCTCCTATTCTTGCAGCCCTGTGCAAGATGTTGCAGATTCATGCAGAACT GGTGCAGCTACCAATGTTATCTTCGGCCTTGCTCTTGGTTACAAATCCGTCATTATTCCAATCT TTGCTATTGCTATCAGTATATTCGTTAGCTTCAGCTTTGCTGCTATGTATGGTGTTGCTGTTGC TGCTCTTGGTATGCTCAGTACCATTGCCACTGGTTTGGCAATTGATGCTTATGGTCCCATCAGT GACAATGCTGGTGGTATTGCTGAAATGGCTGGAATGAGCCACCGCATCCGTGAAAGAACTGATG CTCTTGATGCCGCTGGAAACACCACTGCTGCTATTGGAAAG |